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ÉCOLE NATIONALE VETERINAIRE D’ALFORT
Année 2009
L’HÉPATITE E D’ORIGINE ZOONOTIQUE
THESE
Pour le
DOCTORAT VETERINAIRE
Présentée et soutenue publiquement devant
LA FACULTE DE MEDECINE DE CRETEIL
le……………
par
Fleuriane Marine MARULIER
Née le 19 août 1983 à Bois-Colombes (Hauts-de-Seine)
JURY
Président : M.
Professeur à la Faculté de Médecine de CRETEIL
Membres
Directeur : M. Marc ELOIT
Professeur à l’ENVA
Assesseur : Mme Nadia HADDAD – HOANG-XUAN
Maître de conférences à l’ENVA
Invité : Mme Nicole PAVIO
UMR 1161 de Virologie INRA-AFSSA-ENVA

LISTE DES MEMBRES DU CORPS ENSEIGNANT
Directeur : M. le Professeur MIALOT Jean-Paul
Directeurs honoraires : MM. les Professeurs MORAILLON Robert, PARODI André-Laurent, PILET Charles, TOMA Bernard
Professeurs honoraires: MM. BRUGERE Henri, BUSSIERAS Jean, CERF Olivier, CLERC Bernard, LE BARS Henri, MILHAUD Guy, ROZIER
Jacques,
DEPARTEMENT DES SCIENCES BIOLOGIQUES ET PHARMACEUTIQUES (DSBP)
Chef du département : Mme COMBRISSON Hélène, Professeur - Adjoint : Mme LE PODER Sophie, Maître de conférences
- UNITE D’ANATOMIE DES ANIMAUX DOMESTIQUES
Mme CREVIER-DENOIX Nathalie, Professeur
M. DEGUEURCE Christophe, Professeur
Mme ROBERT Céline, Maître de conférences
M. CHATEAU Henry, Maître de conférences*
- UNITE DE PATHOLOGIE GENERALE , MICROBIOLOGIE,
IMMUNOLOGIE
Mme QUINTIN-COLONNA Françoise, Professeur*
M. BOULOUIS Henri-Jean, Professeur
M. FREYBURGER Ludovic, Maître de conférences
- UNITE DE PHYSIOLOGIE ET THERAPEUTIQUE
Mme COMBRISSON Hélène, Professeur*
M. TIRET Laurent, Maître de conférences
Mme STORCK-PILOT Fanny, Maître de conférences
- UNITE DE PHARMACIE ET TOXICOLOGIE
Mme ENRIQUEZ Brigitte, Professeur
M. TISSIER Renaud, Maître de conférences*
M. PERROT Sébastien, Maître de conférences
- DISCIPLINE : ETHOLOGIE
M. DEPUTTE Bertrand, Professeur
- DISCIPLINE : ANGLAIS
Mme CONAN Muriel, Professeur certifié
- UNITE D’HISTOLOGIE , ANATOMIE PATHOLOGIQUE
M. CRESPEAU François, Professeur
M. FONTAINE Jean-Jacques, Professeur *
Mme BERNEX Florence, Maître de conférences
Mme CORDONNIER-LEFORT Nathalie, Maître de conférences
- UNITE DE VIROLOGIE
M. ELOIT Marc, Professeur *
Mme LE PODER Sophie, Maître de conférences
- DISCIPLINE : PHYSIQUE ET CHIMIE BIOLOGIQUES ET
MEDICALES
M. MOUTHON Gilbert, Professeur
- UNITE DE GENETIQUE MEDICALE ET MOLECULAIRE
M. PANTHIER Jean-Jacques, Professeur
Mme ABITBOL Marie, Maître de conférences*
- UNITE DE BIOCHIMIE
M. MICHAUX Jean-Michel, Maître de conférences*
M. BELLIER Sylvain, Maître de conférences
- DISCIPLINE : EDUCATION PHYSIQUE ET SPORTIVE
M. PHILIPS, Professeur certifié
DEPARTEMENT D’ELEVAGE ET DE PATHOLOGIE DES EQUIDES ET DES CARNIVORES (DEPEC)
Chef du département : M. POLACK Bruno, Maître de conférences - Adjoint : M. BLOT Stéphane, Maître de conférences
- UNITE DE MEDECINE
M. POUCHELON Jean-Louis, Professeur*
Mme CHETBOUL Valérie, Professeur
M. BLOT Stéphane, Maître de conférences
M. ROSENBERG Charles, Maître de conférences
Mme MAUREY Christelle, Maître de conférences
- UNITE DE CLINIQUE EQUINE
M. DENOIX Jean-Marie, Professeur
M. AUDIGIE Fabrice, Maître de conférences*
Mme GIRAUDET Aude, Praticien hospitalier
Mme MESPOULHES-RIVIERE Céline, Maître de conférences
contractuel
Mme PRADIER Sophie, Maître de conférences contractuel
- UNITE DE REPRODUCTION ANIMALE
Mme CHASTANT-MAILLARD Sylvie, Maître de conférences
(rattachée au DPASP)
M. NUDELMANN Nicolas, Maître de conférences
M. FONTBONNE Alain, Maître de conférences*
M. REMY Dominique, Maître de conférences (rattaché au DPASP)
M. DESBOIS Christophe, Maître de conférences
Mme CONSTANT Fabienne, Maître de conférences (rattachée au
DPASP)
Mme DEGUILLAUME Laure, Maître de conférences contractuel
(rattachée au DPASP)
- DISCIPLINE : URGENCE SOINS INTENSIFS
Mme Françoise ROUX, Maître de conférences contractuel
- UNITE DE PATHOLOGIE CHIRURGICALE
M. FAYOLLE Pascal, Professeur *
M. MAILHAC Jean-Marie, Maître de conférences
M. NIEBAUER Gert, Professeur contractuel
Mme VIATEAU-DUVAL Véronique, Maître de conférences
Mme RAVARY-PLUMIOEN Bérangère, Maître de conférences (rattachée
au DPASP)
M. ZILBERSTEIN Luca, Maître de conférences contractuel
M. JARDEL Nicolas, Maître de conférences contractuel
- UNITE D’IMAGERIE MEDICALE
Mme BEGON Dominique, Professeur*
Mme STAMBOULI Fouzia, Praticien hospitalier
- DISCIPLINE : OPHTALMOLOGIE
Mme CHAHORY Sabine, Maître de conférences
- UNITE DE PARASITOLOGIE ET MALADIES PARASITAIRES
M. CHERMETTE René, Professeur *
M. POLACK Bruno, Maître de conférences
M. GUILLOT Jacques, Professeur
Mme MARIGNAC Geneviève, Maître de conférences
Mme HALOS Lénaïg, Maître de conférences
M. HUBERT Blaise, Praticien hospitalier
- DISCIPLINE : NUTRITION-ALIMENTATION
M. PARAGON Bernard, Professeur
M. GRANDJEAN Dominique, Professeur
DEPARTEMENT DES PRODUCTIONS ANIMALES ET DE LA SANTE PUBLIQUE (DPASP)
Chef du département : M. MAILLARD Renaud, Maître de conférences - Adjoint : Mme DUFOUR Barbara, Maître de conférences
- UNITE DES MALADIES CONTAGIEUSES
M. BENET Jean-Jacques, Professeur*
Mme HADDAD/ HOANG-XUAN Nadia, Maître de conférences
Mme DUFOUR Barbara, Maître de conférences
- UNITE D’HYGIENE ET INDUSTRIE DES ALIMENTS
D’ORIGINE ANIMALE
M. BOLNOT François, Maître de conférences *
M. CARLIER Vincent, Professeur
Mme COLMIN Catherine, Maître de conférences
M. AUGUSTIN Jean-Christophe, Maître de conférences
- DISCIPLINE : BIOSTATISTIQUES
M. SANAA Moez, Maître de conférences
- UNITE DE ZOOTECHNIE, ECONOMIE RURALE
M. COURREAU Jean-François, Professeur
M. BOSSE Philippe, Professeur
Mme GRIMARD-BALLIF Bénédicte, Professeur
Mme LEROY Isabelle, Maître de conférences
M. ARNE Pascal, Maître de conférences
M. PONTER Andrew, Maître de conférences*
- UNITE DE PATHOLOGIE MEDICALE DU BETAIL ET DES
ANIMAUX DE BASSE-COUR
M. MILLEMANN Yves, Maître de conférences
Mme BRUGERE-PICOUX Jeanne, Professeur (rattachée au DSBP)
M. MAILLARD Renaud, Maître de conférences
M. ADJOU Karim, Maître de conférences*
* Responsable de l’Unité

REMERCIEMENTS
A Monsieur le Professeur, de la Faculté de Médecine de Créteil,
qui nous a fait l’honneur d’accepter la présidence du jury de cette thèse.
A Monsieur le Professeur Marc ELOIT, de l’Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort, directeur de cette
thèse,
dans un premier temps, pour la proposition de ce sujet. Vous m’avez offert un sujet aux marges de ma
formation finale mais d’autant plus passionnant et enrichissant. Je vous suis également très
reconnaissante pour nos discussions sur ce sujet ou sur un autre, pour votre disponibilité et votre
confiance en mes capacités tout au long de ce travail.
A Madame le Maître de conférences Nadia HADDAD – HOANG-XUAN, de l’Ecole Nationale
Vétérinaire d’Alfort, en qualité d’assesseur,
pour avoir accepté ce rôle. Le choix d’un professeur de l’Unité Pédagogique de Maladies Contagieuses
et plus particulièrement de vous en tant qu’assesseur était évident.
A Madame Nicole PAVIO, de l’UMR 1161 de Virologie INRA-AFSSA-ENVA,
pour votre article de synthèse qui m’a passionnée et a été à la base de cette thèse. Par la suite, nos
entrevues m’ont permis de recadrer mes idées et ont été un véritable moteur pour achever ce travail. Je
vous remercie également pour la lecture attentive et votre participation au jury de cette thèse.
A Madame Gaétana DI LIBIERTO - VANDEMEULEBROUCK, de l’UMR 1161 de Virologie
INRA-AFSSA-ENVA,
pour m’avoir éclairée dans le monde obscur des modèles cellulaires et expliqué ses recherches.
A ma famille.
L’occasion m’est donnée de vous témoigner toute ma gratitude et mon amour. Votre soutien
indéfectible et votre confiance en moi m’ont permis d’être ce que je suis et où je suis aujourd’hui.
Alors simplement et sincèrement merci.
A Julien,
pour tant de raisons : ta présence à mes côtés bien avant et durant l’aventure vétérinaire, ton soutien à
tout épreuve, ta compréhension face à un métier-passion très prenant, ta joie de vivre et surtout ton
amour. Merci pour tout ce qui est passé et tout ce qui reste à venir.
A mes amis, dont je ne citerai pas les noms mais qui, je le sais, se reconnaîtront.
Aux amis de longue date, merci d’être toujours là et j’espère pour de nombreuses années encore.
Aux amis « du quotidien », merci d’être présents à tout moment et surtout d’être une véritable bulle
d’oxygène.
Aux amis vétérinaires ou futur(e)s vétérinaires, merci pour tous les bons et aussi les mauvais
moments. Mes années à l’ENVA n’auraient pas été les mêmes sans vous.

1
TABLE DES MATIÈRES
Liste des figures et tableaux 5
Liste des annexes 7
INTRODUCTION 9
I.ÉTUDE DE L’AGENT PATHOGÈNE : LE VIRUS DE L’HÉPATITE E 14
1.Taxonomie du VHE 14
2.Structure et organisation génétique 16
a.Données générales 16
b.Le génome viral 19
c.Les protéines virales : nature et fonctions 20
α. Protéines codées par l'ORF1 19
β. Protéines codée par l'ORF2 20
γ. Protéines codée par l'ORF3 21
3.Cycle viral 24
4.Variabilité génétique du VHE 27
a.Notions de base 27
b.De nombreuses souches, mais quels liens, quelle proximité génétique ? 28
c.Stratégies évolutives 34
5.Propriétés physico-chimiques 36
6.Quels modèles pour la culture cellulaire in vitro ? 37
II.L’HÉPATITE E – ENTITÉ CLINIQUE ET DIAGNOSTIC 42
1.Physiopathogénie 42
2.Pouvoir pathogène du VHE : symptômes et lésions 44
a.Hépatite E chez l’Homme : une expression typique des virus hépatiques
entérotransmissibles 44
α. Symptômes 41
β. Lésions histopathologiques 44
b.Une symptomatologie différente chez l’animal 48

2
3.Evolution des marqueurs biologiques : analyses comparées Homme/Animal 51
a.Marqueurs des fonctions hépatiques 51
b. Chronologie et profil de la réponse immunitaire 55
4.Modalités de diagnostic et de dépistage 59
a.Examens d’orientation 59
b.Mise en évidence des marqueurs sérologiques de l’hépatite E 61
c.Recherche du virus 63
d.En résumé : application chez l’Homme et chez l’animal 64
α. Chez l'Homme 60
β. Chez l'animal 62
III.ÉPIDEMIOLOGIE DE L’HÉPATITE E 69
1.Approche descriptive 69
a.Quels espèces atteintes ? 69
b.Distribution du VHE 73
c.Fréquence de l’infection 77
α. Chez l'Homme: une situation hétérogène 71
β. Chez l'animal: un constat simple: le VHE est omniprésent dans le monde 73
(1) Vue d'ensemble de l'infection animale 73
(2) L'infection porcine en détail 75
2.Approche analytique 84
a.Quels modes de transmission pour le VHE ? 84
α. Le point chez l'Homme 77
β. La situation chez le porc 80
b.L’hépatite E, maladie émergente? 89
IV.L’HÉPATITE E AUTOCHTONE ZOONOTIQUE, UNE RÉALITE? 93
1.Une composante zoonotique désormais reconnue 93
a.Proximité génétique des souches virales humaines et porcines de génotypes
3 et 4 93
b.Notion de barrière d’espèce 97
c.Cas de transmission zoonotique documentés 100
α. Cas scientifiquement confirmés: peu de preuves 91
β. Cas considérés comme avérés 92