3V523- genetique bacterienne et regulations - Licence SdV

Fiche&d’U.E.&–&3V523&
Génétique&microbienne&et&régulations&cellulaires&
!
!
− Responsables&de&l’U.E&:&&
Laure!TEYSSET,![e-mail]!!
Guennadi!SEZONOV,![e-mail]!
− Nature&de&l’U.E:&&
Complémentaire!
− Nombre&d’ECTS&:&&
6ECTS!!
− Semestre&où&l’enseignement&est&proposé&:&
S5!
− Nombre&d’heures&de&cours&:&&
18h!de!cours!
− Nombre&d’heures&de&TD&:&&
12h!de!TD!
− Nombre&d’heures&de&TP&:&&
30h!(TP!obligatoirement!groupé!sur!une!semaine!pour!des!raisons!expérimentales)!
− Evaluation:&
Compte‐rendu!de!TP!(25%),!Contrôle!Continu!(25%)!et!Examen!final!(50%)!
− Capacité&d’accueil&
150!étudiants!
!
!
Cette& UE& de& génétique& et& de& microbiologie& composée& d'une& partie& théorique& et& d'une&
partie& pratique& a& pour& but& d’introduire& les& principes& fondamentaux& de& la& génétique& des&
procaryotes& et& de& leurs& virus,& et& de& présenter& les& divers& mécanismes& de& régulation&
indispensables&pour&leur&fonctionnement.&&
!
!!!!!! a)!Objectifs!de!l'Unité!d'Enseignement!
L’objectif!de!cette!UE,!qui!s’appuie!sur!les!acquis!des!UE!de!tronc!commun!de!L2!de!génétique!et!
de!microbiologie,!est!d’introduire!les!principes!fondamentaux!de!la!génétique!des!procaryotes!
et!de!leurs!virus,!et!de!présenter!les!divers!mécanismes!de!régulation!indispensables!pour!leur!
fonctionnement.!L’enseignement!théorique,!sous!forme!de!cours!et!travaux!dirigés,!sera!illustré!
par!un!atelier!pratique!d’une!semaine!sur!le!modèle!de!la!bactérie!Escherichia)coli.!Au!cours!de!
celui‐ci,!l’organisation!physique!et!fonctionnelle!d’un!régulon!sera!étudiée!grâce!à!la!production!
de! mutants! suivie! de! leur! caractérisation! phénotypique! et! moléculaire! par! conjugaison!

bactérienne!et! par! PCR.! Ces! travaux!pratiques! seront!également!l'occasion!d'introduire!par!un!
exemple! concret! une! analyse! in) silico! simple! de! ce! régulon! en! utilisant! différents! outils!
bioinformatiques!d'analyse!de!séquences.!!
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! b)!Thèmes!abordés!!
‐Variabilité!génétique!
‐Mécanismes!d’échanges!génétiques!chez!les!bactéries!
‐Interactions!bactéries/!bactériophages!
‐Génétique!directe!et!génétique!inverse!
‐Régulation!de!l’expression!des!gènes!sur!différents!exemples!(catabolisme!du!maltose!;!modèles!
phagiques!;!régulation!des!écosystèmes!bactériens…)!
!
! c)!Connaissances!et!compétences!attendues!
Les! connaissances! et! compétences! requises! pour! pouvoir! suivre! cet! enseignement!
correspondent!aux!acquis!des!UE!de!tronc!commun!de!L2!de!génétique!et!microbiologie.!!
A! l'issu! de! cet! enseignement,! les! étudiants! auront! acquis! les! bases! fondamentales! de! la!
génétique!des!procaryotes!et!de!leurs!virus.!Grâce!à!la!partie!pratique,!ils!auront!appris!à!suivre!
une! démarche! expérimentale! :! de! la! mise! en! oeuvre! du! protocole! jusqu'à! l'analyse! et!
l'interprétation!des!résultats.!
!
! d)!Evaluation!
Compte‐!rendu!de!TP!(25%),!Contrôle!Continu!(25%),!Examen!Final!(50%)!
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! e)!Particularités!pédagogiques!!
Cette!unité!d'enseignement!est!constituée!d'une!partie!théorique!présentant!les!concepts!et!les!
outils! utilisés! en! génétique! bactérienne! dont! un! certain! nombre! seront! illustrés! directement!
dans!la!partie!expérimentale.!!
Ces! outils! incluent! des! expériences! de! génétique! classique! (mutagenèse! aléatoire)! et! de!
génétique! inverse! (mutagenèse! dirigée),! des! expériences! de! biologie! moléculaire! (PCR)! pour!
générer!les!outils!nécessaires!à!la!mutagenèse!dirigée!et!localiser!les!mutations,!des!expériences!
de! caractérisation! phénotypique! des! mutants! et! de! conjugaison! bactérienne.! Ces! diverses!
approches! expérimentales! seront! couplées! à! une! analyse! bioinformatique! de! la! séquence! des!
gènes! impliquées! dans! la! voie! métabolique! étudiée.! Au! cours! de! ce! TP,! les! étudiants! seront!
amenés! à! analyser! leurs! propres! résultats,! et! à! proposer! des! expériences! pour! améliorer! la!
caractérisation!des!mutants.!Certains!de!ces!expériences!pourront!être!mises!en!oeuvre!durant!
le!TP.!
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