10. Pharmacogénétique_O.Mir

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Pharmacogénétique
et traitement médical du cancer
10 janvier 2017
Dr. Olivier Mir
Département de Médecine Oncologique
Gustave Roussy, Villejuif
[email protected]
Médicament
Enzyme de transport et de métabolisme (ETMM)
Elimination
Effet
Toxicité
* L ’efficacité et la toxicité des médicaments dépend de leur
métabolisme (quantité et qualité des ETMM)
* L ’expression des ETMM est très variable
* Cette expression dépend de facteurs: Génétiques
Environnementaux
Physiopathologiques
INTERET DE LA PHARMACOGENETIQUE
*Les variations du métabolisme /transport ont des
conséquences:
- pharmacocinétiques
- pharmacodynamiques
- toxiques
* Le rôle du métabolisme / transport est important quand:
- la fenêtre thérapeutique est étroite
- l’efficacité est difficile à évaluer rapidement
* Il est possible de prédire la capacité métabolique
- génotypage
- phénotypage
Métabolisme
investigations

Phénotypage
Tests fonctionnels
Pour tester une voie métabolique in vivo
 administration d’une substance de référence (ex: midazolam /
CYP3A4)
dosage de la molécule mère (+/- de son métabolite)
calcul du rapport  indice de métabolisation
résultat valable pour tous les médicaments métabolisés
par cette voie ?
Tests in vitro
Sur prélèvement sanguin ou biopsie
Exemples : déficit en pseudocholinestérases, hyperthermie
maligne, mesure d’activité enzymatique
Métabolisme
investigations (2)
 Génotypage
 Recherche de mutations, délétion, duplication
Sur prélèvement sanguin (simple)
Différentes techniques (PCR)
 Inconvénients :
- Ne renseigne
fonctionnelles
pas
sur
les
conséquences
- Corrélation approximative avec le phénotype
(« vérité statistique »)
Phénotype:
- activité réelle
- quantifiable
- mise en oeuvre plus difficile
- variations (xénobiotiques, pathologies)
- pas permanent
Génotype:
- facile
- permanent
- pas quantifiable
- pas activité réelle
Conséquences de la variabilité génétique
métaboliseur
lent
Effet sur [médicament]
[médi]
Phénotype
Conséquence clinique
Index
thérapeutique
• toxicité
métaboliseur
rapide
[médi]
tps
Index
thérapeutique
• efficacité
thérapeutique
Index
thérapeutique.
• inefficacité
thérapeutique
métaboliseur
ultrarapide
[médi]
tps
tps
Métabolisme
modulation pharmacogénétique
Conséquences cliniques
 métaboliseurs lents
- accumulation de la molécule mère et risque d’effets indésirables, de
toxicité (CPT11 et Sd. de Gilbert)
- pas d’effet thérapeutique des prodrogues
 métaboliseurs ultrarapides:
- pas d’effets thérapeutiques
 Ex: polymorphisme du CYP 2D6
Codéine  morphine
=  effets analgésiques chez les métaboliseurs lents
Déficits génétiques en enzymes
du métabolisme des
xénobiotiques
CYP 1A1(induction ~ 10%)
CYP 2A6* (5%)
CYP 2C9 (3%)
CYP 2C18 (?)
CYP 2C19(5-20%)
CYP 2D6* (5-7%)
CYP 2E1(>1%)
CYP3A4/5 (?)
GSTM1* (50%)
GSTT1 (10-20%)
GSTP1 (10%)
UGT1A1 (~10%)
NAT2 (50%)
EH (<5%)
TPMT(<1%)
* : gènes pour lesquels une duplication est connue
Les fréquences varient selon les populations: ethno-pharmacogénétique
Conséquences cliniques ??
ou
Irinotecan (CPT-11):
Prédiction de la toxicité
Gene UGT1A1
*28/*28
*1/*1
Pharmacokinetics Parameters of lrinotecan and polymorphisms in
UGT1A1 promoter
20 pts treated with CPT11 (phase 1)
Genotype and
SN38G/SN38 ratio
Iyer, Pharmacogenomics J 2002
Leconte et al, CCR 2010
Neutropenia (5FU / Irinotecan) and UGT1A1 genotype
n = 76
%
80
no severe neutropenia
(6/8)*
1.00
75
p = 0,001
60
40
(8/39)
20
20
0
(4/29)
14
Neutropénie
grade
Neutropenia
3/4Grade 3/4
6/6
0.75
6/7
0.50
p = 0,0001
0.25
7/7
6/7
7/7
6/6
Nb of cures
0.00
*: toxic death in a pt
with a 7/7 génotype
0
10
20
Nb of cures median (7/7) : 4
30
Phase 1 de l’irinotecan guidée par le génotype UGT1A1
Innocenti et al, JCO 2014
Doses différentes, mais même exposition au SN38
Innocenti et al, JCO 2014
Phase 1 de l’irinotecan guidée par le génotype UGT1A1
Génotype
*1/*1
*1/*28
*28/*28
Dose
maximale
tolérée
850 mg DT
700 mg DT
500 mg DT
Dose
recommandée
700 mg DT
500 mg DT
400 mg DT
NB: administration IV toutes les 3 semaines, G-CSF autorisé
Innocenti et al, JCO 2014
Métabolisme du 5-Fluorouracile (5-FU)
H
N
O
NH
F
O
DPD
Produits peu actifs ou inactifs
dUMP
TP
5-dFUMP
5-dFUTP
Inhibition de la synthèse
de l’ARN
Présence de métabolites fluorés
inhibant la synthèse de l’ADN
Thymidylate
Synthase (TS)
dTMP
Défaut de synthèse de l’ADN
par manque de thymidine
DPD= dihydropyrimidine deshydrogénase; TP=thymidine phosphorylase
Polymorphismes génétiques et prédiction de la réponse au 5-FU
Défaut d’élimination
Dosage des fluoropyrimidines guidé par le génotype DPD
Caudle et al, CPT 2013
http://www.pharmgkb.org
Polymorphisme du promoteur du gène de TS
Allèle 3R
Allèle 2R
R R Gène TS
ADN
germinal
R R R Gène TS
Transcription
TS
TS
R
Traduction
= séquence répétée de 28 paires de bases
TS TS
TS
TS TS
Toxicité de l’association 5-FU / irinotécan et polymorphismes du promoteur
de la thymidylate synthase (TS)
%
40
(4/11)
36
p = 0,02
30
20
10
(5/33)
Diarrhée
grade 3/4
15
(0/19)
0
0
2R/2R 2R/3R 3R/3R
Génotype TS
Lecomte, 2004
Neurotoxicité chronique à l’Oxaliplatine et polymorphisme de GST-P1
64 pts inclus et génotypés pour le polymorphisme de
GSTP1(Ile105Val)
Dose cumulée min. de 500 mg/m2
%
50
(19/39)
49
40
p = 0,04
(5/20)
30
25
20
(0/5)
10
Neuropathie
chronique
grade 3
0
0
A/A
A/G
G/G
Génotype GSTP1
Lecomte, et al, CCR 2007
Neurotoxicité chronique au Docetaxel et polymorphisme de GST-P1
58 pts inclus et génotypés pour le polymorphisme de
GSTP1(Ile105Val)
Mir et al, Ann Oncol 2009
Impact des polymorphismes génétiques
des EMX en cancérologie
Gènes
Médicament
Effets Secondaires
DPD,TS
5-fluorouracile
MTHFR
méthotrexate
myélotoxicité
et neurotoxicité
hématotoxicité
NAT1/2
amonafide
myélotoxicité
TPMT
6-mercaptopurine
hématotoxicité
UGT1A1
irinotécan
GST P1
oxaliplatine
toxicité hématologique
et intestinale
neurotoxicité
Conclusions
- Influence des variations génétiques sur la réponse aux médicaments
* réelle
* cliniquement significative
- Impact clinique:
* validité de l’association
* prévalence et sévérité de l ’ADE
* possibilité de surveillance
* prévalence des polymorphismes
* phénotypage et/ou génotypage disponible et coût
* interprétation clinico-biologique
- génétique
- métabolisme
Bertholee, Maring & van Kuilenburg, Clin Phamacokinet Sep 2016
Newsletter du GPCO, Oct 2016
annonc.oxfordjournals.org
The molecular portrait based on genotype…
…does not predict
for the current phenotypic portrait
of the patient
Lenuzza et al, Eur J Drug Metab Pharmacokinet 2014
TAKE HOME MESSAGES
 Génotypage:
 rare en essais précoces pour
métabolisme/toxicité,
 études ancillaires phases III +++ ou post-AMM
 Phénotypage:
 Indispensable
 En complément de la pharmacogénétique
 Médecine « personnalisée »:
 « enrichir » les essais cliniques
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