uf bacteriologie - hygiene

UF BACTERIOLOGIE - HYGIENE
Responsable de Pôle Dr B.Rigou poste
PH Responsable UF Dr C OLIVE poste 96 64
Praticiens hospitaliers Dr R THEODOSE poste 22 77
Dr K PAILLA
Secrétariat Mme M JEAN MARIE poste 21 70
Cadre de santé Mme D AARNAUD poste 22 75
Secteurs :
Bactériologie poste 30 60
Hémocultures poste 20 71
Mycobactéries (BK) poste 30 76
Hygiène poste 33 58
Pour tout résultat d’analyses, appeler :
De 7 h à 15 h : Secrétariat poste 21 70
De 15 h à 21 h, ainsi que samedi à partir de 13 h, dimanche et jours fériés :
Bactériologie poste 30 60
Hémocultures poste 20 71

UF BACTERIOLOGIE - HYGIENE
URINES
Examen Cytobactériologique des Urines
Permet de faire le diagnostic d’une infection urinaire sous réserve d’un respect des bonnes
pratiques de prélèvement. (cf protocoles de prélèvement des urines)
Acheminer dès que possible au laboratoire : si délai >2 heures, conserver le tube à +4°C,
maximum 12 heures
Plusieurs types de recueil étant possibles (préciser sur le bon de
demande)
• par voie naturelle, recueil dit en milieu de jet ou à la volée : à faire si
possible au moins 4 heures après la miction précédente
• sur sonde à demeure : précisez la date de la pose
• par sondage évacuateur extemporané
• par dispositif collecteur : peniflow, poche nourrisson, néphrostomie,
cathéter suspubien
• autre origine (intra rénal per opératoire, néphrostomie,…)
Utiliser les tubes BD à bouchon kaki (contenant du borate pour la
conservation) avec le kit de recueil des urines.
Poste 3060
Résultats
Examen direct :
Dans la journée
Culture et
antibiogramme
24- 48 heures
Diagnostic d’une infection urinaire à mycobactéries (bacille tuberculeux : BK)
La totalité des urines du matin après restriction hydrique la veille.
Sur flacon stérile approprié
Résultats
examen direct : dans la
journée si prélèvement
parvenu avant 9 heures
du matin
négatifs : 90 jours
culture
Antigénurie Legionella
Peut être prescrite sur une urine antérieure (max 7 jours après son prélèvement)
Utiliser les tubes BD à bouchon kaki (contenant du borate pour la
conservation) avec le kit de recueil des urines.
Réaliser systématiquement un prélèvement pulmonaire
(expectoration, aspiration trachéale,…) pour une mise en culture sur
milieux spécifiques Legionella
Résultats :
2 heures
Antigénurie Streptococcus pneumoniae
Peut être prescrite sur une urine antérieure (max 7 jour après son prélèvement)
Utiliser les tubes BD à bouchon kaki (contenant du borate pour la
conservation) avec le kit de recueil des urines.
Résultats :
2 heures

UF BACTERIOLOGIE - HYGIENE
HEMOCULTURES
L’hémoculture permet de faire le diagnostic d’une bactériémie (présence de bactéries dans le
sang). Remplir un bon de demande par série :
1 série = 1 flacon aérobie + 1 flacon anaérobie chez l’adulte .
L’étiquette patient ne doit pas être collée sur les codes à barres des flacons
Diagnostic d’une bactériémie
Chez l’adulte : minimum 10 ml par flacon
1 série par ponction veineuse périphérique.
Si prescription médicale de plusieurs séries d’hémocultures, privilégier le
prélèvement unique : soit 2 séries simultanément en une seule ponction
Chez l’enfant : 1 flacon pediatric
• <1 kg 0,5 - 2 ml
• 1- 2kg 1,5- 4,5 ml
• 2 - 13 kg 3 - 6 ml
• -13 - 36 kg 5 - 7 ml
• > 36 kg 10 ml ou flacons aero ana de l’adulte
Résultats :
en cas de
positivité :
2 heures à 7 jours
pour les négatifs :
7 jours
Diagnostic d’une infection microbienne liée à un dispositif intravasculaire
(cathéter, chambre implantable)
• 1 série par ponction veineuse périphérique
+ simultanément
• 1 série sur le cathéter suspecté (après l’avoir purgé).
A l’ablation du cathéter penser à l’envoyer au
laboratoire pour mise en culture (cf chapitre matériel)
Bien préciser
sur le bon le
cathéter
concerné
Résultats :
En cas de
positivité :
2 heures à 7 jours
Pour les négatifs :
7 jours
Diagnostic microbiologique d’une endocardite
• 3 séries par 24 heures en conservant des intervalles d’au moins une
heure entre chaque série (pas de prélèvement unique). Ne pas
attendre le pic fébrile.
• A renouveler 3 jours après.
• Cochez la case suspicion endocardite sur le bon de demande (cette
notion peut être précisée dans les 7 jours suivant le prélèvement)
Résultats :
En cas de
positivité :
2 heures à 7 jours
Pour les négatifs :
7 jours
Diagnostic d’une bactériémie à mycobactéries (bacille tuberculeux (BK)et
atypiques)
•
••
• 1 flacon spécifique pour les mycobactéries
Résultats :
1 à 42 jours
Diagnostic d’une fongémie (levures et champignons filamenteux) Cf laboratoire
de parasitologie - mycologie

UF BACTERIOLOGIE - HYGIENE
PRELEVEMENTS PULMONAIRES
Permet de faire le diagnostic d’une infection broncho-pulmonaire
Acheminer des que possible au laboratoire (délai <2heures) (fragilité du pneumocoque)
Plusieurs types de recueil sont possibles
(à préciser sur le bon de demande)
Résultats :
Examen direct :
dans la journée
Culture et
antibiogramme :
48 à 72 heures
Examen Cytobactériologiques des Crachats ECBC (expectorations)
(examen non recommandé pour le diagnostic de pneumopathie communautaire)
Indications :
• surinfections de bronchite chronique
• infections à mycobactéries (demande spécifique cf bon de demande)
infections chez patients avec mucoviscidose (à préciser dans les renseignements cliniques)
Protocole de recueil :
• Le matin au réveil après avoir rincé la bouche avec de l’eau avant le
prélèvement
• Lors d’un effort de toux +/- kinésithérapie
Aspiration endotrachéale
Indications :
Diagnostic des colonisations et/ou infections des patients sous ventilation mécanique
Protocole de recueil :
Cf protocole institutionnel pour le prélèvement
Prélèvement par bronchoscopie
Indications :
• diagnostic de pneumopathie
• type de prélèvement à préciser :-sécrétions bronchiques
• Lavage Broncho alvéolaire (LBA)
• Prélèvement Distal Protégé
Protocole de recueil :
Cf procédure plateau technique bronchoscopie

UF BACTERIOLOGIE - HYGIENE
PRELEVEMENT PUS SUPERFICIEL
Ce type de prélèvement comprend :
• les plaies chirurgicales superficielles
• les ulcères
• les plaies de surface
• les écoulements superficiels
• les sites de cathéters et de stomies
• tous les prélèvements génitaux de surface
PREALABLE : Les prélèvements microbiologiques de plaie se font sur prescription médicale
uniquement
Prélèvement sur peau saine et non suintante
Exemple : Prélèvement sur point de ponction cathéter central
Effectuer le prélèvement avec 1 écouvillon préalablement imbibés de
sérum physiologique stérile en dosette unitaire (1 à 2 gouttes)
Résultats :
Examen direct :
dans la journée
Culture et
antibiogramme :
48 à 72 heures
Infection du site opératoire (ISO)
Technique du prélèvement* en cas d’écoulement spontané :
1. Eliminer les exsudats
2. Désinfecter la zone cutanée autour de la cicatrice à l’aide de
Polyvidone iodée moussante (ou chlorexidine aqueuse si allergie)
3. Rincer au sérum physiologique pour ôter les reliquats d’antiseptique
4. Prélever 2 écouvillons préalablement imbibés de sérum physiologique
stérile en dosette unitaire (1 à 2 gouttes)
*l’écouvillonnage sans nettoyage de la cicatrice est rigoureusement
proscrit
Résultats :
Examen direct :
dans la journée
Culture et
antibiogramme :
48 à 72 heures
Résultats :
Examen direct :
dans la journée
Culture et
antibiogramme :
48 à 72 heures
Sans écoulement spontané :
Avant toute antibiothérapie, les prélèvements doivent être réalisés par le
chirurgien, une ouverture chirurgicale de la plaie étant recommandée
Fractures ouvertes :Prélèvements à l’admission inutiles : Privilégier les
prélèvements au bloc opératoire
Dépistage de B.M.R. (BactériesMulti-Résistantes)
Qui prélever ? Patients selon :
• protocoles validés par le CLIN (ex en Réanimation : à l’entrée puis 1 fois/semaine)
• recommandations de l’Equipe Opérationnelle d’hygiène (situation épidémique)
Quand et comment prélever ?
• Avant toute toilette ou antisepsie