L’analyse discriminante
Alain Paris
alain.paris@mnhn.fr
Septembre 2016
1
Cours de statistiques M2
Plan
•Introduction : que sont les données ?
•Analyse discriminante : cas n individus >> p variables &&
données complètes
–Généralités
–Exemple : iris de Fisher :
•Représentations
•Manova & tests d’hypothèses
•AFD décisionnelle et prédictions des inconnus
•Bibliothèque ade4
•Analyse discriminante : cas n individus >> p variables &&
données incomplètes
–Bibiothèques ropls et mixOmics
–L’analyse canonique : une autre manière de faire l’AFD
•Les données en grandes dimensions : cas n individus < ou << p
variables && données incomplètes ou incomplètes
–AFD +/- OSC
–OPLS-DA
–SDA +/- OSC
•Conclusions 2
Plan
•Introduction : que sont les données ?
•Analyse discriminante : cas n individus >> p variables &&
données complètes
–Généralités
–Exemple : iris de Fisher :
•Représentations
•Manova & tests d’hypothèse
•AFD décisionnelle et prédictions des inconnus
•Bibliothèque ade4
•Analyse discriminante : cas n individus >> p variables &&
données incomplètes
–Bibiothèques ropls et mixOmics
–L’analyse canonique : une autre manière de faire l’AFD
•Les données en grandes dimensions : cas n individus < ou << p
variables && données incomplètes ou incomplètes
–AFD +/- OSC
–OPLS-DA
–SDA +/- OSC
•Conclusions 3
Que sont les données ?
4
Analyses statistiques multivariées : aspects généraux
•Structure des données
–Tableau Y : 1 ou q facteurs (ou 1 variable de groupe)
–Tableau X : p (a priori) variables indépendantes mesurées sur n
individus (souvent n << p)
•Objectif stratégique du data mining :
–Trouver les données aberrantes (outliers) à l’intérieur des
groupes d’individus construits a priori
–Trouver une structure cachée d’organisation des individus en
sous-groupes
–Révéler des contrastes “plausibles” existant entre les groupes
d’individus construits a priori
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