bhattacharjee - Labex Cortex

MANIK BHATTACHARJEE
3 rue Lachmann
38 000 Grenoble
Tél : [phone]
E-mail : [e-mail]
32 ans
Formation
•2009 : Doctorat (laboratoire CNRS UPR640, CRICM, université Paris XI).
•2008 : DU de Neurologie Expérimentale (Université Paris V)
•2005-2008 : DU de Formation Supérieure Biomédicale - IFSBM Université Paris XI.
•2005 : Master Information, Systèmes et Technologies - Imagerie médicale (Paris XI).
•2004 : Diplôme d'ingénieur de l'Ecole des Mines de Nantes option Génie informatique pour l'aide
à la décision.
•1999 : Baccalauréat S mention bien.
Langues
•Français : langue maternelle.
•Anglais : lu, parlé, écrit. 8/9 à l'examen international IELTS
•Espagnol : niveau basique.
•Allemand : niveau scolaire.
Expérience
•2010-2014 : Ingénieur de recherche – postdoc INSERM U836: développement de logiciels et de
séquences IRM pour la Stimulation Cérébrale Profonde (STN, PPN, cortex cingulaire).
Développement d'une base de données et de logiciels de visualisation pour l'analyse de données
SEEG chez les patients épileptiques.
•2009-2010 : ingénieur consultant chez Altran: développement logiciel pour la radiologie
interventionnelle pour General Electric Healthcare.
•2007-2009 : enseignant de TD pour le Certificat Informatique et Internet à l'Université Paris 7.
•2005-2009 : doctorant - conception et développement de logiciels pour la neurochirurgie
(simulation de chirurgie en Python et C++, recalage d'images en C++, analyse de signaux
électrophysiologiques en Perl, Matlab et Python)
•2006 : co-organisation du colloque de l'IFSBM: "Nouvelles technologies d'imagerie médicale".
•Juin à Septembre 2005 : vacataire au CNRS UPR 640 : “Etude de la corrélation entre
enregistrements électrophysiologiques per-opératoires et cartographie des noyaux gris centraux sur
une série de patients Parkinsoniens. Influence du phénomène de pneumocephalus”.
•Mars à Juin 2005 : vacataire à l'INSERM U289 : “intégration dans le logiciel BrainVisa
d'un logiciel de segmentation de l'hippocampe”
•Septembre 2004 à Février 2005 : auxiliaire de recherche au CNRS UPR 640
•Février 2004 à Août 2004 : développement logiciel au CNRS UPR 640 – “analyse et fusion
de données multimodales pour la neurochirurgie fonctionnelle”.
•Mai-Juin-Juillet 2003 : migration de systèmes et logiciels vers Linux dans l'entreprise
Intranet Consulting International, à Santiago du Chili.

•Octobre 2002 à Avril 2003 : chef de projet d'une équipe de quatre étudiants pour la
réalisation d'un logiciel de vidéoconférence.
• December 2002 : conception de l'architecture d'un réseau informatique pour l'association
Les Castors de l'Ouest, reliant les 24 agences au siège social, avec trois autres étudiants.
•Mai 2002 : optimisation du flux de production dans l'entreprise de charpente métallique
Girard Hervouet.
•Octobre à mai 2002 : chef de projet d'une équipe de quatre étudiants pour le développement
d'un logiciel de gestion d'albums multimédias.
•Mars à décember 2001 : analyste-programmeur dans une équipe de sept étudiants dans un
projet de logiciel de calcul de la transmission du bruit dans un navire pour la société
Log&Lin, sous-traitante pour Les chantiers de l'Atlantique.
Compétences informatiques
•Systèmes d'exploitation : Linux, Microsoft Windows, Sun Solaris
•Languages de programmation : C++, Java, Perl, Python, Matlab, Shell, Erlang, Visual Basic,
Haskell, Prolog, assembleur x86, HTML, PHP.
•Bases de données : MySQL, PostgreSQL, Oracle.
•Autres : Open Office.org, CVS, Subversion, UML, LaTeX,
administration système (linux).
Publications - colloques
•Avec comité de lecture
•Anatomy-preserving nonlinear registration of deep brain ROIs using confidence-based
block-matching. Bhattacharjee M et al. MICCAI Int Conf 2008
•A three-dimensional, histological and deformable atlas of the human basal ganglia. II. Atlas
deformation strategy and evaluation on retrospective series of Parkinsonian patients treated
by Deep Brain Stimulation. Bardinet E, Bhattacharjee M et al. J Neurosurg 2008
•A Brainvisa/Anatomist Visualisation and Processing Toolbox for Deep Brain Electrode
Implantation Under Stereotactic Conditions, Bhattacharjee M, et al., Computer Assisted
Radiology and Surgery 2008
•Modeling and detecting deep brain activity with MEG & EEG. Attal Y, Bhattacharjee M et
al. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 2007;2007:4937-40.
•Retrospective cross-evaluation of an histological and deformable 3D atlas of the basal
ganglia on series of Parkinsonian patients treated by deep brain stimulation. Bardinet E,
Dormont D, Malandain G, Bhattacharjee M et al. MICCAI Int Conf 2005;8(Pt 2):385-93.
•Sans comité de lecture
•Anatomo-functional study of Deep Brain Stimulation Signals in Parkinson Disease
(intervention orale et poster) Bhattacharjee M et al. Human Brain Mapping Conf 2006
•Colloques
•Intervention “Apports d'un atlas des noyaux gris centraux et de l'imagerie à l'étude et au
traitement des maladies neurodégénératives” au colloque de l'IFSBM 2008 “Maladies
neurodégénératives : Où en sommes-nous ?”
•Présentation “Microelectrode recordings in Parkinsonian patients during implantation surgery”,

Spike train analysis workshop, University of Newcastle, UK.
Loisirs
•Photographie : président du club photo de l'Ecole des Mines de Nantes en 2001-2002 et 2002-2003.
Organisation d'un concours régional en 2002.
•Cinéma d'art et essai: président du ciné-club de l'Ecole des Mines de Nantes en 2001-2002 et 2002-
2003.
•Voyages (Inde, Chili, Bolivie, Pérou, Etats-Unis, Tanzanie, Espagne, République Tchèque...)