Infections par les Rotavirus - Pôle de Biologie Pathologie Génétique

CBP
Infections par les
Rotavirus
ANNE GOFFARD
UNIVERSITÉ LILLE 2 DROIT ET SANTÉ
FACULTÉ DES SCIENCES PHARMACEUTIQUES ET BIOLOGIQUES
DE LILLE
[e-mail]
2012
1.0

Table des
matières
Objectifs 5
I - Infections par les rotavirus 7
A. Taxonomie et structure.................................................................................. 7
1. Taxonomie....................................................................................................................... 7
2. Structure de la particule virale............................................................................................ 7
3. Variabilité des Rotavirus.....................................................................................................8
B. Épidémiologie des infections à rotavirus...........................................................8
1. Epidémiologie mondiale..................................................................................................... 8
2. Épidémiologie en France.................................................................................................... 8
3. Modes de transmission des rotavirus....................................................................................8
C. Tableaux cliniques des infections à rotavirus..................................................... 9
1. Gastro-entérites à rotavirus chez l'enfant............................................................................. 9
D. Diagnostic des infections par les rotavirus........................................................9
1. Échantillons biologiques................................................................................................... 10
2. Diagnostic direct............................................................................................................. 10
3. Diagnostic indirect...........................................................................................................10
E. Traitement et prévention des infections à rotavirus..........................................10
1. Prise en charge de l'épisode aigu chez l'enfant.................................................................... 10
2. Prévention des gastro-entérites à Rotavirus........................................................................ 11
3

Objectifs
Ce cours est tiré de l'enseignement de virologie de la faculté de
pharmacie de Lille, destiné aux étudiants de 5ème année qui
préparent le concours de l'Internat en pharmacie.
5

I - Infections par les
rotavirus I
Taxonomie et structure 7
Épidémiologie des infections à rotavirus 8
Tableaux cliniques des infections à rotavirus 9
Diagnostic des infections par les rotavirus 9
Traitement et prévention des infections à rotavirus 10
A. Taxonomie et structure
1. Taxonomie
Les rotavirus appartiennent à la famille des , au genre Rotavirus. 7
groupes ont été identifiés.
2. Structure de la particule virale
Ce sont des virus nus de structure icosaédrique et à ARN double brin
segmenté (11 segments). En microscopie électronique, les virions de 60 à 80 nm
de diamètre ont l'aspect d'une roue, d'où leur nom.
Leur génome est constitué de onze segments (numérotés de 1 à 11) codant douze
protéines.
Leur capside est formée de trois couches de protéines :
la couche interne est formée par VP2,
la protéine VP6 forme la couche intermédiaire de la capside détermine les
sérogroupes, A à G. Trois d'entre eux (A, B et C) infectent les humains,
majoritairement le groupe A,
les protéines de la couche externe sont constituées de VP4 et VP7 qui
induisent la production d'anticorps. Les déterminants antigéniques de VP4
permettent de définir les sérotypes P, ceux portés par VP7 déterminenet
les sérotypes G.
Enfin, les protéines VP1 et VP3 sont associées au génome
3. Variabilité des Rotavirus
Les arrangements génétiques sont fréquents mais ont peu d'impacts sur
7

l'épidémiologie.
Les mutations peuvent entraîner une dérive génétique avec pour conséqunce
l'apparition de mutants d'échappement voire de souches épidémiques.
Les réassortiments entre génomes humains et entre génomes de différentes
espèces sont à l'origine de l'émergence de nouveaux génotypes humains
comme par exemple les rotavirus G9.
B. Épidémiologie des infections à rotavirus
1. Epidémiologie mondiale
Les rotavirus sont la première cause de diarrhée aiguë sévère du jeune
enfant dans le monde.
Presque tous les enfants sont infectés par un rotavirus au cours des cinq premières
années de leur vie.
> 500 000 enfants de moins de 5 ans meurent de diarrhée à rotavirus
chaque année, à plus de 85% dans les pays à faible revenu d'Afrique et d'Asie.
Dans les pays industrialisés, les infections à rotavirus représentent 15 à 50%
des cas de gastro-entérites ; la mortalité associée à celles-ci reste faible.
Principale cause de mortalité infantile, la gastro-entérite à rotavirus est
responsable d'un demi-million de décès par an, chez les enfants de moins
de cinq ans.
On rencontre des gastro-entérites à Rotavirus lors d'épidémies hivernales, mais il
existe également des cas sporadiques tout au long de l'année.
2. Épidémiologie en France
En France, près de 300 000 épisodes annuels seraient décomptés chez les
enfants de moins de cinq ans avec une dizaine de décès
Les infections à Rotavirus sont observées en France pendant l'hiver, de Novembre
à Mars avec un pic en décembre et janvier.
Cependant des cas sporadiques peuvent survenir en dehors de cette période.
3. Modes de transmission des rotavirus
Virus nus très résistants dans l'environnement.
Transmission fécale-orale directe : par les mains souillées, lors du nettoyage des
sanitaires.
transmission indirecte : par les aliments (coquillages...), par les eaux souillées.
Infections par les rotavirus
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