Mécanismes de variation des traits fonctionnels dans les prairies

Université Joseph Fourier Grenoble 1
Ecole Doctorale Chimie et Sciences du Vivant
THESE
Pour l‟obtention du titre de
Docteur en Biologie
Mention Biodiversité-Ecologie-Environnement
Mécanismes de variation des traits fonctionnels dans
les prairies des Alpes.
Par Fabrice Grassein
Soutenue le 23 octobre 2009
Membres du jury :
Marie Laure Navas Professeur, ENSAM, Montpellier Rapporteur
Laurent Hazard Chargé de recherche, INRA, Toulouse Rapporteur
Philippe Cozic Directeur de recherche, CEMAGREF, Grenoble Examinateur
Bill Shipley Professeur, Université de Sherbrooke (Qc), Canada Examinateur
Sandra Lavorel Directeur de recherche, CNRS, Grenoble Directrice de thèse
Irène Till Directeur de recherche, CNRS, Grenoble Directrice de thèse
Thèse réalisé au sein du Laboratoire d’Ecologie Alpine1 et de la Station Alpine Joseph
Fourier2
1 : UMR UJF-CNRS 5553 BP53 Université Joseph Fourier 38041 Grenoble Cedex 9
2 : UMS UJF-CNRS 2925 BP53 Université Joseph Fourier 38041 Grenoble Cedex 9
Avant-propos
Ce manuscrit déposé à l‟école doctorale Chimie et Sciences du vivant de l‟université de
Grenoble (Université Joseph Fourier) se présente sous la forme d‟une thèse sur articles. Il
comporte une introduction en français du contexte général et des méthodes employées, trois
chapitres regroupant les articles en anglais et une présentation succincte des objectifs et
résultats obtenus, et enfin une discussion sous la forme de synthèse des résultats obtenus.
Mon allocation de recherche pour trois ans a été financée par la région Rhône Alpes
dans le cadre du Cluster Environnement. Ma quatrième année a été financée grâce à un poste
d‟attaché temporaire à l‟enseignement et à la recherche à l‟UFR de Biologie de l‟UJF. Le
financement des expérimentations a été rendu possible grâce au soutien financier du Cluster
ainsi que par le biais du projet ANR-05-BDIV-009-01 QDIV auquel le Laboratoire
d‟Ecologie Alpine participait. Ce travail a été réalisé au sein du Laboratoire d‟Ecologie
Alpine de l‟université de Grenoble ainsi que sur les zones expérimentales de la Station Alpine
Joseph Fourier à Grenoble et au Col du Lautaret (Hautes Alpes).
Avant-propos
Remerciements
-
En premier lieu, je tiens à remercier mes directrices de thèse préférées. Ce travail de
thèse se veut un pont entre écologie et évolution ? Il se résume surtout par des allers retours
conceptuels entre les visions de ces deux personnes. Toujours enrichissantes, ces discussions
se sont toujours terminées sur une vision commune, malgré des façons de dire les choses (ou
de ne pas les dire) différentes. Merci pour votre disponibilité, votre patience, et votre
enthousiasme pour toute nouvelle idée. En effet, bien que Sandra ait été bien entraînée avec
Nico, vous avez toujours été accueillantes pour des explications boiteuses sur des théories
fumeuses avec des données squelettiques. Merci pour tout.
Je tiens à remercier les membres du jury, Philippe Cozic et Bill Shipley qui ont
accepté d‟évaluer ce travail, ainsi que Marie-Laure Navas et Laurent Hazard qui ont relevé le
défi d‟être rapporteurs de ce manuscrit touffu dans des délais relativement brefs tout en
produisant un rapport de bon conseil.
Un grand merci aussi à la région Rhône Alpes qui a financé ces travaux ainsi que le
travailleur que je suis. Merci aussi aux usagers des terrains que j‟ai utilisés (famille Vial à
Allevard et agriculteurs du Lautaret et du Galibier).
Dans un deuxième temps, je me dois de remercier certaines personnes sans qui je ne
serais pas (mais plutôt en fac de math, à quincher, sport n°1 de la fac de Dijon). Christophe
Deschamps, premier et deuxième maître de stage, sans qui rien de ceci ne se serait orienté
comme cela, et pour son partage de l‟amour de la nature. Cette orientation ONF m‟a guidé
vers Jean Claude Tandy et Bernard Pinel, deux personnes qui, en école de technicien, m‟ont
fait quitter ce métier pour un autre. Deux passionnés par la science et l‟enseignement,
responsables de la poursuite de mes études. Études qui m‟ont conduit à Grenoble, et les
cours de Philippe Choler (un extraterrestre parmi les MCF) ont fini de clore mon avenir
proche. Sans toutes ces personnes, jamais je n‟aurais été aussi loin dans ces études et je serais
sûrement garde à cheval dans un parc du Canada.
Philippe Choler a aussi été responsable de mon entrée au Leca avec mon troisième
maître de stage, Fabien. Reste qu‟en entrant au laboratoire, je ne savais pas que j‟allais y
rester si longtemps au final. Je tiens donc à remercier toutes les personnes qui sont passées
plus ou moins longtemps, ainsi que mes différents collègues de bureau successifs. Bureau
308: Amandine, Carole, Myriam, Matthieu, Pierre, Sébastien, Saïd et Amid, Bureau 111 :
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