présentation semestre 2 L3V

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PRINCIPAL SITE : SITE DU DEPARTEMENT SCIENCES DE LA VIE
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onglet LSV3
Emploi du Temps, Dates d’examen…..
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Master - 1 réunions d’information prévue (obligatoire)
Semaine Ronde des Facs : Journée d’information sur les Masters
accessibles à Nice après une L3SVS (après les CCI)
Infos Masters Nice sur le site du département onglet LSV3
Master SVS Nice :
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7 Février: BDE- Bio Journée de la bio
Les dossiers sont à remplir assez tôt, renseignez vous dès maintenant !
Les Masters demandent les notes du S6 avant réponse définitive….
Semestre 6 : Spécialisation de parcours
2 UEs communes
IDS -
BMG
- BPN
- BIM
-
BOE
-
- Bio-Informatique Appliquée à l’Analyse de Séquence (4)
- UE libres (sauf parcours BIM)
- UEL
- UEL Stage été 2012
- DS = fête de la science déjà fait
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Si vous êtes déjà inscrits à vos options et souhaitez les changer
après cet réunion, n’oubliez pas de le modifier sur votre IP Web,
en plus de l’indiquer sur la fiche à nous remettre
Biologie Moléculaire et Génétique
A - Animal / B - Végétal
Karine Mandon
- Evolution Moléculaire et Phylogénèse (4)
- Biotechnologies (4)
- Régulation Génique Procaryotes (4)
Choix A
Endocrinologie Générale (4)
Biologie des Adaptations et
Ecophysiologie (4)
Choix B
Biologie du Développement
Animal (4)
Biologie du Développement
Végétal (4)s
Choix C
Techniques
d’Exploration
Fonctionnelles (4)
Imagerie
Tissulaire (4)
Botanique Systématique
et Phylogénèse (4)
Biochimie/Physiologie/Neurologie
Aline Grechez-Cassiau
- Endocrinologie générale (4)
- Techniques d’Exploration Fonctionnelle en Physiologie Animale (4)
- Neurobiologie et Pathologies Cérébrales (4)
- Electrophysiologie et Pharmacologie (4)
- Physiopathologie de la nutrition et du métabolisme (PPNM) (4)
Biotechnologies (4)
Choix
Imagerie Tissulaire (4)
Analyse Métabolites Secondaires (4)
Biologie des Organismes et des
Ecosystèmes
Didier Forcioli
- Biodiversité (3)
- Introduction à l’Ecotoxicologie (2)
- Biologie des Adaptations et Ecophysiologie (4)
- Evolution Moléculaire et Phylogénèse (4)
- Paléoenvironnement (2)
Choix A
Ecologie et Biologie
Marine (3)
Biologie du
Développement
Végétal - BOE- (3)
Choix B
Stage Pratique /
Bibliographique(2)
Communication en
Environnement (2)
Choix C
Biologie du
Développement
Animal (4)
Botanique
Systématique et
Phylogénèse (4)
Biologie / Informatique /
Mathématique
Patrick Coquillard
- Algorithmique et Structure des Données (4)
- Bases Mathématiques des Statistiques (4)
- Initiation à la Programmation (4)
- Projet Pluridisciplinaire en Anglais (6)
- Evolution Moléculaire et Phylogénèse (4)
1 UE au choix
Electrophysiologie
et Pharmacologie)
Biotechnologies (4)
Biologie des
Adaptations et
Ecophysiologie (4)
Neurobiologie et
Pathologies
Cérébrales (4)
Responsable : Elisabetta de Maria
L3 BIM: Initiation à la programmation 4ECTS
3 parties:
Introduction à Linux: Gilles Bernot 10h (avec un CCI)
Initiation à la programmation Python : Romain Gautier
CCI sur machine
Application avec la réalisation d'un projet de programmation en python
Rapport + oral
Cours/TD au MIPS (3ème étage salle Linux, salle 316)
Mercredi 13h
Jeudi 13h
1er cours : mercredi 29 janvier 13h-15h
Bioinformatique Appliquée
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Parcours BMG 46h
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6 h de cours
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16 h de cours / TD
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UE: Biologie du Développement Animal (BDA)
responsable C. Ghiglione ([email protected])
Discipline qui regroupe embryologie, génétique, biologie cellulaire et imagerie
Objectif : Comprendre les grands mécanismes utilisés lors de la construction d’un organisme
I) Cours :
De la pluripotentialité à l’hyperdifférenciation :
- totipotence
- cellules souches et différenciation in vitro
Début des cours Lundi 27 janvier
- différenciation in vivo
Les contrôles génétiques :
- localisation des ARNm
- mise en place des axes embryonnaires
- cascades génétiques et gènes homéotiques
- contrôle de l’expression génique par les microARN
Les mouvements cellulaires :
- cytosquelette et matrice extracellulaire
- changements de forme et déplacements de cellules et de feuillets
Les interactions cellulaires :
- communication directe : adhésion cellule-cellule, signalisation par contact
- communication par substance diffusible (morphogène et signalisation)
La mort cellulaire programmée : l’apoptose physiologique au cours du développement
II) 3 Travaux pratiques :
- mise en place des axes A/P et D/V chez l’embryon de drosophile
- apoptose et développement des membres de poulet
- ossification polarisée selon l'axe A/P chez l’embryon de souris
III) 1 journée d’immersion dans un laboratoire de Biologie du Développement de la région (optionnel)
Biologie du Développement Animal
*Obligatoire Parcours BMG – A
*Optionnel Parcours BOE (10 étudiants)
Une petite lettre dans laquelle vous expliquerez (email à Didier Forcioli) :
- Vos motivations pour suivre cette UE
- Dans quelle mesure cette UE est importante pour votre projet
professionnel
Biologie du Développement
Végétal
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Obligatoire Parcours BMG – V
Optionnel Parcours BOE
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Les objectifs:
- Présenter les outils et modèles pour l’étude des processus liés au développement
végétal
- Appréhender le rôle des différentes phytohormones dans le développement végétal
(biosynthèse, métabolisme et signalisation).
Cytokinin
Auxin
Abscisic Acid
- Etudier différents programmes du développement végétal (embryogénèse,
germination, transition et morphologie florale).
- Les tropismes végétaux et la perception lumineuse. Photorécepteurs et transduction
du signal lumineux. Rythme circadien et photopériodisme.
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TP « culture in vitro »: comment régénérer une plante à
partir d’une seule cellule?
TP « régulations hormonales et tropismes »: quels rôles
jouent les hormones végétales sur les grands
programmes de développement?
TP « Stress abiotiques et régulation génique »: comment
illustrer l’influence des hormones végétales sur la
tolérances aux stress abiotiques. (interaction cours BAE)
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Obligatoire Parcours BMG
Optionnel Parcours BPN-BIM
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Licence 3 des Sciences de la Vie et de la Santé
Partie II
Biotechnologies Végétales
Isabelle Garcia, Mathieu Gourgues, Michael Quentin
• Génie génétique et transgénèse végétale
I - Les grandes étapes de la transgénèse chez les végétaux
II- Les techniques de transfert de gènes chez les végétaux
III- Transgénèse: Pourquoi faire?
• Techniques de culture in vitro
I- Les grandes étapes de la culture in vitro
II- Les fondements techniques de la culture in vitro
III- Les différentes techniques et applications de culture in vitro
UE Imagerie Tissulaire
Objectif :
Initiation et utilisation de différentes techniques de microscopie
(électronique et confocale) pour observer un échantillon biologique à
plusieurs niveaux et explorer ses fonctions.
Informations pratiques :
Pour les étudiants des parcours BMG et BPN
36 heures – 4 ECTS
Mardi de 15h15 à 17h15 ou 18h15
16 étudiants maximum.
Choix des étudiants selon les réponses au questionnaire proposé >> Venez me
voir à la fin de la réunion
Responsable UE Isabelle Gillot - [email protected]
UE Techniques d’Exploration Fonctionnelle en PhyA (TEF) : 4 ECTS, 40h
-Responsable : Aline Grechez
-Concerne les parcours BMG (UE optionnelle) et BPN (UE obligatoire)
-Composée : Absence de CM / 10h TD / 30h TP (manipulation animaux : le rat)
Objectif :
-Application des méthodes et concepts de la Physiologie Animale au niveau tissulaire et de
l’organisme (notion de réponse intégrée)
-Application des notions abordées en cours de PIA : compréhension du fonctionnement des grands
systèmes physiologiques (rénal, cardio-vasculaire, respiratoire) et notion de régulation nerveuses
et hormonales.
- Illustration des cours d'endocrinologie, du métabolisme.
-Initier les étudiants à la manipulation d’animaux : Apprentissage des gestes techniques de base et
connaissance des notions éthiques de base de l’expérimentation animale
- Apprentissage et confirmation des bases de l’exposé écrit
- Contenu :
-TP (30h ; 6 séances de 5h):
Modèle animal utilisé : le rat
-Opération sur le rat et détermination du volume sanguin
- Contrôle de la pression artérielle et de la ventilation
- Exploration fonctionnelle du rein
- Etude de la vasomotricité des vaisseaux
- Régulation hormonale de la lipolyse
- Régulation hormonale de la glycémie
TD (10h) :
Bases de l’éthique et respect de la réglementation concernant l’expérimentation animale
Application des techniques d’exploration fonctionnelle sur animaux sains ou génétiquement
modifiées
Correction des TP
- Evaluation : CR TP 40 % / Pratique 20% / CT : 40%
UE Neurobiologie des Pathologies Cérébrales (NBPC) : 4 ECTS, 48h
Responsable : Isabelle Lena
Composée : 20h CM / 17h TD / 3h TP
Objectif : Introduction aux principales pathologies cérébrales
Contenu :
-Troubles neuropsychologiques (aphasies, amnésies, apraxies et agnosies),
- Troubles neurodégénératifs (Parkinson, Alzheimer) et psychiatriques (toxicomanie, troubles
anxieux)
UE obligatoire pour le parcours BPN et
optionnelle pour parcours BIM
UE Analyse Métabolites Secondaires (AMS) : 4 ECTS, 44h
Responsable : Olivier Thomas
Composée : Absence de CM / 4h TD / 40h TP (5 jours bloqués fin semestre 6)
Objectif : Appréhender les techniques analytiques chimiques (Chromatographies et
spectroscopies) utiles pour isoler des métabolites secondaires d’un organisme vivant et
caractériser leur structure. Ces métabolites sont susceptibles d’avoir des applications en
pharmacologie
Contenu :
-Appréhender les voies du métabolisme secondaire chez les organismes
- Identifier le rôle naturel des métabolites secondaires (écologie chimique) et leurs applications
chez l’homme (pharmacologie)
- Purifier les métabolites secondaires d’une éponge marine Axinella damicornis et d’un épibionte
Parazoanthus axinellae.
- Caractériser la structure des composés isolés.
UE Electrophysiologie et Pharmacologie: bases théoriques et
moléculaires, rôle physiologique (EP) : 4 ECTS, 50h
Responsable : Olivier Soriani
Composée : 32h CM / 10h TD / 8h TP
Objectif : Apporter les bases théoriques de l’électrophysiologie et de la Pharmacologie
Contenu :
Partie Electrophysiologie :
- Bases théoriques de la physiologie des canaux ioniques (Dr O. Soriani, iBV)
- Structure moléculaire des canaux ioniques (O. Soriani, iBV)
- Canaux de fond et potentiel de repos (Dr F. Chatelain, IPMC)
- Canaux ioniques et plasticité synaptique (Dr C. Nicolas, iBV)
- Récepteurs canaux (Pr JM Mienville)
Partie Pharmacologie :
- Pharmacocinétique et pharmacodynamique (Dr E. Macia, IPMC)
- Métabolisme des Médicaments (Dr C. Onesto, ICV)
- Pharmacologie du SNC (Pr J. Noël, IPMC)
- Pharmacologie Cardiaque (Pr L. Counillon, LP2M)
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TP Modélisation
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L1
Maîtrise des concepts:
•Comprendre et interpréter
•Insertion dans les labos niçois
•Besoins des entreprises pharmaceutiques:
•
Cardio
•
Maladies neurodégénératives
•
Cancer
•
Maladies autoimmunes
•
Douleur chronique
Transports membranaires
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Gradient électrochimique
Principes de diffusion
Cellules excitables
Transmission synaptique
Stim/sécretion/contraction
Canaux et transporteurs
Propriétés physico-chimiques des
membranes
25
UE Endocrinologie Générale – 4 ECTS, 30h
Coordonnatrice : Marielle GUIBBOLINI
UE obligatoire pour le Parcours BPN - UE optionnelle pour le Parcours BMG
Objectif
Acquisition des connaissances fondamentales en Endocrinologie
Programme
-Analyse du système endocrinien: Notions d’hormones, de production et
distribution du message hormonal, Mécanismes d’action des hormones et réponses
des cellules au message hormonal.
-Glandes endocrines chez les Vertébrés : Système Hypothalamo-hypophysaire,
Thyroïde, Cortico- et Médullo-surrénales, Pancréas, Gonades et la Reproduction…
-Dans chaque chapitre seront abordés :
->la morphologie, l’anatomie, la cytologie et l’origine embryologique de chaque
glande.
->la biosynthèse, la sécrétion et son contrôle, le transport, la dégradation et le mode
d’action de chaque hormone.
->les effets physiologiques et physiopathologiques.
UE de 4 ECTS
UE de 30h : 24h CM / 6h TD / Absence de TP (voir UE TEF)
Exam : CCI (25%) + Synthèse d’article (25%) + CT (50%)
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Obligatoire Parcours BOE et BMG – V
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Stage bibliographique (stage)
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Botanique systématique et phylogénèse (optionnelle BOE et BMG-V)
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Objectifs généraux :
1. Connaitre les concepts et processus de la spéciation, propres au monde
végétal
2. Connaitre les principales méthodes et concepts de la systématique végétale
3. Une initiation à la systématique des végétaux supérieurs, à travers l’étude de
quelques familles courantes en Europe tempérée
Objectif des travaux pratiques (5 x 3 heures):
1. Identification et hiérarchisation des caractères morpho-anatomiques
d’importance
2. Acquérir l’autonomie en matière de détermination des espèces (TP)
CCI : 3 interrogations de 20 mn
4 notes de TP;
1 note de contrôle terminal (dont TP + cours)
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1er cours : jeudi 30 janvier
1er TD : mardi 4 février
1) l'UE Communication en Environnement (Jean de
Vaugelas – Responsable) et Paolo Guidetti
2) UELs "Projets ID-Bio" et "Dynamique des Structures
Organisées (DSO)", UEL ouverte aux L3
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