1
Virus:
Diversité génétique et variation antigénique
Conséquences épidémiologiques et thérapeutiques
M. Segondy
Virus: Diversité génétique
Virus:
Génome
+
Capside
±
Enveloppe
2
Virus: Diversité génétique
Génome viral
ADN ou ARN
Porte l’information génétique
Protéines structurales
Capside, glycoprotéines d’enveloppe
Protéines non structurales
Enzymes (ARN ou ADN polymérases, protéases…)
Protéines de régulation (Transactivateurs…)
Variabilité génétique des virus
Causes de la variabilité génétique:
Mutations
Recombinaisons
3
Mutations
Taux de mutation très variable selon les
virus:
Virus génétiquement stables
Virus à ADN
Taux de mutation: 1/10
9
nucléotide/cycle
Virus génétiquement instables
Certains virus à ARN: VIH, Hépatite C, …
Taux de mutation: 1/10
4
nucléotide/cycle
Mutations
Virus génétiquement instable:
Erreurs de transcription par l’ARN
polymérase ou la reverse transcriptase
Enzymes dépourvues de système de
correction
Accumulation des erreurs au cours des
cycles de réplications successifs
4
Variabilité génétique des virus
Virus génétiquement instables
Variabilité génétique des virus
Virus génétiquement instables:
quasispecies
Terme utilisé pour
décrire un cluster de
virus variants qui
découlent de mutations
au cours du temps au
sein d'un isolat
5
Variabilité génétique des virus
Recombinaison:
1 / 16 100%
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