Manuscrit Thèse final

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Je dédie cette thèse
à ma très grande Famille qui a fait de moi ce que je suis,
à Mathieu qui a toujours cru en moi, pour son amour et son soutien,
et à tous mes Amis pour avoir rendu mon quotidien récréatif et passionnant.
Invictus
Aussi étroit soit le chemin,
Bien qu’on m’accuse et qu’on me blâme
Je suis le maître de mon destin,
Le capitaine de mon âme.
William Ernest Henley

Remerciements
Je tiens tout d’abord à remercier Philippe Lemanceau, directeur de l’UMR ‘Microbiologie des
Sols et de l’Environnement’, pour m’avoir accueillie au sein de son unité. Vous avez rendu
possible la réalisation de ce travail. Au-delà de votre rôle de directeur, le temps que vous
m’avez consacré, vos critiques pertinentes et votre esprit de synthèse ont été des éléments
déterminants dans la valorisation de cette thèse.
Je souhaite remercier Sylvie Mazurier pour l’encadrement de ce travail. Ton investissement
sans faille, le partage de ton expérience et tes conseils m'ont fait progresser. Nos diverses
discussions professionnelles, mais aussi personnelles, ont été enrichissantes à tout point de
vue. Je te remercie sincèrement pour tout le soutien que tu m’as accordé au cours de cette
thèse. Ta franchise et tes encouragements ont su me remettre sur le droit chemin dans les
moments où le moral n'était pas au rendez-vous. Je veux également te remercier pour m’avoir
autant aidée pendant la période de rédaction : tes corrections, ta rapidité de réflexion et ta
volonté de me voir réussir ont été essentielles pour l’aboutissement de ce travail.
Merci à l’ensemble de l’équipe 1. Chacun d’entre vous a participé activement au bon
déroulement de ce travail de thèse et sans vous, certaines études expérimentales n'auraient pu
être réalisables. Christophe, je te remercie pour ta gentillesse, l'aide que tu m’as apportée au
quotidien et surtout pour ton investissement dans le chapitre IV de ce manuscrit. J'emmène
avec moi le célèbre sobriquet que vous m'avez délicatement attribué toi et tes collègues de
bureau. Gérard, merci pour ton humour et ta bonne humeur si communicative. Je penserai
souvent à toi et tes nombreux jeux de mots inimitables vont me manquer. Tu m’as sortie de
bien des situations, toi le spécialiste des astuces et du bricolage. Je te souhaite une retraite
bien méritée. Laure, je te remercie pour tout ce que tu as fait pour moi, notamment dans le
chapitre V. Grâce à toi la microscopie électronique est désormais moins obscure dans mon
esprit et je promets de te faire signe si un jour je dois à nouveau isoler des nodosités.
Je remercie tout particulièrement Thérèse pour m'avoir formée au travail de laboratoire et
pour toute l’aide technique qu’elle m’a apportée. Une de plus dans ta longue liste d’étudiants
que tu as accompagnés et j'espère ne pas t'avoir rendu la vie trop difficile. Tu as été ma
confidente et jamais je n'oublierai tout ce que tu as fait. Tu es pour moi plus qu'une collègue
de travail et j'espère que notre "collaboration" ne s'arrêtera pas aux portes de l'INRA. Je te dis
à très bientôt ma Thérèse et te souhaite à toi aussi une retraite douce et heureuse.
J'adresse également mes remerciements aux membres de mon comité de pilotage, Eliane
Dumas-Gaudot, Stéphane Genin et Daniel Wipf, pour l'intérêt qu'ils ont montré à la réalisation
de ce travail et à la cohérence des recherches menées. Je vous remercie pour tous vos conseils.
Je souhaite remercier toutes les personnes qui ont participé étroitement à l'avancée de mes
recherches et à la réalisation des études expérimentales : Barbara Pivato, Cécile Guby-Rangin
et Jean-Claude Cleyet-Marel, Jeannine Lherminier, Christine Arnould et Aline Bonnotte. Je
souhaite également remercier Jérôme, stagiaire en licence qui par son travail a également
contribué à cette thèse.
Un grand merci aux secrétaires, Roselyne, Catherine, Fabienne, Stéphanie et Sylvie, pour leur
disponibilité et leurs sourires et leur aide indispensable pour régler tous les tracas
administratifs. Je tiens à remercier Barbara, pour sa générosité et son aide à la laverie. Grâce