2016-2017 Différenciation cellulaire
III) Différenciation cellulaire
A) Principe et méthode d'étude
Dans notre corps, on a 200 types cellulaires différents que l'on peut identifier par analyse cytologique.
Il y a 3 types de différenciation différentes :
•La différenciation morphologique et structurale : On le fait par MO, ME, MET, MOF ...
•La différenciation biochimique et physiologique : Les cellules sont en présence de molécules et de
protéines particulières avec des fonctions métaboliques particulières.
•La différenciation moléculaire:On regarde la diversité quantitative et qualitative des ARNm et des
protéines. On peut analyser la diversité grâce à plusieurs techniques :
▪Électrophorèse bi-dimensionnelle (protéines) sur gel poly-acrylamide: On va les séparer en
fonction du pH isoélectrique (pHi) et en fonction de leur masse. Chaque spot va constituer une
protéine ou un ensemble de protéines qui sera déterminé par le pHi et la masse moléculaire.
On a toutes les protéines de la cellule qui seront exprimées dans un échantillon donné. Les
spécialistes connaissent les cartes d'électrophorèse bidimensionnelle de plusieurs molécules.
L'électrophorèse est différente en fonction du tissu humain. On peut bloquer et transférer les gènes
de l'électrophorèse dans un gel de nitrocellulose, et immunologique avec un anticorps spécifique.
Mais cette technique est difficile à réaliser dans un labo ou TP, c'est pourquoi on fera plutôt un
Western Blot.
Exemple : Analyse du spectre d'une tissu de cerveau humain et d'un tissu de foie humain.
▪Western blot (protéines): on obtient une bande observée, colorée avec un colorant non spécifique
de toute les protéines, on met sur une feuille de nitrocellulose
On peut apprécier la présence d'une protéine, et l'intensité de la bande qui sort et donne
l'abondance de la protéine.
C'est une séparation des protéines en fonction de leur taille.
▪PCR quantitative : On peut étudier la présence d'ARNm en amont d'une protéine par PCR
quantitative bactérienne ( faite quotidiennement en laboratoire ). Cela suppose que l'on connaît ce
que l'on cherche on cherche l'ARNm d'une protéine d’intérêt et avec des sondes, on amplifie une
partie du gène, et on peut regarder l'abondance en ARNm comparé à l'abondance d'un ARN de
▪Les puces à ARN (ARN): Quand on veut regarder le transcriptome ( ensemble des gènes
différentiellement exprimés dans un échantillon par rapport a un autres ) on fait les puces à ARN .
On va extraire tout les ARN d'un échantillon, on aura 2 échantillons auxquels on aura extrait tous
les ARNm, on va tous les amplifier et comparer leur abondance.
On peut comparer le transcriptome d'un, de deux ou plusieurs échantillon. On va pouvoir voir dans
tel échantillon que gène est exprimé, on sort des tableaux avec le niveau d'expression des gènes.
Les ARNm d'un échantillon seront marqués par une sonde fluorescente rouge et ceux de l'autre
échantillon par un fluorochrome vert. Les ARNm vont s'hybrider en fonction de leur structure, de
2/13