programme de colle BIOSPE2 n°18 – semaine du 13 au 18 février REVISIONS DE 1ère ANNEE + L'expression génétique • La transcription : première étape de l’expression du génome • La traduction : seconde étape, synthèse des protéines par décodage de l’information des ARN • Le contrôle de l’expression : un phénomène essentiellement transcriptionnel - Un contrôle adaptatif chez les eubactéries : notion d’opéron (exemple de l’opéron lactose), dérépression par le lactose, opérons inductibles et répressibles - Un contrôle lié à la différenciation cellulaire chez les eucaryotes : mise en évidence, contrôles aux niveau chromatinien (variation de condensation de la chromatine, épigénétique), transcriptionnel (facteurs Cis et Trans) et posttranscriptionnel (épissage alternatif, ARN interférent) + Les enzymes • Propriétés générales des enzymes - Les enzymes sont des catalyseurs biologiques - Les enzymes sont des protéines - Les enzymes possèdent une double spécificité : substrat, réaction • Caractéristiques cinétiques des enzymes (michaeliennes et allostériques) • Le site actif : un exemple, à bien connaître • Modulation de l’activité enzymatique - Niveau d’expression des gènes codant les enzymes (eucaryotes et procaryotes) - Activation / inhibition d’enzymes allostériques par des effecteurs - Activation / inhibition par modifications covalentes (ex : glycogène phosphorylase) - Inhibition compétitives/non compétitives des enzymes michaeliennes • Les enzymes dans la cellule - L’activité enzymatique est spécifique du type cellulaire et du compartiment - Les enzymes interviennent dans des voies de synthèse spécifiques REVISIONS DE 2nde ANNEE + TD mécanismes de l'évolution (début) mise en évidence d'une sélection naturelle (sélection de moustiques résistants aux insecticides, sélection de génotypes humains (A//S) dans les régions à paludisme) + Espèces et spéciation : - plusieurs définitions de l'espèce = A. espèce phénétique (basée sur la ressemblance); B. espèce biologique (basée sur l'interfécondité); C. espèce écologique (basée sur l'occupation d'une niche écologique); liens entre ces 3 définitions - mécanismes de spéciation : A. Spéciation allopatrique (par fractionnement de l'aire de répartition; par colonisation exemple de la spéciation de Zérinthia, suite à une glaciation; spéciation en anneau du pouillot verdâtre); B. spéciation sympatrique (spéciation écologique - ex des Cychlidés des gds lacs africains; spéciation par polyploïdie - ex des Spartines); diversité des mécanismes d'isolement reproducteur - la notion d'espèce, une notion utile mais tjrs discutée : A. Tsferts horizontaux, hybridation interspécifique : des limites à l'isolement génétique des espèces; notion d'évolution réticulée : l'arbre phylogénétique devient un réseau; B. L'espèce n'est pas pérenne : définition de l'espèce dans le tps = l'espèce phylogénétique > ce chapitre nécessite de réinvestir les connaissances du cours "mécanismes de l'évolution" et les notions de sup sur les transferts horizontaux + Une synthèse sur les Alpes : à la recherche de témoins de l'histoire d'une chaîne de collision - des témoins de paléomarges passives (blocs basculés, corps sédimentaires associés) - des vestiges de l'océan alpin (caractéristiques des ophiolites alpines, de la couverture sédimentaire associée) - des témoins de la fermeture de l'océan alpin et de la collision (témoins de subduction et d'obduction = témoins sédimentaires, métamorphiques / témoins de la collision = plis, failles inverses et chevauchements; témoins métamorphiques, gravimétriques et sismiques) > pour les élèves, ce chapitre nécessite une bonne maitrise des données vues en TP1 et TP2 Alpes, TP métamorphisme + La diversité morpho-fonctionnelle des êtres vivants - fonction de nutrition et vie libre = autotrophie, réalisée par les algues et les cyanobactéries (schéma comparatif); autotrophie en milieu terrestre et cormophytes; autotrophie en milieu aquatique et algues/cyanobactéries (adaptations présentées vis à vis du milieu; le rôle des pyrénoïdes et carboxysomes); hétérotrophie (les pb posés = trouver la nourriture, mobiliser les nutriments; prélèvement, digestion par phagotrophie chez les protozoaires (ex Paramécie) / exodigestion et absorbotrophie chez les champignons et bactéries) - fonction de nutrition en collaboration étroite avec d'autres êtres vivants = vie symbiotique (ectomycorhizes, lichens, nodosités); schémas fonctionnels pour chaque type + mise en place de la symbiose entre Rhizobium et racines de Fabacées; vie parasitaire (ex limités à Plasmopara et Trypanosoma) = prélèvement des nutriments par absorbotrophie; schéma fonctionnel d'un suçoir de Plasmopara) - la croissance des pluricellulaires = croissance diffuse, croissance localisée (apicale) +TP les algues pluricellulaires, champignons (en révision) + TP diversité des micro-organismes unicellulaires ou pluricellulaires : eucaryotes autotrophes (Diatomées, Chlamydomonas, Spirogyre) et hétérotrophes (Paramécie et Trypanosome); procaryotes autotrophes (Cyanobactérie, ex du Nostoc) et hétérotrophes (E. coli et Rhizobium) Montages et observations de tous ces exemples (ou PM); photographies en MET de Chlamydomonas, Nostoc et Rhizobium, E. coli (pour rappel); coupes de nodosités au MO et MET => mise en évidence de leur organisation cellulaire; lien avec leur mode de nutrition, qd c'est possible. Mise en culture d'E. coli dans différents milieux de culture (mise en évidence de l'hétérotrophie), et colorations; principe et intérêt de la coloration de Gram à connaître.