ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE

UMR CNRS 6293, INSERM U 1103, Laboratoire GReD (Génétique, Reproduction & Développement),
Université Clermont Auvergne (C. Vaury)
Directeur de thèse : Olivier Mathieu (DR2 CNRS, HDR)
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Méthylation de l’ADN et silencing épigénétique chez Arabidopsis thaliana
La structure de la chromatine joue un rôle essentiel dans l’expression du génome. Elle est influencée par
la présence de marques épigénétiques au niveau de l’ADN et des protéines histones. La présence d’un fort
niveau d’une de ces marques, la méthylation ADN, est associée à une absence de transcription (ou
silencing). L’hétérochromatine, qui présente un niveau élevé de méthylation ADN, est une cible préférentielle
du silencing.
Afin d’identifier les acteurs moléculaires du silencing, nous avons conduit un crible génétique qui a permis
d’isoler plusieurs mutants d’Arabidopsis montrant une réactivation transcriptionnelle de l’hétérochromatine.
Un des mutants identifiés porte une mutation dans le gène codant la sous-unité catalytique de l’ADN
polymérase epsilon impliquée dans la réplication de l’ADN. L’analyse préliminaire de ce mutant révèle une
forte réactivation transcriptionnelle de l’hétérochromatine et une désorganisation de l’hétérochromatine. De
manière paradoxale, le mutant présente également une forte augmentation du niveau de méthylation ADN,
contrairement à la plupart des mutants de silencing qui induisent généralement une baisse de méthylation.
Le projet a pour but de caractériser la fonction moléculaire jouée par la polymérase epsilon dans le silencing,
la méthylation de l’ADN, et la transmission des marques épigénétiques.
Rigal et al. (2016). Epigenome confrontation triggers immediate reprogramming of DNA methylation and
transposon silencing in Arabidopsis thaliana F1 epihybrids. Proc Natl Acad Sci USA. 113(14) E2083-92.
Rigal et al. (2012). DNA methylation in an intron of the IBM1 histone demethylase gene stabilizes chromatin
modification patterns. EMBO J. 31(13):2981-93.