3V523- genetique bacterienne et regulations - Licence SdV

Fiche d’U.E. – 3V523 Génétique microbienne et régulations cellulaires −
Responsables de l’U.E : Laure TEYSSET, [email protected] Guennadi SEZONOV, [email protected] −
Nature de l’U.E: Complémentaire −
Nombre d’ECTS : 6ECTS −
Semestre où l’enseignement est proposé : S5 −
Nombre d’heures de cours : 18h de cours −
Nombre d’heures de TD : 12h de TD −
Nombre d’heures de TP : 30h (TP obligatoirement groupé sur une semaine pour des raisons expérimentales) −
Evaluation: Compte‐rendu de TP (25%), Contrôle Continu (25%) et Examen final (50%) −
Capacité d’accueil 150 étudiants Cette UE de génétique et de microbiologie composée d'une partie théorique et d'une partie pratique a pour but d’introduire les principes fondamentaux de la génétique des procaryotes et de leurs virus, et de présenter les divers mécanismes de régulation indispensables pour leur fonctionnement. a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement L’objectif de cette UE, qui s’appuie sur les acquis des UE de tronc commun de L2 de génétique et de microbiologie, est d’introduire les principes fondamentaux de la génétique des procaryotes et de leurs virus, et de présenter les divers mécanismes de régulation indispensables pour leur fonctionnement. L’enseignement théorique, sous forme de cours et travaux dirigés, sera illustré par un atelier pratique d’une semaine sur le modèle de la bactérie Escherichia coli. Au cours de celui‐ci, l’organisation physique et fonctionnelle d’un régulon sera étudiée grâce à la production de mutants suivie de leur caractérisation phénotypique et moléculaire par conjugaison bactérienne et par PCR. Ces travaux pratiques seront également l'occasion d'introduire par un exemple concret une analyse in silico simple de ce régulon en utilisant différents outils bioinformatiques d'analyse de séquences. b) Thèmes abordés ‐Variabilité génétique ‐Mécanismes d’échanges génétiques chez les bactéries ‐Interactions bactéries/ bactériophages ‐Génétique directe et génétique inverse ‐Régulation de l’expression des gènes sur différents exemples (catabolisme du maltose ; modèles phagiques ; régulation des écosystèmes bactériens…) c) Connaissances et compétences attendues Les connaissances et compétences requises pour pouvoir suivre cet enseignement correspondent aux acquis des UE de tronc commun de L2 de génétique et microbiologie. A l'issu de cet enseignement, les étudiants auront acquis les bases fondamentales de la génétique des procaryotes et de leurs virus. Grâce à la partie pratique, ils auront appris à suivre une démarche expérimentale : de la mise en oeuvre du protocole jusqu'à l'analyse et l'interprétation des résultats. d) Evaluation Compte‐ rendu de TP (25%), Contrôle Continu (25%), Examen Final (50%) e) Particularités pédagogiques Cette unité d'enseignement est constituée d'une partie théorique présentant les concepts et les outils utilisés en génétique bactérienne dont un certain nombre seront illustrés directement dans la partie expérimentale. Ces outils incluent des expériences de génétique classique (mutagenèse aléatoire) et de génétique inverse (mutagenèse dirigée), des expériences de biologie moléculaire (PCR) pour générer les outils nécessaires à la mutagenèse dirigée et localiser les mutations, des expériences de caractérisation phénotypique des mutants et de conjugaison bactérienne. Ces diverses approches expérimentales seront couplées à une analyse bioinformatique de la séquence des gènes impliquées dans la voie métabolique étudiée. Au cours de ce TP, les étudiants seront amenés à analyser leurs propres résultats, et à proposer des expériences pour améliorer la caractérisation des mutants. Certains de ces expériences pourront être mises en oeuvre durant le TP.