Gestion de connaissances et de données dans l`aide à la

Julie Bourbeillon
20/12/2004
1
Gestion de connaissances et de données dans
l'aide à la conception de Tissue Microarrays
(TMA)
Laboratoire TIMC-IMAG
Equipes SIC et RFMQ
Julie Bourbeillon, Catherine Garbay et Françoise Giroud
GDR I3
GT « Documents multimédia »

Julie Bourbeillon
20/12/2004
2
Contexte
● Domaine d'application
➔ Domaine biomédical - Recherche en oncologie
➔ Récente technologie des Tissue Microarrays (puces à tissus)
● Projet
➔ Plate-forme TMA-Explorer
➔ Ensemble d'outils autour de la technologie
➔ Accessible par le WEB pour les personnes utilisant la
technique pour capitaliser les connaissances du domaine
● Entre autres
➔ Génération d'un ensemble de documents multimédia
➔ Pour l'aide à la conception de TMAs
➔ Pour accompagner la fouille de données

Julie Bourbeillon
20/12/2004
3
La technique des TMA
Analyse
Anatomopathologique
Marqueurs
Tumoraux
Lame
Histologique
Biopsie
Coupes
sériées
Lame
Histologique
Étude à réaliser
Lame TMA virtuelle
Fouille
de données

Julie Bourbeillon
20/12/2004
4
La technique des TMA
Analyse
Anatomopathologique
Marqueurs
Tumoraux
Lame
Histologique
Biopsie
Coupes
sériées
Lame
Histologique
Étude à réaliser
Lame TMA virtuelle
Fouille
de données
Aide à la conception de blocs
TMA réels
Construction de plans de fabrication de TMA

Julie Bourbeillon
20/12/2004
5
La technique des TMA
Analyse
Anatomopathologique
Marqueurs
Tumoraux
Lame
Histologique
Biopsie
Coupes
sériées
Lame
Histologique
Étude à réaliser
Lame TMA virtuelle
Fouille
de données
Accompagnement
de la fouille de données
Création de
lames TMA virtuelles