Analyse du génome du virus PAV1 de l `archée Pyrococcus abyssi

Analyse du génome du virus PAV1
Analyse du génome du virus PAV1
de l
de l ’archée ’archée Pyrococcus abyssi Pyrococcus abyssi
Karen
Karen Rouault Rouault
DEA
DEA Génomique Génomique et Informatique_2003 et Informatique_2003
Laboratoire de Microbiologie et Biotechnologie des Extrêmophiles
IFREMER – Centre de Brest
Equipe Microbiologie
LEMAR – Institut Universitaire Européen de la Mer

BASALTE
1000°C
Pôle chaud
Communauté microbienne thermophile Méthanogénèse
Réduction du soufre
Réduction du sulfate
Réduction du fer
Fermentation
Pôle froid
OO
Oxydation des composés
soufrés réduits
OO
Communauté microbienne
symbiotique mésophile
Les sources hydrothermales profondes : un écosystème extrême
4000°C
350°C
350°C

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ARCHAEA
ARCHAEA, ,
the
the third domain third domain of life of life
(C. Woese, 1977)

Sur les 5.000 bactériophages décrits, 29 virus concernent le dom
Sur les 5.000 bactériophages décrits, 29 virus concernent le domaine aine
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Archaea. .
ª
ª16 virus du règne 16 virus du règne Euryarchaeota Euryarchaeota
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ª13 virus du r 13 virus du rè ègne gne Crenarchaeota Crenarchaeota
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)4 virus d 4 virus d ’ ’arch arché ées es hyperthermophiles s hyperthermophiles sé équenc quencé és s. .
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Virus du domaine Archaea Archaea
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1 seul virus observé échez les chez les Euryarchaeota Euryarchaeota hyperthermophiles hyperthermophiles. .
)
)Pyrococcus abyssi Pyrococcus abyssi virus 1 (PAV1) virus 1 (PAV1)

Souche GE23 de
Souche GE23 de Pyrococcus abyssi Pyrococcus abyssi
Génome de PAV1 : molécule d
Génome de PAV1 : molécule d ’ADN circulaire double brin de 18.098 ’ADN circulaire double brin de 18.098 pb pb
Morphologie originale en citron (120 nm x 60 nm)
Morphologie originale en citron (120 nm x 60 nm)
similaire à celle des virus de la famille
similaire à celle des virus de la famille
Fuselloviridae
Fuselloviridae (SSV1 de (SSV1 de Sulfolobus Sulfolobus sp sp) )
Relation hôte
Relation hôte- -virus : état porteur virus : état porteur
Pas de pouvoir infectieux mis en évidence
Pas de pouvoir infectieux mis en évidence
Composition : enveloppe du virus composée de protéines et de lip
Composition : enveloppe du virus composée de protéines et de lipides ides
Virus PAV1
Virus PAV1