Régulation des intégrases d`intégrons de résistance aux

Intitulé de la thèse : Régulation des intégrases d’intégrons de résistance aux
antibiotiques: développement de modèles in vitro et in vivo
Nature
du financement : Contrat doctoral en co-finacement Inserm-Région Limousin
Ecole doctorale thématique de rattachement : BioSanté PRES Limousin Poitou Charentes
Domaine de compétence :
 Agronomie
 Biologie, Médecine, Santé
 Chimie
 Environnement
 Informatique, électronique
 Mathématiques
 Physique
 Sciences de la société
 Sciences humaines
 Sciences pour l’ingénieur
 Terres, univers, espace
Lieu de travail :
Domaine de compétence secondaire
(éventuellement) :
 Agronomie
 Biologie, Médecine, Santé
 Chimie
 Environnement
 Informatique, électronique
 Mathématiques
 Physique
 Sciences de la société
 Sciences humaines
 Sciences pour l’ingénieur
 Terres, univers, espace
Faculté de médecine de Limoges, 2 rue du Dr Marcland, 87025 Limoges
Cedex
Laboratoire d'accueil: EA3175/ Equipe Avenir Inserm "Analyse moléculaire des résistances aux
antimicrobiens"
Description du sujet de thèse (limitée à 1500 caractères espaces compris) :
Les intégrons de multi-résistances (MRI) constituent des systèmes de capture et d’expression de
gènes (codant des résistances aux antibiotiques) sous forme de cassettes. Différentes études montrent que
les intégrons participent très largement à la dissémination de la résistance aux antibiotiques au sein du
monde bactérien. Des résultats récents de l'EA3175 ont montré que l'acquisition de cassette est contrôlé par
la réponse SOS bactérienne, laquelle peut être activée par certains antibiotiques. Cependant, ces résultats
ont été montrés in vitro en culture planctonique.
Le sujet consiste à développer des modèles expérimentaux plus proches des conditions
environnementales dans lesquelles s'observent les échanges de cassettes entre bactéries: un modèle
biofilm in vitro, et un modèle animal murin. Ces deux modèles permettront d'explorer plusieurs axes de
recherche: i) Etude des conditions/régulateurs d’expression de l’intégrase de MRI dans des modèles
simples avec une seule espèce bactérienne soumise à différents stress, dont stress antibiotiques; ii) Etude
des échanges de cassettes de MRI entre bactéries de même ou différente espèces, et du rôle des
antibiotiques sur ce transfert.
Le développement de modèles expérimentaux originaux plus proches des contextes réels dans
lesquels peuvent s’observer l’acquisition de résistance par les intégrons, devrait amener à une meilleure
compréhension de ce phénomène et du rôle joué par les antibiotiques eux mêmes sur le recrutement de
résistances.
Conditions restrictives sur les candidatures :
Expérience souhaitée/profil : microbiologie, biologie moléculaire, PCR temps réel, biofilm
Modalités de dépôt de candidature et contact :
contacts:
Marie-Cécile PLOY; [email protected]; tel: 05 55 43 59 74 ou 05 55 05 67 27.
Sandra DA RE; [email protected]; tel: 05 55 43 59 74