Exploitation d`Anagene

Les parentés d’après des critères moléculaires
(Utilisation du logiciel « Anagène »)
On cherche à préciser la parenté de l’Homme avec différents Vertébrés. Pour cela, on utilise
des comparaisons moléculaires entre les séquences nucléotidiques de gènes codant pour des
protéines homologues désignées par la même appellation. Le CMH et le HLA sont des
protéines portées à la surfaces des cellules servant à leur reconnaissance par le système
immunitaire. La NAD est une enzyme catalysant des réactions d’oxydation cellulaires.
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Utilisez la fiche technique d’Anagène pour réaliser les opérations suivantes :
 Choisir dans la Banque de séquences / séquences personnelles, les
séquences utiles pour préciser la parenté de l’Homme avec les
Vertébrés proposés. Pour cela il faut sélectionner les lignes
intéressantes en cliquant dessus et en appuyant sur Ctrl à partir de la
deuxième ligne sélectionnée. Les séquences sont désignées par le nom
de la protéine codée par le gène suivie du nom de l’espèce.
 Justifiez le choix des séquences que vous avez fait.
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Les séquences étant affichées, la première sert de séquence de référence. On peut
faire que chaque séquence serve de référence en la plaçant en ligne supérieure.
Pour cela il fau la sélectionner à l’aide du curseur rouge situé à sa gauche, puis la
déplacer vers le haut à l’aide du curseur situé en haut de la ligne verticale des
curseurs.
Traitez les séquences . Pour cela, utilisez le menu « Traiter » de la barre d’outils
en les comparant par une comparaison simple.
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Utilisez le menu Informations/informations sur la ligne pointée de la barre
d’outils pour obtenir des informations sur la séquence pointée. Notez le
pourcentage de différence entre la séquence pointée et la séquence servant de
référence. Effectuez cette opération pour les différentes séquences en plaçant tour
à tour chaque séquence en position de référence. Réalisez un tableau de
comparaison contenant les pourcentages de différence entre les séquences des
espèces comparées deux à deux. Utilisez, en le recopiant, le modèle ci-dessous.
Homme
Chimpanzé
Gorille
Orang-outan
Chien
Anguille
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Homme
Chimpanzé
Gorille
Orang-outan
Précisez la parenté de l’Homme avec les autres Vertébré sen utilisant les
données du tableau. Représentez ces parentés par un arbre phylogénique.