ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE

UMR CNRS 6023 Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement, Clermont Université (T.
SIME-NGANDO)
Directeur de thèse : Télesphore SIME-NGANDO, DR CNRS
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Etude du fonctionnement du cycle de l’azote au sein de communautés microbiennes anaérobie
utilisées dans des approches biotechnologiques : mise en évidence de la nitrification anaérobie
Le cycle de l'azote fait partie des grands cycles biogéochimiques. Il décrit la succession des
modifications subies par les différentes formes de l'azote (diazote, nitrate, nitrite, ammoniaque, azote
organique). L’azote est un composé essentiel à la vie, de l’azote atmosphérique aux acides aminés des
protéines et bases azotées de l’ADN.
Dans le cadre du projet ANR Bioénergies Anabio-H2 (ANR-08-BIOE-013), portant sur la « Valorisation des
coproduits agricoles et industriels via la production d’hydrogène utilisant des souches microbiennes
anaérobies mésophiles », Pessiot et al ont pu mettre en évidence une minéralisation de l’azote protéique
sous forme de diazote gazeux en condition strictement anaérobie. Ce cycle suppose une nitrification
anaérobie et s’opère uniquement avec certains mix microbiens notamment en présence de microorganismes
issus de la zone anoxique du Lac Pavin.
Le projet a pour objectif d’identifier par métagénomique les acteurs microbiens impliqués dans cette voie de
nitrification anaérobie et d’étudier par une approche métatranscriptomique le couplage entre les différents
processus de minéralisation de l’azote : nitrification, dénitrification au sein de ces communautés
microbiennes.
Ce travail de thèse sera également soutenu par la société AFYREN qui apportera son expertise sur la
culture de ces différentes communautés microbiennes.
Pessiot J, et al. (2012) Fed-batch Anaerobic Valorization of Slaughterhouse By-products with Mesophilic
Microbial Consortia Without Methane Production ApplBiochemBiotechnol 2012 Jan 6