TAHAR AMROUCHE CONTRIBUTION À L’ÉTUDE DU POUVOIR IMMUNOMODULATEUR DES BIFIDOBACTÉRIES : ANALYSE IN VITRO ET ÉTUDE EX VIVO DES MÉCANISMES MOLÉCULAIRES IMPLIQUÉS Thèse présentée à la Faculté des études supérieures de l’Université Laval dans le cadre du programme de doctorat en Sciences et Technologie des aliments pour l’obtention du grade de Philosophiæ doctor (Ph.D.) DÉPARTEMENT DES SCIENCES DES ALIMENTS ET DE NUTRITION FACULTÉ DES SCIENCES DE L’AGRICULTURE ET DE L’ALIMENTATION UNIVERSITÉ LAVAL QUÉBEC 2005 © Tahar Amrouche, 2005 Résumé Les bifidobactéries sont des bactéries probiotiques exerçant différents effets bénéfiques sur la santé de l’hôte. Parmi les effets revendiqués, la modulation des différentes fonctions immunitaires demeure l’un des effets les plus intéressants. Plusieurs travaux sont rapportés dans la littérature sur les effets immunomodulateurs de certaines souches probiotiques. Cependant, les résultats sont parfois controversés et les mécanismes impliqués dans cet effet immunomodulateur sont encore très peu élucidés. Le but de ce projet est d’évaluer le potentiel immunomodulateur de certaines souches de bifidobactéries isolées à partir de fèces de bébé, et d’identifier les mécanismes moléculaires par lesquels ces bifidobactéries exercent leurs effets sur les différentes fonctions immunitaires. Trois souches de bifidobactéries d’origine fécale productrices d’exopolysaccharides (B. thermoacidophilum RBL81, RBL82 et RBL64), une souche de Bifidobacterium lactis Bb12 et des souches ATCC (B. animalis, B. breve, B. longum, B. infantis, B. bifidum et B. pseudolongum) ont été utilisées. Les résultats obtenus montrent que la paroi cellulaire induit la plus forte stimulation de la prolifération cellulaire (splénocytes), accompagnée d’une forte production de IFN-γ et d’une augmentation de la sécrétion de IL-10. Une stimulation des fonctions immunitaires a également été observée avec le contenu cytoplasmique mais à un niveau moindre par rapport à la paroi. Par contre, les exopolysaccharides bruts ou fractionnés n’ont induit aucun effet. Une étude plus approfondie utilisant B. lactis Bb12 comme modèle a démontré que l’activité immunomodulatrice du contenu cytoplasmique est associée à la présence de peptides et/ou protéines acides, de poids moléculaire très variable et de faible hydrophobicité. Par ailleurs, le pouvoir immunogène de la paroi de bifidobactéries a été mise à profit pour produire des anticorps monoclonaux spécifiques capables de détecter les espèces du genre Bifidobacterium. Ces anticorps semblent être spécifiques à une protéine majeure d’environ 58 kDa de poids moléculaire (PM) commune à plusieurs bifidobactéries. Une fois purifiés, ces anticorps ont été utilisés pour développer un test d’immuno-culture original permettant la détection spécifique et sensible des bifidobactéries. ii Résumé long Les bifidobactéries sont des bactéries candidates potentielles aux probiotiques à cause de leurs effets bénéfiques sur la santé de l’homme incluant la prévention et/ou traitement des gastro-entérites, intolérance au lactose, cancer, hypercholestérolémie, etc. Une des propriétés intéressantes des bifidobactéries est leur capacité à moduler certaines fonctions du système immunitaire et remédier à certaines pathologies immunologiques. Cependant, les études rapportées démontrant les effets immunomodulateurs des probiotiques sont basées sur des modèles utilisant des cellules bactériennes vivantes et limités à certaines souches probiotiques. L’effet des composants issus de la lyse cellulaire dans le tractus gastro-intestinal sur le système immunitaire demeure mal connu, d’où alors la nécessité d’élucider les mécanismes d’immunostimulation induits par ces derniers. Le but de ce projet est d’étudier le potentiel immunomodulateur de certaines souches de bifidobactérie isolées d’humains et utilisées à l’état non viable et d’explorer les mécanismes moléculaires impliqués dans cette action immunomodulatrice. Notre étude visait d’une part, à évaluer les effets de certains composants cellulaires de bifidobactérie notamment le contenu cytoplasmique brut, la paroi cellulaire, et les exopolysaccharides (EPS) sur la réponse immunitaire, et d’autre part, caractériser à l’échelle moléculaire les composants à pouvoir immunomodulateur et exploiter leur propriété pour produire des anticorps monoclonaux permettant de détecter spécifiquement les bifidobactéries dans les aliments. Trois souches locales de bifidobactéries, B. thermoacidophilum RBL81, RBL82 et RBL64 (fèces de bébés) productrices d’EPS ont été étudiées et comparées au Bifidobacterium lactis Bb12 (souche de référence). Des souches ATCC de bifidobactéries ont également été utilisées pour développer des anticorps monoclonaux. Les résultats obtenus montrent des effets immunostimulants dépendant de la souche/espèce, du composant cellulaire et de la dose utilisée. Une meilleure stimulation de la prolifération cellulaire (Indice de stimulation =16) est obtenue avec la paroi cellulaire de B. lactis Bb12 (40 µg/ml). Le contenu cytoplasmique stimule la réponse immunitaire à un niveau moindre que la paroi, par contre, les EPS bruts ou fractionnés n’induisent aucun effet. La stimulation de la prolifération à été confirmée par le dosage des cytokines révélant iii une forte production de IFN-γ (> 4 µg/ml) générée par la paroi cellulaire, et une stimulation de la sécrétion de IL-10 dans le milieu (< 1 µg/ml). Par ailleurs, les résultats obtenus démontrent que l’effet immunostimulant induit par le cytoplasme de B. lactis Bb12 est associé aux fractions peptidiques et/ou protéiques intracytoplasmiques, notamment les fractions acides. Les peptides et les protéines immunostimulants sont de poids moléculaire très variable et de caractère moins hydrophobe. Toutefois, des études in vivo et cliniques devraient être réalisées afin de valider ces résultats et laisser envisager une perspective d’utilisation des bifidobactéries à l’état de lysats cellulaires comme agents immunomodulateurs commercialisables sous forme de nutraceutiques. Il était prévu dans ce projet de mettre à profit les propriétés immuno-actives des bifidobactéries pour produire des anticorps monoclonaux spécifiques aux bifidobactéries. Par cette approche, nous voulions aborder une problématique liée à l’utilisation des bifidobactéries comme probiotiques vivants dans les produits alimentaires et se résumant en la difficulté de détecter les souches de bifidobactéries vivantes dans ces produits. Cette partie du projet a pour objectif de produire et caractériser des anticorps monoclonaux dirigés contre les protéines de paroi (antigène de surface) de bifidobactéries en vue de mettre au point des tests immunologiques combinés à la culture bactérienne (en plaque) permettant la détection spécifique et sensible des bifidobactéries vivantes dans les aliments. L’analyse du profil protéique des parois (SDS-PAGE) de six espèces différentes de bifidobactérie (B. animalis, B. breve, B. longum, B. infantis, B. bifidum et B. pseudolongum) a révélé des bandes différentes et des bandes similaires (PM: 34 à 58 kDa) (protéines communes probables). Testées pour leur immunogénicité chez des souris Balb/c, une forte production d’anticorps polyclonaux a été mise en évidence (test ELISA) chez les souris immunisées avec les protéines de B. bifidum et B. longum (titre en anticorps de 53333). Ces deux souris ont alors été sélectionnées pour la fusion cellulaire et la production d’anticorps monoclonaux. Les anticorps (IgG) anti-B. longum produits ont montré une réactivité croisée avec l’ensemble des espèces de bifidobactérie testées indiquant une antigénécité iv partagée entre les espèces de bifidobactéries. En effet, un épitope commun porté par une protéine de 58 kDa (PM) a été révélé par une analyse de type "western-blot". De plus, une analyse en ELISA directe a permis de confirmer la spécificité des anticorps produits puisque le test s’est révélé négatif avec d’autres souches non apparentées aux bifidobactéries. La fixation de l’anticorps sur les bifidobactéries a été observée au microscope électronique après un traitement immunochimique. La sensibilité de l’anticorps a été estimée par ELISA à 105 cfu/ml. La détection des cellules viables de bifidobactéries par l’anticorps produit a été par ailleurs démontrée par le test d’immuno-culture. Toutefois, les résultats de ce test devraient être validés sur des produits probiotiques (yogourt, lait fermenté, etc) afin de rendre le test utilisable à l’échelle industrielle. Mots clés : Nutraceutiques, probiotiques, Bifidobactéries, système immunitaire, immunomodulation, prolifération cellulaire, Cytokines, Cytoplasme, Exopolysaccharides, Paroi cellulaire, Anticorps. v Abstract Probiotic bifidobacteria are known to have beneficial effects on host health. One of the interesting properties of these bacteria is their capacity to modulate the host immune function. However, the mechanisms by which the bifidobacteria influence the immune response are not well known. This project aimed to evaluate the immunodulatory potential of some bifidobacterial strains isolated from newborn feces. We tried to determine the cellular and molecular mechanisms involved in immune response induced by cytoplasmic content, cell wall and exopolysaccharides from bifidobacteria. Three exopolysaccharideproducing fecal strains of bifidobacteria (B. thermoacidophilum RBL81, RBL82, and RBL64) and a commercial available strain (Bifidobacterium lactis Bb12) were tested using mouse splenocytes. The results demonstrate that a high stimulation of cell proliferation and interferon-gamma (IFN-γ) production were induced by cell wall. In addition, a concomitant stimulation of interleukin-10 (IL-10) secretion was observed. The cytoplasmic content was also shown to be immunostimulating, but less than cell wall. However, the effects observed were dose or strain-species-dependent. B. lactis Bb12 was found to be significantly more immunostimulating than other bifidobacterial strains used. Partially fractionated peptides and acidic fraction from B. lactis Bb12 showed a low hydrophobicity and appeared heat stable and mitogenic. In contrast, no immunostimulating effects were induced by exopolysaccharides. The mitogenic properties of cell wall protein were then explored to develop specific monoclonal antibodies (Mab) able to detect bifidobacteria species in food. Common proteins were revealed in cell wall extracts from bifidobacteria (B. animalis, B. breve, B. longum, B. infantis, B. bifidum et B. pseudolongum). The proteins obtained were found to be immunonogenic in Balb/c mouse. Monoclonal antibodies (IgG) -anti-B. longum- produced cross-reacted with all bifidobacteria tested. The shared antigenicity shown by bifidobacteria was revealed by an epitope supported by a common protein of 58 kDa. This was confirmed by immune-transmission electron microscopy observation, which showed the specific interaction of these antibodies with bifidobacterial cell wall proteins. The Mab produced was also shown to be sensitive (105 cfu/ml) and specific to members of the bifidobacterial genus. The Mab developed allowed detection of viable cells of bifidobacteria using immuno-culture test. vi Key words: Antibodies, bifidobacteria, cell proliferation, cell wall, cytokines, cytoplasm, exopolysaccharides, immunomodulation, immune system, nutraceutics. Agzul (résumé en berbère) Bifidubaktiri d iprubyuteken (probiotiques) i yetwassnen atas assagi, yeεni ţţibaktiryin mara twarnunt i tgulliyin ţţakent ayen yelhan i tdawsa. Tibaktiriyin agi zemrent ad snernint kra n tsuγnin yeţhuddun γef tfekka mgal atanan n uεebbud d izerman n bnadem. D acu kan, ar assa, ur nessin ara amek tibaktiriyin stanent tafekka. Iswi n usenfar agi d anelmud n unezmar n usnerni n ustan n bifidubaktiri. Ayagi i wakken a d-naf isemduyen n kra n tsegrin n tsiluliyin (cellules) am iferdisen (éléments) yellan daxel, sufella neγ i d-deggirent ar berra γef tririt n uhuddu. Krad (3) n ccetlat n bifidubaktiri idyekkan seg izerman llufan ţwalmendent ţwasdemrent ar yiwet n ccetla tamselγut Bifidobacterium lactis Bb12. Agmuden i d-nessufeγ qqaren-d d akken asnerni yelhan n ufadi n tsiluliyin n udihan (rate) n amumad, i d- yettabaε unerni amuqran n IFN-γ yakw d usennerni n usufeγ (sécrétion) n IL-10, yefkaten-id ulesi n tsilulit (paroi cellulaire). Ayen yellan daxel n tsilulit d tazunin-ines (ipeptidiyen yak tiprutiniyin) snernayent drus γef ulesi. Ma d ayen yεenan EPS (exopolysaccharides) ulac asnnerni i d-yekkan segsen. Ma d tiprutiniyin n ulesi n bifidubakiri (B. animalis, B. breve, B. longum, B. infantis, B. bifidum et B. pseudolongum) banent-ed d timesnerniyin timuqranin n uhareb γef tfekka n umumad (Balb/c) ssutuyent afares amuqran n tfekkamgalin. Tifekkamgalin i d-yeffγen d yiwet n txellalt (IgG) mgal B. longum ţwafursent-ed s trennawet u sknent-ed tasedmirt tanmidagt (réaction croisée) yakw d ccetlat nniden n bifidubakiri. Anecta yekka-d seg yiwet n teprutint (protéine) tamsihart i yezzayen 58 kd. Tulmist n tfekkamgalin i d-yefursen yeţwasentem-ed s usadez (test) ibaw i d- yelummzen mi ţ-nerεed yakkw d cctali nniden n tbaktiriyin. Tufin n bifidubaktiri yeddren s tfekkamgalin i d-yedran yefursen yedra-d s usadez n immuno-culture. Tifekkamgalin tulmisin i-d yekkan seg yiwet n txellayt idnessenfel zemrent ad ţwaqedcent i tifin n cctali n bfidobktiri di tgwellyin. Awalen n tsurra : Nutraceutiques, iprubyutiken, bifidubaktiri, anagraw amhaddan, asnerni uhuddu, afadi n tsiluliyin, cytokines, cytoplasme, exopolysaccharides, alessi n tsilulit, tafekkamgalt. Avant-Propos La présente thèse est le fruit d’un travail de longue halène accompli en quatre années. Elle porte sur un sujet d’actualité traitant principalement des probiotiques et de la modulation de la fonction immunitaire. Ce sujet relève de l’interface entre la microbiologie et l’immunologie et ouvre des perspectives prometteuses dans le domaine de la bactériothérapie. La réalisation de ce projet de doctorat m’a permis de relever un défi en découvrant cette nouvelle interface aussi passionnante que complexe. Cette thèse comporte trois articles scientifiques, dont je suis l’auteur principal, rédigés en anglais et précédés chacun par un résumé en français, et une revue de littérature écrite en français. L’introduction et le Chapitre I, intitulé « Revue de littérature », présentent la problématique de recherche et font état des connaissances actuelles sur les probiotiques, les prébiotiques et les symbiotiques. L’effet des probiotiques sur la modulation de la fonction immunitaire constitue l’essentiel de cette revue et est introduit comme une propriété prometteuse pour l’utilisation des probiotiques, puisque cette propriété ne semble pas être nécessairement liée à la viabilité des probiotiques. Les travaux rapportés dans la littérature sont discutés et leur analyse m’a permis de cerner la problématique, de poser l’hypothèse et de définir les objectifs de recherche à réaliser. Le Chapitre II, intitulé « Effects of bifidobacterial cytoplasm, cell wall and exopolysaccharides on mouse lymphocyte proliferation and cytokine production”, constitue la première étape de mes travaux. Dans ce chapitre, sont étudiées les propriétés immunomodulatrices des composants cellulaires de bifidobactéries. J’avais effectué mes travaux expérimentaux à l’Université Laval et, en partie, au CEGEP Lévis Lauzon (Qc) sous la supervision du Dr Ismail Fliss et Dr Yvan Boutin respectivement. Guénolée Prioult avait contribué aux tests de prolifération lymphocytaire et à l’analyse des cytokines. Ce chapitre présente intégralement le contenu d’un article scientifique (en anglais) qui est sous presse à : International Dairy Journal. Le Chapitre III, portant le titre « Effects of bifidobacterial cytoplasm peptide and protein fractions on mouse lymphocyte proliferation and cytokine production », est viii consacré à l’étude de certains composants intra cytoplasmiques responsables de l’effet immunomodulateur induit par une souche de bifidobactérie ayant montré des propriétés immunostimulantes potentielles dans le chapitre II. Nous avions donc étudié l’effet des fractions peptidiques et protéiques extraites du cytoplasme de B. lactis Bb12 sur la prolifération des lymphocytes et la sécrétion de cytokines. J’ai accompli tous mes travaux expérimentaux à l’Université Laval aux laboratoires du Dr Ismail Fliss, du Dr Sylvie Gauthier et du Dr Julie Jean et au laboratoire d’analyse instrumentale. Dr Najat Attouri avait contribué aux essais de prolifération lymphocytaire, alors que Alain Gaudreau a apporté sa contribution dans l’analyse et le fractionnement des peptides et protéines. Le présent chapitre fait objet d’un article à soumettre prochainement à International Dairy Journal. Quant au Chapitre IV, intitulé «Production and characterization of antibifidobacteria monoclonal antibodies and their application in the development of an immuno-culture detection method» a été réalisé dans le but de développer des anticorps monoclonaux spécifiques capables de détecter des espèces de bifidobactéries viables par un test d’immuno-culture. La fusion cellulaire a été réalisée au laboratoire du Dr Yvan Boutin au CEGEP Lévis Lauzon (Qc). J’ai réalisé la production et la caractérisation des anticorps anti-bifidobactéries, ainsi que le test d’immuno-culture, au laboratoire du Dr Ismail Fliss à l’Université Laval. Olivier Moroni avait contribué à l’extraction des protéines pariétales, alors que Dr Ehab Kheadr et Richard Janvier ont apporté leur contribution dans la réalisation des travaux de microscopie électronique. L’immunisation des souris et la collecte de sang ont été effectuées par Julie Brassard, Mélanie Alain et Vincent Leclerc à l’Université Laval. Le présent travail a eu le mérite du 3ème prix de meilleure présentationaffiche attribué par le comité d’évaluation lors du Symposium international de Montréal (La santé par les probiotiques-Applications dans ce troisième millénaire, 28 et 29 octobre 2004). Ce chapitre est présenté sous forme d’un article scientifique rédigé en anglais et accepté à la publication au Journal of Microbiological Methods. Enfin, une Conclusion générale est présentée pour donner une vision globale de mes travaux de thèse de doctorat tout en mentionnant les conclusions les plus importantes qui en ressortent, et en soulignant leur impact et les perspectives d’avenir. ix Remerciements Le mérite de ce travail revient à toutes les personnes qui ont participé à sa réalisation et auxquelles d’ailleurs j’exprime ma profonde reconnaissance. La réussite de ce travail ne saurait être possible sans le grand apport de mon directeur Dr Ismail Fliss et de mon co-directeur Yvan Boutin. Je remercie Dr Ismail Fliss de m’avoir offert l’opportunité de réaliser ce projet au sein de son équipe, pour ses conseils précieux, ses orientations scientifiques, ainsi que son optimisme affiché malgré toutes les contraintes. Mes vifs remerciements s’adressent également au Dr Yvan Boutin pour son encadrement tant apprécié assuré pendant l’expérimentation et la rédaction de la thèse, sa rigueur scientifique, ses encouragements et ses conseils judicieux. Je tiens à remercier FCAR, NOVALAIT, MAPAQ, NSERC et la banque mondiale pour leur support financier. Je voudrai remercier également Dr Sylvie Gauthier et Dr Julie Jean pour l’accès accordé à certains équipements de leurs laboratoires respectifs, pour les conversations scientifiques et leurs encouragements. J’adresse aussi mes remerciements au directeur du CEGEP Levis Lauzon de m’avoir bien accueilli au sein de son établissement, où une bonne partie de mes travaux expérimentaux a été réalisée. Je désire remercier Dr Gisèle Lapointe pour la pré lecture du manuscrit, ainsi que les membres du jury pour avoir examiné et jugé mon travail. Mes remerciements vont aussi aux Dr Ehab Kheadr et Dr Nadjat Attouri pour leur disponibilité et leur contribution appréciable à ce projet. J’aimerai remercier énormément Julie Brassard, Mélanie Alain et Vincent Leclerc pour toute l’aide fournie au niveau de l’animalerie. J’exprime ma profonde gratitude à toute l’équipe de l’ADVITECH Solution pour l’esprit de coopération manifesté tout au long de ce projet. Je remercie tout particulièrement Josée Fortier, Lynda Labarre, Nicolas. Le personnel de la clinique des maladies d’allergie (Place de la Cité, Sainte-Foy, Québec) est également remercié pour les échantillons de sang de donneurs fournis pour nos expériences préliminaires. x Ce projet n’aurait pu être une réussite sans la contribution de plusieurs personnes parmi elles: Olivier Moroni, Guénolée Prioult, Alain Gaudreau, Richard Janvier, Claude Gosselin, Céline Paquin, Edith Tousignant, Anne-Françoise Allain, Myriam Roy (CEGEP Levis Lauzon), Arezki Djaout et Chem Chi. Que tout le personnel administratif du centre STELA, de l’INAF, du département ALN et de la faculté FSAA (Université Laval) ayant contribué directement ou indirectement à ce projet soit remercié. Je n’oublierai évidemment pas de remercier toutes les personnes auxquelles revient le mérite de ma formation au Québec et ailleurs. Je remercie également toute ma famille pour son soutien moral à distance et tou(te)s mes ami(e)s avec lesquel(le)s j’ai partagé durant mon séjour au Québec des moments de loisir et d’humour agréables et des soirées inoubliables. xi A ceux et celles qui me sont cher(e)s. A la mémoire des victimes du mouvement citoyen en Kabylie et ailleurs. Table des matières Résumé Résumé long Agzul (résumé en berbère) Remerciements Liste des tableaux Liste des figures Chapitre I. Revue de littérature 1.1 Écosystème gastro-intestinal : composition et évolution 1.1.1 Description générale 1.1.2 La microflore intestinale 1.1.3 Les facteurs majeurs influençant la microflore gastro-intestinale 1.2 Les probiotiques et les prébiotiques 1.2.1 Définitions 1.2.2 Les probiotiques et leurs effets bénéfiques sur la santé 1.2.3 Les principales souches microbiennes à potentiel probiotique 1.2.4 Propriétés et critères de sélection des probiotiques 1.3 Les probiotiques et le système immunitaire 1.3.1 Le système immunitaire de l’hôte 1.3.2 La modulation de la réponse immunitaire 1.3.3 Effets des probiotiques et de leurs composants sur le système immunitaire 1.3.4 Les probiotiques et l’immunomodulation : Études in vitro et in vivo 1.4 Problématique de recherche et objectifs Chapitre II. Effets du contenu cytoplasmique, de la paroi cellulaire et des exopolysaccharides de bifidobactéries sur la prolifération de lymphocytes de souris et la production de cytokines. Effects of bifidobacterial cytoplasm, cell wall and exopolysaccharides on mouse lymphocyte proliferation and cytokine production. 2.1 Résumé 2.2 Abstract 2.3 Introduction 2.4 Material and methods xiii 2.4.1 Bacterial strains and culture conditions 2.4.2 EPS isolation, purification and fractionation 2.4.3 EPS molecular mass determination 2.4.4 Preparation of cytoplasm and cell wall extracts of bifidobacteria 2.4.5 Stimulation of mouse splenocytes by bifidobacterial extracts 2.4.6 Statistical analysis 2.5 Results and discussion 2.5.1 EPS production by bifidobacteria 2.5.2 Splenocyte proliferation induced by bifidobacterial extracts 2.5.3 Cytokine production 2.6 Conclusions Chapitre III. Effets des fractions peptidiques et protéiques du cytoplasme de bifidobactéries sur la prolifération des lymphocytes de souris et la production de cytokines. Effects of bifidobacterial cytoplasm peptide and protein fractions on mouse lymphocyte proliferation and cytokine production. 3.1 Résumé 3.2 Abstract 3.3 Introduction 3.4 Material and methods 3.4.1 Bacterial strains and culture conditions 3.4.2 Preparation of bifidobacterial cytoplasm extracts 3.4.3 Cytoplasm peptide and protein profile analysis 3.4.4 Separation of acidic and basic peptide and protein fractions 3.4.5 Characterization of cytoplasm peptide and protein fractions of bifidobacteria 3.4.6 Proliferation assay 3.4.7 Cytokine analysis 3.4.8 Statistical analysis 3.5 Results and discussion 3.5.1 Peptide and protein profile of bifidobacterial cytoplasm 3.5.2 Fractionation of cytoplasmic content into acidic and basic fractions 3.5.3 Characterization of cytoplasmic acidic and basic fractions xiv 3.5.4 Cell proliferation and cytokine production induced by semi purified peptides and proteins 3.5.4.2 Effect on cytokine production 3.6 Conclusion Chapitre IV. Production et caractérisation d’anticorps monoclonaux anti-bifidobactéries et leur application dans le développement d’une méthode de détection en immuno-culture. Production and characterization of anti-bifidobacteria monoclonal antibodies and their application in the development of an immuno-culture detection method 4.1 Résumé 4.2 Abstract 4.3 Introduction 4.4 Material and methods 4.4.1 Bacterial strains and culture conditions 4.4.2 Protein extraction and purification 4.4.3 Immunization of mice and evaluation of specific antibody production 4.4.4 Monoclonal antibody (Mab) production 4.4.5 Purification and isotyping of monoclonal antibody 4.4.6 Determination of cross reactivity by western blot 4.4.7 Antibody specificity test 4.4.8 Sensitivity test 4.4.9 Immune-Transmission electron microscopy (TEM) 4.4.10 Detection of bifidobacteria using an Immuno-culture (IC) method 4.5 Results and discussion 4.6 Conclusion Conclusion générale Liste des tableaux Tableau 1.1. Les principaux facteurs influençant la composition et la fonction de la microflore intestinale. Adapté de Holzapfel et al. (1998). Tableau 1.2. Les prébiotiques et les candidats aux prébiotiques (Blaut, 2002). Tableau 1.3. Quelques souches probiotiques et leurs effets cliniques. Adapté de MattilaSandholm et al. (1999). Tableau 1.4. Distribution des différentes espèces de Bifidobacterium dans le tractus digestif de l’homme en fonction de l’âge (Ballongne, 1993). Tableau 1.5. Réponses immunes vis-à-vis d’une denrée alimentaire au niveau de la muqueuse intestinale. Adapté de Kaminogawa (1996). Tableau 1.6. Études in vitro, in vivo et cliniques récentes sur les effets immunomodulateurs des probiotiques. Table 3.1. Average molecular weight of most abundant peptides or proteins detected in each labelled peak from acidic and basic fractions. Liste des figures Figure 1.1. Schéma simplifié décrivant les compartiments de l’appareil digestif de l’homme et leurs microflores. Adapté et modifié de Ouwehand & Vesterlund (2003). Figure 1.2. Vue générale sur la microflore du colon humain. Adapté de Roberfroid (1995). Gibson & Figure 1.3. Les principaux effets bénéfiques attribués aux probiotiques. Adapté de Mercenier et al. (2002). Figure 1.4. Propriétés et critères de sélection des probiotiques. Adapté de Salminen et al. (1998). Figure 1.5. Organisation fonctionnelle tripolaire des cellules T helper et équilibre Th1/Th2. Adapté et modifié de Bot et al. (2004). Figure 1.6. Description schématique du fonctionnement de l’immunité induite par un antigène détecté. ADCC, cellules cytotoxiques dépendant des anticorps; Tr : Lymphocyte T régulateur; B, Lymphocyte B; Th, Lymphocyte T helper; CPA, cellules présentatrices de l’antigène; Tc, Lymphocyte T cytotoxique; NK : cellules naturelles tueuses; K, cellules tueuses. Schéma tiré de : Roitt I, Brostoff J, Male D. (1998), Immunology (Fifth Edition), Philadelphia: Mosby, et modifié par Kidd (2003). Figure 1.7. Les propriétés anti-allergiques potentielles de IL-10. Adapté de Till et al. (2004) Figure 1.8. Les différents effets biologiques des anticorps. Adapté de Casadevall et al. (2004). Figure 1.9. Description schématique générale du système immunitaire associé à la muqueuse intestinale. A, B et C : voies d’entrée de l’antigène: (A), les cellules épithéliales intestinales ; (B) interaction des cellules dendritiques et cellules épithéliales; (C) cellules M. Flèches : sens de drainage lymphatique des plaques de Peyer et de Lamina propria des villosités (vers les nodules lymphatiques mésentériques). Adapté de Spahn & Kucharzik (2004). Figure 1.10. Les sources de variation de la fonction immunitaire. Adapter de Calder & Samantha (2002). Figure 1.11. Représentation schématique de la polarisation des cellules Th1 et Th2 et de la sécrétion des cytokines. Ag, antigène; MHC II, Molécules du CMH de classe II; TCR, Récepteur cellulaire des cellules T; LPs, lipoprotéines; CpG, motif de nucléotide non méthylé; APC, cellules CPA; LPS, lipopolysaccharides; TLRs, Toll-like receptors; B7.1 et B7.2, molécules de co-stimulation ; CD, Cluster déterminant ( Brandtzaeg, 2002). xvii Figure 1.12. Les thérapies possibles basées sur la manipulations des lymphocytes in vivo proposées pour le traitement de certaines maladies immunologiques. (+), expansion; (-) inhibition. Adapté de McGuirk & Mills (2002). Figure 1.13. Action des probiotiques et des prébiotiques sur le système immunitaire de l’intestin. Adapté de Ouwehand et al. (2002). Figure 1.14. Représentation schématique de la paroi des bactéries Gram-positives (Delcour et al., 1999). Figure 1.15. Schéma illustrant l’interaction entre les composants bactériens (Lactobacillus grasseri) et la cellule immunitaire. TLR, Toll-like receptor. Adapté de Saito (2004). Figure 2.1. EPS content of polysaccharide fractions from three bifidobacterial strains isolated from newborns feces (A), strain RBL81; (B), strain RBL82; (C), strain RBL64. The fractions were separated by centricon based on their molecular weight: F1 > 100 000 Da; F2: 5 000 – 100 000 Da; F3: < 5 000 Da. Figure 2.2. Gel permeation chromatography analysis of crude bacterial exopolysaccharides : A1, 1600x103 Da; A2, 100x103 Da; B, L. rhamnosus RW-9595M; C, strain RBL 82. Figure 2.3. Gel permeation chromatography analysis of fractioned EPS from bifidobacterial strain RBL82 using pullulan standard: A1, 1600x103 Da; A2, 100x103 Da; D, F1 > 100,000 Da; E, F2: 5 000 – 100 000 Da; F, F3 < 5 000 Da. Figure 2.4. Effect of (A) cytoplasmic content, (B) cell wall, and (C) EPS extracts from the strains RBL64 and B. lactis Bb12 on splenocyte proliferation when the preparations were normalized on the basis of their protein content. Columns with different letters are significantly different. Figure 2.5. Synergistic effect of PHA and cellular preparations (A) cytoplasmic content, (B) cell wall, and (C) exopolysaccharides from bifidobacterial strain RBL64 and B. lactis Bb12 on IFN-γ splenocyte production when cells were cultured in complete RPMI medium added with mitogen agent (PHA) (10 µg mL-1). No IFN-γ was detected in PHA-free media and there was no significant difference between treatments with exopolysaccharides. *, higher than 4 µg mL-1. Figure 2.6. Synergistic effect of PHA and cellular preparations (A) cytoplasmic content, (B) cell wall, and (C) exopolysaccharides from bifidobacterial strain RBL64 and B. lactis Bb12 on IL-10 splenocyte production when cells were cultured in complete RPMI medium added with mitogen agent (PHA) (10 µg mL-1). No IL-10 was detected in PHA-free media and there is no significant difference between treatments with cytoplasmic content. ND, not detected. Figure 3.1. Peptide and protein profile of cytoplasmic extracts from strains B. thermoacidophilum RBL64, RBL82 and RBL84, and B. lactis Bb12 obtained by SDSPAGE using 10 % acrylamide gel. xviii Figure 3.2. Peptide and protein profile of acidic fraction (B. lactis Bb12) analysed by RPHPLC (C18 column). Labelled peaks are selected and collected using an appropriated colum. Figure 3.3. Peptide and protein profile of basic fraction (B. lactis Bb12) analysed by RPHPLC (C18 column). Labelled peaks are selected and collected using an appropriated colum. Figure 3.4. Effect of (A) acidic and basic fractions and crude cytoplasmic extract, and (B) semi purified peptides and proteins from B. lactis Bb12 on splenocyte proliferation. The cytoplasmic preparation was normalized on the basis of its protein content. Columns with different letters are significantly different. Figure 3.5. Effect of acidic fraction, basic fraction, and crude cytoplasmic extract from B. lactis Bb12 on splenocyte IFN-γ production. The cytoplasmic preparation was normalized on the basis of its protein content. Columns with different letters are significantly different. Figure 3.6. Effect of acidic and basic fraction, and crude cytoplasmic extract from the strains B. lactis Bb12 on splenocyte IL-4 production. The cytoplasmic preparation was normalized on the basis of its protein content. Columns with different letters are significantly different. Figure 4.1. SDS-PAGE of cell wall proteins from six bifidobacteria strains carried out with 10 % acrylamide gel. Figure 4.2. Antibody level of mice immunized by cell wall proteins from six bifidobacterial species. The averages presented were calculated from values corresponding to the three mice receiving the same antigen. Figure 4.3. Western blot carried out with protein solution from bifidobacteria using purified monoclonal antibody anti-B. longum ATCC 15708 at concentration of 0.06 µg/ml. The proteins were separated on acrylamide (10%) gel and transferred in PVDF membrane. Figure 4.4. Bifidobacterium longum cells bounded by the monoclonal antibody produced against B. longum ATCC 15708 shown by transmission electronic microscopy: (a) negative control (treatment without antibody), (b) treatment with antibody. Bar indicate 200 nm. Figure 4.5. Specificity of monoclonal antibody anti-B. longum ATCC 15708 tested against cells (OD650 nm = 0.1) from (a) Bifidobacterium genera and (b) other species of bacteria at concentration of 0.5 µg/ml. Control (+), supernatant from clone culture tested for anti-B. longum production. Figure 4.6. Variation of the reactivity of the monoclonal antibody produced against B. longum ATCC 15708 tested at different concentration against bacterial cells (OD650 nm= 0.1). Supernatant from clone culture tested for anti-B. longum production was used as positive control. xix Figure 4.7. Sensitivity test carried out with diluted cell suspension using purified monoclonal antibody anti-B. longum ATCC 15708 at the optimal concentration of 0.5 µg/ml. Figure 4.8. Immune-culture test carried out with anti-B. longum and fresh culture of B. longum using 6-wells plate. Because of high size of wells in culture plate a maximal concentration of anti-B. longum (1.5 µg/ml) was used for coating; mother- solution of B. longum: 1.4x 109 cfu/ml; dilution A1: 10-7, B2: 10-6, and B1:10-5; A2: negative control (non-coated well). Introduction L’Homme à l’instar des animaux vit continuellement en association avec la population de microorganismes complexe habitant son tractus gastro-intestinal. L’un des principaux effets bénéfiques émanant de leur alliance est la protection et l’amélioration de la résistance aux maladies infectieuses de l’organisme-hôte (Fuller, 1989; Asahara et al., 2001a,b; Saavedra & Tschernia, 2002; Tlaskalová-Hogenová et al., 2004; Sullivan & Nord 2005). Cependant, la composition de cette flore peut être altérée par divers facteurs alimentaires et environnementaux, qui rendent l’organisme-hôte susceptible aux maladies ou aux désordres digestifs. Les travaux de Metchnikoff (1907) ont démontré que la consommation d’aliments fermentés permet de rétablir la flore intestinale en générant des effets bénéfiques sur la santé de l’homme et des animaux. Les investigations récentes ont mis en évidence le rôle crucial que jouent la microflore intestinale dans le maintien et l’amélioration de la santé. Certains de ces travaux ont montré que les animaux conventionnels pourvus d’une microflore intestinale complète sont plus résistants aux infections que les animaux axéniques (germ-free) dépourvus de microflore (Perdigon et al., 2001; Neumann et al., 1998; Lima-Filho et al., 2004). En effet, de nombreuses études scientifiques ont rapporté les propriétés prophylactiques et thérapeutiques de certains microorganismes présents dans les aliments fermentés (Parker, 1974; Gibson & Fuller, 2000; Varcoe et al., 2003; Marelli et al., 2004, Lin et al., 2005). Ces microorganismes favorables pour la santé de l’homme et de l’animal ont reçu le nom de « Probiotiques ». Ce concept a été développé tout particulièrement après l’émergence, ces dernières décennies, des bactéries résistantes aux antibiotiques et l’intérêt suscité par les agents naturelles d’inhibition pour le contrôle des germes pathogènes (Ouewhand et al., 1999; Kailasapathy & Chin, 2000). Des études récentes (Hirayamma & Rafter, 2000; Reid & Burton, 2002; Ibnou-Zekri et al., 2003; Lodinova-Zadnikova et al., 2003; Rinkinena et al., 2003; Sgouras et al., 2004; 2 Asahara et al., 2004) ont montré que la consommation de produits alimentaires enrichis en probiotiques produit plusieurs effets favorables sur l’organisme tels que l’amélioration des mécanismes de la réponse immunitaire, le rétablissement de l’équilibre microbien dans le colon, le traitement de certaines infections intestinales et uro-génitales, la réduction des risques d’allergie, de cancer, d’ulcère, etc. Les microorganismes probiotiques sélectionnés en alimentation humaine sont représentés essentiellement par les bactéries lactiques, particulièrement celles appartenant au genre Lactobacillus et Bifidobacterium (Sanders, 2000; Sullivan & Nord, 2002; Borriello et al., 2003; Saito et al., 2004). Aujourd’hui, ces deux genres bactériens sont largement utilisés dans la fabrication de produits laitiers fermentés. A titre d’exemple, aux États Unis, près de 60 % des yogourts réfrigérés contiennent des cultures probiotiques tels que Lactobacillus acidophilus et / ou Bifidobacterium sp. La consommation de yogourt dans ce pays est passée de 0.5 à 2 kg/ personne/an (Blum et al., 1999). En Europe, le marché des probiotiques destinés à la consommation humaine a été évalué à près de 12.9 millions $ US en 2003, ce marché augmente actuellement d’environ de 14 % par an (Anderson, 2004). La perception des propriétés prophylactiques et thérapeutiques des probiotiques est à l’origine de la consommation accrue des produits laitiers fermentés notamment le yogourt (Mercenier et al., 2002; Chukeatirote, 2003). Cependant, l’effet probiotique des bifidobactéries dépend de leur taux de survie non seulement dans les aliments mais également dans le tractus gastro-intestinal (Shah, 2000; Marteau et al., 2003; Gagnon et al., 2004). Pour cette raison, il devient nécessaire d’identifier et d’évaluer la population de bifidobactéries dans les produits fermentés afin de s’assurer d’un apport en probiotiques suffisant pour obtenir les effets bénéfiques escomptés. Ceci donc inciterait à développer de nouvelles méthodes moléculaires fiables permettant de détecter spécifiquement les espèces ou souches de bifidobactéries (Klein, 2003; Corsetti et al., 2003; Vitali et al., 2003). Un des effets positifs sur la santé attribué aux probiotiques est leur action sur le système immunitaire. La modulation de certains paramètres de la réponse immunitaire par 3 les probiotiques suscite actuellement de plus en plus d’intérêt compte tenu des problèmes d’ordre immunologique observés chez l’homme (infections, allergies, déficiences immunitaires, etc) (Cunningham-Rundles et al., 2000; Chiang et al., 2000; Fang et al., 2000; Cano & Perdigon, 2003). Les études déjà rapportées ont montré que certaines bifidobactéries sont capables de stimuler la fonction immunitaire en favorisant l’activité des macrophages, la production d’anticorps, l’induction d’effets anti-tumoraux, la réduction d’allergie et l’induction du phénomène de tolérance orale (Ducluzeau et al., 1984; Yamazaki et al., 1985; Reddy & Rivenson, 1993; Calder & Samantha, 2002; Welman & Maddox, 2003; Chukeatirote, 2003; Prioult et al., 2003; Mastrandrea et al., 2004). Par ailleurs, certains travaux de recherche ont suggéré que la flore intestinale pourrait être un facteur indispensable pour rétablir l'équilibre entre les cellules immunitaires Th1 et Th2 qui jouent un rôle pivot dans le processus d’immunomodulation. Il semblerait que certaines souches intestinales peuvent jouer un rôle important dans la suppression (greffes, maladies auto-immunes) ou la stimulation (défenses contre les bactéries ou les virus) de la réponse immunitaire. Cependant, les mécanismes cellulaires et moléculaires par lesquels les probiotiques exercent ces effets immunomodulateurs ne sont pas encore bien élucidés (Isolauri et al., 2001; Kaur et al., 2002; Perdigon et al., 2003; Kidd, 2003 ). Les effets immunomodulateurs observés ont été souvent associés à la consommation de souches probiotiques vivantes. Cependant, des études récentes ont montré que certains probiotiques non viables sont également capables d’exercer des effets similaires sur le système immunitaire En effet, il a été mentionné dans la littérature que des lysats cellulaires de souches probiotiques (Lactobacillus casei, L. rhamnosus GG, L. acidophilus, L. delbrueckii subsp. bulgaricus, Bifidobacterium lactis, et Streptococcus thermophilus) ont des effets immunorégulateurs (Pessi et al., 1999; Bautista-Garfias et al., 2001; Kankaanpa et al., 2003). Des études ont démontré que certains motifs d’acides nucléiques provenant du génome des probiotiques présentent des propriétés immunomodulatrices (Lammers et al., 2003; Klinman et al., 2004; Jijon et al., 2004). Il semblerait aussi que les exopolysaccharides capsulaires ou excrétés dans le milieu par les souches bactériennes 4 stimulent également les composants du système immunitaire (Rangavajhyala et al., 1997; Brubaker et al., 1999; Ruas-Madiedo et al., 2002). Une étude récente menée par Chabot et al. (2001) a démontré que les exopolysaccharides produits par Lactobacillus rhamnosus RW-9595M stimulent la réponse immunitaire. Cependant, l’effet des exopolysaccharides, ainsi que celui des peptides et des protéines du cytoplasme, des bifidobactéries sur la réponse immunitaire n’ont fait l’objet d’aucune étude. Notre projet vise à évaluer le potentiel de certaines souches de bifidobactéries d’origine humaine à moduler certaines fonctions immunitaires. Il vise également à identifier, à l’aide d’essais in vitro et ex vivo, les constituants cellulaires responsables de cette fonction immunomodulatrice et d’identifier ainsi les mécanismes impliqués.. De façon plus spécifique, ce projet vise à i) évaluer le potentiel de certaines souches de bifidobactéries isolées d’humain à moduler certaines fonctions immunitaires; ii) identifier les composantes cellulaires (contenu cytoplasmique, paroi cellulaire et exopolysaccharides) responsables de cet effet immunomodulateur; iii) caractériser, à l’aide de tests in vitro et ex vivo cette activité immunomodulatrice; iv) caractériser à l’échelle moléculaire les fractions identifiées et v) exploiter l’effet immunodulateur de certains constituants cellulaires pour produire et caractériser des anticorps monoclonaux spécifiques aux bifidobactéries et de les utiliser pour la détection de bifidobactéries vivantes dans les aliments. Chapitre I: Revue de littérature 1.1 Écosystème gastro-intestinal : composition et évolution 1.1.1 Description générale Le tractus gastro-intestinal est un écosystème complexe et ouvert aux microorganismes exogènes. De par sa surface totale (muqueuse) estimée à 200-300 m2, il représente la plus grande surface du corps en contact avec l’environnement (Holzapfel et al., 1998). L’écosystème gastro-intestinal est généré par une alliance stable entre l’épithélium gastro-intestinal, le système immunitaire et une importante flore microbienne. Ces trois composants sont continuellement liés entre eux et évoluent ensemble en assurant une fonction et une activité normales de l’écosystème. Si l’un des trois composants de l’écosystème est défaillant, l’alliance est altérée et par conséquent diverses pathologies s’y installent (McCracken & Lorenz, 2001). La Figure 1.1 montre les principaux compartiments constituant le tractus gastro-intestinal de l’homme. Les interactions entre les microorganismes et l’hôte peuvent être de trois types: symbiose, commensalisme et pathogénicité (Hooper & Gordon, 2001). L’hôte est protégé contre la microflore intestinale pathogène par les barrières chimiques et physiques formées par l’épithélium gastrointestinal (Kagnoff & Eckmann, 1997). 1.1.2 La microflore intestinale Selon la définition de Isolauri et al. (2002), la flore intestinale normale est une collection complexe et en équilibre de microorganismes qui habitent normalement le tractus gastro-intestinal et remplissant un rôle dans la nutrition, la physiologie et le contrôle du système immunitaire de l’hôte. Après une colonisation complète, la microflore intestinale est considérée comme un organe acquis après la naissance. Il est constitué d’une grande diversité d’espèces microbiennes assurant différentes fonctions pour l’hôte. La microflore du tractus gastro-intestinal a été estimée à près de 1013-1014 cellules microbiennes représentant 400 à 500 espèces et sous espèces. Cette microflore représente environ 10 fois le nombre total de cellules du corps humain (Moore et Holdeman, 1974; Bjorksten, 2004). 6 Œsophage : mucus, péristaltisme. Seuls les microorganismes provenant des aliments ou de la cavité orale sont présents Duodénum: Secrétions pancréatiques et biliaires, mucus, faible O2. Microflore: 103-104 cfu/g Bacteroides Candida albicans Lactobacillus Streptococcus Colon: Anaérobiose, motricité, enzymes bactériennes, acides gras volatiles, ammoniaque… Microflore: 1010-1011 cfu/g Bacteroides Bacillus Bifidobacterium Clostridium Enterococcus Eubacterium Fusobacterium Peptostreptococcus Ruminococcus Streptococcus Estomac: pH acide (HCl), O2, enzymes (pepsines, lipases…), mucus. Microflore: 104 cfu/g Candida albicans Helicobacter pylori Lactobacillus Streptococcus Jéjunum: Secrétions pancréatiques et biliaires, mucus, péristaltisme. Microflore: 105-107 cfu/g Bacteroides Candida albicans Lactobacillus Streptococcus Iléon : Anaérobiose, sels biliaires, enzymes. Microflore : 107-108 cfu/g Bacteroides Clostridium Enterobacteriacea Enterococcus Lactobacillus Veillonella Figure 1.1. Schéma simplifié décrivant les compartiments de l’appareil digestif de l’homme et leurs microflores. Adapté et modifié de Ouwehand & Vesterlund (2003). La prévalence des bactéries dans le tractus gastro-intestinal dépend des conditions régnant dans le compartiment du tractus. Deux catégories de bactéries ont été identifiées : les bactéries autochtones ou indigènes se trouvant dans des niches particulières, et les bactéries allochtones ou transitoires rencontrées dans d’autres habitats du tractus. La majorité des bactéries pathogènes sont allochtones et vivent normalement en harmonie avec l’hôte, excepté lorsque l’équilibre du système est rompu (Hao & Lee, 2004). 7 Du point de vue microbiologique, comme le montre la Figure 1.1, l’environnement gastro-intestinal comprend trois régions principales qui offrent des conditions très différentes pour la survie des différents microorganismes. Dans le premier compartiment, l’estomac, la prolifération microbienne est fortement réduite par la présence d’oxygène apporté par la déglutition et d’une forte acidité. De ce fait, l’estomac héberge sélectivement les microorganismes acidotolérants et anaérobies facultatifs comme les lactobacilles, streptocoques, levures, etc. Dans le deuxième compartiment qui est le petit intestin, la microflore est constituée essentiellement de bactéries anaérobies facultatives tels que les lactobacilles, les streptocoques et les entérobactéries, et anaérobies strictes notamment les bifidobactéries, les bactéroides et les clostridies. Dans le dernier compartiment qui est le colon (dépourvu d’oxygène), le transit digestif est plus lent et la flore microbienne est plus abondante, représentant 35 à 50 % du volume du contenu du colon humain (Cummings et al., 1989; Gounier-Château,1994). La microflore du colon est très complexe et dominée par les bactéries anaérobies strictes (Bacteroides spp., Clostridium spp, Bifidobacterium spp., Atopobium spp…). Tandis que les bactéries anaérobies facultatives sont moins nombreuses et représentées par les lactobacilles, les entérocoques, les streptocoques et les Enterobacteriaceae. Les levures (ex. Candida albicans) sont relativement faiblement représentées. La charge microbienne dans les différents compartiments a été estimée à environ : 104, 103-4, 105-7, 107-8 et 1010-11 colonies formant unité (cfu)/g dans l’estomac, le duodénum, le jéjunum, l’iléon et le colon respectivement (Ouwehand & Vesterlund, 2003; Isolauri et al., 2004). Les bifidobactéries et les lactobacilles, ainsi que certains entérocoques, E. coli, streptocoques et bactéroides, se distinguent par leurs effets bénéfiques sur la santé de l’hôte, comme l’amélioration de la maturation et de l’intégrité de l’intestin, l’antagonisme contre les pathogènes et la modulation de la fonction immunitaire (Gibson & Roberfroid, 1995; Schiffrin & Blum, 2002; Rastall, 2004). Les principaux composants de la flore du colon ainsi que leurs effets sur l’hôte sont présentés dans la Figure 1.2. Toutefois, il faut noter qu’une partie de la flore gastro-intestinale (fraction minoritaire) demeure non cultivable et moins explorée, et ce pour diverses raisons: 8 méconnaissance des besoins de croissance de certaines bactéries, la sélectivité des milieux utilisés, le stress dû aux conditions de culture, la nécessité d’anaérobiose stricte et la difficulté de stimuler les interactions entre les bactéries et les autres microorganismes ou les cellules de l’hôte (Zoetendal et al., 2004). Organismes négatifs pour la santé Organismes positifs pour la santé 1 Putréfaction intestinale Ps. aeruginosa Proteus sp. Production de carcinogènes Staphylocoques Clostridies Veillonellae Diarrhées, constipation, infections, atteinte du foie, Cancer, toxigénèse, encéphalopathie Inhibition de la croissance de bactéries exogènes et pathogènes Entérocoques E. coli Lactobacilles Digestion/absorption d’ingrédients alimentaires et minéraux Stimulation de la fonction immunitaire Streptocoques Bifidobactéries Bactéroides 2 Synthèse de vitamines No./g fèces (log10) Figure 1.2. Vue générale sur la microflore du colon humain. Adapté de Gibson & Roberfroid (1995). 1.1.3 Les facteurs majeurs influençant la microflore gastro-intestinale La composition et les fonctions de la microflore du tractus gastro-intestinal sont influencées par divers facteurs liés au changement des conditions physiologiques de l’hôte 9 ( âge, état de santé,…), de la composition du régime alimentaire et des circonstances environnementales (contamination par les pathogènes, antibiothérapie, chimiothérapie, climat, stress, hygiène …) (Mitsuoka, 1989; Hopkins et al., 2002). Selon, Holzapfel et al. (1998), les facteurs majeurs influençant la microflore gastro-intestinale sont résumés dans le Tableau 1.1. Tableau 1.1. Les principaux facteurs influençant la composition et la fonction de la microflore intestinale. Adapté de Holzapfel et al. (1998). Facteurs médiés par l’hôte Facteurs microbiens - pH, secrétions (immunoblogulines, - Adhésion bile, sels, enzymes), - Motilité - Motilité (péristaltisme), - Flexibilité nutritionnelle - Physiologie (variable selon les - Spores, capsules, enzymes, composants antimicrobiens compartiments), - Cellules détachées, mucines, exsudats - Temps de génération. de tissus. Interactions microbiennes Synergie Antagonisme/ stimulation - Coopération métabolique - Acides gras de courte chaîne, amines. - Excrétion de vitamines et facteurs - Changement de Eh, pH et tension d’O2 - Composants antimicrobiens, de croissance siderophores, - Changement de Eh (potentiel d’oxydoréduction), pH et tension d’O2 . - Besoins nutritionnels, etc. Régime alimentaire Composition, fibres non digestibles, drogues, etc. Les divers facteurs mentionnés dans le Tableau 1.1 peuvent perturber l’équilibre de l’écosystème intestinal en favorisant des espèces particulières par rapport à d’autres. Dans certains cas, ce déséquilibre peut être très favorable à la prolifération de microorganismes 10 opportunistes pathogènes pouvant compromettre la santé et le bien-être de l’hôte. Il serait donc impératif de rechercher des solutions alternatives permettant la restauration de l’équilibre de la microflore intestinale de l’hôte. L’utilisation des probiotiques et/ou des prébiotiques (préparations microbiennes ou à base de certaines substances) s’est avérée une alternative prometteuse. Ces nouveaux concepts sont décrits dans la section suivante. 1.2 Les probiotiques et les prébiotiques 1.2.1 Définitions 1.2.1.1 Les probiotiques La notion de '' probiotiques'' a été développée grâce aux travaux de Metchnikoff (1907) qui avait constaté que les paysans bulgares, grands consommateurs de laits fermentés, vivaient très vieux et en bonne santé. Ainsi, Metchnikoff avait proposé l’ingestion de bactéries vivantes, particulièrement des bactéries lactiques, pour réduire les désordres intestinaux et améliorer l’hygiène digestive, et donc augmenter l’espérance de vie (Gournier-Château et al., 1994). Le terme probiotique dérive des deux mots grecs '' pros'' et '' bios'' qui signifient littéralement ''pour la vie'' contrairement au terme antibiotique signifiant ''contre la vie''. Ce terme a été introduit pour la première fois par Lilly et Stillwell (1965) pour décrire des substances produites par un microorganisme et stimulant la croissance d’autres microorganismes. Depuis, plusieurs définitions ont été données aux probiotiques dépendamment de leurs effets sur la santé. Selon Parker (1974), « probiotiques » désigne les microorganismes et les substances qui contribuent au maintien de l’équilibre de la flore intestinale. Cette définition englobant les microorganismes et les métabolites microbiens produits (les antibiotiques), a été modifiée par Fuller (1989) qui redéfinit les probiotiques comme étant : ''des préparations microbiennes vivantes utilisées comme additif alimentaire et qui ont une action bénéfique sur l'animal hôte en améliorant la digestion et l'hygiène intestinale''. Enfin, selon la définition adoptée par le groupe de travail mixte formé par l’Organisation des Nations Unies (ONU) pour l’agriculture et l’alimentation et l’Organisation Mondiale pour la Santé (OMS) (Report of FAO/WHO, 2002), les 11 probiotiques sont « des microorganismes vivants administrés en quantités adéquates et qui sont bénéfiques pour la santé de l’hôte ». De façon plus spécifique, pour qu’un organisme soit considéré comme étant potentiellement probiotique il doit présenter les caractéristiques suivantes: - être un habitant naturel de l’intestin, - être capable de coloniser le milieu intestinal, persister et se multiplier - adhérer aux cellules intestinales et exclue ou réduit l’adhérence des pathogènes - avoir un métabolisme actif et produire des substances inhibant les pathogènes (acides, H2O2, bactériocines…) - non invasif, non carcinogène et non pathogène - être capable de co-agréger pour former une flore normale équilibrée - survivre aux différents procédés technologiques de production - garder sa viabilité dans l'aliment et durant le transit intestinal (Salminen et al., 1996, Tannock, 1999a,b; Stanton et al., 2001). Dans toutes les définitions prononcées, la notion de viabilité apparaît comme un critère de sélection important. Cependant, cette notion demeure très controversée puisque des études récentes, ont clairement démontré que même les souches non viables de probiotiques sont capables d’exercer certains effets positifs sur la santé entre autres la stimulation de certaines fonctions immunitaires, l’inhibition de l’adhésion et l’invasion de certains pathogènes (Coconier et al., 1993; Ouwehand et al., 1999). Ceci laisserait donc envisager une éventuelle redéfinition des probiotiques où la notion de viabilité sera à reconsidérer. 1.2.1.2 Les prébiotiques Certains composants de la microflore intestinale, particulièrement les bifidobactéries, sont capables de fermenter des substances essentiellement non digestibles (hydrates de carbone) dans le colon grâce à son pouvoir saccharolytique important (Kaplan et al., 2000). Cette propriété permet d’augmenter la croissance ou l’activité des microorganismes spécifiques du tractus gastro-intestinal en influençant positivement la 12 santé de l’hôte. Les effets bénéfiques générés par ces interactions ont permis le développement du nouveau concept « prébiotiques » (Berg, 1998; Kaialaspathy & Chin, 2000). Le concept de prébiotique a été développé suite aux travaux de Gibson et al. (1995) qui ont mis en évidence une stimulation sélective de la croissance de bifidobactéries dans le colon de sujets ayant ingérés de l’oligofructose et de l’inuline. Ainsi, les prébiotiques ont été définis comme étant des ingrédients alimentaires non digestibles exerçant des effets bénéfiques sur l’hôte en stimulant sélectivement dans le colon la croissance et/ou l’activité d’une ou d’un nombre limité de bactéries capables d’améliorer la santé de l’hôte. Les prébiotiques doivent être non digestibles pour servir de substrat aux bactéries spécifiques, principalement les bifidobactéries et les lactobacilles, qui sont actives et améliore la santé de l’hôte. Les fibres alimentaires comme les polysaccharides tels que l’amidon, l’inuline, la pectine, la gomme guar, et les oligosaccharides non digestibles sont ainsi fermentées par les bactéries intestinales en produisant des acides gras à courte chaîne notamment les acides acétique, propionique et butyrique…qui sont alors utilisés par les différents tissus de l’hôte comme substrats énergétiques, ou comme facteurs de régulation cellulaire (Blaut, 2002). Par exemple, le butyrate est non seulement utilisé par les cellule épithéliales du colon à des fins énergétiques, mais aussi joue un rôle majeur dans la régulation de leur processus de prolifération et différenciation cellulaires (Mortensen et al., 1996; Litvak et al., 1998). Pour être considéré comme prébiotique, un ingrédient alimentaire doit: a- être ni hydrolysé ni absorbé dans le tractus gastro-intestinal, b- être sélectif pour un nombre limité de bactéries endogènes, c- modifier la microflore intestinale en améliorant sa composition, d- induire des effets intestinaux ou systémiques bénéfiques pour la santé de l’hôte (Gibson et al., 1995) Le Tableau 1.2 rapporte les principaux ingrédients alimentaires considérés comme prébiotiques. 13 Tableau 1.2. Les prébiotiques et les candidats aux prébiotiques (Blaut, 2002). Composant prébiotique Xylo-oligosaccharides Composition Oligosaccharides de soja Raffinose(F-Gal-G)+stachyose(F-Gal-Gal) 3–4 Oligosaccharides transgalactosylés 6’ Galactosyllactose β (1→4) liés aux unités de xylose Degré de polymérisation 2–4 2–8 Condensats de Palatinose Molecules de sucrose réarrangées par voie 2–7 enzymatique Isomaltooligosaccharides Transgalactosylation de maltose 2–8 Inuline β (2→1) Fructans 2–65 Oligofructose β (2→1) Fructans 2–8 Lactulose (Bifiteral®) Galactosyl-β (4→1) fructose 3–5 1.2.1.3 Les symbiotiques Un symbiotique est un mélange de probiotiques et de prébiotiques qui affecte positivement l’hôte en améliorant la survie et l’implantation d’espèces microbiennes vivantes apportées sous forme de suppléments alimentaires dans le tractus gastro-intestinal, et, par conséquent, la santé et le bien-être de l’hôte (Isolauri et al., 2002). Le terme symbiotique évoque la propriété de synergie et est réservé uniquement aux produits contenant les probiotiques et les prébiotiques au même temps. Dans ces produits, les prébiotiques stimulent sélectivement la croissance des probiotiques. Par exemple, un produit contenant l’oligofructose et une bifidobactérie probiotique est considéré comme un symbiotique. Cependant, lorsque un Lactobacillus probiotique est associé à l’oligofructose, la combinaison ne forme pas un symbiotique (Schrezenmeir & Vrese, 2001). Cette différence serait due au fait que les bifidobactéries produisent une grande quantité de 14 ß-fructosidases, enzymes capables de dégrader sélectivement la liaison entre les fructoses présents dans l’oligofructose. Une étude récente de Bartosch et al. (2005) réalisée sur un groupe de volontaires âgés (> 62 ans) dont le contenu intestinal en bifidobactéries est fortement réduit par l’âge, a démontré que l’ingestion d’un symbiotique à base de Bifidobacterium bifidum BB-02 et Bifidobacterium lactis BL-01 (probiotiques) et de l’inuline (prébiotique) a augmenté significativement la taille et la diversité des populations de bifidobactéries dans les matières fécales par rapport au groupe contrôle et groupe placebo. 1.2.2 Les probiotiques et leurs effets bénéfiques sur la santé Plusieurs effets bénéfiques sur la santé ont été associés à la consommation des probiotiques. La Figure 1.3 illustre la diversité des effets bénéfiques sur la santé documentés et rapportés dans la littérature. Amélioration de la digestion du lactose (sécrétion de lactase) Influence positive sur la flore intestinale Bonne croissance et le bien-être Régulation de la motilité intestinale (constipation, syndrome d’irritation intestinale) Réduction des produits du catabolisme éliminés par le foie et le rein Probiotiques Prévention de : ostéoporose, cancer, hypertension et athérosclérose (réduction du taux de cholestérol) Augmentation de la valeur nutritionnelle (bonne digestion et absorption des minéraux et vitamines Prévention des infections intestinales (virus, i et Helicobacter pylor…) urogénitales Modulation du système immunitaire Réduction de l’inflammation ou des réactions allergiques Figure 1.3. Les principaux effets bénéfiques attribués aux probiotiques. Adapté de Mercenier et al. (2002). 15 Il est à noter que la validité scientifique de ces effets bénéfiques est très variable. Pour certains effets, des preuves scientifiques irréfutables appuyées par des études cliniques existent et permettent d’attribuer certaines allégations-santé aux produits probiotiques. Pour d’autres, les allégations demeurent encore à un stade hypothétique et des études plus approfondies demeurent nécessaires pour apporter des preuves scientifiques convaincantes à ces allégations. a) Les probiotiques et les infections gastro-intestinales: des études cliniques ont démontré que des infections gastrointestinales causées par Helicobacter pylori, la diarrhée du voyageur, diarrhée due aux rotavirus, diarrhée-associée aux antibiotiques comme celle causée par Clostridium difficile, peuvent être contrecarrées avec succès par l’utilisation de probiotiques (Mercenier et al., 2002, Turchet et al., 2003; Wang et al., 2004; Tursi et al., 2004, Plummer et al. 2004). A titre d’exemple Wang et al. (2004) ont rapporté que la consommation régulière de yogourt additionné de Lactobacillus acidophilus La5 ou de Bifidobacterium lactis Bb12 induit une suppression effective de l’infection due à H. pylori. Tandis que Rosenfeldt et al. (2002) ont mentionné que des souches de L. rhamnosus et L. reuteri ont permis de traiter des gastro-entérites à rotavirus chez des enfants hospitalisés. b) Les probiotiques et l’intolérance au lactose : il a été rapporté que la consommation de lait ou de yogourt enrichis en probiotiques améliore l’absorption de lactose chez les patients déficients en lactase et réduit les symptômes digestifs dus à l’intolérance au lactose. Jiang et al., 1996 ont démontré que la consommation de lait contenant des souches de Bifidobacterium longum réduit les symptômes de la malabsorption de lactose chez des sujets humains suite à une élévation de la sécrétion de βgalactosidase. c) les probiotiques et le cholestérol: des études préliminaires ont révélé que la consommation de yogourt ou de lait fermenté contenant des probiotiques entraînent une diminution du taux de cholestérol dans le sang, et par conséquent la réduction les risques d’hypercholestérolémie responsable des maladies coronariennes. Par exemple, Bukowska et 16 al. (1998) ont mis en évidence une diminution du taux de cholestérol sanguin chez des sujets soumis à un régime supplémenté avec Lactobacillus plantarum 299 v. d) Les probiotiques et la prévention du cancer du colon: selon certaines études, les bactéries probiotiques ont la propriété d’inhiber les processus conduisant à la formation du cancer du colon chez l’homme. En effet, Matsumoto et Benno (2004) ont mentionné que la consommation de yogourt contenant Bifidobacterium lactis LKM512 réduit significativement la mutagénécité dans l’intestin de volontaires par comparaison à un placebo. e) Les probiotiques et les maladies inflammatoires de l’intestin: selon la littérature, les processus inflammatoires impliqués dans les pathologies de l’intestin de l’homme comme la maladie de Crohn, la colite ulcéreuse et la pouchite sont contrôlés par les probiotiques. Une étude de Guandalini (2002) a montré que l’ingestion de Lactobacillus GG entraîne une amélioration notable de l’état clinique chez des enfants souffrant de la maladie de Crohn. De même Gosselink et al. (2004) ont observé des effets cliniques bénéfiques chez des patients affectés par une colite ulcéreuse après ingestion de produits fermentés contenant Lactobacillus GG (1-2x1010 bactéries/jour). f) Les probiotiques et la perméabilité intestinale : l’altération de la perméabilité intestinale (fonction-barrière) causée par une infection, toxines ou autre facteur favorise un transfert aberrant d’antigènes (y compris la microflore locale) à travers l’intestin en engendrant des réponses immunitaires inappropriées (réactions inflammatoires ou autoimmunes) (Baumgart & Dignass, 2002 ; Gill, 2003). Des études récentes ont montré que la consommation de probiotiques stabilise la fonction barrière de l’épithélium intestinal. Par exemple, Isolauri et al. (1993) ont démontré que Lactobacillus GG normalise le processus de perméabilité intestinale chez le rat. En outre, une étude récente de Rosenfeldt et al. (2004) a démontré qu’une administration de probiotiques (Lactobacillus rhamnosus et Lactobacillus reuteri) permet de stabiliser la fonction-barrière de l’intestin et de diminuer les symptômes gastro-intestinaux chez des enfants souffrant d’une dermatite atopique. 17 Cependant les mécanismes impliqués dans cette normalisation ne sont pas encore bien connus. g) Les probiotiques et la motilité de l’intestin : la motilité intestinale joue un rôle important dans la réduction de la croissance des microorganismes pathogènes dans l’intestin. Les probiotiques pourraient avoir des effets positifs sur la motilité de l’intestin en réduisant le temps de transit des microorganismes pathogènes (Takiguchi et al.,1998). Une étude de Grimaud et al. (1993) a montré que l’ingestion de lait fermenté avec Bifidobacterium animalis entraîne une réduction significative du temps du transit du contenu gastro-intestinal chez des volontaires. Tandis que Verdu et al. (2004) ont rapporté que l’effet de Lactobacillus paracasei (probiotique) sur la motilité de l’intestin se traduit par une atténuation de l’hyper contractilité post-infection du muscle. Ils suggèrent que les probiotiques peuvent être utilisés dans le traitement du syndrome de l’intestin irritable. Dans d’autres cas, les allégations-santé revendiquées demeurent purement hypothétiques et des études scientifiques plus approfondies sont nécessaires pour confirmer ou infirmer ces allégations. Cette situation est particulièrement vraie pour les effets des probiotiques sur le système immunitaire et pour lesquels très peu de preuves scientifiques et d’études cliniques ont été apportées pour valider ces allégations. Néanmoins, la stimulation du système immunitaire de l’hôte demeure un aspect très important dans le développement du concept « probiotiques », d’autant plus que certains travaux rapportés dans la littérature (voir section 1.3.4) suggèrent que certaines souches à fort potentiel probiotique sont capables de stimuler certaines fonctions immunitaires notamment lors d’infections bactériennes ou virales. 1.2.3 Les principales souches microbiennes à potentiel probiotique 1.2.3.1 Les souches probiotiques utilisées en alimentation humaine et animale Les souches ou espèces probiotiques sont des composants normaux de la flore intestinale (Dunne et al., 2001). En alimentation humaine, les genres microbiens les plus utilisés comme probiotiques sont Lactobacillus, Bifidobacterium et Streptococcus (Goldin 18 et Gorbach, 1992; Berg, 1998). Par contre, en alimentation animale de nombreux genres bactériens et fongiques sont utilisés, comme Lactobacillus, Bifidobacterium, Bacillus, Streptococcus, Pediococcus, Enterococcus, Propionibacterium, Saccharomyces, Aspergillus et Torulopsis (Tannock, 1997; Pirkka et al., 1999; Huang et al., 2003). En général, les souches probiotiques sont sélectionnées prioritairement pour leurs effets bénéfiques et leur sécurité d’utilisation (innocuité). Le Tableau 1.3 rapporte quelques souches probiotiques pour les quelles des effets bénéfiques sur la santé sont bien documentés. Cependant, l’aptitude des souches bactériennes à stimuler la fonction immunitaire est très variable, seulement certaines souches sont reconnues capables d’exercer des effets immunomodulateurs sur l’organisme-hôte (Gill et al., 2000). Il faut noter que les bactéries du genre Bifidobacterium sont de plus en plus utilisées dans les produits probiotiques à causes des nombreux effets bénéfiques sur la santé associés à leur consommation. (Kimura et al., 1998). Pour obtenir certains effets positifs sur la santé (réduction des infections intestinales, digestion du lactose, réduction du cholestérol…), une souche probiotique doit atteindre le gros intestin à une concentration d’environ 1x107 cellules viables/gramme (Stanton et al., 2001). De ce fait, la concentration d’un probiotique dans un aliment doit tenir compte de cette contrainte pour permettre d’atteindre les concentrations ciblées dans le colon. Cette concentration dépend évidemment de la nature de l’aliment utilisé et de la quantité journalière consommée. 19 Tableau 1.3. Quelques souches probiotiques et leurs effets cliniques. Adapté de Mattila-Sandholm et al. (1999). Souche probiotique Effets cliniques sur l’Homme Adhésion aux cellules intestinales humaines, réduction de l’activité des enzymes fécales, Lactobacillus GG ATCC 53103 prévention des diarrhées associées aux antibiotiques, prévention et traitement des diarrhées à rotavirus et autres diarrhées, modulation de la réponse immunitaire Prévention de la diarrhée du voyageur, modulation Lactobacillus jonhsonii Lj-1(LA-1) de la flore intestinale, réduction des symptômes de l’intolérance au lactose, traitement de la constipation, amélioration de l’immunité, adjuvant dans le traitement de Helicobacter pylori Prévention de la diarrhée du voyageur, traitement Bifidobacterium lactis (bifidum) Bb- des diarrhées virales (rotavirus), modulation de la flore intestinale, traitement de la constipation, 12 modulation de la réponse immunitaire. Lactobacillus reuteri ATCC 55730 Colonisation du tractus intestinal, réduction de la durée des diarrhées aux rotavirus, traitement des diarrhées virales Modulation de la flore intestinale, réduction de Lactobacillus casei Shirota l’activité des enzymes fécales, effets positifs sur le cancer superficiel. Lactobacillus plantarum DSM 9843 Adhésion aux cellules intestinales humaines, modulation de la flore intestinale Prévention et traitement des diarrhées associées Saccharomyces boulardii aux antibiotiques (ex. Clostridium difficile colitis) 1.2.3.1 Les bifidobactéries Les bactéries appartenant au genre Bifidobacterium, ont été décrites pour la première fois par Tessier (1900) qui a isolé à partir de fèces d’un enfant allaité au sein, une bactérie anaérobie de morphologie bifide qu’il appela Bacillus bifidus. En général, les bifidobactéries montrent un polymorphisme cellulaire (bifide ou ramifié) dépendant des conditions de culture comme teneur du milieu en N-acetylglucosamine, alanine, acide glutamique ou ions Ca2+ (Scardovi, 1984). Diverses espèces et souches de bifidobactéries de propriétés fonctionnelles différentes peuvent coloniser simultanément l’intestin de homme (Matto et al., 2004). 20 Les bifidobactéries sont des bactéries Gram-positives, immobiles, non sporulées, non productrices de gaz, anaérobies (sauf quelques espèces pouvant tolérer l’oxygène), catalasenégatives (excepté B. indicum et B. asteroides) et saccharolytiques. Leurs niches écologiques sont: l’intestin de l’homme, la cavité buccale, le tractus gastro-intestinal de l’animal, l’intestin de l’insecte et les eaux résiduaires (Ventura et al., 2004). La température de croissance des bifidobactéries isolées de l’humain ou des animaux varie respectivement de 36° à 38 °C et de 41° C à 43 °C (Dong et al., 2000). Les souches de bifidobactérie identifiées chez l’humain sont entre autres : B. catenulatum, B. adolescentis, B. longum, B. infantis, B. breve…(Scardovi 1984; Lauer & Kandler, 1983). Tandis que le groupe de bifidobactéries d’origine animale comprend principalement: B. suis, B. thermophilum, B. animalis, B. pseudolongum… (Matteuzzi et al., 1971; Mitsuoka,1969; Scardovi & Trovatelli, 1974; Simpson et al., 2003). La variation de la distribution des bifidobactéries dans le tractus gastro-intestinal de l’homme selon l’âge est indiquée dans le Tableau 1.4. Tableau 1.4. Distribution des différentes espèces de Bifidobacterium dans le tractus digestif de l’homme en fonction de l’âge (Ballongne, 1993). Population Jeunes enfants nourris au sein Espèces mineures Jeunes enfants nourris au biberon Enfants et adolescents B. bifidum biovar.b Adultes Personnes âgées B. bifidum biovar.a Espèces majeures B. longum B. infantis B. breve B. adolescentis B. infantis B. breve B. bifidum biovar.b B. longum B. adolescentis biovar.a et b B. adolescentis biovar.b B. longum Du point de vue physiologique, les bifidobactéries se caractérisent par leur activité enzymatique leur permettant d’utiliser de nombreux sucres, comme le lactose, le galactose, 21 le raffinose, le sucrose, l’amylopectine, l’amylose, le xylan, etc (Scardovi, 1984) et de produire de l’acide lactique et de l’acide acétique (Gibson & Wang 1994; Yildirim & Johnson 1998). Les bifidobactéries se distinguent des lactobacilles principalement par la production d’une enzyme caractéristique: fructose 6-phosphate phosphocétolase impliquée dans la voie métabolique de D-fructose-6-phosphate (DeVries et Stouthamer, 1967). Cette enzyme caractérise essentiellement les bifidobactéries provenant de l’humain, alors que les bifidobactéries isolées des animaux se distinguent par le duo de substrat : xylulose-5phospate/fructose-6-phosphate phosphocétolase (Meile et al. 2001). Une autre enzyme clé intervenant dans la fermentation des sucres a été identifiée chez les bifidobactéries, il s’agit de la β-galactosidase qui catalyse les réactions d’hydrolyse et de transgalactosylation (Zarate et al., 1990; Hughes & Hoover, 1995; Tannock et al., 2004). Les méthodes classiques d’identification des bifidobactéries basées sur les propriétés phénotypiques et biochimiques (morphologie cellulaire, fermentation des sucres…) n’ont pas permis d’établir une classification définitive de ces bactéries, à cause des ambiguïtés observées dans les résultats d’analyse. La mise au point de nouvelles techniques basées sur la biologie moléculaire a permis de déterminer une unité phylogénétique cohérente au sein des membres du genre Bifidobacterium. Par exemple, le séquençage du gène de l’ARN ribosomal (rRNA), principalement le gène de 16S rRNA, permet une identification précise de nombreuses espèces appartenant au genre Bifidobacterium. Ce séquençage indique une similitude (identité) de plus 93 % pour les séquences de 16S rDNA (Miyake et al. 1998; Ventura et al., 2004, Masco et al., 2004). Cependant, en comparant le genre Bifidobacterium avec les autres genres bactériens sur la base de pourcentage de G+C (Guanine+Cytosine) indiquant le contenu en base de l’ADN bactérien, il est difficile de distinguer entre les genres Gardnerella et Bifidobacterium (Scardovi, 1984). 1.2.4 Propriétés et critères de sélection des probiotiques Les probiotiques présentent des propriétés qui sont variables selon l’espèce ou la souche microbienne. Le choix des probiotiques dépend de ces propriétés et du type 22 d’utilisation. Selon le rapport de la FAO/WHO (2002), pour qu’un produit soit reconnu comme étant probiotique, une évaluation du produit basée sur plusieurs critères doit être effectuée suivant les recommandations suivantes : a) Désignation du Genre/Espèce/Souche : il est nécessaire de connaître le genre et l’espèce de la souche utilisée, car les effets probiotiques sont spécifiques à la souche microbienne. Le probiotique doit porter un nom reconnu scientifiquement et son identification doit être effectuée à l’aide de méthodes récentes et valides combinant les tests phénotypiques et génotypiques. b) Dépistage des probiotiques potentiels par des tests in vitro : les tests in vitro sont réalisés afin de déterminer les mécanismes par lesquels les microorganismes probiotiques exercent leurs effets bénéfiques. Il est recommandé d’utiliser des tests spécifiques à la cible et appropriés pouvant corréler avec les résultats des essais in vivo. Les principaux tests in vitro réalisés pour étudier les probiotiques sont : - Résistance à l’acidité gastrique - Résistance aux acides biliaires - Adhérence au mucus et/ou cellules épithéliales humaines - Activité antimicrobienne contre les bactéries potentiellement pathogènes - Capacité de réduire l’adhésion des pathogènes aux surfaces - Activité de l’hydrolase sur les sels biliaires (dissociation des sels biliaires) - Résistance aux spermicides ( application vaginale des probiotiques) c) Innocuité de souches probiotiques : les probiotiques utilisés dans les produits alimentaires sont des microorganismes appartenant à la flore normale intestinale. Cependant, l’innocuité de la souche microbienne doit être prouvée avant toute utilisation du probiotique dans l’aliment. Les bifidobactéries ne présentent aucun risque d’infection chez l’homme. En théorie, des effets secondaires peuvent être associés à la consommation de produits contenant certaines souches probiotiques. Ces effets secondaires se résument-en : - Infections systémiques - Activités métaboliques délétères 23 - Stimulation immunitaire excessive chez des personnes sensibles - Transfert de gènes entre les espèces bactériennes probiotiques et celles de la flore intestinale. d) Études in vivo sur des animaux et humains : afin de confirmer ou valider les résultats des tests in vitro, il serait nécessaire de réaliser des essais in vivo sur des animaux de laboratoire ou, de préférence, sur des sujets humains dans des conditions expérimentales appropriées. En général, une méthode standard d’évaluation clinique des probiotiques comprend les phases suivantes: - Phase 1 : consistant à évaluer l’innocuité de la souche probiotique. - Phase 2 : permet d’étudier l’efficacité d’un probiotique par comparaison à un placebo. - Phase 3 : permet de comparer des probiotiques avec un traitement standard (condition spécifique). - Phase 4 : consisterait à surveiller l’utilisation du probiotique (effets produits). e) Allégations-santé et marque du produit : la mention d’allégations-santé générales est actuellement autorisée sur les produits contenant des probiotiques dans certains pays comme les Etats-Unis, Angleterre, etc. Il est cependant recommandé de mentionner sur les produits les allégations spécifiques lorsque des données scientifiques sont disponibles. Par exemple, mentionner « réduit l’incidence et la sévérité des diarrhées à rotavirus chez les enfants » au lieu de «améliore la santé de l’intestin ». La marque (étiquette) doit porter : Genre/espèce/souche, nombre minimal de cellules viables, allégation santé, conditions de stockage, etc. En plus de l’innocuité et des propriétés fonctionnelles, des critères technologiques sont également pris en considération dans la sélection des souches probiotiques. Selon Saarela et al. (2000), ces critères sont : - Bonnes propriétés sensorielles - Résistance aux phages - Viabilité durant le traitement technologique 24 - Stabilité dans le produit et durant le stockage. L’ensemble des propriétés et critères de sélection des probiotiques est présenté dans la Figure 1.4. Origine humaine Effets sur la santé; maintien de la viabilité; applicabilité aux aliments Stabilité (acides, bile) Survie dans l’intestin Adhésion à l’intestin humain Exclusion compétitive des pathogènes, stimulation des cellules immunitaires Colonisation de l’humain Multiplication dans le tractus intestinal au moins temporairement, modulation immunitaire Production de substances antimicrobiennes Inactivation des pathogènes dans l’intestin, normalisation de la flore intestinale Antagonisme contre les bactéries pathogènes Prévention de: adhésion de pathogènes et affaiblissement dentaire Absence de risques dans les aliments et aspect clinique documenté Identification précise des souches (genre, espèce et souche) Effets sur la santé documentés et cliniquement validés Données sur la dose effective minimale dans différents produits Traitement, durée de conservation, stabilité Toutes les propriétés ci-dessus (adhésion, effets antimicrobiens…) devraient être maintenues durant le traitement et le stockage Figure 1.4. Propriétés et critères de sélection des probiotiques. Adapté de Salminen et al. (1998). 25 Toutefois, le critère de viabilité ou de survie demeure essentiel dans la sélection des probiotiques. La capacité de survie des probiotiques dans l’hôte après leur ingestion, dépend de leur résistance intrinsèque, des facteurs de l’hôte et du véhicule par lequel ont été ingérés (Marteau et al., 2003). Parmi les facteurs de l’hôte qui réduisent la survie des probiotiques, on cite principalement l’acide gastrique, l’oxygène, le potentiel redox, les sels biliaires, les autres secrétions digestives (mucus, défensines) et l’interaction avec la flore endogène (Blehaut et al., 1989 ; Marteau & Vesa, 1998; Godward et al., 2000 ). Compte tenu des tous ces facteurs, il est donc recommandé de consommer les probiotiques à des doses appropriées pour obtenir les effets bénéfiques escomptés. Contrairement au Lactobacillus acidophilus, les souches de Bifidobacterium utilisées commercialement ne survivent pas au pH gastrique ni à l’acidité de l’aliment durant le stockage (Trindade, 2000). Pour augmenter leur taux de survie, les probiotiques doivent être ingérés pendant le repas, ou bien protégés dans des capsules ou par microencapsulation (Kailasapathy, 2002). Le choix des vecteurs dans lesquels ou par lesquels sont ingérés les probiotiques est aussi important. Par exemple, Saxelin et al. (1995) ont rapporté que le taux de survie de Lactobacillus strain GG est variable lorsqu’il est ingéré dans les tablettes, les capsules de gélatine, les laits fermentés ou les boissons à base de lactosérum. 1.3 Les probiotiques et le système immunitaire Parmi les allégations-santé attribuées aux probiotiques, la modulation de la fonction immunitaire suscite actuellement une attention particulière à cause du lien établi entre l’altération de la flore microbienne de l’hôte et les maladies auto-immunes et l’émergence des maladies atopiques et des allergies dans les sociétés occidentales. Il semblerait que les probiotiques jouent un rôle crucial dans la prévention et la thérapie de ces maladies en assurant la maturation du système immunitaire chez l’enfant et la modulation de la réponse immunitaire à l’âge adulte. 26 1.3.1 Le système immunitaire de l’hôte 1.3.1.1 Description générale L’organisme humain ou animal met en œuvre divers mécanismes de défense pour se protéger contre l’invasion massive des microorganismes ou matières étrangères. La nature de la réponse de l’organisme dépend du type de particules étrangères (virus, bactéries, parasites, champignons, pollen…) et de la voie d'entrée (peau, poumons, épithélium…). Le système immunitaire répond par deux types de mécanismes : l’immunité non spécifique (ou naturelle ou innée) et l’immunité spécifique (ou acquise ou adaptative) impliquant des facteurs cellulaires et humoraux qui régulent la réponse à l’antigène. Les cellules du système immunitaire inné permettent l’initiation de la réponse immunitaire de l’hôte et l’orientation du système immunitaire adaptatif. Les cellules qui méditent l’immunité sont représentées par les lymphocytes et les cellules accessoires tels que les macrophages, les cellules présentatrices d’antigène, et dans certains cas les cellules épithéliales. Les lymphocytes se trouvent dans le système lymphoïde constitué d’organes primaires (le thymus et la moelle osseuse) et secondaires (rate, les ganglions lymphoïdes…). La rate produit une réponse contre les antigènes venant du sang, alors que les nodules lymphoïdes agissent contre les antigènes provenant de la lymphe. Les antigènes sont principalement absorbés via la peau ou les muqueuses. Le tissu lymphoïde associé à la muqueuse (ex. : les plaques de Peyer, le tissu lymphoïde urogénital), répond aux antigènes franchissant la barrière mucosale (Erickson & Hubbard, 2001). La réponse du système immunitaire implique trois processus: reconnaissance de la particule étrangère, sa destruction et enfin la régulation de la réponse immunitaire à l’aide de cellules spécialisées et médiateurs (cytokines). La réponse immunitaire non spécifique est réalisée par les phagocytes (monocytes/ macrophages et les neutrophiles) qui reconnaissent, neutralisent et détruisent les microorganismes pathogènes. Alors que la réponse spécifique est produite par les lymphocytes B sécrétant des anticorps et les lymphocytes T produisant des cytokines. 27 1.3.1.2 Les cellules du système immunitaire : les lymphocytes T et B Les lymphocytes T et B sont des cellules immunitaires dont la maturation se produit dans le thymus et la moelle osseuse respectivement. Ils représentent les cellules effectrices de l'immunité spécifique, leur immunocompétence dépend de leur capacité à synthétiser un récepteur membranaire reconnaissant spécifiquement un antigène. Ils sont impliqués dans la réponse à médiation cellulaire et la réponse humorale (production d’anticorps) respectivement. Les lymphocytes T se différencient en lymphocytes T auxiliaires (CD4+) ou Th qui jouent un rôle pivot dans l’immunomodulation, ou en lymphocytes T cytotoxiques (CD8+) ou Tc détruisant les cellules infectées. Les cellules Th se subdivisent en duex groupes, les Th1 et les Th2. Les cellules Th1 dirigent l’immunité cellulaire qui permet d’éliminer les pathogènes intracellulaires (ex.: virus) et les cellules cancéreuses, et de prévenir les réactions d’hypersensibilité de la peau (Pulendran, 2004). Tandis que les cellules Th2 dirigent l’immunité humorale permettant la destruction des organismes extracellulaires grâce aux anticorps sécrétés. L’équilibre entre les deux sous populations de lymphocytes T permet de maintenir une homéostasie fonctionnelle générant une réponse immunitaire appropriée (Kidd, 2003). D’autres sous populations de lymphocytes T, appelées cellules T régulatrices (CD4+CD25+), comme Tr et Th3, ont été récemment décrites (Allez & Mayer, 2004; van Amelsfort et al., 2004; Rook & Brunet, 2005). Les Tr se distinguent des cellules Th1 et Th2 par leur phénotype, leur fonction immunosuppressive et leurs profils en cytokines. Elles jouent un rôle dans le maintien de la tolérance et peuvent être induites contre les antigènes bactériens, viraux et parasitaires. Elles peuvent également prévenir les immunopathologies induites par les infections ou l’effet de la persistance prolongée du pathogène par suppression de la réponse de type Th1 (McGuirk & Mills, 2002). La Figure 1.5 illustre l’organisation fonctionnelle tripolaire des cellules Th1, Th2 et Tr. Les cellues Th1 sont impliquées dans l’immunité à médiation cellulaire, alors que les cellules Th2 assurent l’immunité à médiation humorale. La réponse immunitaire produite par les deux types de 28 cellules est régulée par les cellules Tr qui maintiennent une homéostasie immunitaire. Si l’équilibre entre les cellules Th1 et Th2 est rompu, ces cellules produiront selon leur dominance des réponses immunitaires anormales se traduisant par des maladies autoimmunes ( type Th1) ou allergies (type Th2). Tr Immunité à médiation cellulaire Th1 Th2 Immunité à médiation humorale Homéostasie immunitaire Th2 Th1 Th1 Th2 Auto-immunité Réponses anormales Allergie Figure 1.5. Organisation fonctionnelle tripolaire des cellules T helper et équilibre Th1/Th2. Adapté et modifié de Bot et al. (2004). Les lymphocytes T et B montrent une parfaite collaboration dans leur fonction. Les lymphocytes T sont activés grâce aux cellules présentatrices de l’antigène ou CPA (les 29 cellules dendritiques, les cellules B et les monocytes/macrophages). Les lymphocytes B sont ensuite activés à leur tour par les lymphocytes T pour se différencier en plasmocytes et produire des anticorps (Hodgkin et al., 1998). Les lymphocytes T reconnaissent des antigènes sous forme de peptides liés au complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) des CPA. Les cellules Th reconnaissent seulement les peptides (ex. peptides d’origine bactérienne) liés aux molécules du CMH classe II alors que les lymphocytes T cytotoxiques identifient uniquement les peptides (ex. peptides d’origine virale) liés aux molécules du CMH classe I (Chamberlain, 2002). Par contre, les lymphocytes B reconnaissent différents types d’antigènes comme les protéines, les acides nucléiques, les polysaccharides, certains lipides et des haptènes (petites molécules organiques) grâce à des récepteurs liés à la surface cellulaire. Après la destruction de l’antigène, la réponse immunitaire diminue alors que les lymphocytes B mémoires persistent pour répondre rapidement au même antigène lors d’une éventuelle réintroduction dans l’organisme (McHeyzer-Williams & McHeyzer-Williams, 2005). Lors d’une infection, des molécules dérivant des pathogènes se fixent aux cellules présentatrices de l’antigène (ex. cellules dendritiques) en stimulant leur maturation et dirigeant la différentiation des lymphocytes T en Th1 et Th2. D’autres molécules activent les CPA dirigeant l’induction des lymphocytes régulateurs (Tr). Le rôle des lymphocytes Th dans la réponse immunitaire est illustré dans la Figure 1.6. Lorsque le lymphocyte Th est stimulé, il secrète dans le milieu des cytokines (médiateurs) qui vont activer d’autres cellules comme les lymphocytes B impliqués dans réponse de type humorale, et les lymphocytes cytotoxiques, les macrophages, les cellules tueuses, etc qui interviennent dans la réponse de type cellulaire. Les macrophages activés sont également capables de produire des cytokines interagissant avec d’autres cellules immunitaires (les cellules tueuses et granulocytes). Notons toutefois que le développement ou la polarisation des cellules Th1 et Th 2 est influencé par plusieurs facteurs comme le type de CPA (cellules dendritiques, macrophages 30 ou cellules B), l’avidité de l’interaction de TcR (récepteur de Tc) avec l’antigène et des cytokines induites par les cellules Th1 et Th2 (Mosmann & Coffman, 1989; Macatonia et al., 1993). Les cytokines jouent un rôle majeur dans la différentiation des cellules Th et la régulation des réponses immunitaires produites (Swain, 1993; Spellberg & Edwards, 2001). antigène Tr CPAn Th B anticorps cytokines Tc K NK macrophage ADCC granulocyte cytokines Figure 1.6. Description schématique du fonctionnement de l’immunité induite par un antigène détecté. ADCC, cellules cytotoxiques dépendant des anticorps; Tr : Lymphocyte T régulateur; B, Lymphocyte B; Th, Lymphocyte T helper; CPA, cellules présentatrices de l’antigène; Tc, Lymphocyte T cytotoxique; NK : cellules naturelles tueuses; K, cellules tueuses. Schéma tiré de : Roitt I, Brostoff J, Male D. (1998), Immunology (Fifth Edition), Philadelphia: Mosby, et modifié par Kidd (2003). 1.3.1.3 Les cytokines : propriétés et activités Les cytokines sont des médiateurs chimiques assurant la communication entre les cellules et pouvant affecter plusieurs éléments du système immunitaire. Ce sont des molécules de nature glycoprotéique sécrétées en cascade par les cellules immunitaires en 31 réponse à un stimulus, elles méditent et régulent l’immunité, l’inflammation et l’hématopoïèse. Les cytokines agissent rapidement et à de très faibles concentrations sur les cellules cibles en se liant spécifiquement à un récepteur membranaire par lequel un signal (activation de tyrosine kinase) est transmis à la cellule pour induire l’expression d’un gène (Townsend & McKenzie, 2000; Ollier, 2004). Les cytokines comprennent les lymphokines (lymphocytes), monokines (monocytes), chémokine (substances chimiotactiques), interleukine (produite par un leucocyte et agit sur un autre). Une cytokine peut agir sur la cellule la sécrétant (action autocrine), les cellules avoisinantes (action paracrine), ou les cellules distantes (action endocrine). Le type de cytokine produite est variable selon la sous-population de lymphocytes Th stimulée. Les cellules effectrices (Th1 ou Th2) produisent des cytokines soit « pro-inflammatoires » (ex. IFN-γ), soit « anti-inflmmatoires » (ex. IL-10). Par contre, les cellules régulatrices (Th3 ou Tr1) secètent des cytokines (ex. TGF-β) qui inhibent l’une ou l’autre des réponses générées par les cellules effectrices (Monteleone et al., 2002). Les effets exercés par les cytokines peuvent être synergiques ou antagonistes. En général, les cytokines stimulent la prolifération et la différentiation des cellules immunitaires. Parmi elles, on cite l’IL-1 qui active les cellules T; l’IL-2 qui stimule la prolifération des cellules T et B; l’IL-4, l’IL-5 et l’IL-6 stimulant la prolifération et la différentiation des cellules B; l’IL-3, l’IL-7 et le GM-CSF (Granulocyte Monocyte ColonyStimulating Factor) qui stimulent l’hématopoïèse (Townsend & McKenzie, 2000; Pyo et al., 2003). Le profil de cytokines des populations de lymphocytes T impliquées dans la réponse immunitaire induite par une denrée alimentaire au niveau de la muqueuse intestinale est indiqué dans le Tableau 1.5. Selon ce tableau, Th1 produit IFN-γ mais pas de IL-4 et IL-10. Par contre, Th2 secrète IL-4 mais pas de L’IFN-γ. Cependant, IL-10 est produite par les cellules Th2 et Tr, tandis que TGF-β est secreté essentiellement par les cellules régulatrices. 32 Tableau 1.5. Réponses immunes vis-à-vis d’une denrée alimentaire au niveau de la muqueuse intestinale. Adapté de Kaminogawa (1996). Sous-classes de lymphocytes TCD4+ Profils de cytokines Th1 Th2 Th3 Tr1 IFN-γ IL-4 TGF-β IL-10 Facteurs de différentiation ++++ +/IL-2 ++++ +/++ IL-4 +/+/++++ +/TGF-β + ++ ++++ IL-10 Commutation isotopique IgG2a IgG1/ Ig E IgA IgG4? Suppression Th2 Th1 Th1/ Th2 Th1/ Th2 L’IFN-γ joue un rôle multiple, il induit la production de CMH de classe I et II; augmente l’activité antimicrobienne et antitumorale des monocytes/macrophages, neutrophiles et cellules NK; stimule la synthèse et l’adhésion de facteurs sur les cellules endothéliales et les leucocytes pour la diapédèse; augmente ou inhibe l’activité d’autres cytokines; inhibe la production et l’activité de cellules Th2; exerce une faible activité antivirale (Kawai et al., 1999; Hokeness et al., 2005). L’IL-10, produite par les lymphocytes T et B, est une cytokine multifonctionnelle qui régule la fonction de plusieurs cellules immunocompétentes, telles que les lymphocytes T, lymphocytes B, les cellules NK, les monocytes/macrophages et les neutrophiles. L’IL-10 exerce un effet antagoniste sur l’IFN-γ. En outre, comme le montre la Figure 1.7, l’IL-10 joue un rôle important dans l’inhibition des réactions allergiques en diminuant l’activation des mastocytes dépendant de IgE, la survie et l’activation des éosinophiles, etc (Till et al., 2004). 33 Mastocytes Eosinophile ↓ Expression de FcεRI ↓ Activation des mastocytes dépendant de IgE ↓ Survie et activation des éosinophiles CD4+CD25+ Tr B IgG4 ↓ Présentation d’antigène dépendant de IgE IL-10 Th2 (et contact cellulaire?) ↓ Cytokines et prolifération Figure 1.7. Les propriétés anti-allergiques potentielles de IL-10. Adapté de Till et al. (2004) Le TGF-β, produite par les lymphocytes Th3 ou Tr, a une fonction immunomodulatrice, elle est impliquée dans le mécanisme moléculaire de suppression de l’action cytotoxique des lymphocytes Tc (CD8+) (Chen et al., 2004). Cette cytokine joue aussi un rôle dans la régulation de l’immunité dans les muqueuses et la stimulation des la sécrétion de IgA par les lymphocytes B (Spellberg & Edwards, 2001). 1.3.1.4 Les anticorps: propriétés, production et activités Les anticorps ou immunoglobulines (IgG), sont des glycoprotéines qui sont produites par les lymphocytes B en réponse à une substance immunogène. Chaque anticorps se lie spécifiquement à un déterminant antigénique (fragment d’antigène ou épitope). Les immunoglobulines, en forme de Y, sont constituées de deux chaînes légères et deux chaînes lourdes, présentant des ponts di-sulfure inter et intra-chaînes. Elles montrent une région variable (Fab, fragment antibody) portant le site de fixation à l’antigène et lui 34 conférant sa spécificité, et une autre région dite région constante qui détermine le mécanisme utilisé par l’anticorps pour détruire l’antigène (Carlisle et al., 1991). Selon la séquence en acides aminés de la région constante des chaînes lourdes et la fonction immunitaire, on distingue plusieurs classes (IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) et sousclasses (IG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, IgA2) d’anticorps. Par contre, la différence entre les séquences en acides aminés de la région constante des chaînes courtes permet de distinguer deux types d’Ig (Ig à chaîne légère Kappa ou Lamda) et des sous-types (Lamda1, Lamda2, Lamda3, Lamda4). La région hyper variable des IgG permet la reconnaissance de l’antigène, alors que leur partie commune permet de fixer le complément (protéines du sérum) qui est activé pour lyser l’antigène, de lier l’anticorps aux cellules (phagocytes et tueuses), et de traverser l’épithélium. La production des anticorps par les cellules B dépend des cytokines sécrétées par les lymphocytes T. La biosynthèse des IgG2a est favorisée par les cytokines sécrétées par les cellules de type Th1, tandis que la production de IgE et IgA est induite par les cytokines issues des cellules de type Th2 (Kaminogawa, 1996). Les anticorps IgG ont une grande demi-vie et sont plus abondants dans le sérum humain où ils représentent plus de 85 % des anticorps totaux (Bienvenu et al., 1996). IgA est sécrété principalement au niveau des muqueuses, alors que sa production dans le sang est réduite (7 % - 15 % des anticorps totaux). Par contre, IgM, IgD et IgE sont faiblement synthétisés (Kerr, 1990; Metzger, 1970). Il faut rappeler qu’une forte synthèse de IgE engendre des réactions allergiques par sensibilisation et activation des mastocytes qui libèrent des médiateurs inflammatoires (histamine et sérotonine…). Lors d’une réponse humorale divers types d’anticorps peuvent être sécrétés et exercer différentes activités biologiques dans l’organisme telles qu’illustrées dans la Figure 1.8. Toutefois, il faut mentionner que certaines effets comme la neutralisation des virus et toxines et la génération d’oxydants sont indépendants des autres composants du système immunitaire, alors que d’autres activités comme la cytotoxicité cellulaire dépendant des anticorps et l’opsonization dépendant des cellules et des médiateurs de l’hôte (Casadevall et al., 2004). 35 Génération d’oxydants Réduction des dommages de l’hôte dus à la réponse inflammatoire Immunomodulation Régions variables Chaîne courte Chaîne lourde Opsonization Régions constantes Activation du complément Activité antimicrobienne directe Cytotoxicité cellulaire dépendant des anticorps Neutralisation des virus et toxines Figure 1.8. Les différents effets biologiques des anticorps. Adapté de Casadevall et al. (2004). 1.3.1.5 Le système immunitaire de la muqueuse intestinale La muqueuse intestinale est le centre immunologique du corps, elle héberge 80 % de la population des leucocytes du corps. Ces leucocytes sont indispensables pour l’homéostasie du corps avec l’immense population bactérienne de l’intestin. La dérégulation de cette homéostasie entraîne de nombreux désordres, notamment les maladies de l’inflammation de l’intestin comme la colite ulcéreuse et la maladie de Crohn (Schiffrin & Blum, 2002 ; Velazquez et al., 2004). En effet, le maintien de l’intégrité de l’intestin et de sa fonction digestive dépend en partie de la capacité du système immunitaire de sa muqueuse à faire la distinction entre les antigènes offensifs et inoffensifs et de produire une réponse appropriée: une immunité 36 active ou une tolérance (Brandzaeg, 1996). Le système immunitaire de la muqueuse intestinale, à l’instar des autres muqueuses, est doté de deux armes de défense contre les antigènes ou agents pathogènes (Brandzaeg, 2002): a) exclusion de l’antigène à l’aide d’anticorps sécrétoires IgA et IgM en modulant ou inhibant la colonisation de l’hôte par les microorganismes et la pénétration d’antigènes solubles dangereux; b) mécanismes de suppression de la réponse afin d’éviter une réaction locale ou périphérique excessive (hypersensibilité) contre des substances inoffensives atteignant la surface de la muqueuse. La suppression de la réponse induite par des antigènes alimentaires via l’intestin est désignée sous le nom de ‘’tolérance orale’’. Du point de vue anatomique, le système lymphoide de l’intestin comprend les plaques de Peyer ou des follicules isolés, le Lamina propria enrichi en cellules plasmatiques (cellules dendritiques…), les ganglions lymphatiques mésentériques et les plaques cryptiques. Ces compartiments constituent les sites d’induction et effecteurs de l’immunité intestinale. La Figure 1.9 montre une description schématique générale du système immunitaire de l’intestin. Les voies d’entrée de l’antigène au niveau intestinal sont: les cellules épithéliales intestinales (jonctions); via interaction des cellules dendritiques de Lamina propria et cellules épithéliales; les cellules M (Spahn & Kucharzik, 2004). Selon Monteleone et al. (2002), la distribution phénotypique des cellules T CD4+ et CD8+ est similaire à celle des lymphocytes du sang périphérique avec la prédominance des cellules CD4+ et αβTcR+. Les lymphocytes B sont très abondants dans la muqueuse intestinale, particulièrement dans les follicules isolés et les plaques de Peyer, et médient la première réponse immunitaire de type humorale protégeant l’organisme des pathogènes entériques ou autres organisme infectieux. Une des propriétés remarquables des lymphocytes B est la maturation des cellules B productrices d’IgM en cellules productrices de IgA. 37 A Cellules épithéliales intestinales Cellules dendritiques Lymphocytes intraépithéliaux Lymphocytes de Lamina propria B Plaques cryptiques Lumière intestinale Cellules M Plaques de Payer C Dogme Vaisseau lymphatiques Aire des cellules T Lamina propria Follicules lymphoïdes isolés Follicules de cellules B Nodules lymphatiques mésentériques Plaques cryptiques Figure 1.9. Description schématique générale du système immunitaire associé à la muqueuse intestinale. A, B et C : voies d’entrée de l’antigène: (A), les cellules épithéliales intestinales ; (B) interaction des cellules dendritiques et cellules épithéliales; (C) cellules M. Flèches : sens de drainage lymphatique des plaques de Peyer et de Lamina propria des villosités (vers les nodules lymphatiques mésentériques). Adapté de Spahn & Kucharzik (2004). En outre, une hypothèse récente suggère que les lymphocytes B jouent un role clé dans la régulation de l’homéostasie immunitaire intestinale et la prévention des maladies de l’inflammation de l’intestin. Leur rôle immunorégulateur consisterait à activer les cellules tueuses (NK) et favoriser la migration des cellules régulatrices CD4+CD8+ au site effecteur. Cependant, le rôle des cellules NK ou CD4+CD8+ dans la production de IL-10 demeure moins clair (Velazquez et al., 2004). 38 1.3.1.6 Les sources de variation de la fonction immunitaire La fonction immunitaire varie d’un individu à un autre et elle est influencée par plusieurs facteurs comme les infections, l’alimentation, le stress, l’âge, facteur génétique, etc. L’un des facteurs majeurs est le polymorphisme génétique qui régule l’expression des cytokines et de leurs récepteurs, des molécules d’adhésion, etc. L’influence de ces facteurs sur le fonctionnement du système immunitaire pourrait entraîner une perte d’homéostasie et par conséquent des pathologies immunologiques chez l’homme, d`où alors la nécessité de rechercher des alternatives adéquates pour son rétablissement et sa régulation (Calder & Samantha, 2002). La Figure 1.10 indique les facteurs responsables de la variation de la fonction immunitaire. Événements antérieurs (la vie) État nutritionnel Facteur génétique Genre Fonction immunitaire Age Statut hormonal Historique de Exposition aux vaccination pathogènes (infection) - Présence; Histoire Obésité ? Consommation d’alcool Tabagisme Exercices - Aigu - Chronique Stress - Environnemental - Physiologique - Psychologique Figure 1.10. Les sources de variation de la fonction immunitaire. Adapté de Calder & Samantha (2002). 39 1.3.2 La modulation de la réponse immunitaire 1.3.2.1 Principe de l’immunomodulation Une réponse immunitaire est caractérisée par (a) sa magnitude déterminée par l’équilibre entre l’activation des lymphocytes et la tolérance induite par un antigène, (b) sa nature déterminée par la spécificité et la fonction des lymphocytes activés par l’antigène et (c) les mécanismes de régulation (reconnaissance, activation et phase effective). En théorie, la régulation immunitaire se traduit par une homéostasie entre l’activité des cellules Th1 et celle des cellules Th2 qui jouent un rôle central dans le mécanisme de régulation immunitaire. Elle représente un processus complexe et dynamique impliquant des facteurs cellulaires et moléculaires permettant d’éviter les réponses indésirables ou excessives du système immunitaire à des substances à caractère immunogène. Une substance immunogène est capable de stimuler la réponse immunitaire humorale, à médiation cellulaire, ou les deux à la fois (Chamberlain, 2002). La population de Th1 produit des IFN-γ et confère une protection contre les pathogènes intracellulaires (virus et certaines bactéries) par recrutement et activation des macrophages (la phagocytose) (Kawakami, 2003). Tandis que les cellules Th2 sécrètent IL4, IL-5 et sont plus impliquées dans l’immunité humorale par activation et différenciation des cellules B, et particulièrement dans la production des anticorps IgE et IgA. Elles participent aussi au recrutement des éosinophiles, des mastocytes et confèrent une protection contre une infection parasitaire. Une inhibition croisée entre les cellules Th1 et Th2 induite par IFN-γ et IL-10 respectivement permet de maintenir un équilibre entre les Th1 et Th2 (Kidd, 2003). 1.3.2.2 Polarisation Th1/Th2 Lorsque les cellules T naïves entrent en contact direct avec les CPA, elles sont activées et se différencient en cellules matures de type Th1 ou Th2. Ce processus de différenciation cellulaire, réalisé grâce aux cytokines principalement, est appelé « Polarisation Th1/Th2 ». Selon Romagnani (2004), les cellules Th1 et Th2 ne sont pas deux 40 sous-populations de cellules T CD4+ distinctes, mais elles représentent tout simplement les formes polarisées de la réponse immunitaire très hétérogène médiée par les cellules T CD4+. Le phénomène de polarisation des cellules Th est régulé par plusieurs facteurs comme le répertoire lymphocytaire (diversité des lymphocytes), les cytokines du milieu, la dose et la voie d’administration de l’antigène, le type de cellules présentatrices de l’antigène, etc. Les cytokines du milieu et leurs récepteurs cellulaires jouent un rôle essentiel dans l’induction de la polarisation des cellules T actives (Comerford & Nibbs, 2005). En effet, les cellules T actives migrent vers le site d’infection et se polarisent selon le type de cytokines produites dans le milieu, soit en Th1 en présence de l’IL-12, soit en Th2 en présence de l’IL-4 (Spellberg & Edwards, 2001, Brandtzaeg, 2002, Sun et al., 2005). La polarisation des réponses Th1/Th2 est décrite schématiquement dans la Figure 1.11. Immunité à médiation cellulaire Production d’anticorps Facteurs microbiens Production d’anticorps Hyperproduction d’IgE Activation d’éosinophiles Figure 1.11. Représentation schématique de la polarisation des cellules Th1 et Th2 et de la sécrétion des cytokines. Ag, antigène; MHC II, Molécules du CMH de classe II; TCR, Récepteur cellulaire des cellules T; LPs, lipoprotéines; CpG, motif de nucléotide non méthylé; APC, cellules CPA; LPS, lipopolysaccharides; TLRs, Toll-like receptors; B7.1 et B7.2, molécules de co-stimulation ; CD, Cluster déterminant ( Brandtzaeg, 2002). 41 Récemment, Bote et ses collaborateurs (2004) ont mentionné que l’organisation fonctionnelle de l’immunité médiée par les cellules Th1 (productrices de IFN-γ) et Th2 (productrices de l’IL-4), est plutôt tripolaire que bipolaire, puisqu’une autre souspopulation de cellules Th, les cellules Tr (productrices de l’IL-10 ou TGF-β), sont impliquées dans l’immunité et exercent un contrôle négatif sur les cellules Th1 et Th2. La polarisation Th1/Th2 est nécessaire pour le maintien ou l’altération de l’équilibre entre la réponse à un antigène et la tolérance à un antigène au niveau de la muqueuse intestinale (Markus et al., 2002). Selon Perdigon et al. (2002), l’effet des probiotiques sur l’équilibre Th1/Th2 est dépendant de la souche probiotique utilisée. Les effets induits par les probiotiques sur l’équilibre Th1/Th2 peuvent être déterminés par la réponse systémique après une injection parentérale d’ovalbumine. Par exemple, L. casei, L. delbrueckii ssp. bulgaricus et L. acidophilus augmente la production de IgG1 en modifiant la balance en faveur de Th2, alors que L. acidophilus favorise aussi la production de IgG2a en variant la balance en faveur de Th1. Par contre, S. thermophilus ne montre aucune influence sur l’équilibre Th1/Th2. Toutefois, une polarisation inappropriée des réponses Th1/Th2 se caractérisant par la forte dominance de la réponse de type pro-Th1/anti-Th2 ou de type anti-Th1/pro-Th2, peut conduire respectivement à une auto-immunité (inflammation chronique, arthrite…) ou des allergies (Robinson, 2004). Dans ce cas de figure, des cellules T régulatrices (Tr ou Th3) interviennent pour inhiber les effecteurs cellulaires en produisant des cytokines de type IL10 ou TGF-β qui bloquent Th2 ou Th1 (Kidd, 2003). 1.3.2.3 Les pathologies immunitaires et les stratégies thérapeutiques Chez un individu en santé normale, les lymphocytes Tr maintiennent l’homéostasie et préviennent les réponses immunitaires anormales notamment au niveau intestinal et pulmonaire. Cependant, un déséquilibre entre les lymphocytes régulateurs et les lymphocytes effecteurs apparaissent dans certains cas de maladies. En effet, une expansion des lymphocytes Tr supprime les réponses de type Th1 dans le cas de l’inflammation chronique et du cancer. Par contre, une hyperactivité des lymphocytes Th1 entraîne des 42 pathologies comme les maladies auto-immunes, l’inflammation induite par l’infection et le rejet des greffes. Une réponse anormale de type Th2 peut causer des allergies. Selon Kemp (2000), il existe une corrélation entre l’effet clinique de l’infection et le profil en cytokine de la réponse immunitaire induite par Leishmania, un parasite affectant aussi bien l’homme que la souris. Chez la souris, l’infection engendre une polarisation des cellules Th en cellules Th1 ou Th2 spécifique à l’antigène de Leishmania. Par contre, chez l’homme, en présence de L. donovani, les cellules Th sont polarisées en cellules Th1 et Th2. De même, Ogawara et al.(2005) ont mentionné que le rapport Th1/Th2 a une signification clinique, il varie sensiblement avec l’état de la maladie de myélome. En évaluant l’IFN-γ et de IL-4, ils ont constaté que le rapport Th1/Th2 augmente significativement chez les patients par comparaison au groupe contrôle. Pour remédier à certaines immunopathologies, des stratégies thérapeutiques basées sur la manipulation in vivo des lymphocytes Tr ont été suggérées (McGuirk & Mills, 2002). Ces thérapies sont présentées dans la Figure 1.12. Les approches basées sur l’utilisation des probiotiques ou prébiotiques pourraient constituer une alternative d’immunothérapie possible et sécuritaire ouvrant de nouveaux horizons dans le domaine de la prévention et le traitement des anomalies ou pathologies immunologiques chez les enfants, les personnes âgées, etc (Fooks & Gibson, 2002; Kaur et al., 2002; Calder et al., 2002; Ouwehand et al., 2002; Noverr et al., 2004). 43 Inflammation, rejet de greffe Maladie Th1 Tr Th1 TrTr Tr IFN-γ et TGF-β TGF-β IFN-γ —— —— IL-10 IL-10 et IFN-γ Allergie Cancer, infection chronique (-) Tr IL-4 (+) Résolution Thérapie (+) Th2 IFN-γ —— IL-10 et TGF-β IFN-γ IL-4 —— IL-10 et TGF-β Figure 1.12. Les thérapies possibles basées sur la manipulations des lymphocytes in vivo proposées pour le traitement de certaines maladies immunologiques. (+), expansion; (-) inhibition. Adapté de McGuirk & Mills (2002). 1.3.3 Effets des probiotiques et de leurs composants sur le système immunitaire Selon la littérature, les probiotiques, grâce à leurs composants intra ou extracellulaires actifs, sont capables d’influencer le système immunitaire par contact avec les cellules immunocompétentes, en transmettant des signaux qui modifient la réponse immunitaire de l'organisme-hôte. De nombreuses études ont en effet rapporté que la prolifération des lymphocytes et la production de cytokines par les cellules du système immunitaire peuvent être sensiblement modifiées par l’ingestion de probiotiques. Selon la nature de leurs constituants cellulaires, les probiotiques influencent sélectivement la fonction immunitaire en induisant la réponse humorale, cellulaire ou non spécifique. Les probiotiques ont aussi la propriété de réduire ou supprimer la réponse immunitaire induites par les ingrédients 44 alimentaires en induisant la tolérance orale et prévenant les allergies (Prioult et al., 2003; Tanaka & Ishikawa, 2004). Au niveau de la muqueuse intestinale, les probiotiques et les prébiotiques, comme le montre la Figure 1.13, peuvent influencer directement ou indirectement le système immunitaire via les cellules M actives qui permettent le transfert de l’antigène aux CPA. Leur action peut conduire à la modification de l’équilibre Th1/Th2 en faveur d’une augmentation de lymphocytes B produisant des IgA et d’une réduction concomitante de lymphocytes B sécrétant des IgE responsables des allergies (Ouwehand et al., 2002). Prébiotiques Probiotiques Microflore intestinale CPA Th Th0 IL-2 IL-12 IL-18 IgA Th1 Th2 IL-2 IFN-α IFN-β B Virus IL-4 IL-10 TGF-β B IgE Tumeur Figure 1.13. Action des probiotiques et des prébiotiques sur le système immunitaire de l’intestin. Adapté de Ouwehand et al. (2002). 45 1.3.3.1 Pouvoir immunomodulateur des cellules procaryotes Certaines structures ou composants endo et exocellulaires issus des bactéries lactiques possèdent des propriétés immunogènes. En effet, il a été rapporté que la paroi des bactéries lactiques a un effet adjuvant sur la réponse immunitaire chez la souris et l’homme (Tomasî icâ et al., 2000; Halassy et al., 2003; Wang et al., 2004). La paroi des bactéries lactiques a une structure typique des bactéries Gram-positives caractérisée par une épaisse multicouche de peptidoglycane, décorée avec des protéines, des acides teichoïques, des polysaccharides et entourée, chez certaines espèces, par une couche para cristalline de protéines de la couche S (Delcour et al., 1999). Une description schématique de la paroi des bactéries lactiques est rapportée dans la Figure 1.14. Acide lipoteichoique Polysaccharides neutres Acide teichoique Membrane plasmique Peptidoglycane Couche S (protéines) Figure 1.14. Représentation schématique de la paroi des bactéries Gram-positives (Delcour et al., 1999). Le peptidoglycane, élément majeur de la paroi bactérienne, est un glycopeptide sensible à l’action du lysozyme, enzyme secrétée dans l’intestin par les cellules de Paneth (Peeters et al., 1975). Ce composant est constitué de : glucosamine, acide muramique, Lalanine, acide D-glutamique, lysine, acide D-aspartique et D-alanine (Wallinder et al., 1971). Par ailleurs, des études ont montré que le peptidoglycane, l’acide teichoïque et le 46 contenu cytoplasmique de bactéries lactiques stimulent la production de certaines cytokines (IL-1, IFN-γ, IL-6, TNF-α…), l’activité du macrophage et la prolifération des cellules de plaques de Peyer (Iribe et al., 1981; Yamamoto et al., 1985; Meydani & Ha, 2000; Kankaanpa et al., 2003). L’effet immunomodulateur peut être également induit par les protéines de la couche S de la paroi et d’autres composants intracellulaires (acides nucléiques, peptides, protéines) ou extracellulaires (exopolysaccharides). Selon Grogono-Thomas et al. (2003), les protéines de la couche S de la paroi bactérienne sont de taille variable et hautement antigénique. Elles génèrent une forte production d’anticorps (IgG) chez l’hôte. Des études ont rapporté que des peptides dérivant du processus de biosynthèse des protéines chez la flore normale du colon ont la propriété de générer in vivo une inflammation des muqueuses. Ces peptides sont formylés et à effet chémotactique, ils induisent la migration des cellules inflammatoires dirigées vers leur cible et stimulent leurs fonctions biologiques comme la dégranulation, la production de radicaux d’oxygène, la phagocytose, et la synthèse d’eicosaenoides (ex. leukotriene B4) stimulant la réponse des leucocytes (Chadwick et al., 1988; Nast & LeDuc,1988; Hobson et al., 1990). Selon certaines études, l’ADN bactérien et des oligodeoxynucléotides exprimant des motifs de CpG (deoxycytidylatephosphate-deoxyguanylate) non méthylés induisent la maturation, la différentiation et la prolifération des cellules immunitaires : cellules B, T et NK, les monocytes, les macrophages et les cellules dendritiques (Roman et al., 1997; Sun et al., 1998; Klinman et al., 2004). Jijon et al. (2004) ont souligné que l’ADN produit par les probiotiques ont la propriété d’améliorer la fonction immunitaire et épithéliale chez la souris et l’homme en réduisant les réponses pro-inflammatoires. Une étude similaire menée par Lammers et al. (2003) a démontré que l’ADN génomique de bifidobactéries induit une sécrétion d’une cytokine anti-inflammatoire IL-10 par les cellules mononuclées du sang périphérique humain. Des composants bactériens extracellulaires ont également la propriété de stimuler la réponse immunitaire. Ruiz-Bravo et al. (2001) ont indiqué que des exopolysaccharides 47 produits par le bacille Paenibacillus jamilae CP-7, administré par voie intra péritonéale aux souris Balb/c ont permis de mettre en évidence des effets immunomodulateurs intéressants en améliorant la résistance à Listeria monocytogenes. En outre, ils ont observé une augmentation in vitro de la prolifération lymphocytaire. Tandis que Gonzalez et al. (2003) ont démontré que des polysaccharides capsulaires extraits et purifiés de Porphyromonas gingivalis, utilisés comme antigène pour immuniser des souris, augmentent la production des IgM et IgG dans le sérum par rapport aux souris traitées avec les cellules bactériennes entières. Chabot et al. (2001) ont récemment étudié in vitro les propriétés immunostimulantes des EPS produits par Lactobacillus rhamnosus RW- 9595M en utilisant des splénocytes de souris C57Bl/6 et BALB/c, la lignée macrophagique murine RAW.264.7 et les cellules mononuclées du sang humain. Les indices de stimulation de la prolifération cellulaire obtenus dans cette étude se sont avérés faibles, estimés à moins de 155 % par rapport au contrôle (100%). Néanmoins, la détection de certaines cytokines dans le milieu de culture indique un certain effet mitogène des EPS synthétisés par L. rhamnosus. En résumé, de nombreuses études s’accordent à affirmer que les cellules microbiennes inactivées (non viables), ainsi que leurs composants cellulaires ou produits de sécrétion (métabolites), sont capables de stimuler certains composants du système immunitaire de la même façon que les cellules viables. Cependant, les composants endo et exocellulaires de bifidobactéries impliqués dans l’induction de l’effet immunomodulateur sont très peu documentés. Seuls les effets immunomodulateurs des EPS de L. rhamnosus ont été étudiés. Par contre, les EPS produits par les bifidobactéries pourtant candidates aux probiotiques ne sont pas encore explorés. L’identification des composants cellulaires à pouvoir immunomodulateur issus des bifidobactéries serait donc d’un grand intérêt. 48 1.3.3.2 Mécanismes d’interaction entre les probiotiques (ou procaryotes ) et les cellules immunitaires Le processus de modulation immunitaire est amorcé grâce à l’interaction entre le composé bactérien actif et des récepteurs cellulaires de signal bactérien se trouvant sur les cellules immunitaires. Ces récepteurs sont appelés Toll like receptors (TLR)s. Comme le montre la Figure 1.15, cette interaction génère un signal qui est transmis au noyau de la cellule immunitaire en induisant la transcription du gène codant pour la synthèse des cytokines. Selon Mastrandrea et al. (2004), les bactéries et leurs produits sont capables de stimuler le processus de sécrétion des cytokines par activation des récepteurs cellulaires spécifiques et par conséquent la translocation nucléaire des facteurs de transcription. Les TLRs influencent le développement de la réponse immunitaire adaptative par activation des cellules CPA et jouent un rôle crucial dans l’induction des réponses de type Th1 et Th2 (Dabbagh & Lewis, 2003). Probiotiques (Bactéries lactiques) ADN de L. gasseri Peptidoglycane Ac. teichoique Oligo ADN Membrane cellulaire Signal de transduction Cellule dendritique Production de cytokines Immunostimulation Figure 1.15. Schéma illustrant l’interaction entre les composants bactériens (Lactobacillus grasseri) et la cellule immunitaire. TLR, Toll-like receptor. Adapté de Saito (2004). 49 Environ dix récepteurs de signaux bactériens de nature protéique, ont été répertoriés chez les cellules immunitaires (monocytes, neutrophiles, macrophages) (Medzhitov et al., 1997; Chaudhary et al., 1998; Wang et al., 2003). Par exemple, le TLR2, TLR4 et TLR9 reconnaissent les signaux provenant des composants de la paroi et du cytoplasme de bactéries Gram-positive (Saito, 2004). Cependant, TLR4 reconnaît aussi le signal induit par le composant de la paroi de bactéries Gram-négative (LPS), alors que TLR2 et TLR6 agissent ensemble contre les particules de paroi de bactéries Gram-positives et celles des levures (Takeuchi et al., 2000; Echchannaoui et al., 2002). Ishii et al. (2004) ont rapporté que l’ADN des bactéries contient des motifs CpG interagissant avec le TLR9 des cellules immunitaires en induisant la production de cytokines, de chémokines et d’immunoglobulines. Chez l’humain, l’expression de la protéine TLR2 est prédominante sur les monocytes et neutrophiles, et non sur les cellules T, les cellules B ou cellules NK (Flo et al., 2001). En effet, Hosono et al. (1997) ont démontré qu’un composant polysaccharidique isolé de la membrane cellulaire de Bifidobacterium adolescentis induit une forte prolifération des lymphocytes. De même, Kitazawa et al. (2000) ont souligné qu’un phosphopolysaccharide extracellulaire neutre produit par Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus OLL 1073R-1 stimule la fonction phagocytaire des macrophages in vivo et in vitro. 1.3.4 Les probiotiques et l’immunomodulation : Études in vitro et in vivo Pour mettre en évidence les effets immunomodulateurs des probiotiques tant recherchés dans le cas de la tolérance orale, des allergies et des infections, les études réalisées de nos jours font appel à des méthodes in vitro ou ex vivo (ex. : lignées cellulaires en culture) et / ou in vivo chez l’animal (animaux conventionnels ou axéniques) et rarement chez l’Homme. 1.3.4.1 Probiotiques et tolérance orale Les travaux récents de Prioult et al. (2003) ont mis en évidence l’effet des probiotiques sur l’induction et le maintien de la tolérance orale à la β-lactoglobuline bovine 50 chez la souris conventionnelle. L’effet observé au niveau humoral et cellulaire dépendait de la souche probiotique utilisée. Lactobacillus paracasei s’est avéré plus efficace que Bifidobacterium lactis et L. johnsonii. Kankaanpa et al. (2003) ont mentionné que Lactobacillus GG, Bifidobacterium Bb-12 et L. acidophilus inhibent la prolifération des cellules mononuclées du sang périphérique humain, l’expression des marqueurs cellulaires CD25, CD69 et de HLA-DR (système CMH-Antigène humain) sur les lymphocytes T stimulées avec phytohémagglutinine et la production de IL2 et IL4. Par ailleurs, Ulisse et al. (2001) et Morita et al. (2002) ont démontré que des souches probiotiques appartenant au genre Lactobacillus induisent in vitro et in vivo une production significative de cytokines anti-inflammatoires notamment IL-10. De même, Jijon et ses collaborateurs (2004) ont démontré que l’ADN des bactéries probiotiques réduisent in vitro et in vivo les réponses inflammatoires au niveau de l’épithélium intestinal. Ils ont étudié l’effet de l’ADN issu d’un mélange de 8 souches probiotiques (L. acidophilus MB 443, L. delbrueckii subsp. bulgaricus MB 453, L. casei MB 451, L. plantarum MB 452, B. longum Y10, B. infantis Y1, B. breve Y8 et S. salivarius subsp. thermophilus MB 455), sur des mono couches de cellules épithéliales HT-29, des segments de colon, des splénocytes murins, et des souris déficientes en IL-10 en présence de stimulus pro-inflammatoire. Ils ont observé une réduction de la sécrétion de IL-8 par HT-29, une inhibition des mécanismes pro-inflammatoires (protéine kinase, facteur kappa B) et la sécrétion de IFN-γ dans le colon et par les splénocytes. Une diminution de la production de TNF-α et IFN-γ au niveau de la muqueuse et une amélioration de l’état histologique des souris ont été également constatées 1.3.4.2 Probiotiques et allergies De nombreux travaux de recherches sont actuellement focalisés sur les maladies allergiques à cause de l’augmentation de la prévalence des allergies observée particulièrement dans les pays occidentaux. L’émergence de ces maladies s’explique en partie par l’hypothèse d’hygiène, selon laquelle la présence d’hygiène diminue l’exposition du corps aux agents infectieux en réduisant l’activité du système immunitaire et augmentant les risques d’apparition des désordres allergiques atopiques (Sheikh & 51 Strachan, 2004). Les études rapportées ont démontré l’effet anti-prolifération des souches probiotiques sur les cellules immunitaires impliquées dans les réactions allergiques (dermatite et allergies alimentaires), l’expression des récepteurs et la production de cytokines. En effet, une étude clinique de Mastrandrea et al. (2004) effectuée sur des sujets humains (6 à 48 ans) présentant des symptômes cliniques d’asthme et/ou conjonctivite, rhinite, urticaire, dermatite atopique, allergie alimentaire et le syndrome de l’intestin irrité, a montré les effets positifs des probiotiques dans le traitement des maladies allergiques. Selon cette étude, une administration quotidienne d’un mélange (1 x 109 bactéries vivantes) de Lactobacillus acidophilus, L. delbrueckii et Streptococcus thermophilus permet de réduire significativement le taux de précurseurs circulants de lymphocytes CD34+ impliqués dans l’inflammation allergique systémique. Wang et al (2004) ont rapporté que l’ingestion de lait fermenté contenant Lactobacillus paracasei-33 ( 2 x 109 cfu/pot) pendant 30 jours, permet d’améliorer la qualité de vie chez des patients souffrant d’une rhinite allergique. 1.3.4.3 Probiotiques et infections Des souris Balb/C et des rats Wistar et Brown infectés par Listeria monocytogenes ont montré, après une administration orale de cellules (109 cfu ) de Lactobacillus casei Shirota, une réduction significative de l’infection et une amélioration de la mémoire immunologique de la réponse à médiation cellulaire induite. Les effets observés dépendaient de la dose, de la viabilité et de la durée de supplémentation, mais pas de l’espèce ou de la caractéristique génétique de l’hôte (de Waard et al., 2003). Récemment, Lee et al. (2004) ont étudié in vitro l’activité anti-prolifération des fractions cytoplasmiques de Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus casei et Bifidobacterium longum sur les lignées de cellules tumorales SNUC2A, SNU1, NIH/3T3 et Jurkat. Ils ont constaté que toutes les fractions cytoplasmiques, particulièrement celles de L. casei et B. longum, inhibent la prolifération des cellules tumorales. Ils ont mentionné que 52 les mêmes souches bactériennes administrées à des souris induisent un effet immunomodulateur se traduisant par une augmentation du nombre de cellules T, cellules NK, cellules CMH classe II+ et cellules T CD4−CD8+. Une forte activité antimicrobienne des bifidobactéries contre la souche bactérienne pathogène E. coli O157:H7 a été révélée par une étude Gagnon et al.(2004). Cette étude a démontré que deux souches de bifidobactéries isolées à partir de fecès de nourrissons, B. bifidum RBL 71 et B. bifidum RBL 460, ont une forte capacité d’adhésion aux cellules Caco-2 et permettent de réduire significativement l’adhésion des E. coli à cette lignée cellulaire de colon humain, laissant suggérer une possible protection contre l’infection causée par ce pathogène. Valeur et al. (2004) ont tenté d’établir cliniquement un lien entre la colonisation due aux bactéries probiotiques et la fonction immunitaire au niveau de la muqueuse intestinale. En supplémentant la ration alimentaire de 19 volontaires avec Lactobacillus reuteri ATCC 55730, à raison de 4 x 108 cfu/jour pendant 28 jours, une forte colonisation du tractus gastro-intestinal suivie d’une diminution du nombre d’histiocytes dans la muqueuse gastrique et d’une augmentation significative du nombre de lymphocytes B dans le duodénum et de lymphocytes T CD4+ dans l’épithélium de l’iléon a été observée. Une étude de Shu et al. (2000) a montré que l’administration par voie orale de la souche probiotique Bifidobacterium lactis (HN019) à des souris Balb/c confère une meilleure protection contre l’infection due à Salmonella typhimurium par comparaison aux souris contrôles n’ayant pas ingéré de B. lactis. Selon cette étude, l’ingestion de B. lactis entraîne chez les souris infectées une réduction de la translocation du pathogène aux tissus viscéraux (rate et foie) et une amélioration significative des paramètres immunologiques comme la prolifération des lymphocytes, l’activité macrophagique sanguine et péritonéale, la production des anticorps anti-S. typhimurium. De même, Jain et al. (2004) ont observé chez des patients souffrant d’une septicémie une réduction significatifve de l’incidence des bactéries potentiellement 53 pathogènes suite à l’ingestion pendant une semaine d’un mélange symbiotique contenant Lactobacillus acidophilus La5, Bifidobacterium lactis Bb 12, Streptococcus thermophilus, Lactobacillus bulgaricus et oligofructose. Dans le Tableau 1.6 sont résumées certaines autres études in vitro, ex vivo, in vivo et cliniques rapportées dans la littérature. Les études in-vitro rapportées dans ce tableau démontrent que certaines souches de probiotiques du genre Lactobacillus et Bifidobacterium stimulent l’activité des macrophages et des cellules mononuclées en induisant la sécretion de plusieurs cytokines (TNF-α, IFN-γ, Il-10, etc). Les effets observés mettent donc en évidence l’influenece des probiotiques sur certains composants du sytème immunitaire. Les études ex vivo et in vivo démontrent que l’ingestion de probiotiques (Streptococcus, Lactobacillus, Bifidobacterium) réduit la colonisation du tube digestif par les bactéries pathogènes (ex. Helicobacter pylori) et stimule la réponse immunitaire spécifique en activant les cellules CD4+. Selon les études cliniques rapportées, l’ingestion de probiotiques augmente les capacités de défense de l’hôte en activant les lymphocytes T CD4+, stimulant l’activité anti- tumorale et réduisant les infections comme la colonisation vaginale aux coliformes et levures. Toutefois, les effets observés dans ces études sont variables selon la souche probiotique utilisée. 54 Tableau 1.6. Études in vitro, in vivo et cliniques récentes sur les effets immunomodulateurs des probiotiques. Méthodologie Effets observés Références Etudes in vitro Induction de la sécrétion de cytokines proinflammatoires : IL-12 et TNF-α He et al., 2002 Activation de NF-κB et production de TNF-α: protoplaste > paroi cellulaire >> complexe Matsuguchi peptidoglycane – polysaccharide. Activation de l c- et al., 2003 Jun N-terminal kinase par l’acide lipotéichoique. Lactobacillus plantarum 299 Augmentation de IL-1β, TNF-α et IFN-γ (en Pathmakan testé sur les cellules présence de E. coli pathogène). Augmentation than et al., mononuclées du colon de IL-10 produite par les cellules de colon en 2004 inflammation. Études ex vivo et in vivo Co-culture : macrophages (J774.1) + bifidobactéries : B. adolescentis et B. longum Cellules de Lactobacillus casei testées sur les macrophages RAW264.7 Ingestion (14 jours) par les souris B6C3F1 de : Streptococcus thermophilus, Lactobacillus bulgaricus, L. acidophilus et Bifidobacterium Co-culture: Muqueuse (iléon humain: maladie de Crohn ) + L. casei et L. bulgaricus Absence d’effet sur CD8+ (cellules Tc), B220+ + (cellules B), IgA, ni IgM dans la rate et les plaques de Peyer. Augmentation significative du nombre de cellules CD4+ (Th) Réduction du nombre de cellules CD4+. Inhibition de l’expression de TNF-α par les lymphocytes intra épithéliaux Pestka et al., 2001 Borruel et al., 2002 Co-culture : Cellules de colon Activation de la protéine anti-apoptotique (humain et murin) + Akt/protéine kinase. Inhibition de la protéine pro- Yan & Polk, Lactobacillus rhamnosus GG apoptotique p38/protéine kinase 2002 Ingestion par des souris de Réduction significative du taux de colonisation de L. casei shirota après infection H. pylori dans la muqueuse et diminution de Sgouras et à Helicobacter pylori. l’inflammation de la muqueuse gastrique. al., 2004 Études cliniques Ingestion de L. rhamnosus Augmentation de lymphocytes CD56+ dans le HN001 ou B. lactis HN019. sang. Elévation ex vivo de l’activité anti- Gill et al., 2001 Volontaires âgés (70 ans) tumorale. Administration orale de Lactobacillus rhamnosus subspecies GG à des volontaires sains (5 semaines) Ingestion de L. rhamnosus GR1 et L. fermentum RC-14 par des femmes (60 jours) Activation des lymphocytes T CD4+ Diminution significative de TNF-α , IL-6 et IFN-γ Schultz et al., 2003 Augmentation de IL-10 et IL-4. Réduction de la colonisation vaginale due aux coliformes et levures. Reid et al., 2003 55 1.4 Problématique de recherche et objectifs Selon la littérature, les aliments probiotiques présentent incontestablement un fort potentiel pour prévenir certaines maladies infectieuses et ont des effets positifs sur l'homéostasie du système immunitaire sans induction d'effets négatifs, comme l'allergie ou les réponses auto-immunes. En effet, une amélioration de la protection de l’organisme contre les maladies observée suite à la consommation de produits fermentés laisse suggérer qu’il existe une relation directe entre les probiotiques et les systèmes immunitaires inné et adaptatif qui réagissent d’une manière simultanée et coordonnée. Il apparaît que des composants, des activités enzymatiques ou des produits métaboliques/fermentions issus de bactéries probiotiques peuvent contribuer ou méditer des effets bénéfiques spécifiques sur la fonction immunitaire. Il semblerait que les exopolysacharides produits par certaines bactéries lactiques (probiotiques) exercent un effet stimulant sur la réponse immunitaire. Cependant, les preuves apportées pour soutenir cette affirmation demeurent très fragmentaires et plusieurs questions demeurent encore sans réponse telles que : - Quelles sont, parmi les espèces probiotiques connues, celles capables d’exercer un effet immunomodulateur significatif? - Quels sont les facteurs cellulaires et moléculaires impliqués dans l’interaction entre les probiotiques et les composants du système immunitaire? - Quels sont les mécanismes impliqués dans cet effet immunomodulateur? En outre, l’implantation d’une souche probiotique dans la flore intestinale d’un individu peut se confronter au problème de résistance à la colonisation manifestée par la flore locale, et les conditions gastro-intestinales hostiles (acidité, bile, enzymes…) affectant la survie du probiotique. Ainsi, l’ingestion de probiotiques doit être massive et continue ou semi-continue pour qu’ils puissent avoir une action efficace et mimer l’effet d’une flore implantée dans l’organisme. 56 Les études peu nombreuses consacrées à l’effet immunomodulateur des probiotiques ont majoritairement été basées sur des modèles expérimentaux permettant de déterminer l’effet des souches ou espèces du genre Lactobacillus sur les réponses immunitaires de l’hôte. Cependant, le potentiel immunomodulateur des bifidobactéries est très peu étudié. De plus, le rôle des EPS produits par les bifidobactéries dans l’effet immunomodulateur n’est pas encore déterminé. Par ailleurs, les mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans l’immunomodulation induite par les bifidobactéries ne sont pas encore bien élucidés. La connaissance de ces mécanismes permettrait certainement une meilleure sélection des souches en fonction de l’activité recherchée et par conséquent une utilisation plus efficace et plus ciblée. L’étude du pouvoir immunomodulateur des composants endo et exocellulaires de souches de bifidobactéries s’avère nécessaire compte tenu de la lyse cellulaire des probiotiques après leur ingestion et de la susceptibilité du système immunitaire à répondre aux signaux bactériens. L’hypothèse que nous nous sommes proposée de vérifier par ce travail se résume comme suit : Certaines bactéries appartenant au genre Bifidobacterium seraient capables de moduler certaines fonctions du système immunitaire à travers les organes immunitaires du tube digestif. Cette fonction immunomodulatrice n’est pas nécessairement associée à la viabilité des souches et des composantes cellulaires issues de la lyse des bifidobactéries lors de leur passage dans le tractus gastro-intestinal seraient également capables d’exercer cette fonction sur le système immunitaire. Parmi les composantes cellulaires impliquées, les polysaccharides seraient la composante ayant les effets les plus marqués sur les différentes fonctions immunitaires. Afin de vérifier l’hypothèse ci-dessus, nous avions visé l’objectif général suivant : Étudier à travers des modèles in vitro et ex vivo, le potentiel immunostimulant des composants intra-cellulaire et extra-cellulaire de certaines souches probiotiques appartenant 57 au genre Bifidobacterium et productrices d’exopolysaccharides, et élucider les mécanismes moléculaires qui y sont impliqués. Les objectifs spécifiques assignés à notre étude sont les suivants: Objectif 1. Produire et caractériser les EPS biosynthétisés par certaines souches de bifidobactéries; Objectif 2. Évaluer ex vivo l’effet du contenu cytoplasmique, de la paroi cellulaire et des EPS de bifidobactéries sur la prolifération des lymphocytes et la production de cytokines; Objectif 3. Identifier, caractériser et valider à l’échelle biochimique, immunologique et moléculaire les fractions bactériennes responsables de l’activité immunomodulatrice observée; Objectif 4. Exploiter les résultats obtenus dans les objectifs précédents pour produire et caractériser des anticorps monoclonaux spécifiques aux bifidobactéries en vue de développer une méthode d’immuno-culture permettant la détection de souches de bifidobactéries viables dans les aliments. Chapitre II: Effets du contenu cytoplasmique, de la paroi cellulaire et des exopolysaccharides de bifidobactéries sur la prolifération de lymphocytes de souris et la production de cytokines. Effects of bifidobacterial cytoplasm, cell wall and exopolysaccharides on mouse lymphocyte proliferation and cytokine production. T. Amrouche a,b,c, Y. Boutin b,d, G. Prioult a, and I. Fliss a,b* a Dairy Research Center STELA, Pavillon Paul-Comtois, Université Laval, Québec (Qc) G1K 7P4 b Institute of Nutraceutical and Functional Foods INAF, Université Laval, Québec (Qc) G1K 7P4 c Department of Food Technology, Faculty of Agronomy and Biological Sciences, University of Tizi-Wezzu, Algeria d TransBiotech, CEGEP Lévis Lauzon, Lévis (Qc) G6V 9V6 International Dairy Journal : sous presse 59 2.1 Résumé Les bifidobactéries, candidates aux probiotiques, sont des bactéries exerçant des effets bénéfiques sur la santé de l’être humain comme le rétablissement de l’équilibre de la flore colique, l’amélioration de l’immunité, le traitement des diarrhées, etc. Des études récentes ont rapporté que les bactéries probiotiques ont la capacité de stimuler certaines fonctions immunitaires et offrent ainsi des possibilités d’augmenter les capacités de défense de l’organisme hôte contre les infections gastro-intestinales. Cependant, les mécanismes impliqués dans cet effet immunomodulateur demeurent mal connus. Le but de ce projet est d’étudier les effets de certains constituants des cellules de bifidobactérie notamment le contenu cytoplasmique, la paroi bactérienne et les exopolysaccharides (EPS) sur la réponse immunitaire. L’effet immunomodulateur a été étudié par une mesure de la prolifération lymphocytaire ainsi que par le dosage de certaines cytokines notamment IFN-γ et IL-10. Trois souches de bifidobactéries, B. thermoacidophilum RBL81, RBL82 et RBL64, isolées à partir de féces de bébés et sélectionnées pour leur capacité à produire des EPS, ont été étudiées. Une souche commerciale, Bifidobacterium lactis Bb12 a été utilisée comme souche de référence. Les résultats obtenus montrent qu’une meilleure stimulation de la prolifération cellulaire est obtenue avec la paroi cellulaire. Un effet immunostimulant important a été également obtenu avec le contenu cytoplasmique de B. lactis Bb12. Cependant, l’effet observé est dépendant de la souche microbienne et de la dose utilisée. Par contre, les EPS bruts ou fractionnés n’induisent aucun effet. La paroi cellulaire de B. lactis Bb12 s’est avérée plus immunostimulante (Indice de stimulation =16) que celle des autres souches testées. Le dosage des cytokines a confirmé les résultats de la prolifération cellulaire et a montré une forte production de IFN-γ (> 4 µg/ml) générée par la paroi cellulaire, et une augmentation de la sécrétion de IL-10 dans le milieu ( < 1 µg/ml ). Les résultats obtenus démontrent que les extraits cellulaires de bifidobactéries, notamment les parois, stimulent la prolifération des lymphocytes et laissent suggérer la possibilité d’utilisation de ces derniers dans le contrôle de certaines pathologies immunitaires. Mots clés: Bifidobactéries, Cytokines, Cytoplasme, Exopolysaccharides, Paroi cellulaire, Prolifération cellulaire. 60 2.2 Abstract Probiotic bifidobacteria have been reported to stimulate the immune system and thus offer the possibility of improving host immune defence against pathogens. The aim of this work was to study the effects of bifidobacterial cytoplasm, cell wall, and exopolysaccharide (EPS) on splenocyte proliferation and production of IFN-γ and IL-10. Three bifidobacteria, RBL64, RBL81, and RBL82 isolated from newborn infant feces were used in our study. Commercial strain Bifidobacterium lactis Bb12 was used as a positive control. Among different cell extracts, the cell wall components showed the most profound effects on cell proliferation and cytokine production. EPS neither stimulate lymphocyte proliferation nor induced cytokine secretion. B. lactis Bb12 exhibited a significant immunostimulating effect (stimulation index = 16) compared to other bifidobacteria studied. More IFN-γ (> 4 ng mL-1) was produced in response to cell wall and about 0.8 ng mL-1 of IL-10 was detected in the cell culture supernatant. The results demonstrate that bifidobacterial extracts, mainly the cell walls, stimulate the proliferation of lymphocytes and suggest that such extracts could be used in controlling certain immune pathologies. Keywords: Bifidobacteria, Cell wall, Cytokines, Cell proliferation, Cytoplasm, Exopolysaccharides. 2.3 Introduction Recent studies on human and animal infections suggest that the natural intestinal microflora plays a major role in resisting both viral infections and colonization of the gastrointestinal tract by pathogenic bacteria (Sherwood & Gorbach, 2000; Ibnou-Zekri, Blum, Schiffrin, & von der Weid, 2003; Asahara, Shimizu, Nomoto, Hamabata, Ozawa & Takeda, 2004). It has been shown that protection by microflora can be improved by ingesting probiotics, which are microorganisms that favourably influence host physiology by modifying the intestinal flora (Kirjavainen, Arvola, Salminen & Isolauri, 2002; Hattori et al., 2003). Bifidobacteria, discovered in 1899 by Tessier, are a major component of the gastrointestinal tract microflora (Mitsuoka, 1990) and a constituent of the gut mucosal barrier (Mullie et al., 2002). Like many other bacteria, bifidobacteria are known to produce 61 capsular and extracellular polysaccharides (EPS) (Roberts, Fett, Osman, Wijey, O’Connor & Hoover, 1995), which have a role in cell recognition, adhesion to surfaces, and formation of biofilms to facilitate colonization of various ecosystems. They also have a protective function in the natural environment, for example against phagocytosis, phages, and osmotic stress (Whitfield & Valvano, 1993; Looijesteijn, Trapet, De Vries, Abee & Hugenholtz, 2001). Probiotic bifidobacteria, especially B. longum, B. infantis and B. breve, have been shown to stimulate the immune system and thus may increase the capacity of the host to fight against gastrointestinal infections (Mullie et al., 2004) and help to reduce allergic inflammation (Von der Weid, Ibnou-Zekri, & Pfeifer, 2002). Some evidence suggests that the effects of probiotic bacteria on the immune system may be utilized to treat immunologically exacerbated pathologies in humans (Matsuzaki & Chin, 2000; Perdigon, Fuller & Raya, 2001; Cross, Stevenson & Gill, 2001; Prioult, Fliss & Pecquet, 2003). Probiotic modulation of humoral, cellular and non-specific immunity has been studied in disease models (Yasui, Shida, Matsuzaki & Yokokura, 1999; Qiao et al. 2002; Hart et al., 2004), and new species and strains of probiotic bacteria are continually being identified and evaluated for their capacity to modulate immune functions. The mode of action of bifidobacteria and lactic acid bacteria in the gastrointestinal tract appears to be non-specific, increasing immune responsiveness to a wide variety of antigens (De Roos & Katan, 2000). Ouwehand, Kirjavainen, Gronlund, Isolauri and Salminen (1999) reported that probiotics exert effects through interactions between lymphoid tissue and intact microorganisms, fragments thereof or metabolites produced in situ. Bacterial cell wall breakdown products may play an important role in a number of homeostatic mechanisms as well as non- specific immunity (Erickson & Hubbard, 2000; Kankaanpa, Sutasb, Salminena & Isolaurib, 2003). It has also been reported that probiotic bacteria can preferentially promote Th1-type responses (IFN-γ secretion) (He et al., 2002; Morita et al., 2002). Regular ingestion of several Lactobacillus species has been shown to enhance the capacity of murine splenic leukocytes to produce IFN-γ following mitogenic 62 stimulation, while IL-4 or IL-5 production is unaffected (Gill, 1998; Gill, Rutherfurd, Prasad & Gopal, 2000). Preliminary results reported for lactic acid bacteria suggest that EPS may be useful not only for their rheological properties but also for health-promoting properties, which may include anti-tumor and immunostimulatory actions (Ricciardi & Clementi, 2000; Chabot et al., 2001). Van Calsteren, Pau-Roblot, Begin and Roy (2002), and RuasMadiedo, Hugenholtz and Zoon (2002) reported that EPS from lactic acid bacteria may influence the immune system by enhancing lymphocyte proliferation, macrophage activation and cytokine production. At the present time, there is no clear understanding of the molecular or cellular basis for immunostimulation by bifidobacteria. To address the lack of data that convincingly show immunomodulatory effects of bifidobacteria, we have attempted to elucidate a mechanism by studying the action of four bifidobacteria. Three isolates of Bifidobacterium acidophilum from newborn infant feces were compared to the commercial strain Bifidobacterium lactis Bb12. The abilities of cytoplasm, cell wall and EPS from bifidobacteria to stimulate mouse splenocyte proliferation and production of cytokines IFNγ and IL-10 were measured. 2.4 Material and methods 2.4.1 Bacterial strains and culture conditions Isolates from newborn infant faeces were identified as bifidobacteria by fructose-6phosphate phosphoketolase assay and by the PCR method (Touré, Kheadr, Lacroix, Moroni and Fliss, 2003). Isolates RBL81, RBL82, and RBL64 were selected on their basis of exopolysaccharide production. Bifidobacterium lactis Bb12 (Chr. Hansen, Moersolm, Denmark) was used as positive control. Bacteria were first cultured for 18 hours at 37°C in De Man-Rogosa-Sharpe broth (MRS) (Rosell Institute Inc., Montreal, Canada) supplemented with 1% Tween 80 and 0.05% cysteine-HCl (v/v) to lower the oxidationreduction potential of the medium (Screekumar & Hosono, 1998). After incubation, 100 63 mL of this pre-culture was transferred into 900 mL MRS broth and incubated under anaerobic conditions for 24 h at 37 oC. All incubations were stationary. 2.4.2 EPS isolation, purification and fractionation EPS was isolated and purified by the method of Cerning et al. (1994). After incubation, cultures were heated at 100°C for 15 min to inactivate potential EPS hydrolases and to improve detachment of EPS from the microbial cell walls (Tuinier, Van Casteren, Looijesteijn, Schols, Voragen & Zoon, 2001). The cultures were then centrifuged at 10,000 rpm for 20 min at 4°C to separate bacteria and cell debris. EPS were precipitated with three volumes of chilled 95% ethanol and standing overnight at 4°C. The precipitate, collected by centrifugation at 9,000 rpm for 20 min at 4°C, was re-suspended in 25 mL of deionised water and then freeze-dried. The resulting powder was dissolved in 15 mL of 10 % trichloroacetic acid (TCA) and the solution was centrifuged at 9,000 rpm for 15 min at 4°C to remove proteins. The protein content of the supernatant was determined by the Lowry method using bovine serum albumin (BSA) as standard. As required, TCA extraction was repeated to remove the remaining proteins. EPS solutions were dialysed (1000 Da MW-cut off) at 4 °C for 2 days against deionised water. After dialysis, EPS solutions were fractionated by successive filtrations through Centricon (Millipore) 5,000 and 100,000 MW-cut off filters. Three fractions were obtained: F1: > 100,000 Da; F2: 5,000 to 100,000 Da; and F3: < 5 000 Da. The total sugar content of the EPS suspensions was estimated by the phenol/sulfuric method (Dubois, Gilles, Hamilton & Roberts, 1956). All samples were aliquoted and kept at –20 °C until use. EPS solutions were passed through a 0.22 µm filter prior to addition to cell cultures. 2.4.3 EPS molecular mass determination EPS molecular weights were determined by gel permeation chromatography (GPC) on a Waters HPLC system (Milford, MA, U.S.A.). Two columns, TOSOHAS G 4000 PWXL (30 cm x 7.8 mm) and BECKMAN TSK 4 000 SW (60 cm x 7.5 mm) were connected in series. The mobile phase was 0.1 M ammonium acetate (pH 7.2) at a flow rate of 0.5 mL min-1. Pullulan standards (Shodex Standards, Japan) of 100,000 Da and 1.6 x 106 Da and purified EPS were adjusted to 1 mg L-1 and 50 µL volumes were injected. A light- 64 scattering detector (SEDX Scientific Products & Equipment, Concord, Canada) was used at 45°C to detect the presence of exopolysaccharides resulting in variation of scattered light intensity. 2.4.4 Preparation of cytoplasm and cell wall extracts of bifidobacteria Fourteen-hour MRS broth cultures were centrifuged at 5,000 x g for 10 min at 4 °C and washed with 0.01 M potassium phosphate buffer (PBS) at pH 7.0. Pelleted cells were disrupted manually for 30 min at 4 °C with three or four volumes of alumina micro-beads (Sigma Co., Saint Louis, Mo, USA) in a mortar laid in ice. PBS (1 mL) was added to the mixture to facilitate extraction. The alumina beads were separated from the suspension by centrifugation at 1,000 x g for 15 min at 4 °C. The homogenate was re-centrifuged at 30,000 x g for 30 min at 4 °C in order to pellet cell walls and obtain cytoplasmic extract in the supernatant fraction. Cell walls were resuspended in 2 mL of bi-distilled water. The protein content of the cytoplasmic and cell wall extracts was determined by the Lowry method. The extracts were diluted in RPMI 1640 medium to a final protein concentration of 2 mg mL-1 and passed through a 0.22 µm-filter. 2.4.5 Stimulation of mouse splenocytes by bifidobacterial extracts Spleens were removed aseptically from euthanized Balb/C mice and single cell suspensions were prepared by mechanically disrupting the tissues through a cell strainer into RPMI 1640 medium (Gibco BRL Inc., Paisley, Scotland). Red blood cells were removed from the cell suspension by lysis with 0.87 % NH4Cl solution. Cells were then washed, suspended in RPMI 1640 complete medium (with 10 % fetal calf serum (FSC), 0.1 mL mL-1 50 mM mercaptoethanol, 100 U mL-1 penicillin, and 100 µg mL-1 streptomycin, all from Gibco). Cells were transferred to 96-well round bottom plates at a concentration of 5x105 cells mL-1. Various concentrations of bifidobacterial extracts were added alone or with phytohemagglutinin (PHA) (10 µg mL-1) to the cells. They were incubated for 48 h in a humidified 5 % CO2 atmosphere at 37 °C. 65 2.4.5.1 Cell proliferation After incubation, the plates were centrifuged and the supernatants were kept for cytokine analysis while the cells were used to measure proliferation. Cell proliferation was measured by adding 20 µL of 5-bromo-2’-deoxyuridine (BrdU) for the last 24 h of culture and determining BrdU incorporation using a cell proliferation ELISA kit (Roche Diagnostics Gmbh, Mannheim, Germany). Proliferation responses were expressed as a stimulation index calculated as the ratio of mean OD (450 nm) obtained for stimulated culture to the mean OD (450nm) obtained for un-stimulated control cell cultures. 2.4.5.2 Measurement of IFN-γ and IL-10 Interferon gamma (IFN-γ) and interleukin 10 (IL-10), in supernatants of splenocyte cultures, were determined by cytokine-specific sandwich ELISAs. Antibodies R 4-6A2 and biotinylated XMG1.2 were used for IFN-γ while MM-011 and biotinylated MM-16E3 were used for IL-10 (all from Endogen, Woburn, MA, USA). Coating antibodies were diluted to 2 µg mL-1 and conjugate antibodies were diluted to 0.5 µg mL-1. Streptavidin-horseradish peroxydase (Endogen, Woburn, MA, USA) and 3, 3, 5,,5-tetramethylebenzidine (KPL, Maryland, USA) were used in these assays. The reaction was stopped with 1 M H2SO4 and optical densities at 450 nm was determined using an ELISA plate reader (Molecular Device, Sunnyvale, USA). Cytokine concentrations were derived from linear dose-response standard curves obtained using dilutions of recombinant mouse IFN-γ (BD Pharmigen, San Diego, CA, USA) or recombinant mouse IL-10 (Endogen). Fresh cell-free complete RPMI 1640 was used as negative control. 2.4.6 Statistical analysis Splenocyte proliferation assay and cytokines evaluation were carried out in triplicate for each bacterial extract, and all analysis was done in duplicate. Statistical analyses were carried out with STATGRAPHICS plus 4.1 (Manugistics Inc., Rockville, MD, USA). Significant differences between treatments were tested by analysis of variance (ANOVA) followed by a comparison between treatments performed by Fisher’s least significant difference (LSD) method, with a level of significance of P < 0.05. 66 2.5 Results and discussion Few studies suggest that EPS produced by certain lactic acid bacteria may have immunostimulatory (Hosono, Amenati, Natsume, Hirayama, Adachi & Kaminogawa, 1997), antitumoral (Oda, Hasegawa, Komatsu, Kambe & Tsuchiya, 1983; Ebina, Ogata & Murata, 1995) activities. Induction of cytokine (IFN-γ and IL-1α) production has been reported (Kitazawa, Itoh, Tomioka, Mizugaki & Yamaguchi, 1996) and phosphate groups in these polysaccharides are believed to play an important role in macrophage and lymphocyte activation (Kitazawa, Harata, Uemura, Saito, Kaneko & Itoh, 1998; Kitazawa et al., 2000; Nishimura-Uemura, Kitazawa, Kawai, Itoh, Oda & Saito, 2003). We therefore sought to evaluate the effect of crude and fractioned bifidobacterial EPS as well as cytoplasm and cell wall extracts on splenocyte proliferation and production of IFN-γ and IL-10. Since similar results were obtained with all fractions of the three isolates RBL64, RBL81, and RBL82, we present herein only the comparison of RBL64 and B. lactis Bb12. 2.5.1 EPS production by bifidobacteria The average yields of crude (total) EPS obtained from 24-hour cultures of isolates RBL81, RBL82, RBL64, and B. lactis Bb12 were respectively 0.53, 0.42, 0.32, and 0.33 mg mL-1 of supernatant. Concentrations of EPS were in the same range as those obtained by Roberts et al. (1995) from Bifidobacterium longum BB-79 (0.47 g L-1). EPS yield has been reported to vary widely depending on species and culture conditions. For example, Streptococcus thermophilus has been shown to produce 20 to 100 mg EPS L-1 in fermented milk medium (Vaningelgem et al., 2004), while Lactobacillus rhamnosus RW-9595M yielded 2350 mg L-1 of purified EPS when grown on supplemented whey permeate at 37 °C (Bergmaier, Champagne, & Lacroix, 2003). Lactococcus lactis subsp. cremoris SBT 0495 has been reported to produce 600 mg L-1 in lactose-containing medium (Higashimura, Mulder-Bosman, Reich, Iwasaki & Robin, 2000). Bifidobacterial EPS were fractionated into F1 (> 100,000 Da), F2 (5,000 to 100,000 Da) or F3 (< 5,000 Da) portions. Proportions of each fraction of the isolate are shown in 67 Figure 2.1. Fraction F1 of all isolates was found to have a higher EPS content (ranging from 63.5 to 79.3%) than fraction F2 (18.1 to 30.9%) or F3 (1.6 to 5.6%). Aa 100 % Total EPS 76,1 50 22,5 2,1 0 F1 F2 F3 EPS fraction b B 100 % Total EPS 79,3 50 18,1 1,6 0 F1 F2 F3 EPS fraction % Total EPS Cc 100 63,5 50 30,9 5,6 0 F1 F2 F3 EPS fraction Figure 2.1. EPS content of polysaccharide fractions from three bifidobacterial strains isolated from newborns feces (A), strain RBL81; (B), strain RBL82; (C), strain RBL64. The fractions were separated by centricon based on their molecular weight: F1 > 100 000 Da; F2: 5 000 – 100 000 Da; F3: < 5 000 Da. 68 Isolate RBL82 produced more EPS in the molecular weight range > 100,000 Da than did RBL64 or RBL81. The comparison of the EPS molecular weight profiles of isolate RBL82 and Lactobacillus rhamnosus RW-9595M (Bergmaier et al., 2001) is shown in Figure 2.2. With the aid of Figure 2.3, which shows three peaks corresponding respectively to the EPS of fractions F1, F2, and F3, it can be seen that most of the EPS produced by bifidobacteria appears to be of lower molecular weight. Fraction F1 appears to contain some of fraction F2, which may have been retained by the 105 Da cut-off filter or may be an artefact of fractionation. Tone-Shimokawa, Toida and Kawashima (1996), who analysed cell wall polysaccharides of Bifidobacterium infantis Reuter ATCC 15697 by gel filtration chromatography using pullulan standards, reported that polysaccharides were affected by the ionic strength of the eluting solution and may interact with the column matrix. The weight range of F1 appears consistent with the findings of Roberts et al. (1995), who estimated by chromatography the average weight EPS from Bifidobacterum longum BB-79 to be greater than 200,000 Da. A2 Light scattering (eV) A1 C Elution time (min) Figure 2.2. Gel permeation chromatography analysis of crude bacterial exopolysaccharides : A1, 1600x103 Da; A2, 100x103 Da; B, L. rhamnosus RW-9595M; C, strain RBL 82. 69 Light scattering (eV) A1 A2 D E F Elution time (min) Figure 2.3. Gel permeation chromatography analysis of fractioned EPS from bifidobacterial strain RBL82 using pullulan standard: A1, 1600x103 Da; A2, 100x103 Da; D, F1 > 100,000 Da; E, F2: 5 000 – 100 000 Da; F, F3 < 5 000 Da. 2.5.2 Splenocyte proliferation induced by bifidobacterial extracts The crude EPS preparation had only a weak stimulating effect on cell proliferation (Figure 2.4). Tzianabos, Wang and Kaspera (2003) reported that different bacterial capsular polysaccharides with molecular weights greater than 17 kDa stimulated CD4+ cell proliferation in vitro. Our results suggest that molecular weight does not likely influence any possible stimulatory effect of bifidobacterial EPS on the proliferation of mouse splenocytes. 70 18 16 Strain RBL64 a)A B. lactis Bb12 Stimulation index 14 d 12 Cells+PHA (10 µg/ml) d 10 8 b 6 4 2 c a a a a b a 0 2 20 40 PHA alone 200 Cytoplasmic (µgProtein protein mL-1) Cytoplasmic content content (µg mL-1) 18 16 d d b)B c Stimulation index 14 c 12 10 8 b 6 4 2 b b a a 0 2 20 40 200 PHA alone Cell wall proteinmL-1) mL-1 ) Cell wall(µg (µg Protein 18 Stimulation index 16 c)C 14 12 10 8 d 6 4 2 0 a b 0,1 a b b c abc abc 10 100 b 1 PHA alone -1 Exopolysaccharides (µg Exopolysaccharides (µgmL-1) mL ) Figure 2.4. Effect of (A) cytoplasmic content, (B) cell wall, and (C) EPS extracts from the strains RBL64 and B. lactis Bb12 on splenocyte proliferation when the preparations were normalized on the basis of their protein content. Columns with different letters are significantly different. 71 Several factors influencing the effects of EPS on lymphocyte proliferation have been reported. Kitazawa et al. (1998), who fractionated EPS from Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus 1073R-1 into neutral and acidic fractions, demonstrated that the acidic polysaccharide stimulated mitogenic responses of murine splenocytes and Peyer’s patches but not thymocytes. They also reported that de-phosphorylation of EPS reduced their mitogenic activity in lymphocytes. Obviously, polysaccharide structure may be modified during extraction and purification procedures (structural alteration induced by heat or trichloroacetic acid treatment), causing losses of their properties to stimulate the cell proliferation. Recent studies suggest that the cell proliferation stimulation induced by bacterial EPS are indeed structure-dependent and that the active structures are in turn charge dependent. Kalka-Moll, Tzianabos, Bryant, Niemeyer, Ploegh, and Kasper (2002) emphasized that bacterial polysaccharides with a zwitterionic charge spatial motif, such as capsular polysaccharides, elicit potent CD4 T-cell responses both in vivo and in vitro. Recently, Stingele, Corthesy, Kusy, Porcelli, Kasper and Tzianabos (2004) demonstrated that zwitterionic polysaccharides interact directly with T cells with rapid association/dissociation kinetics. The proliferative response of T cells depends on free amino (positively charged) and carboxyl or phosphate groups (negatively charged) that are part of the repeating unit structure. Chemical neutralization of either charged group results in loss of the ability of the polysaccharide to activate T cells (Tzianabos et al., 2000; Tzianabos, Wang & Kasper, 2001). Using gas-liquid chromatography and GLC-mass spectrometry, Roberts et al. (1995) found that EPS from Bifibobacterium longum BB-79 appear to be composed of galactose and an unidentified hexose (possibly glucose) with a lactic acid substituent. Splenocyte proliferation stimulated by bifidobacterial cytoplasm and cell wall from strains RBL64 and B. lactis Bb12 can be clearly observed after 48 h of incubation. Figure 2.4 shows that splenocyte proliferation is dose dependent and the SI is significantly increased at protein concentrations ranging from 20 to 40 µg mL-1. For both strains, cell wall extract was a more efficient stimulator of splenocyte proliferation than the cytoplasm 72 fraction. However, B. lactis Bb12 extracts were more effective than those from RBL64. Prioult et al. (2003) reported that Bifidobacterium lactis Bb12 (NCC 362) was more effective than Lactobacillus paracasei (NCC 2461) or Lactobacillus johnsonii (NCC 533) at inducing and maintaining oral tolerance to bovine β-lactoglobulin in mice. Other studies have reported that Gram-positive bacteria, which do not contain lipopolysaccharide (LPS) but carry surface teichoic acids, lipoteichoic acids and peptidoglycan, can stimulate immune cells. However, whole peptidoglycan is much less active than LPS on a dry weight basis (Weintraub, 2003; Moreillon & Majcherczyk, 2003). The mechanisms by which Gram-positive bacteria stimulate cellular response thus require further study. The stimulation of cell proliferation by cytoplasm may be due to DNA and bioactive peptides. Indeed, Hemmi et al. (2000) reported that bacterial DNA has stimulatory effects on mammalian immune cells, which depend on the presence of unmethylated CpG (deoxycytidylate-phosphate-deoxyguanylate) dinucleotides in the bacterial DNA. They postulated that cellular response to CpG DNA is mediated by a Toll-like receptor (TLR9), which consists of phylogenetically conserved transmembrane proteins recognizing bacteriaderived ligands. They demonstrated that TLR9-deficient mice express a non-responsive phenotype to CpG-DNA, suggesting that murine TLR9 is a CpG-DNA receptor. Bacterial DNA and synthetic oligodeoxynucleotides expressing unmethylated CpG motifs stimulate the immune system, inducing maturation, differentiation, and proliferation of multiple immune cells, including B and T lymphocytes, NK cells, monocytes, macrophages, and dendritic cells (Roman et al., 1997; Sun, Zhang, Tough, & Sprent, 1998; Klinman, Currie, Gursel & Verthelyi, 2004). Other sources of immunomodulators from bifidobacteria may include peptidases, which could generate bioactive peptides with mitogenic effects on splenocytes (Gobbetti, Corsetti, Smacchi, Zocchetti, and De Angelis, 1998; Samartsev, Astapovich and Novik, 2000). Differences in the level of stimulation may arise from the proportions of immunoactive components in specific probiotics. While our results demonstrate that cell extracts, mainly cell wall extract, stimulate splenocyte proliferation and suggest that such extracts could be used to enhance host immune responses or in controlling certain 73 immunopathologies. Pessi, Sutas, Saxelin, Kalliooinen and Isolauri (1999) reported that extracts from probiotics such as L. rhamnosus GG, B. lactis, L. acidophilus, L. delbrueckii subsp. bulgaricus, and S. thermophilus suppress immune response in vitro. Dijkstra, Alber and Keck (1997) have suggested that bacterial surface constituents, being readily accessible to detection, have been biologically selected by the immune system as indicators of bacterial presence and are thus potent inducers of host responses. Since peptidoglycan is the major constituent of the Gram-positive bacterial cell wall and is located at the cell surface, this glycoprotein is a suitable target for such immune responses. Moreover, the basic architecture of peptidoglycan appears to be highly conserved among bacteria, with minor variations in exact chemical composition while an additional layer of S-proteins may provide additional variation (Beveridge & Graham, 1991; Labischinski & Maidhof, 1994). 2.5.3 Cytokine production IFN-γ is secreted by T-cell helper type 1 cells (Th1), which are associated with antibody responses (Knopf, 2000). Although it has antiviral and antiparasitic activities in mice, the main biological activity of IFN-γ appears to be immunomodulatory. IL-10 produced by T-cell helper type 2 cells (Th2) inhibits the synthesis of a number of cytokines, including IFN-γ. IL-10 is also produced by regulatory T cells and lead to both suppression of Th2 responses and a switch from IgE to IgG4 antibody production preventing allergic disease (Robinson, Larche & Durham, 2004). Induction or enhancement of cytokine production could be major mechanisms by which bifidobacteria exert immunomodulatory activities (Marin, Lee, Murtha, Ustunol & Pestika, 1997). Since no cytokines were detected after adding bifidobacterial extracts alone, we checked for synergistic effects with PHA. Levels of IFN-γ and IL-10 produced by splenocytes in the presence of bifidobacterial extracts with PHA are shown in Figure 2.5 and Figure 2.6. A significant increase in IFN-γ production was obtained in splenocyte cultures with bacterial cell wall at concentrations of 20 to 40 µg mL-1. More than 4 ng mL-1 of IFN-γ was obtained by adding cell wall from B. lactis Bb12 while little or none was produced by adding EPS (Figure 2.5c). IL-10 was not detected (Figure 2.6c) in response to EPS. These results are consistent with those obtained in the proliferation assay. In addition to the proliferation immune cells also react to 74 conserved bacterial molecules such as peptidoglycan by secreting cytokines (Moreillon & Majcherczyk, 2003). Increased IL-10 production by splenocytes (0.8 ng mL-1) was obtained in response to isolate RBL64 cell wall and PHA. These results suggest a strain or species dependent effect of bifidobacterial cell wall extracts on splenocytes, since they may induce pro- or anti- inflammatory cytokines. Indeed, IFN-γ is known to be a major macrophage-activating lymphokine and regulates the induction of other cytokines, particularly Th2 cytokines such as IL-4, IL-5 and IL-10. Because of its role in mediating macrophage and NK cell activation, IFN-γ is important in host defence against intracellular pathogens such as Mycobacterium tuberculosis and viruses and against tumours (Meydani & Ha, 2000). However, overexpression of cytokines may lead to inflammation in the intestine and is thus considered undesirable, especially for allergic infants and the elderly. He et al. (2002), in finding that bifidobacterial induction of cytokine secretion is strain and species dependant, demonstrated that Bifidobacterium adolescentis and B. longum, known as adult-type bifidobacteria, induced significantly more pro-inflammatory cytokine secretion (IL-12 and TNF-α) by a murine macrophage-like cell line than did the infant-type bifidobacteria B. bifidum, B. breve and B. infantis. In contrast, B. adolescentis did not stimulate the production of anti-inflammatory IL-10. 75 4 A Strain RBL64 IFN-γ (ng mL-1) B. lactis Bb12 3 Cells+PHA (10µg/ml) d 2 cd bcd bc bcd 1 ab a a a 0 2 20 40 200 PHA alone Cytoplasmic content (µg protein mL-1) IFN-γ (ng mL-1) 4 * B * e e cd bcd 3 abc 2 ab 1 a bc a 0 2 20 40 200 PHA alone -1 Cell wall (µg protein mL ) IFN-γ (ng mL-1) 4 C 3 2 1 0 0,1 1 10 100 PHA alone -1 Exopolysaccharides (µg mL ) Figure 2.5. Synergistic effect of PHA and cellular preparations (A) cytoplasmic content, (B) cell wall, and (C) exopolysaccharides from bifidobacterial strain RBL64 and B. lactis Bb12 on IFN-γ splenocyte production when cells were cultured in complete RPMI medium added with mitogen agent (PHA) (10 µg mL-1). No IFN-γ was detected in PHA-free media and there was no significant difference between treatments with exopolysaccharides. *, higher than 4 µg mL-1. 76 IL-10 (ng mL-1) 1 A Strain 0,8 B. lactis Bb12 0,6 0,4 0,2 N.D 0 2 20 40 200 PHA alone -1 Cytoplasmic content (µg protein mL ) 1 B c IL-10 (ng mL-1) 0,8 b 0,6 b 0,4 b b b b 0,2 a N.D 0 2 20 40 200 -1 1 PHA alone Cell wall (µg protein mL ) C IL-10 (ng mL-1) 0,8 0,6 0,4 0,2 0 N.D N.D N.D 0,1 1 10 N.D 100 N.D PHA alone -1 Exopolysaccharides (µg mL ) Figure 2.6. Synergistic effect of PHA and cellular preparations (A) cytoplasmic content, (B) cell wall, and (C) exopolysaccharides from bifidobacterial strain RBL64 and B. lactis Bb12 on IL-10 splenocyte production when cells were cultured in complete RPMI medium added with mitogen agent (PHA) (10 µg mL-1). No IL-10 was detected in PHA-free media and there is no significant difference between treatments with cytoplasmic content. ND, not detected. 77 Splenocyte proliferation and cytokine secretion in mice probably reflect stimulation of lymphocyte-governed inherent immunity to bacterial immunogens. It thus appears that the immunoregulatory action of bifidobacteria may be mediated primarily by enhancement of interferon production by spleen cells. In theory, this mechanism could serve to regulate over-expression of the Th2-type immune response and thus help to fight against allergic response. Increased lymphocyte proliferation and IFN-γ production in response to lactic acid bacteria in rat spleen has been previously reported (De Simone, Bianchi Salvadori, Jirillo, Baldinelli, Bitonti & Vesely, 1989; De Simone, Bianchi Salvadori & Jirillo, 1993; Attouri, Bouras, Tome, Marcos & Lemonnier, 2002). Decreased IL-10 secretion could in effect stimulate pro-Th1-type responses, since IL-10 is a potent deactivating signal for cytokine production and can suppress IFN-γ production and Th1 phenotype expression (De Wall Malefyt, Abrams, Bennet, Figdor & De Vries, 1993; D’Andrea, Aste-Amezaga, Valiante, Ma, Kubin, & Trinchieri, 1993). Establishment of a robust Th1-type immunity in the site of infection is a prerequisite for effective defence against most viruses and intracellular bacteria, whereas the coinduction of Th2-type immunity lead to the maintenance of immune homeostasis during Th1-mediated responses (Bot, Smith &Von Herrath, 2004). In addition, IL-10 detected in the culture media could be produced by regulatory T cells, distinct in function and phenotype from the Th1 and Th2 populations (McGuirk & Mills, 2002). CD4+CD25+ regulatory T-cell, secreting high levels of IL-10, were recently shown to be re-directed against pathologic T-lymphocytes, facilitating the treatment of autoimmune disease (Mekala & Geiger, 2004). 2.6 Conclusions The results demonstrate overall that cell components from bifidobacteria promote in vitro immune responses in mouse splenocytes. Cell wall and cytoplasm were found to stimulate lymphocyte proliferation and increase IFN-γ, and IL-10 while bifidobacterial EPS recovered from culture broth did not produce a significant response. It is therefore suggested that live probiotic bacteria may not be required to influence the immune system. Components such as cell wall from autolysed bifidobacteria may stimulate lymphatic cell proliferation and cytokine production. The use of nonviable probiotics in foods should have the advantage of allowing a longer product shelf life and easier storage. Since the 78 composition of bacterial cell wall and cytoplasm is very complex, additional research to identify specific immunoregulatory agents, particularly the components favouring pro-Th1 activity, should provide valuable insight into probiotic immunostimulation. Understanding of these modulatory functions could provide a unique opportunity to prevent or treat intestinal disorders associated with food allergy, intestinal infections, inflammatory bowel disease and autoimmunity. Probiotic bifidobacteria could be used as nutritional supplements to improve the immune function of neonate or the elderly, for whom these functions are diminished. The use of probiotic homogenates as components of functional foods should also be studied clinically. Since bifidobacteria and lactic acid bacteria are indigenous inhabitants of the healthy intestine and have been used safely for the production of food all over the world since ancient times, they are particularly suited to use as probiotics or immunomodulators for both the prevention and therapeutic treatment of diseases mediated by immune responses. ACKNOWLEDGMENTS This work was supported by grants from FCAR, NOVALAIT, MAPAQ and NSERC. T. Amrouche was recipient of scholarships from the World Bank. Dr Stephen Davids is thanked for reading the manuscript. Chapitre III: Effets des fractions peptidiques et protéiques du cytoplasme de bifidobactéries sur la prolifération des lymphocytes de souris et la production de cytokines. Effects of bifidobacterial cytoplasm peptide and protein fractions on mouse lymphocyte proliferation and cytokine production. T. Amrouche a,b,c, Y. Boutin b,d, and I. Fliss a,b* a Dairy Research Center STELA, Pavillon Paul-Comtois, Université Laval, Québec (Qc) G1K 7P4 b Institute of Nutraceutical and Functional Foods INAF, Université Laval, Québec (Qc) G1K 7P4 c Department of Food Technology, Faculty of Agronomy and Biological Sciences, University of Tizi-Ouzou, Algeria d TransBiotech, CEGEP Lévis Lauzon, Lévis (Qc) G6V 9V6 International Dairy Journal : à soumettre prochainement 80 Dans le premier chapitre, nous avions mentionné que le contenu cytoplasmique des bifidobactéries, notamment celui de la B. lactis Bb12, exerce un effet stimulant sur la prolifération des lymphocytes et la production de cytokines. A cet effet, nous avions postulé que cet effet immunostimulant a été induit par les peptides et les protéines retrouvés dans le cytoplasme des cellules de bifidobactéries. Afin de vérifier cette hypothèse, nous avons réalisé les travaux rapportés dans ce chapitre. Nous avons fractionné et caractérisé les peptides et les protéines cytoplasmiques de B. lactis Bb12. Les fractions peptidiques et protéiques ont été ensuite étudiées pour leurs propriétés immunomodulatrices. 3.1 Résumé Les bifidobactéries sont des bactéries très utilisées dans les produits fermentées probiotiques. L’une des propriétés intéressantes des bifidobactéries est leur capacité à rétablir ou améliorer la fonction immunitaire chez l’homme et l’animal. Dans une étude antérieure, nous avions démontré que le contenu cytoplasmique de certaines souches de bifidobactéries stimule la prolifération des splénocytes et la sécrétion de cytokines. Cependant, les composants responsables de l’effet immunostumulant observé ne sont pas encore identifiés. La présente étude a pour but de caractériser et d’étudier l’effet des peptides et des protéines du cytoplasme de Bifidobacterium lacis Bb12 sur la prolifération des splénocytes de souris et la production de cytokines. L'analyse par SDS-PAGE de l’extrait cytoplasmique de B. lacis Bb12 cultivée sur le milieu MRS en anaérobiose a révélé la présence d’un groupe hétérogène de peptide et de protéines. Les peptides et les protéines ont été fractionnés par électrofocalisation (pH isoélectrique ou pI) en fraction acide (pI 2-5) et fraction basique (pI 5-12). Analysées par RP-HPLC, chacune des deux fractions montre la prédominance de peptides et de protéines relativement moins hydrophobes. Le poids moléculaire des peptides et des protéines des pics majeurs a été estimé par spectrométrie de masse à environ 510.16 à 10048.03 Da et plus de 13142.83 Da respectivement. Quatre pics majeurs ont été sélectionnés dans chaque fraction puis testés pour leur activité mitogénique sur des splénocytes de souris. Le cytoplasme brut (avant fractionnement) de la souche B. lactis Bb 12 s’est montré immunostimulant (indice de stimulation (IS) = 2,96 ± 0,35) comparativement à la PHA (IS=1,66 ± 0,20) en confirmant les effets immunostimulants observés dans notre étude antérieure. La fraction acide (100 81 µg/ml) stimule la prolifération des splénocytes (SI=1,61 ± 0,08) plus que la fraction basique (SI=1,33± 0,02). Les deux cytokines IFN-γ et IL-4 ont été détectées dans le milieu de culture à différentes concentrations indiquant la stimulation des cellules T helper. Une forte sécrétion de IFN-γ (1199,57±127,60 pg/ml) a été induite par l’extrait cytoplasmique brut (40 µg/ml) indiquant probablement une forte stimulation des cellules Th1. Une augmentation notable de la production de IFN-γ (578,55±195,16 pg/ml) a été également générée par la fraction basique (40 µg/ml). Une stimulation maximale de la sécrétion de IL4 (9,14±4,04 pg/ml) induite par le contenu cytoplasmique à une concentration de 40 µg/ml indiquerait la stimulation des cellules Th2. Enfin, les effets immunostimulants ainsi démontrés laissent suggérer une possibilité d’utilisation de l’extrait cytoplasmique de bifidobactéries comme nutraceutique (agent immunomodulateur). Key words: Bifidobactéries, prolifération cellulaire, cytokines, cytoplasme, peptides, protéines. 3.2 Abstract Bifidobacteria are probiotic bacteria shown to possess immunonodulatory properties in human and animal. Cellular components such as cytoplasmic content from bifidobacteria were demonstrated to elicit a mitogenic activity when tested in vitro with immune cells. Based on previously reported immunostimulating effects of bifidobacterial cytoplasm, we tested the potentiating effects of representative peptides and proteins from. B. lactis Bb12 cytoplasm on immune response measuring splenocyte proliferation and secreted cytokines. SDS-PAGE analysis of cytoplasmic extract resulted in a profile indicating an heterogeneous protein and peptide group in B. lactis Bb12. Cytoplasmic peptides and proteins were fractionated into acidic and basic fractions by liquid-phase electrofocalisation based on amino acid isoelectric pH. Both acidic and basic fractions were further fractionated by RP-HPLC into different peptides and protein fraction based on their hydrophobicity. The most abundant components in both fractions were eluted early indicating their low hydrophobicity. Four majors peaks selected in each fraction were analysed by mass spectrometry and showed individually an abundant peptide or protein with contaminants. The molecular weight of the components ranged from 510.16 to 82 10048.03 Da (peptides) or higher than 13142.83 Da (proteins). Each fraction was tested for its mitogenic activity on mouse splenocytes. The acidic fraction (100 µg/ml) was found to stimulate cell proliferation more (stimulation index (SI)= 1,61 ± 0,08) than the basic fraction (SI=1,33± 0,02), but less than the cytoplasmic content (2,96 ± 0,35). Secreted IFNγ and IL-4 were detected in culture media at different level indicating the stimulation of helper T cells. The basic fraction was shown to induce more IFN-γ (578,55±195,16) than the acidic fraction (191,08±7,50 pg/ml). The results demonstrate that several peptides and proteins from B. lactis Bb12 exhibit an immunostimulating activity suggesting the possibility of the use of cytoplasmic content as nutraceutical products to enhance immune responses in children or elderly persons with reduced immune function. Key words: Bifidobacteria, cell proliferation, cytokines, cytoplasm, peptides, proteins. 3.3 Introduction Probiotics such as bifidobacteria have been recently reported to enhance the human and animal immune system. Immunomodulatory effects of probiotic bacteria were shown to be associated not only with live microorganisms but also with nonviable organisms (Tejada-Simon and Pestka, 1999; Christensen et al., 2002; Kankaanpa et al., 2003; McCarthy et al., 2003; Chukeatirote, 2003; Mastrandrea et al., 2004). In our previous work, we demonstrated that cell wall and cytoplasm from bifidobacteria stimulated in vitro the lymphocyte proliferation and cytokines production. In addition, Lee et al. (2004) mentioned that cytoplasmic preparations of lactic acid bacteria were found to have antitumor effects in vivo with the modulation of cellular immunity. According to Reid et al. (2002), several novel peptides from Lactobacillus fermentum RC-14 may prove to be significant with respect to its probiotic activity. Recently, Nouaille et al.(2003) mentioned that a new application for lactic acid bacteria is their use as live delivery vectors for antigenic or therapeutic protein or peptides in mucosal surfaces enhancing both mucosal and systemic immune responses. Chadwick et al. (1988) reported that peptides produced by intestinal bacteria could promote an inflammatory response and should cross the 'mucosal barrier'. They mentioned that these peptides activate 83 in vitro and in vivo human neutrophils inducing chemotaxis and lysosomal enzyme. Furthermore, a bacterial formylpeptide, N-formyl-methionyl-leucyl-phenylalanine (fMLP), has been reported by Arbour et al. (1996) to induce and modulate various cellular responses and secretion of pro-inflammatory cytokines by peripheral blood mononuclear cells. In addition, some prokaryotic proteins such as heat shock proteins were shown to be a potential source of microbial peptides generated by digested bacteria and could enhance presentation of peptides to CD8+ T cells (Castellino et al., 2000; Aaron et al., 2004, Tobian et al., 2004). However, cytoplasm-derived peptides inducing the immunomodulatory effects are few investigated in bifidobacteria. In this study, we aimed to characterize the peptides or proteins fractions from bifidobacteria (Bifidobacterium lactis Bb12) cytoplasm responsible for immunomodulation. 3.4 Material and methods 3.4.1 Bacterial strains and culture conditions Isolates Bifidobacterium thermoacidophilum RBL81, RBL82 and RBL64 from newborn infant faeces were identified by fructose-6-phosphate phosphoketolase assay and by the PCR method of Touré et al. (2003). These isolates and Bifidobacterium lactis Bb12 (Chr. Hansen, Moersolm, Denmark) were individually subcultured anaerobically for 18 hours at 37 °C in 300 mL of De Man-Rogosa-Sharpe broth (MRS) (Rosell Institute Inc., Montreal, Canada) supplemented with 0.05 % cysteine-HCl (v/v) to lower the oxidationreduction potential of the medium and thereby improve anaerobic growth (Sreekumar & Hosono, 1998). Tween 80 was added at a concentration of 1 % (v/v). Three hundred mL of each pre-culture was transferred to 270 mL of broth in separate 1 L flasks (3 flasks for each culture), which were incubated for 16 h at 37 °C in an anaerobic jar containing a carbon dioxide generating sachet (AnaeroGen, OXOID Ltd., Basingstoke, England). 3.4.2 Preparation of bifidobacterial cytoplasm extracts After incubation (16 h), bifidobacteria cultures were used to extract cytoplasmic content according to method of Fernandez-Espla et al. (2000) with some modifications. 84 Briefly, cells were collected at the end of exponential growth phase (16 h) by centrifugation at 5,000 x g for 10 min at 4 °C and washed three times with 0.01 M potassium phosphate buffer (PBS) at pH 7.0. The contents of bacterial cells were released by disruption of pelleted cells manually for 30 min at 4 °C with three or four volumes of alumina powder (Sigma Co., Saint Louis, Mo, USA) in a mortar laid in ice. PBS (1 mL) was added to the mixture to facilitate extraction. The alumina was separated from the suspension of disrupted cells by centrifugation at 1,000 x g for 15 min at 4 °C. Finally, the preparations were re-centrifuged at 30,000 x g for 30 min at 4 °C in order to pellet cell walls and obtain cytoplasmic extract in the supernatant fraction. The protein content of the cytoplasmic extract was determined by the Lowry method. All samples were stored at – 20 °C until they were used. 3.4.3 Cytoplasm peptide and protein profile analysis SDS-PAGE analysis was carried out to compare the peptide and protein profile of cytoplasm from bifidobacterial strains used. The analysis was carried out using 10 % polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) performed in the presence of sodium dodecyl sulfate (SDS) according to Laemmli (1970). Molecular markers Bio-Rad (Broad Range) with molecular mass ranging from 21.5 to 97.5 kDa were used. 3.4.4 Separation of acidic and basic peptide and protein fractions Cytoplasmic content was separated by ampholyte-free isoelectric focusing using the method described by Groleau et al. (2002). Briefly, cytoplasmic extracts (0.1 g ) were resuspended in 40 mL of deionized water and fractionated for 2 h at 4 oC by liquid-phase isoelectric focusing in a preparative Rotofor cell (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA) at constant power (15 W). Twenty fractions were collected and the pH of each fraction was measured to determine the isoelectric pH (pI). The fractions were then pooled to obtain the acidic fraction (pI from 2 to 5) and basic fraction (pI from 5 to 12). Acidic and basic fractions were dried by Speed Vac concentrator (Savant Instrument Inc., Farmingdale, NY) and stored at 4 0C until use. 85 3.4.5 Characterization of cytoplasm peptide and protein fractions of bifidobacteria 3.4.5.1 Characterization by Reverse Phase-HPLC The acidic and basic fractions from B. lactis Bb12 cytoplasm were resuspended separately in saline phosphate buffer and were analyzed by RP-HPLC for peptide and protein content. Analysis were performed with a Luna C18 column (3.9 i.d. x 150 mm, Phenomenex) using Waters HPLC system described above and following conditions: flow rate, 1 mL/min; column temperature, 39 0C; solvent A, trifluoroacetic acid (TFA) 0.11% (v/v) in HPLC-grade water; solvent B, acetonitrile/water/TFA 60%/40%/0.1% (v/v). Elution was performed with a linear gradient of solvent B from 0 to 60% over 45 min (Groleau et al., 2002). Major peaks corresponding to peptide or protein from B. lactis Bb12 were individually collected at different time (elution time), thoroughly dried by Speed Vac concentrator (Savant Instrument Inc., Farmingdale, NY) and resuspended in water to be assayed for their immunoactivity. 3.4.5.2 Characterization by mass spectrometry Collected peaks from acidic and basic fraction were analyzed separately by mass spectrometry using a MSD QUAD Agilent 1100 Series (Agilent Technologies, Palo Alto, CA), following the method described by Groleau et al. (2002). In order to reduce the effect of TFA, collected fractions (individual peaks) were resuspended in 20 % (v/v) propionic acid prior the infusion in the mass spectrometry interface. Signals were recorded in positive mode using a 90-V fragmentation with a scan range of 300-3000 m/z. Nitrogen was used as the drying gas at 13.0 L/min and 350oC, and nebulizer gas at 241 kPa. The capillary voltage was set at 3000V. The instrument was calibrated using ES tuning mix (G2431A, Agilent). 3.4.6 Proliferation assay A proliferation assay was carried out to evaluate the mononuclear cell response to cytoplasm fractions from B. lactis Bb12. Spleens were removed aseptically from euthanized Balb/C mice and single cell suspensions were prepared by mechanically disrupting the tissues through a cell strainer into RPMI 1640 medium (Gibco BRL Inc., Paisley, Scotland). Erythrocytes were removed from cell suspension by osmotic shock with 86 2 mL of 0.87 % NH4Cl solution for 2 min at 37oC. Spleen cells were then washed three times at 4°C, suspended in RPMI 1640 complete medium (with 10% fetal calf serum (FSC), 0.1 mL mL-1 50 mM mercaptoethanol, 100 U mL-1 penicillin, and 100 µg mL-1 streptomycin, all from Gibco). The crude cytoplasmic extract and acidic and basic fractions were diluted in supplemented RPMI to 0.8, 8, 80 and 200 μg/mL; whereas the fractionated components (peaks) were diluted in supplemented RPMI at 0.8, 8 and 80 μg/mL. All the samples were filtered (0.22 μm). Cells were plated at a final concentration of 5x105 cells mL-1. A mitogenic agent, phytohemagglutinin (PHA) (10 µg mL-1) was used alone as control for cell proliferation. Medium alone, PHA or above-mentioned concentrations of bifidobacterial components were added to wells in duplicate. Finally, AlamarBlue indicator (BioSource International, Inc., USA) was added to wells (20 µL/well) to measure cell proliferation. AlamarBlue system incorporates an oxidation-reduction indicator that both fluoresces and changes color in response to chemical reduction of culture media resulting from cell growth (Lancaster, 1996). Cell cultures were incubated for 48 h in a humidified 5 % CO2 atmosphere at 37 °C. At the end of incubation, the microplates were centrifuged and supernatants were transferred to a black opaque 96-well microplate (Fisher Scientific, Pittsburgh, USA) to determine fluorescence values. Fluorescence measurements were made by FLUOstar spectrofluorometric microtiter well plate reader (BMG Labtechnologies, Offenburg, Germany) (excitation: 544 nm; emission: 610 nm; gain 026). Proliferation responses were expressed as a stimulation index calculated as the ratio of mean fluorescence value obtained for stimulated culture to the mean fluorescence value obtained for nonstimulated control cell cultures. 3.4.7 Cytokine analysis In order to evaluate cytokine production, a separate microplate was prepared without adding AlamarBlue. Cytokine production was measured in splenocytes cultured in conditions described above and added with bifidobacterial components and 10 μg/mL PHA, at which concentration the stimulation index was not affected. Interferon gamma (IFN-γ) and interleukin 4 (IL-4), in supernatants of splenocyte cultures, were evaluated by cytokinespecific sandwich ELISAs. Antibodies R 4-6A2 and biotinylated XMG1.2 were used for IFN-γ while MM-011 and biotinylated MM-16E3 were used for IL-4 (all from Endogen, 87 Woburn, MA, USA). Coating antibodies were diluted to 2 µg mL-1 and conjugate antibodies were diluted to 0.5 µg mL-1. Cytokine concentrations were derived from linear dose-response standard curves obtained using dilutions of recombinant mouse IFN-γ (BD Pharmigen, San Diego, CA, USA) or recombinant mouse IL- (Endogen). Optical densities were measured at 450 nm after 15 min with TMB (tetramethylbenzidine) peroxidase substrate (Kirkegaard & Perry Laboratories) and H2O2 at room temperature. The reaction was stopped by addition of 1 M H2SO4. Fresh cell-free complete RPMI 1640 was used as negative control. 3.4.8 Statistical analysis Splenocyte proliferation assay and cytokines evaluation were carried out in triplicate for each bacterial extract, and all analysis was done in duplicate. Statistical analyses were performed with STATGRAPHICS plus 4.1 (Manugistics Inc., Rockville, MD, USA). Significant differences between treatments were tested by analysis of variance (ANOVA). The treatments were compared using Fisher’s least significant difference (LSD) method, with a level of significance of P < 0.05. 3.5 Results and discussion 3.5.1 Peptide and protein profile of bifidobacterial cytoplasm To compare the cytoplasmic peptide and protein profile of three isolates of bifidobacteria and B. lactis Bb12 cytoplasm extracts were analysed by SDS-PAGE. The results reported in Figure 3.1 showed difference and similarities in protein profile between the strains tested. The band corresponding to the molecular weight (MW) of 75 kDa was shown only by B. lactis Bb12. While, a common band with MW of 34 kDa was found to be characteristic to the isolates RBL81, RBL82, and RBL64. Bands with high MW (>45 kDa) and weak MW (<31 kDa) allowing discrimination between B. lactis Bb12 and isolates tested were also observed. More proteins and peptides appear to be biosynthesized by B. lactis Bb12 compared to other bifidobacterial strains. However, as can be seen in the 88 Figure 3.1, peptides seem to be produced in quantities non detectable by blue coomassie staining compared to proteins. Marasco et al. (1984) reported that bacteria elaborate in very low concentrations numerous peptides of similar composition, which may differ markedly in their specific biological activities. The differences observed in protein and peptides profile of bifidobacteria should be attributed to the variability and diversity of strain proteome. Champomier-Verges et al. (2002) mentioned that lactic acid bacteria strains grown in the same rich synthetic MRS medium show some common (a dozen) proteins which represent almost 20% of the total protein detected on the acidic proteomic map. However, lactic acid bacteria indicating metabolic adaptation to media conditions show some differences in protein content. Indeed, different stress treatments (e.g., heat, low pH, osmotic shock, etc.) have been reported to induce transiently general and specific proteins (e.g., heat shock proteins) by physiological changes enhancing bacterial ability to survive in adverse environmental conditions (Ang et al., 1991; Prasad et al., 2003, De Angelis et al., lac tis B B. RB L8 2 RB L6 4 RB L8 1 b1 2 2004). M kDa 97,5 66 45 31 21,5 Figure 3.1. Peptide and protein profile of cytoplasmic extracts from strains B. thermoacidophilum RBL64, RBL82 and RBL84, and B. lactis Bb12 obtained by SDS-PAGE using 10 % acrylamide gel. The band corresponding to the molecular weight (MW) of 75 kDa was shown only by B. lactis Bb12. While, a common band with MW of 34 kDa was found to be characteristic to the isolates RBL81, RBL82, and RBL64. Bands with high MW (>45 kDa) 89 and weak MW (<31 kDa) allowing discrimination between B. lactis Bb12 and isolates tested were also observed. More proteins and peptides appear to be biosynthesized by B. lactis Bb12 compared to other bifidobacterial strains. However, as can be seen in the Figure 3.1, peptides seem to be produced in quantities non detectable by blue coomassie staining compared to proteins. Marasco et al. (1984) reported that bacteria elaborate in very low concentrations numerous peptides of similar composition, which may differ markedly in their specific biological activities. The differences observed in protein and peptides profile of bifidobacteria should be attributed to the variability and diversity of strain proteome. Champomier-Verges et al. (2002) mentioned that lactic acid bacteria strains grown in the same rich synthetic MRS medium show some common (a dozen) proteins which represent almost 20% of the total protein detected on the acidic proteomic map. However, lactic acid bacteria indicating metabolic adaptation to media conditions show some differences in protein content. Indeed, different stress treatments (e.g., heat, low pH, osmotic shock, etc.) have been reported to induce transiently general and specific proteins (e.g., heat shock proteins) by physiological changes enhancing bacterial ability to survive in adverse environmental conditions (Ang et al., 1991; Prasad et al., 2003, De Angelis et al., 2004). 3.5.2 Fractionation of cytoplasmic content into acidic and basic fractions Peptides and proteins from B. lactis Bb12 were separated into different fractions by liquid-phase isoelectric focusing. This preparative technique allowed separation of amphoteric molecules such as proteins and peptides according to their isoelectric point (pI). Charged molecules migrate through a pH gradient in an electric field and reach their zwitterionic state at pH corresponding to their pI (Laas, 1998). After isofocusing, the pH of the peptide and protein fractions was measured to obtain the average pI for each fraction collected. The pH gradient generated by isofocusing of the cytoplasmic peptides and proteins resulted in 20 fractions with average pI ranging from 2 to 12. Bacterial peptides and proteins (i.e. Lactococcus lactis) have been reported to be distributed in two groups, an acidic and a basic group (Champomier-Verges et al., 2002). Because of the quantitative distribution of peptides fractions throughout the pH 90 gradient (Prioult et al., 2003), we pooled the peptide and protein fractions according to two ranges of pH: pH 2-5 for acidic fraction (10 fractions) and pH 5-9 for basic fraction (10 fractions). 3.5.3 Characterization of cytoplasmic acidic and basic fractions In order to separate several peptides and proteins with subtle differences in their amino acid composition, the acidic and basic fractions were analysed individually by RPHPLC. The chromatogram of each fraction is shown in Figure 3.2 and Figure 3.3. Chromatography system resulted in marked differences in retention time for several peptides and proteins when applied to the column as a mixture. In both fractions, we observed numerous peaks throughout the elution gradient indicating the presence of heterogeneous group of peptides and proteins. However, most of materials that are eluted earlier (5 to 10 mn) gave high absorbance (A210 > 1.0). Relative absorbance (A214) 1,6 4 1,4 1,2 1 0,8 0,6 0,4 1 0,2 2 3 0 0 5 10 15 20 25 30 Retention tim e (m in) Figure 3.2. Peptide and protein profile of acidic fraction (B. lactis Bb12) analysed by RP-HPLC (C18 column). Labelled peaks are selected and collected using an appropriated colum. 91 Relative absorbance (A214 ) 1,6 1,4 23 1,2 1 4 1 0,8 0,6 0,4 0,2 0 0 5 10 15 20 25 30 Retention time (min) Figure 3.3. Peptide and protein profile of basic fraction (B. lactis Bb12) analysed by RP-HPLC (C18 column). Labelled peaks are selected and collected using an appropriated colum. The early peaks in the HPLC fractionation probably would correspond to the peptides or proteins containing hydrophilic amino acids such as aspartic acid, serine, glutamic acid, alanine, and glycine (Schiffmann et al., 1975). Furthermore, some peptides or proteins could not easily be separated from others. Several minor peaks appear later (12 mn - 30 mn) in chromatogram indicating that more hydrophobic peptides and proteins would be present in cytoplasm in minute concentration. These peptides could be formyl methionyl peptides cleaved post-translationally from the NHs-terminal regions of newly synthesized proteins. The formyl methionine character of these peptides has been suspected since a large number of bacteria were shown to elaborate similar substances (Ward et al., 1968). It has been reported that both the biological activity of peptides and their affinity for the peptide receptor increase as the hydrophobic character of the constituent amino acids increases (Freer et al., 1982). However, complete characterization of these peptides and proteins has been hampered by their weak concentrations. Four peaks with high absorbance (major peaks) were selected in each fraction and were collected individually by preparative HPLC to be analyzed by mass spectrometry and 92 tested for their bioactivity. Mass spectrometry analysis of labelled peaks in chromatograms resulted in variable m/z corresponding to several components in each peak. Indeed, the mass spectra (not shown) demonstrated more than one component when individual fraction (labelled peak) was infused in spectrometry system. These results indicated partially purified peptide or proteins. The extraneous peaks present in the total mass spectra of each peptide or protein fraction (or labelled peak) are contaminants from other peaks due presumably to the interaction of peptides and proteins with column or other factors. Because of small quantities of HPLC-fractionated peptides and proteins selected, we were not able to enhance purity of the materials by subsequent HPLC runs. Then, the data analysis obtained for each labelled peak did not allow identification of peptide or protein fractionated. Moreover, the spectrometry data allow distinction between labelled peaks based on the molecular weight of peptides or proteins previously fractionated. The average molecular weight of the most abundant peptides or proteins fractionated are presented in Table 3.1. The results indicated that peptides with molecular weigh ranging from 510.16 to 10048.03 Da are biosynthesized in B. lactis Bb12. These peptides were detected in both acidic and basic fractions. Also, proteins with molecular weight higher than 13142.83 Da were shown by mass spectra. Table 3.1. Average molecular weight of most abundant peptides or proteins detected in each labelled peak from acidic and basic fractions. Peak 1 Peak 2 Peak 3 Peak 4 Acidic fraction Average mass S.D 510.16 00 10048.03 2.25 22450.60 4.63 13142.83 2.79 Basic fraction Average mass S.D 1187.24 0.08 13148.11 2.25 5.037.01 0.22 13556.74 3.58 In bacteria, most secreted proteins are synthesized as precursors containing the mature protein and an N-terminal signal peptide that is an essential signature for protein secretion. The signal peptide primary sequences are poorly conserved and show a common tripartite structure including a positively charged N-terminus, a hydrophobic core and a 93 neutral or negatively charged C-terminus containing the signal peptide cleavage site (von Heijne, 1990). Bacterial protein synthesis starts with a formylated methionine residue, and this residue is sequentially cleaved away by a unique peptide deformylase and a methionine aminopeptidase to generate mature proteins (Fu et al., 2003). Several bioactive formyl oligopeptides were shown to be produced by different species of enteric bacteria (Hobson et al., 1990). 3.5.4 Cell proliferation and cytokine production induced by semi purified peptides and proteins 3.5.4.1 Effect on cell proliferation The immunoactivity of semi-purified peptides and proteins from acidic and basic fractions were assessed measuring splenocyte proliferation and hallmark Th1 and Th2 cytokines IFN-γ and IL-4 production in the presence of these peptides or proteins at different concentrations in culture media. The cell proliferation was carried out with nonstimulated cells (in PHA-free media). Wells with PHA were used as positive control. The stimulation index (SI) obtained by both acidic and basic are presented in Figure 3.4. The results indicate that a cell proliferation stimulation was induced by cytoplasmic peptides and proteins depending on fraction and concentration used. The acidic fraction is shown to significantly stimulate (1,616 ± 0,08) splenocyte proliferation compared to the nonstimulated cells (cells alone) when used at high concentration (100 µg/ml). The cell proliferation induced by the acidic fraction was comparable with that obtained by PHA (1,66 ± 0,20); the SI given by basic fraction was estimated at 1,3349 (± 0,02). High stimulation of cell proliferation was obtained by cytoplasmic extract which showed a SI increasing from 1,41 (± 0,15) to 2,96 ( ± 0,35) when the extract concentration in culture media varied from 4 to 100 µg/ml respectively. Bacterial peptides and proteins (enzymes) were reported to be immunomodulatory and to influence the specific and nonspecific immune response (Houba et al., 1992; Dobrotina et al., 1992, Panaro and Mitolo, 1999). 94 3,5 d A Acidic fraction Basic fraction Cytoplasmic content Cells+PHA(10 µg/ml) Stimulation index 3 c 2,5 bc 2 1,5 ab ab ab a ab ab a ab bc a 1 0,5 0 0,4 4 40 PHAPH 100 Fraction (µg/ml) 3,5 B Peak 1 Peak 2 Peak 3 Peak 4 Cells+PHA(10 µg/ml) Stimulation index 3 2,5 c 2 1,5 c bc a ab a 1 a a ab 0,5 0 4 40 PHA PHA Peptides/Proteins (µg/ml) Figure 3.4. Effect of (A) acidic and basic fractions and crude cytoplasmic extract, and (B) semi purified peptides and proteins from B. lactis Bb12 on splenocyte proliferation. The cytoplasmic preparation was normalized on the basis of its protein content. Columns with different letters are significantly different. These results are in accordance with those obtained in our previous study. Increased cell proliferation induced by crude cytoplasmic extract could be explained by the presence of synergistic components in cytoplasm of B. lactis Bb12. Indeed, Iliev et al. (2005) demonstrated that chromosomal DNA motifs from Lactobacillus rhamnosus GG are active 95 in both murine and human immune cells. Nevermore, these results agree with those recently reported by Lee et al. (2004) who mentioned that administration of cytoplasmic fraction of Lactobacillus casei and Bifidobacterium longum to mice for 4 weeks enhanced the number of total T cells, NK cells and MHC class II+ cells, and CD4-CD8+ T cells. In order to compare the immunostimulatory effects of peptides and proteins in the acidic fraction, we tested separately four majors peaks (labelled peaks) at concentrations of 4 and 40 µg/ml. Significant increased cell proliferation was induced by semi purified peptides corresponding to peak 1 (1,50± 0,03) and peak 2 (1,68 ± 0,22) when used at 40 µg/ml. It has been reported that several peptides from bacteria are target of both T and B cell responses and could be exploited for vaccine purposes (Chua-Intra et al., 1998; Hussain et al., 2004). Peptides receptor such as formyl-peptide receptor (FPR) and its variant FPRL1 (FPR-like 1) have been found to be expressed at high levels on human leucocytes involved in inflammatory processes induced by bacteria (Le et al., 2002; Ernst et al., 2004). The nature of amino acids was reported to influence the immunoactive properties of the peptide or protein which contains them. For example, a D-methionine-containing peptide, Trp-Lys-Tyr-Met-Val-D-Met-NH2, has been found to be a stronger activator of neutrophils than f-Met-Leu-Phe. D-isomers amino acid are used in protein synthesis only by prokaryotes and then generate danger signals to the innate immune system (Svensson et al., 2002). The overall results suggest that the cytoplasmic peptides (and proteins) are immunoactive components that contribute to immune stimulation induced by cytoplasm of B. lactis B12. The differences in cell proliferation could be attributed to the difference in nature or amino acid composition between peptide and protein from cytoplasm. The low hydrophobicity of peptides and proteins tested does not appear to be a factor influencing greatly the immune response. Vinderola et al. (2004) have investigated the relationship between interaction sites in the gut, hydrophobicity, mucosal immunomodulating capacities and cell wall protein profiles in lactobacilli, bifidobacteria and enterococci. They mentioned that the highest interaction capacity with Peyer’s patches and nodules was observed for enterococci, which presented the smallest hydrophobicity values. While, 96 bifidobacteria and actobacilli, which showed a lower interaction capacity with lymphoid follicles, presented higher values of hydrophobicity. 3.5.4.2 Effect on cytokine production To determine the effect of cytoplasmic peptides and proteins from B. lactis B12 on cytokines secreted by activated lymphocytes, we analyzed the production of IFN-γ and interleukin IL-4. It is well established now that Helper T cells (Th) are heterogeneous with regard to cytokine secretion and their functions. Th1 cells produce mainly IL-2 and IFN-γ, while Th2 cells predominantly produce IL-4 and IL-6. These two cytokines are shown to have antagonistic functions (Yazdanbakhsh et al.,1999; Valentini et al., 2001). The production of IFN-γ and IL-4 by splenocytes cultured with various concentration of cytoplasmic extract, and the acidic and basic fractions is illustrated by Figure 3.5 and Figure 3.6. Acidic fraction Basic fraction Cytoplasmic content Cells+PHA (10 µg/ml) e 1400 1200 IFN-γ (pg/ml) 1000 d cd 800 bc 600 400 200 ab ab ab a ab a a a 0 0,4 4 40 100 PHA Fraction (µmg/ml) Figure 3.5.. Effect of acidic fraction, basic fraction, and crude cytoplasmic extract from B. lactis Bb12 on splenocyte IFN-γ production. The cytoplasmic preparation was normalized on the basis of its protein content. Columns with different letters are significantly different. 97 16 e 14 de 12 IL-4 (pg/ml) Acidic fraction Basic fraction Cytoplasmic content Cells+PHA (10 µg/ml) 10 8 6 4 bc c abc abc abc bc abc 2 cd ab ab a 0 0,4 4 40 100 PHA alone Fraction (µg/ml) Figure 3.6. Effect of acidic and basic fraction, and crude cytoplasmic extract from the strains B. lactis Bb12 on splenocyte IL-4 production. The cytoplasmic preparation was normalized on the basis of its protein content. Columns with different letters are significantly different. According to these results, both crude cytoplasmic extract and basic fraction induce a bell-shaped dose-response curve. As shown in Figure 3.5, splenocytes stimulated by cyplasmic extract from B. lactis Bb12 secreted approximately twofold IFN-γ (1199,57 ±127,60) higher than when stimulated by the basic fraction (578,55±195,16) and fourfold when cultured with the acidic fraction (191,08±7,50 pg/ml). While, IFN-γ production obtained with PHA was estimated at 127,10±101,50 pg/ml. Th1 cells appear to be more stimulated by basic fraction compared to acidic fraction. The results reported in Figure 3.6 demonstrate low IL-4 production compared to those of IFN-γ obtained by cytoplasmic content, and both acidic and basic fractions. Hence, Th2 cells seem to be weakly stimulated. The most significant production of IL-4 was obtained by crude cytoplasmic extract (9,14±4,04) and basic fraction (4,14±2,02). While, the production of IL-4 increased slightly upon treatment with acidic fraction (< 3,86 pg/ml). 98 Th1 lymphocytes stimulate cell-mediated immunity, which is characterized by intense phagocytic activity. Conversely, Th2 cells stimulate humoral immunity, which is characterized by high antibody production. Evidence suggested that coinduction of T2 immunity maintains immune homeostasis during T1-mediated defence reactions. Th1 cells also stimulate moderate levels of antibody production, whereas Th2 cells actively suppress phagocytosis (Spellberg and Edwards, 2001; Bot et al., 2004). It has been demonstrated that synthetic peptides stimulate T cell chemotaxis showing unique signalling and provide a helpful tool to understand the T cell activation mechanism (Zachariae et al., 1992; Kim et al., 2001). The synthetic peptides were shown to stimulate the formation of inositol phosphates in lymphocyte cells (Baek et al., 1996). Wang et al. (2004) reported that a fungal immunomodulatory protein from Flammulina velutipes (FIP-fve) exhibited potent mitogenic effects on human peripheral blood lymphocytes, inducing G1/G0 to S phase proliferation. The activation of T cells resulted in significant production and secretion of IFN-γ associated with intercellular adhesion molecule 1 expression but low detectable levels of interleukin-4 in vitro or in vivo. 3.6 Conclusion These results obtained confirmed previous observations that cytoplasm from B. lactis Bb12 stimulate the cell proliferation and cytokines production in mouse splenocytes. In this study, we have demonstrated that B. lactis Bb12 cytoplasm contains an heterogeneous group of peptides and proteins characterized by a wide range of isoelectic pH and molecular weight. The cytoplasmic peptides and proteins were found to have low hydrophobicity, and to be heat-stable and immunostimulatory. The acidic fraction (100 µg/ml) stimulated cell proliferation (SI= 1,616 ± 0,085), whereas the basic fraction induced more IFN-γ secretion (578,55±195,16 pg/ml). The most significant immunostimulation (SI= 2,96 ± 0,35) was obtained by cytoplasmic content suggesting that the cytoplasm contains a components acting synergistically with immunostimulatory peptides or proteins. However, IL-4 secreted by lymphocytes stimulated by cytoplasmic content, and both acidic and basic fractions, was slightly increased. Further studies could be performed to improve separation of peptides and/or protein using ionic exchange chromatography, and to identify 99 these components by sequencing method. Furthermore, nonlabelled peaks showing high hydrophobicity could be explored for their mitogenicity producing high quantities of material in optimized conditions. Evidence demonstrates that peptides and proteins derived from B. lactis Bb12 cytoplasm could be delivered in intestinal environment and activate the immunocompetent cells of the mucosal immune system. The potent immunostimulating effect of cytoplasm could suggest the possibility of use of bifidobacaterial extract as nutraceutical products. ACKNOWLEDGMENTS This work was supported by grants from FCAR, NOVALAIT, MAPAQ and NSERC. T. Amrouche was recipient of scholarships from the World Bank. We thank ADVITEC team mainly S. Gauthier and N. Attouri for their contribution. Chapitre IV: Production et caractérisation d’anticorps monoclonaux anti-bifidobactéries et leur application dans le développement d’une méthode de détection en immuno-culture. Production and characterization of anti-bifidobacteria monoclonal antibodies and their application in the development of an immuno-culture detection method T. Amrouche a,b,c, Y. Boutin b,d, O. Moroni a,b, E. Kheadr a,e, and I. Fliss a,b* a Dairy Research Center STELA, Pavillon Paul-Comtois, Université Laval, Québec (Qc) G1K 7P4, b Institute of Nutraceutical and Functional Foods INAF, Université Laval, Québec (Qc) G1K 7P4, c Department of Food Technology, Faculty of Agronomy and Biological Sciences, University of Tizi-Wezzu, Algeria, d TransBiotech, CEGEP Lévis Lauzon, Lévis (Qc) G6V 9V6, e Department of Dairy Science and Technology, Faculty of Agriculture, University of Alexandria, Alexandria, Egypt. Journal of Microbiological Methods: sous presse 101 Les travaux rapportés dans ce chapitre représentent la continuité de ceux présentés au premier chapitre et qui démontrent la mitogénicité de la paroi des bifidobactéries. L’objectif visé par ce chapitre est de produire et caractériser des anticorps monoclonaux spécifiques aux bifidobactéries afin de développer une méthode de détection et de quantification des bifidobactéries dans les aliments et l’environnement. Des souches standard ATCC de bifidobactéries d’origine humaine et animale ont été utilisées. 4.1 Résumé Les bifidobactéries, très connues pour leur potentiel probiotique, sont de plus en plus utilisées dans l’industrie alimentaire. Cependant, l’un des problèmes liés à leur utilisation est la détection et l’identification des espèces de bifidobactéries qui survivent dans les produits alimentaires. Cette étude a pour but de développer un anticorps monoclonal permettant de détecter spécifiquement les bifidobactéries vivantes dans les aliments. Dans une étude antérieure on a isolé localement des souches de bifidobactéries et clairement démontré le pouvoir immunogène de la paroi de bifidobactéries. Lors de la présente étude, des protéines de paroi ont été utilisées comme antigènes de surface pour produire des anticorps monoclonaux contre les bactéries du genre Bifidobacterium. Les protéines ont été extraites et purifiées à partir de six espèces différentes de bifidobactérie (B. animalis, B. breve, B. longum, B. infantis, B. bifidum et B. pseudolongum) cultivées sur milieu MRS en anaérobiose. L’analyse par SDS-PAGE des extraits protéiques obtenus a révélé des différences au niveau du profil protéique des parois isolées. Cependant, des bandes similaires (58 et 34 kDa) indiquant probablement des protéines communes aux espèces étudiées ont été identifiées. Testées pour immunogénicité, les protéines pariétales issues de B. bifidum et B. longum ont généré une plus forte production d’immunoglobulines spécifiques (titre en anticorps de 53333) chez la souris Balb/C. Des anticorps monoclonaux spécifiques aux bifidobactéries ont été ensuite produits par fusion cellulaire. Les clones sélectionnés pour leur forte production d’IgG (anti-B. longum) ont montré une réactivité croisée avec l’ensemble des espèces de bifidobactérie indiquant une forte homologie entre les différentes espèces. L’antigénicité partagée par les bifidobactéries a été confirmée par le western-blot révélant un épitope (segment protéique) supporté par une protéine commune (58 kDa) et reconnu par l’anticorps anti- B. longum. En outre, la spécificité de cet anticorps 102 a été déterminée en le testant sur d’autres bactéries (Propionibacterium freudenreichii, Pediococcus acidilacticii, Lactococcus lactis subsp. lactis, Enterococcus faecium et Listeria innocua) répondant négativement au test. A l’exception de Lactobacillus rhamnosus qui a donné un signal relativement élevé indiquant une similitude antigénique avec les bifidobactéries. Par ailleurs, une observation au microscope électronique après un traitement immunochimique des bifidobactéries a montré clairement l’interaction anticorps-antigène bactérien. La sensibilité de l’anticorps produit a été estimée à 10 (5) cfu/ml. L’anticorps ainsi développé a montré son efficacité dans la détection des bifidobactéries vivantes par des tests d’immuno-culture et laisse suggérer une possibilité de son utilisation dans la quantification de ces bactéries dans divers aliments et matrices. Mots clés : Anticorps monoclonaux, Bifidobactéries, Immuno-culture, Protéines pariétales, Quantification. 4.2 Abstract An immuno-culture method has been developed by combination of specific monoclonal antibodies and plate culture to allow detection of viable bifidobacteria. Cell wall proteins were selected as surface antigen to produce antibodies against bifidobacteria. The cell wall proteins were extracted and purified from six ATCC strains of bifidobacteria grown in MRS broth using an anaerobic system. To compare the profile of the protein extracts, all the protein solutions obtained were analyzed by SDS-PAGE. Similar bands corresponding to the major proteins of each species of bifidobacteria were observed. The proteins were tested for their immunogenicity in Balb/c mice after immunization and subsequent analysis using ELISA procedures. Profound immune responses were generated in mice immunized by proteins from Bifidobacterium bifidum and Bifidobacterium longum. Monoclonal antibodies were produced against B. longum and tested for their specificity, sensitivity and cross reactivity with other bifidobacteria species. All the hybridoma cells selected produced anti-B. longum antibodies cross reacting with native and purified proteins from five other bifidobacteria species. An epitope supported by a cross-reacting protein of 58 kDa shared by bifidobacteria was revealed by western blot. This was confirmed by immune-transmission electron microscopy observations which showed the 103 specific interaction of these antibodies with bifidobacterial cell wall proteins. Also, the antibody obtained was found to be specific for the genus Bifidobacterium and sensitive, allowing the detection of at least 105 target cells/ml. An immuno-culture detection approach was then developed using the selected anti-B. longum antibodies. This method was shown to be very efficient for the detection of viable cells of bifidobacteria suggesting the possibility of its use to quantify this bacteria in various food products and matrices. Key words: Bifidobacteria, cell wall proteins, monoclonal antibodies, immuno-culture, quantification. 4.3 Introduction Bifidobacteria were reported to be the main genus in the gut bacterial population of infants (Ouwehand et al., 2004). These bacteria are considered essential for maintaining a healthy equilibrium between the population of beneficial and potentially harmful microorganisms in the gastrointestinal tract (Fuller, 1989, Postnikova et al., 2004). The health and nutritional benefits attributed to bifidobacteria include maintenance of a healthy intestinal microflora, improvement of lactose digestibility and tolerance, antitumor activity, reduction of serum cholesterol levels, synthesis of vitamins, and increasing immunity in host animals (Noda et al., 1994; Jiang et al., 1996; Pereira and Gibson, 2002; You et al., 2004; Vinderola et al., 2004). Therefore, there is an increasing interest in using these bacteria as probiotics, either in fermented dairy products or formulated as tablets. Indeed, several bifidobacteriacontaining products such as yogurt, fermented milk and health foods are currently sold in the world particularly in USA, Japan and Europe (Mercenier et al., 2002). Unfortunately, numerous probiotic products are incorrectly labeled and yielded low bacterial counts, which may decrease their probiotic potential (Drouault et al., 1999; Bunthof et al., 2001). Accurate identification of bifidobacterial strains in products must then be implemented so that consumers can be reliably informed of the content of probiotic products (Tannock, 1999). The use of a microscopic technique is a more direct approach; however, this 104 approach does not allow a differentiation of live and dead bacteria. Auty et al. (2001) assessed the viability of the human probiotic strains Lactobacillus paracasei NFBC 338 and Bifidobacterium sp. strain UCC 35612 in reconstituted skim milk by confocal scanning laser microscopy using the LIVE/DEAD BacLight viability stain. However, the viability staining was limited by environmental factors such as pH, ionic profile, and water activity. Currently, the approach used to analyze probiotic products is still based on culturedependent methods using specific isolation media and allowing identification of a limited number of isolates. These methods are relatively insensitive, laborious, and timeconsuming. The detection or enumeration of surviving bifidobacteria in some products such as yogurts, cheese, butter, and tissues has been most difficult because of lack of a truly selective medium which can discriminate between the genus Bifidobacterium and other genera (Lim et al., 1995; Roy, 2001). However, in the last few years numerous culture-independent approaches based on molecular methods have emerged for the identification and a rapid detection of bifidobacteria in mixed probiotic cultures (Matsuki et al., 2004; Takada et al., 2004). This approach involved extraction of total bacterial DNA directly from the product, polymerase chain reaction (PCR) amplification of 16S ribosomal DNA, and separation of the amplicons on a denaturing gradient gel. These methods allowed direct identification of the amplicons at the species level (Temmerman et al., 2003, Fasoli et al., 2003). For example, culture independent fluorescent in situ hybridization (FISH) technique, and PCR were recently used to analyze the development of intestinal flora in infants, and bifidobacteria in human feces. These methods offer several advantages over cultural methods in terms of sensitivity and specificity (Kok et al., 1996; Harmsen et al., 2000; Takada et al., 2004). However, the molecular methods reported are not able to distinguish between dead and live bifidobacteria in probiotic products. Comprehensive studies should be initiated to develop new methods able to detect and quantify viable bifidobacteria in fermented products. The development of antibodies against a specific cell compound could provide an attractive and reliable method for detecting micro-organisms in biological samples (Porsch-Ozcurumez et al., 2004). 105 Bacterial-detection immunoassays (ELISA, immunobloting, etc…) and immunomagnetic separation offer several advantages compared to conventional cultural methods: easy to use, inexpensive, specific to the target host, and rapid (Varadaraj, 1993). However, newly prepared antibodies are not tested for their reaction towards live cells to determine their affinity to viable bacteria (Brovko et al., 2004). A method based on a combination of semiselective cultivation and colony immunoblotting techniques allowing simple and quantitative detection of Bifidobacterium animalis strains in human feces has been developed by Duez et al. (2000) using rabbit polyclonal antibodies. However, the polyclonal antibodies produced were specific to strains belonging to B. animalis, thus it can not be used to detect other bifidobacteria i.e. the species or strains most frequently found in commercial fermented products. Specific monoclonal antibodies allowing the detection of viable bifidobacterial species and strains in biological media and food products are not available yet. The overall aim of this study was to produce and characterize different monoclonal antibodies against different species of bifidobacteria and to evaluate their effectiveness in developing a new immuno-culture approach allowing the detection and quantification of various viable bifidobacteria. 4.4 Material and methods 4.4.1 Bacterial strains and culture conditions B. animalis ATCC 27536, B. breve ATCC 15700, B. longum ATCC 15708, B. infantis ATCC 15697, B. bifidum ATCC 15696 and B. pseudolongum ATCC 25526 were obtained from the American Type Culture Collection (Rockville, MD, USA). Cells were grown in 300 ml of de Man-Rogosa-Sharpe broth (MRS) (Rosell Institute Inc., Montreal, PQ, Canada) supplemented with 0.05 % cysteine-HCl (vol/vol) to lower the oxidationreduction potential of the medium and to enhance the anaerobic growth of bifidobacteria (Sreekumar and Hosono, 1998). Tween 80 was added to the final concentration of 1% (vol/vol). The incubation of each culture was carried out overnight at 37°C in anaerobic jar 106 containing carbon dioxide generating sachet (AnaeroGen, Oxoid Ltd., Basingstoke, England). 4.4.2 Protein extraction and purification The cells were harvested from MRS broth by centrifugation at 5,500 g for 10 min and washed in 100 ml of phosphate buffered saline (PBS, 0.01M, pH 7.4) to be finally resuspended in 150 ml deionised water. The cells were disturbed mechanically by dynamic high pressure using High-Pressure Homogenizer (Avestin, Ottawa, ON, Canada). The suspension was treated five times at 200 Megapascal (MPa) to obtain a maximal cellular lysis. The suspension was centrifuged three times at 30,000 g for 30 min. The supernatant was removed and pellets washed with PBS between centrifugations. The pellets containing cell wall were suspended together in water at the final volume of 1 ml. Sodium dodecyl sulfate (SDS) was added to the samples at final concentration 20% (wt/vol) and they were heated at 100°C for 10 min to precipitate other portions of cellular wall away from the proteins. The proteins were separated by centrifugation at 15,800 g for 25 min. The residual SDS was removed by maintaining the protein solution overnight at 4°C and then, centrifuged at 15800 g for 25 min. The protein concentration of all samples was determined by Lowry method (1951) using bovine serum albumin (BSA) (Sigma, MO, USA) as standard. The cell wall protein profile of each bifidobacterial strain was obtained by 10% polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) performed in the presence of sodium dodecyl sulfate (SDS) according to Laemmli (1970). Molecular markers (Bio-Rad Laboratories, Hercule CA, USA) with molecular mass ranging from 21.5 to 97.5 kDa were used to compare the molecular weight of cell wall proteins. 4.4.3 Immunization of mice and evaluation of specific antibody production Six to eight week-old male Balb/c (Charles Rivers, St. Constant, Quebec, Canada) mice were immunized with cell wall proteins. In brief, 100 µl of protein solution (1 mg/ml) 107 were emulsified in an equal volume of complete Freund adjuvant (Eskenasy, 1968) for the first injection and incomplete Freund adjuvant for the subsequent injections. The immunization protocol consisted of four subcutaneous injections of 100 µl emulsion (protein plus adjuvant) at three-week interval. Serum samples were obtained just before the first immunization by retro-orbital sinus method to be used as negative control in specific antibody evaluation. Serum samples were also obtained ten days after each antigen injection and subsequently analyzed separately. All sera were analyzed by Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) procedures to determine specific antibody titer. Briefly, wells of flat-bottomed, polystyrene plates (Immulon II, Dynatech Laboratories, Alexandria, VA, USA) were coated overnight at 4°C with a solution (100 µl/well) containing cell wall proteins at optimal concentration of 1 µg/ml in 0.05 M sodium carbonate buffer (pH 9.6). Microplates were washed twice with 200 µl Tris-buffered saline (TBS 1X, pH 7.5) - 0.1% (vol/vol) Tween 20 with an automated ELISA plate washer (Dynex, Chantilly, VA, USA) and then blocked for 1 h at 25°C with PBS – 1% (vol/vol) blocking reagent (Roche Diagnostic GmbH, Mannheim, Germany). All serum samples were initially diluted 1/100 in PBS – containing 0.5% (vol/vol) blocking reagent. If positive, sera were tested at higher dilutions: 1/1000, 1/2000, 1/4000, 1/8000, 1/16000, 1/32000, 1/64000, 1/128000 as needed to determine the antibody titer. After four washes with TBS–0.1% Tween 20, 100 µl of sample were added in duplicate in wells and incubated at 37°C for 2 h. Wells were then washed and horseradish peroxidase-conjugated anti-mouse IgG and IgM (KPL, Maryland, USA) diluted to 1:1000 in PBS – 0.5% BR were added to each well (100 µl/well). Wells incubated with sera collected before the first antigen injection were used as negative control. The wells were washed six times with TBS- 0.1% Tween 20 and added with 100 µl of orthophenylenediamine solution (Sigma, Saint Louis, MO) at 0.4 mg/ml of 0.05 M phosphate-citrate buffer (pH 5.0) as substrate. The absorbance was measured at 450 nm on an ELISA plate reader (Molecular Devices, Sunnyvale, CA, USA). 108 4.4.4 Monoclonal antibody (Mab) production Prior to cell fusion, mouse with the highest antibody titer was boosted with 50 µg of cell wall proteins from B. longum ATCC 15708 without adjuvant for three days successively. The mouse was then sacrificed by cervical dislocation and splenectomised. Spleens were removed aseptically from euthanized Balb/C mice and single cell suspensions were prepared by mechanically disrupting the tissues through a sterile nylon cloth sieve (100 µm pore size) into Iscove Modified Dulbecco’s media (IMDM) containing penicillin/streptomycin (1 % vol/vol). The splenocytes were fused with SP2/O-Ag14 mouse myeloma cells using polyethylene glycol. The fused cells were suspended in IMDM added with 20% (vol/vol) fetal calf serum, antibiotics and hypoxanthine-aminopterin-thymidine (HAT). The suspension was dispensed (200 µl/well) into 96-well microplates (Costar, Cambridge, MA, USA). The microplates were incubated at 37°C in the presence of 4.5% CO2 for 12 days. In order to screen cultures for antibodies production, 100 µl of culture supernatant were added to wells of 96-well Immulon II microplates previously coated with cell wall proteins. The supernatants were also tested on bacterial cells to evaluate the ability of antibodies to detect bifidobacteria. Briefly, suspension of each bifidobacterial strain was prepared in PBS (O.D 650 nm = 0.1) and added (100 µl) to wells and centrifuged at 2800 rpm for 5 min. The cells (pellet) were then immobilized by glutaraldehyde (0.25%, vol/vol) for 15 min at room temperature. The plates were washed and blocked with PBS - 3% (vol/vol) BSA for 1 hour at 37°C. The ELISA test was completed as described above. Hybridomas from cultures showing significant antibody production were selected and cloned by limiting dilution culture. 4.4.5 Purification and isotyping of monoclonal antibody The supernatants from the selected clones were filtered (0.45 µm) and purified by affinity chromatography using ImmunoRPure (A/G) IgG Purification Kit (Pierce, Rockford, IL, USA). The antibodies were eluted using 0.1 M glycine solution (pH 2.5) and harvested in 1 M K2HPO4 solution (pH 9.5). The antibody solution was dialyzed and concentrated in PBS by centrifugation using centricon (30,000 Da). The concentrate was aliquoted and stored at –20°C. The isotype of antibodies from different supernatants was determined 109 using Mouse Monoclonal Antibody Isotyping Kit (Roche Molecular Biochemicals, Indianapolis, USA). 4.4.6 Determination of cross reactivity by western blot To further asses the cross reactivity between bifidobacterial strains, a western blot analysis was performed using one of the anti-B. longum monoclonal antibodies. Briefly, the protein solutions were applied to a 10% SDS-polyacrylamide gel to separate proteins. After electrophoresis, the proteins were transferred in a Immun-Blot PVDF membrane (Bio-Rad Laboratories) at 100 V for 1 h. The membrane was blocked with 3% (vol/vol) BSA for 1 h and reacted with diluted anti-B. longum (0.06 µg/ml) for 2 h. The membrane was washed and incubated for 1 h with horseradish peroxidase-conjugated anti-mouse IgG + IgM diluted 1:1000. After washing, the substrate (3,3`-Diaminobenzidine tetrahydrochloride, Sigma) was added. 4.4.7 Antibody specificity test The specificity of the Mab produced was determined by ELISA comparing the reactivity of the antibody between the different strains of bifidobacteria and nonbifidobacterial species which can be present in foods or tissues: Propionibacterium freudenreichii P36, Pediococcus acidilacticii R1001, Lactobacillus rhamnosus R0011, Lactococcus lactis subsp lactis R0058 and Enterococcus faecium R0026 were obtained from Rosell Institute Inc. Listeria innocua HPB13 was obtained from Health Protection Branch (Health and Welfare Canada, Ottawa, ON, Canada). The bacteria were immobilized using glutaraldehyde according to the procedure mentioned above. 4.4.8 Sensitivity test Bifidobacterial cells from an overnight culture were enumerated on agar media and diluted at 108 cfu/ml in PBS 1X. Serial dilutions from 108 to 103 cfu/ml were prepared to be added at 100 µl/well in 96-well plates (Immulon II) and immobilized by gluataraldehyde as described above. ELISA was carried out using purified antibody (anti-B. longum) at optimal concentration of 0.5 µg/ml. 110 4.4.9 Immune-Transmission electron microscopy (TEM) Cells from 18 h MRS culture of B. longum ATCC 15708 were washed and encapsulated in 3% (wt/vol) agarose. Cubes of agarose (0.8 to 1.0 mm) were fixed overnight at 4°C in 4% (wt/vol) paraformaldehyde in 0.1 M sodium cacodylate buffer (pH 7.2). After being washed four more times with sodium cacodylate buffer, the samples were dehydrated in a graded ethanol series, embedded in Quetol (Marivac, Halifax, NS, Canada), and polymerized at 55°C overnight (Abad et al. 1987). Ultrathin sections (0.1 µm) of samples were cut with an ultramicrotome (Reichert-Jung, Vienna, Austria) and collected on Formvar-coated nickel grids (JBEM, Dorval, PQ, Canada). For the immunological reaction, the grids were incubated at 37°C for 1 h in 0.3% (wt/vol) BSA and washed with PBS. The grids were then incubated at 37°C for 1 h with Mab anti-B. longum (5 µg protein /ml). The grids were then washed five times (10 min each) in PBS. Gold labeling was carried out by incubating the grids for 15 min at room temperature with protein A-colloidal gold (10 nm in diameter; Sigma) diluted 1/10 in PBS containing 0.2% (wt/vol) polyethylene glycol 8000 (Sigma). The grids were washed again six times, dried, stained with uranyl acetate and lead citrate, and examined with a JEOL 1200 EX transmission electron microscope (Tokyo, Japan) at 80 kV. Eight to twelve fields from five to seven ultrathin sections resulting from four grids were examined, and photographs were taken through the observed grids. 4.4.10 Detection of bifidobacteria using an Immuno-culture (IC) method An original approach using a combination of the anti-B. longum Mab and a selective culture medium was developed for the specific detection of strains belonging to the genus Bifidobacterium (genera). To perform this test, anti-B. longum monoclonal antibodies were diluted in PBS to final concentration of 2.5 and 1.5 µg/ml and immobilized on multiwell TM 6-well (Falcon-BD, NJ, USA) plate directly or via protein A. In the last case, protein A was added to microplate wells at a concentration of 10 µg/ml prior to the addition of anti-B. longum Mab. Wells were then washed three times with PBS (1ml/well) and blocked with 1 ml of 0.3% (wt/vol) BSA solution at 37oC for 1h. Wells were washed three times with PBS and then 800 µl of B. longum culture was added at different concentrations. Plates were incubated at 37oC for 2h, before wells were washed four times with PBS. Three ml of MRS-agar supplemented with 0.05, (wt/vol) of L-cysteine were poured into each well and 111 plates were incubated again at 37oC for 24 to 48 h before bifidobacteria colonies were counted. 4.5 Results and discussion To develop an Mab able to be used as molecular tool to detect specifically bifidobacteria species in foods and environment, the cell wall proteins of bifidobacteria were selected as antigens for the present study. These cell components are more advantageous because they should be detected on surface of whole cells. Also, the cell wall proteins should have several amino-acid sequences common to the bifidobacterial strains. However, the composition and the conformation of these proteins are not known. These antigens were purified, analyzed and tested for their immunogenicity by immunization of mice. The profiles of cell wall proteins from six species of bifidobacteria used in this study are represented in Figure 4.1. Major proteins with similar molecular weight around 58, 48, 37 and 34 kDa were visualized after coomassie blue coloration in each strain. The similar bands indicate the probable common proteins shared by the species of bifidobacteria studied. kDa M gum n lis e o s l a um o m um t i ani . brev. long . infan. bifid pseud . B B B B B B. 97,5 66 45 31 21,5 Figure 4.1. SDS-PAGE of cell wall proteins from six bifidobacteria strains carried out with 10 % acrylamide gel. However, other bands showing difference between bifidobacteria were also observed. Indeed, the proteins from B. animalis ATCC 27536, B. breve ATCC 15700 and 112 B. longum ATCC 15708 show some difference with those from B. infantis ATCC 15697, B. bifidum ATCC 15696 and B. pseudolongum ATCC 25526. B. animalis ATCC 27536, B. breve ATCC 15700 and B. longum ATCC 15708 show similar profiles, with major bands of 59, 48, 37 34 and 25 kDa. Whereas, B. infantis has an electrophoretic profile different from the other with a major band of 83 kDa. Protein profiles of B. bifidum and B. pseudolongum are similar but different from the other species. No earlier studies have reported characterization of cell wall proteins from bifidobacteria with antibodies. To study the immunogenicity of proteins used for immunization, antibody titers in sera were evaluated by ELISA after the mice received four injections of the same antigen. The antibody titer is defined by the dilution giving twice the signal (OD450 nm) compared to the serum from a non immunized mouse. The variations of polyclonal antibody generation are shown in Figure 4.2. Sera of mice receiving cell wall proteins from bifidobacteria strains showed an antibody titer increasing with protein administration (data not shown). The maximal antibody titers ranging from 6666 to 53333 were obtained after three or four immunizations of mice by proteins. However, significant differences in antibody responses against the proteins were observed in mice. Indeed, optimal antibody titers were observed with mice immunized by proteins from B. longum ATCC 15708 and B. bifidum ATCC 15696. In contrast, the cell wall proteins from B. animalis ATCC 27536 generated the lowest antibody production in mice (6666). Our results are not in accordance with those reported by Duez et al. (2000) revealing high immunogenic protein in cell wall of B. animalis strain DN-173 010. They demonstrated that a protein of about 45 kDa was detected by specific rabbit polyclonal antibodies at 1: 64,000 dilution of the serum. The contrasting results on the generated antibodies capacity against proteins tested could depend on several factors including variations in composition and/or structure of proteins administrated, purity of protein and immunization procedure and genetic characteristics of mice. The results obtained are in accordance to those reported by Magnarelli et al. (2002). These authors observed a cross reactivity between human sera and several antigens (membrane protein) from Borrelia 113 burgdorferi. Regardless of the antibody levels obtained, the proteins used in our study were able to induce a significant immune response. 80000 70000 Antibody titer 60000 50000 40000 30000 20000 10000 0 B. ma a ni lis B e . br ve B. gu l on m B. an i nf ti s B f . bi i du m ps B. eu on dol gum Bifidobacteria Figure 4.2. Antibody level of mice immunized by cell wall proteins from six bifidobacterial species. The averages presented were calculated from values corresponding to the three mice receiving the same antigen. To further study the reactivity between polyclonal antibody produced and the native total protein exposed on cell surfaces of bifidobacteria, sera raised against purified proteins were tested on all bifidobacteria used in this study. All the sera obtained in 9 weeks were tested against cell wall proteins and whole cells of six bifidobacteria immobilized by glutaraldehyde (data not shown). The sera showed a high reactivity with bifidobacteria species tested compared to the negative control (non immunized mouse). They gave similar or high signals with purified proteins suggesting the exposure of the proteins on cell surface of bifidobacteria. According to Li and Magee (1993), the antibodies react strongly with purified antigen but weakly with native total protein antigen. In addition, the sera cross reacted with all bifidobacteria used due probably to the common proteins mentioned above. As mice immunized with proteins from B. longum ATCC 15708 and B. bifidum ATCC 15696 gave the highest antibody levels, they were selected to produce monoclonal 114 antibodies. Twenty two clones selected for their significant antibody production compared to the positive control (sera from immunized mice) were tested for their cross reactivity with the cell wall protein of bifidobacteria. Interestingly, all supernatants tested reacted with the proteins from the six bifidobacteria species. These results confirm the cross reactivity observed previously with polyclonal antibodies. In order to produce a Mab that will recognize most members of the bifidobacterial genus, only one clone producing antibody potentially specific for B. longum ATCC 15708 was selected and used in our study. This clone was found to produce an antibody cross-reacting with all bifidobacteria used. Indeed, when tested on bacterial cells immobilized by glutaraldehyde it recognized the bifidobacterial species as well as observed in sera from mice immunized (data not shown). The isotype of the monoclonal antibody obtained was found to be Ig G2bκ or Ig Mκ. A western blot was done to determine if the cell wall protein detected by SDS-PAGE matched the cross reacting protein found in ELISA assays. Western blotting carried out using cell wall proteins (Figure 4.3) validate the ELISA results mentioned above and revealed one cross reacting protein at a mass of approximately 58 kDa. an B. im s a li d um tis um e v e lo n g in fa n b ifid p se u r b . . . B B B B. B. n o lo gu m kDa 97,5 58 kDa 66 45 31 21,5 Figure 4.3. Western blot carried out with protein solution from bifidobacteria using purified monoclonal antibody anti-B. longum ATCC 15708 at concentration of 0.06 µg/ml. The proteins were separated on acrylamide (10%) gel and transferred in PVDF membrane. Presence of a common epitope in bifodobacterial species indicate antigenic similarities between different species tested. The same results were obtained by the cells of 115 bifidobacteria (data not shown) suggesting the ability of the antibody to bind its targeted protein on the cell wall. A reasonable explanation of results is that the monoclonal antibody produced was raised against an epitope inherent in the common protein (58 kDa) shown by SDS-PAGE analysis. On the other hand, B. longum cells were observed by TEM after immunochemical treatment. Figure 4.4 indicated that the monoclonal antibody is fixed on cells of bifidobacteria compared to the negative control. a b Figure 4.4. Bifidobacterium longum cells bounded by the monoclonal antibody produced against B. longum ATCC 15708 shown by transmission electronic microscopy: (a) negative control (treatment without antibody), (b) treatment with antibody. Bar indicate 200 nm. In order to determine the specificity of the Mab, the reactivity of the antibody was tested comparatively against bifidobacteria species and other bacteria: Propionibacterium freudenreichii P36, Pediococcus acidilacticii R1001, Lactobacillus rhamnosus R0011, Lactococcus lactis subsplactis R0058, Enterococcus faecium R0026 and Listeria innocua (strain number). The comparison of the reactivity of Mab between bifidobacteria and other bacteria immobilized by glutaraldehyde is given in Figure 4.5 a,b. The results show a distinction between bifidobacteria and other bacteria according to signals obtained by cells 116 immobilized (OD650 nm = 0.1) and Mab (0.5 µg/ml). Compared to bifidobacteria, Listeria innocua like Propionibacterium freudenreichii P36, Pediococcus acidilacticii R1001, Lactococcus lactis subsp lactis R0058, Enterococcus faecium R0026 shown insignificant signal. a 0,8 0,7 O.D O.D (450nm) (450 nm) 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 B im . an as ali B ng . lo b um B e . br vec B fa . in d s nti B f id . bi Bifidobacteria b ume ps B. eud ng olo umf C ro ont l (+ ) 0,8 O.D (450 nm) O.D (450nm) 0,7 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 P e . fr ud e e nr ic h ii P. ac id c ila tic ii L. rh a o mn su s la L. c ti s E. c fa e iu m ua (+ ) oc ol n r t n n L. i Co Other species Figure 4.5. Specificity of monoclonal antibody anti-B. longum ATCC 15708 tested against cells (OD650 nm = 0.1) from (a) Bifidobacterium genera and (b) other species of bacteria at concentration of 0.5 µg/ml. Control (+), supernatant from clone culture tested for anti-B. longum production. The bifidobacterial species showed high signals compared to other bacterial species; this result indicate revealed the specificity of the antibody produced to bifidobacteria tested. However, Lactobacillus rhamnosus R0011 was found to give signals nearly similar to those 117 shown by the bifidobacteria suggesting antigenic similarities between the two bacterial genera. According to Orla-Jensen (1924), bifidobacteria were first grouped in the genus Bacillus and then the genus Bifidobacterium was proposed in the 1920’s. However, there was not a taxonomic consensus for this new genus and it was classified in the genus Lactobacillus, due to their rod-like shapes and obligate fermentative characteristics. The Bifidobacterium genus was characterized by a unique hexose metabolism that occurs via a phosphoketolase (Fructose-6-phosphate phosphoketolase or F6PPK) pathway often termed the ‘bifid shunt’s (Grill et al., 1995). These results suggested that the bacteria not belonging to bifidobacteria genus are not recognized by the antibody anti-B. longum ATCC 15708, probably because of the difference in the characteristics of protein surface. These results agree with those reported by Bolin et al. (1995) demonstrating the high specificity of monoclonal antibodies raised against membrane preparations of Helicobater pylori. To study the effect of the concentration of the Mab on the signal intensity distinguishing between bifidobacteria and other bacterial species, a serial dilution of the Mab ranging from 0.5 to 0.00005 µg/ml was carried out and tested comparatively on bifidobacteria, Lactobacillus rhamnosus and Listeria innocua. According to the results shown in Figure 4.6, the signal decreased significantly when the Mab concentration diminished from 0.5 to O.D nm) O.D(450 (450 nm) 0.05 µg/ml giving an optimal signal for all the bifidobacterial species. 0,8 B. animalis 0,7 B. breve 0,6 B. longum 0,5 B. infantis 0,4 B. bifidum 0,3 B. pseudolongum 0,2 L. rhamnosus 0,1 Listeria innocua 0 5 0,5 Anti- B. longum (µg/ml ) 0,05 0,005 0,0005 0,00005 Figure 4.6. Variation of the reactivity of the monoclonal antibody produced against B. longum ATCC 15708 tested at different concentration against bacterial cells (OD650 nm= 0.1). Supernatant from clone culture tested for anti-B. longum production was used as positive control. 118 The sensitivity of the Mab obtained was evaluated by studying the effect of the concentration of bacterial cells on the signal. Serial dilution of bacterial suspension from 103 to 107 cfu/ml were prepared from overnight culture and tested by ELISA using an optimal antibody concentration of 0.5 µg/ml. The results shown in Figure 4.7 indicate that the purified Mab anti-B. longum ATCC 15708 is more reactive with the antigen (cells) at concentration of 105 cfu/ml. Auty et al. (2001) mentioned that a minimum detection limit for in situ viability staining in conjunction with confocal scanning laser microscopy enumeration was around 108 bacteria/ml (equivalent to around 107 cfu/ml), based on Bifidobacterium sp. strain UCC 35612 counts. Immune-TEM observations showed that bacterial cell envelopes were uniformly recovered by protein-A colloidal gold. The cell wall protein appears to be target of the monoclonal antibody produced. Use of the anti-B. longum for direct immunofluorescence labeling of bacteria in fixed food samples and epifluorescence microscopy could represent an alternative method to detect bifidobacterial species in fermented product. 0,5 aB. animalis bB. breve O.D (450 nm) 0,4 cB. longum 0,3 dB. infantis eB. bifidum 0,2 fB. pseudolongum 0,1 00 10-7 10-6 10-5 10-4 10-3 Bifidobacteria (cells/ml) Figure 4.7. Sensitivity test carried out with diluted cell suspension using purified monoclonal antibody anti-B. longum ATCC 15708 at the optimal concentration of 0.5 µg/ml. 119 Detection and quantification of bifidobacteria remains a major limitation in the field of probiotic research. Until recently, there is no efficient method allowing a specific detection of viable bifidobacteria even in non complex food or environmental matrices. Moreover there is no efficient selective medium for the specific culture of bifidobacteria. In this study, a powerful system based on the use of a combination of a specific Mab and a culture medium was developed for the specific detection and quantification of viable bifidobacteria. Using the developed IC detection method and as reported in Figure 4.8, panel A1, bifidobacteria colonies were detected only when the anti-bifidobacteria Mab was added indicating that these colonies from bifidobacterial cells were being captured by the antibody. There was no bacterial colonies in wells that do not contain specific antibifodobacteria Mabs (Figure 4.8, panel A2). The specificity of the IC detection system was further confirmed by using three different concentrations of bifidobacteria. As shown in Figure 4.8, panel B the number of colonies detected in the microplate wells is proportional to the initial number of bacteria added. A B 1 2 Figure 4.8. Immune-culture test carried out with anti-B. longum and fresh culture of B. longum using 6-wells plate. Because of high size of wells in culture plate a maximal concentration of anti-B. longum (1.5 µg/ml) was used for coating; mother- solution of B. longum: 1.4x 109 cfu/ml; dilution A1: 10-7, B2: 10-6, and B1:10-5; A2: negative control (non-coated well). 120 The IC detection system offers several advantages over the traditional culture methods. Even though a similar sensitivity was obtained, higher specificity was observed with IC detection system because of the addition of the anti-bifidobacteria Mab as a capture probe prior to the addition of MRS-cysteine. Moreover, this method was simple to perform and no special equipment (anaerobic jar containing carbon dioxide generating sachet) was needed to create such as an anaerobic conditions for the growth of bifidobacteria. Only viable bifidobacteria are still detected. 4.6 Conclusion This study was performed to produce specific monoclonal antibody able to detect live bifidobacteria using proteins present on the bacterial cell surface. Cell wall of bifidobacteria was found to have some similar proteins with molecular size ranging from 58 to 34 kDa. Furthermore, proteins extracted and purified from bifidobacteria are shown to be immunogenic in Balb/c mice. Monoclonal antibody was then produced against cell wall protein of B. longum ATCC 15708 and found to be more immunogenic. Interestingly, the antibody produced showed a cross reactivity with purified cell wall proteins and whole cells from other bifidobacterial species studied (B. breve ATCC 15700, B. infantis ATCC 15697, B. bifidum ATCC 15696 B. pseudolongum ATCC 25526 and B. animalis ATCC 27536) sharing antigenicity with B. longum ATCC 15708. The antigenicity shared by bifidobacteria was confirmed by western blot revealing an epitope supported by common protein of 58 kDa recognized by the monoclonal antibody obtained. The antibody produced was also shown to be specific to members of bifidobacterial genus. The sensitivity of the antibody produced was estimated at 105 cfu/ml. Immuno-culture test developed with best detection of viable cells of bifidobacteria using specific monoclonal antibody would be a good tool to detect and quantify viable species of human and animal origin bifidobacteria in bifidus food and tissues. 121 ACKNOWLEDGMENTS This work was supported by grants from FCAR, NOVALAIT, MAPAQ, NSERC. T. Amrouche was recipient of fellowship from World Bank. Stephen Davids is thanked for reading the manuscript. Conclusion générale Les études antérieures ont démontré les propriétés immunomodulatrices des probiotiques sans pour autant parvenir à élucider clairement tous les mécanismes impliqués dans les effets observés. Le présent travail a pour objectif principal d’étudier le potentiel immunomodulateur de certaines souches de bifidobactéries en déterminant in vitro et ex vivo l’effet de leurs composants endo et exocellulaires sur les paramètres immunologiques indicateurs de la réponse immunitaire spécifique chez la souris. Les résultats obtenus démontrent que les composants cellulaires des bifidobactéries lysées exercent un effet immunostimulant significatif sur les splénocytes de souris. En effet, la paroi cellulaire et le contenu cytoplasmique des bifidobactéries stimulent la prolifération des lymphocytes et augmentent la production de deux cytokines, IFN-γ et IL-10, jouant un rôle clé dans les mécanismes de l’immunomodulation. Cependant, les effets observés dépendaient de la souche ou espèce de bifidobactérie, du composant cellulaire et de la dose utilisée. La souche B. lactis Bb12 s’est avérée potentiellement mitogène. Les EPS produits par les bifidobactéries dans le milieu de culture n’induisent pas d’effets stimulants significatifs sur la réponse immunitaire. Les EPS ont été extraits et purifiés par une méthode conventionnelle impliquant une précipitation des macromolécules à l'aide d'un solvant organique, une précipitation des protéines avec le TCA, une purification par la dialyse et une lyophilisation. Cette méthode d’extraction et de purification semble affecter la nature et l’activité mitogénique des EPS produits. Il serait donc intéressant d’utiliser d’autres méthodes comme la technique d’ultrafiltration permettant de préserver l’activité biologique des EPS. 122 L’étude comparative des fractions peptidiques et protéiques du cytoplasme B. lactis Bb12 a mis en évidence la présence de peptides et de protéines de nature acide et basique, de faible hydrophobicité et de poids moléculaire très variable. Les peptides acides stimulent significativement la prolifération des splénocytes et induisent la sécrétion de IFN-γ et IL-4 impliqués dans les mécanismes de la stimulation de la réponse immunitaire. Cependant, la présence d’éventuels oligonucléotides dans les fractions peptidiques/protéiques acides et basiques brutes obtenues à partir du cytoplasme de B. lactis Bb12 n’a pas été vérifiée. Il serait donc intéressant de déterminer à l’avenir la teneur de ces composants intracytolplasmiques et leurs effets sur la réponse immunitaire. En outre, la méthode de fractionnement par RP-HPLC n’a pas permis d’obtenir des fractions peptidiques et protéiques pures, ceci pourrait s’expliquer par la faible hydrophobicité montrée par les peptides et les protéines du cytoplasme des bifidobactéries. Il serait donc plus judicieux d’employer une autre méthode de fractionnement comme la chromatographie d’échange d’ions pouvant améliorer la séparation des peptides et des protéines intra cytoplasmiques. Par ailleurs, la quantité de matériel (peptides et protéines) obtenue à partir du cytoplasme est très limitée, ceci nécessiterait alors une production maximale de biomasse bactérienne dans des conditions de culture optimales. Dans cette étude, nous avions utilisé deux méthodes de mesure de la prolifération cellulaire différentes par leur principe. La méthode basée sur l’incorporation du BrdU dans l’ADN des cellules immunitaires est longue et nécessite un test ELISA. Par contre, la technique à Alamar Blue, basée sur la coloration de cet indicateur en présence d’un métabolisme cellulaire (potentiel d’oxydoréduction), est plus rapide, simple et génère moins de variabilité dans les résultats. Les résultats de cette étude laissent suggérer que les cellules bactériennes viables ne sont pas nécessairement requises pour influencer le système immunitaire de l’hôte. Ceci laisserait penser que les composants cellulaires (surtout la paroi) issus de l’autolyse des bifidobactéries ou de la lyse enzymatique ou acide dans le milieu gastro-intestinal, peuvent donc stimuler la réponse immunitaire. Par ailleurs, l’utilisation de cellules non viables offre 123 plus d’avantages en permettant une longue durée de vie ou de stockage des produits probiotiques à potentiel immunomodulateur. Compte tenu de la complexité de la composition de la paroi cellulaire et du cytoplasme des bifidobactéries, il serait fort intéressant d’envisager d’autres études afin d’identifier d’autres agents responsables de l’immunomodulation, particulièrement les molécules favorisant l’activité des cellules T régulatrices. La compréhension de ces fonctions immunomodulatrices offrirait certainement une opportunité unique pour prévenir ou traiter les désordres intestinaux associés aux allergies et aux maladies de l’inflammation de l’intestin et auto-immunes. Ainsi, les bactéries probiotiques pourraient être utilisées comme suppléments nutritionnels destinés aux personnes âgées ou aux nouveau-nés, dont la fonction immunitaire est réduite. L’utilisation des probiotiques comme ingrédients dans les aliments fonctionnels nécessiterait cependant des études cliniques. Etant donné que les bifidobactéries et les bactéries lactiques appartiennent à la flore naturelle habitant l’intestin de l’homme sain, et qu’elles sont déjà utilisées avec innocuité dans les aliments depuis longtemps partout dans le monde, il serait donc convenu d’utiliser les bifidobactéries comme probiotiques ou agents immunomodulateurs sous forme de nutraceutiques pour la prévention et le traitement des maladies médiées par le système immunitaire. Comme la viabilité des souches probiotiques est requise pour obtenir d’autres effets bénéfiques sur la santé comme la prévention ou le traitement des infections intestinales (compétition d’exculsion), la réduction du taux de cholestrol, la digestion du lactose, la production de vitamines, nous avions aussi songé à développer dans ce projet des anticorps monoclonaux spécifiques aux bifidobactéries afin de détecter à l’état viable les espèces appartenant à ce genre bactérien dans les produits probiotiques. Pour cela, nous avions mis à profit l’immunogénicité de la paroi des bifidobactéries pour produire des anticorps dirigés contre leurs protéines de surface. L’analyse du profil protéique de la paroi de plusieurs espèces de bifidobactérie nous a révélé des protéines communes (poids moléculaire: 34 à 58 kDa) et des différences entre les espèces étudiées. Les protéines de la paroi se sont avérées immunogènes chez les souris Balb/c (immunisées) en générant une forte production d’anticorps polyclonaux. 124 Un anticorps monoclonal dirigé contre les protéines de la paroi de B. longum ATCC 15708 a été produit avec succès. Cet anticorps est caractérisé par sa réactivité croisée avec les autres espèces de bifidobactéries testées (B. breve, B. infantis, B. bifidum, B. pseudolongum et B. animalis). L’anticorps montre une réaction croisée avec une souche de L. rhamnosus qui semble avoir une similitude antigénique avec les bifidobactéries. L’antigénicité partagée chez les bifidobactéries a par ailleurs été confirmée par la méthode western blot qui a révélé un épitope commun supporté par une protéine de poids moléculaire de 58 kDa. La fixation de l’anticorps sur la paroi (protéines) de bifidobactéries a été observée au microscope électronique. L’anticorps développé est capable de détecter les bifidobactéries de facon non spécifique puisqu’il reconnaît aussi les lactobacilles. Il serait donc judicieux de rechercher un autre anticorps de haute spécificité pour les bifidobactéries. Néanmoins, l’anticorps ainsi obtenu s’est montré sensible (105 cfu/ml). Par ailleurs, l’anticorps produit a permis de développer un test immunologique de détection des bifidobactéries. Comparé aux autres méthodes existantes, ce test présente l’avantage de détecter des bifidobactéries vivantes lorsqu’il est combiné avec la culture bactérienne sur plaque (immuno-culture). Ces résultats laissent suggérer une possibilité d’utilisation de cet anticorps comme outil moléculaire pour la détection ou l’identification des bifidobactéries vivantes dans les aliments et les tissus. Néanmoins, l’anticorps produit devrait être testé sur des échantillons d’aliments fermentés supplémentés avec des bifidobactéries afin de rendre possible l’utilisation du test à l’échelle industrielle. Bibliographie Aaron A. R. T., Canaday D. H., Henry Boom W., & Harding C. V., 2004. Bacterial heat shock proteins romote CD91-dependent class I MHC cross-presentation of chaperoned peptide to CD8+ T cells by cytosolic mechanisms in dendritic cells versus vacuolar mechanisms in macrophages. The Journal of Immunology, 172, 5277-5286. Abad A. R., Cease K. R., & Blanchette R. A., 1987. A rapid technique using epoxy resin Quetol 651 to prepare woody plant tissues for ultrastructural study. Canadian Journal of Botany, 66, 677-682. Allez M., & Mayer L., 2004. Regulatory T cells: peace keepers in the gut. Inflammatory Bowel Diseases, 10, 666-676. Anderson N., 2004. Probiotics market face EU challenge. Breaking News on Supplements, Nutrition & Healthy Foods. 08 Janvier, p.1 Ang D. 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