Génétique Microbienne

Module de Génétique Microbienne
M2 Universités Paris 5, 6 et 7
Erick Denamur, PU-PH, INSERM U722, Faculté de Médecine, Paris 7
Ivan Matic, DR CNRS, INSERM U571, Faculté de Médecine Necker Enfants Malades, Paris 5
Ce module se propose d’aborder la génétique bactérienne par une approche globale reposant sur
(i) la diversité et la phylogénie du monde bactérien, (ii) la plasticité du génome et (iii) l’apport de
la génomique.
Le programme est établi sur 5 jours, la journée étant découpée en 3 à 4 exposés.
L’enseignement se tiendra à Faculté de Médecine Xavier Bichat, 16 rue Henri Huchard,
Paris 18ème les 4 premiers jours et au Genoscope à Evry le dernier jour.
Lundi 14 septembre 2009 : Espèce bactérienne, phylogénie et transferts horizontaux
9h30-10h00 Présentation du module et des étudiants
10h00-12h00 Erick Denamur : Structure génétique des populations bactériennes et la notion
d’espèce chez les bactéries
14h00-15h30 Guy Perrière : Phylogénies bactériennes et transferts horizontaux
16h00-17h00 Patrick Trieu-Cuot : Transfert d'information génétique dans les conditions
naturelles
Mardi 15 septembre 2009 Plasticité du génome 1
9h30-10h30 Nelly Dubarry : Structure des génomes bactériens et mécanismes de transfert de
l'information génétique
11h00-12h00 Bénédicte Michel : Rôle de la recombinaison homologue lors de la réplication du
chromosome bactérien
14h00-15h30 Frédéric Boccard : Conformation et dynamique du chromosome bactérien
16h00-17h00: Ivan Matic : Rôle des polymérases trans-lésionnelles
Mercredi 16 septembre 2009 : Plasticité du génome 2
9h30-10h30 Pablo Radicella : Réparation des lésions oxydatives chez Helicobacter pylori
11h00-12h00 Suzanne Sommer : Réparation des cassures double brin de l’ADN chez
Deinococcus radiodurans
14h00-15h15 Ivan Matic : Recombinaison et mutateurs
15h45-17h00 : Alexandra Gruss : Stratégies de survie communes entre bactéries lactiques et
autres bactéries de la famille des Streptococcaceae
Jeudi 17 septembre 2009 : Plasticité du génome 3
9h30-10h30 Michael Dubow : Biodiversité et génomique fonctionnelle des phages
11h00-12h00 Marie Agnès Petit : La recombinaison chez les phages
14h00-17h00 Eduardo Rocha : Ordre et désordre dans les génomes bactériens
Vendredi 18 septembre 2009 : Génomique
9h30-10h30 Valérie Barbe : Les séquences des génomes bactériens
11h00-12h00 Stéphane Cruveiller : Annotation in silico des séquences génomiques bactériennes
14h00- 15h00 : Marcel Salanoubat : Exploration du métabolisme des procaryotes
15h30-16h30 : Denis Le Paslier : Métagénomique : fenêtre ouverte sur l'univers microbien