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Rôle de l’antibiothérapie et des facteurs liés à l’hôte et à
l’hospitalisation sur le risque de colonisation et
d’infection par des bactéries résistantes aux
antibiotiques
THESE DE DOCTORAT
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Présentée
et soutenue publiquement par
Didier LEPELLETIER
Le 23 juin 2006, devant le jury ci-dessous :
Président Mr G POTEL, )*''&'!+'!',)!!'(!!-'
Rapporteurs Mr JC LUCET, )*''&'!+'!',)!!'(!!-)!'
Mr P BERTHELOT-.*'!+'!',)!!'(!!-!
Examinateurs Mr G POTEL, )*''&'!+'!',)!!'(!!-'
Mme N CAROFF,.*'!+'!'-'
Directeur Mr H RICHET, )*''&'!+'!',)!!'(!!-'
Co-Directeur Mme BM IMBERT, )*''&'!+'!',)!! '(!!-'
SOMMAIRE
LISTE DES TABLEAUX……………………………………………………………….
LISTE DES FIGURES………………………………………………………………….
INTRODUCTION………………………………………………………………………..
RAPPEL BIBLIOGRAPHIQUE………………………………………………………..
I. Relation entre antibiothérapie et résistance bactérienne……………………
A. Introduction………………………………………………………………………….
B. Rappels de quelques éléments essentiels de la résistance bactérienne..
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C. Définition du potentiel d'évolution vers la résistance……………………….
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D. Exposition des populations aux antibiotiques ……………………………….
E. La relation entre usage des antibiotiques et portage d’une bactérie
résistante………………………………………………………………………………..
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II. Relation entre antibiothérapie et flore intestinale…………………………….
A. Impact de l’usage des antibiotiques sur la colonisation digestive chez
l’homme………………………………………………………………………………..
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B. Impact de l’usage des antibiotiques en clinique vétérinaire sur la
colonisation digestive chez l’homme………………………………………………
III. De la colonisation à l’infection chez l’homme: le cas de Pseudomonas
aeruginosa………………………………………………………………………………
A. Introduction………………………………………………………………………….
B. Etude des réservoirs et colonisation de la flore digestive chez l’homme.
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C. Relation entre colonisation et infection à P. aeruginosa……………………
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RECHERCHE EPIDEMIOLOGIQUE………………………………………………….
Nature et objectifs des recherches…………………………………………………
A. Etude des facteurs de risque d’infections causées par Escherichia coli
résistant aux antibiotiques…………………………………………………………..
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B. Etude bactériologique et épidémiologique de la résistance aux
céphalosporines de 3ème génération chez Escherichia coli……………………
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C. Etude des facteurs de risque de colonisation gastro-intestinale par des
bacilles à Gram négatif résistants aux antibiotiques…………………………...
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DISCUSSION GENERALE…………………………………………………………….
CONCLUSION ET PERSPECTIVES…………………………………………………
BIBLIOGRAPHIE……………………………………………………………………….
ANNEXES………………………………………………………………………………..
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LISTE DES TABLEAUX
Tableau I. )&$' "! '!' ? "!!! :
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Tableau VII. "( ' ( '(!' ' '& * !'! =4(7'
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Tableau IX. !'!$',!'!('6!'?B"$!*6!'
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