Sujet du stage (sous forme de titre court) : Structure et fonction du

Sujet du stage (sous forme de titre court) :
Structure et fonction du système de transformation naturelle de Streptococcus
pneumoniae
Laboratoire
Nom du Responsable : Rémi
Fronzes
CNRS UMR3528 institut Pasteur
Affiliation
administrative (CNRS,
INSERM...)
et
n°
l'Unité :
Adresse précise
Laboratoire :
du 25 rue du Dr Roux, 75015 Patur
Équipe d'accueil des Doctorants
Nom de l'équipe:
Nom du Responsable :
Biologie structurale de la sécrétion
bactérienne
Rémi Fronzes
École Doctorale de rattachement : Complexité du vivant
Responsable du Stage
Nom :
Rémi Fronzes
Numéro de téléphone :
0145688864
Numéro de télécopie :
Adresse électronique :
[email protected]
Profil de l'étudiant(e) souhaité :
Renseignements complémentaires
X
Perspectiv
oui
es de
poursuite
de thèse :
Avec une
bourse
spécifique
:
oui
Non
X
Non
4
dans
l'équipe
d'accueil)
si
oui
précisez :
Laboratoire d'accueil (Unité CNRS, INSERM, etc..) :
Nombre
de
chercheur
4
(dont
s:
Nombre
d'enseign
antschercheur
s:
0
(dont
0
dans
l'équipe
d'accueil)
Nombre
de "HDR"
:
1
(dont
1
dans
l'équipe
d'accueil)
Nombre
d'ITA :
1
(dont
1
dans
l'équipe
d'accueil)
Nombre
de
"post-docs
":
3
(dont
3
dans
l'équipe
d'accueil)
0
0
Nombre
(dont
dans
de
l'équipe
visiteurs
d'accueil)
étrangers
:
Sujet de stage (et principales techniques) :
Notre laboratoire s’intéresse aux systèmes permettant aux macromolécules de traverser
l’enveloppe cellulaire bactérienne. Ces systèmes de sécrétion sont essentiels à la survie et à
la virulence des bactéries pathogènes. Nous nous intéressons tout particulièrement aux
systèmes qui permettent à l’ADN d’entrer ou de sortir de la bactérie. Grâce à ces
systèmes, les bactéries ont la capacité d’échanger de l’information génétique et d’acquérir
de nouvelles compétences comme la résistance à un antibiotique ou la capacité à survivre
dans un environnement qui leur est hostile.
Dans le laboratoire, nous intéressons à l’architecture moléculaire des systèmes de
transfert d’ADN responsables de la transformation bactérienne. Au cours de ce processus,
de l’ADN est importé dans la bactérie depuis le milieu extérieur. Une machinerie
moléculaire composée de plusieurs protéines et située au niveau de l’enveloppe cellulaire
permet cet import. Les différents composants de cette machinerie d’import ont été
identifiés mais leur structure ainsi que leur agencement au sein du complexe sont
inconnus. Nous utilisons la microscopie électronique à haute résolution et la
cristallographie afin comprendre comment la machinerie d’import est bâtie et comment
elle fonctionne.
Au cours de son stage, l’étudiant de M2 réalisera l’étude biochimique et structurale de
sous-unités du système de transformation de Streptococcus pneumoniae. Elle/il utilisera
des techniques de biologie moléculaire (clonage de gènes, électrophorèse, Western blot,
expression de protéine recombinantes), de biochimie (Chromatographie) et de
biophysique (Microscopie électronique et/ou cristallographie de protéines) afin de purifier
ces protéines et d’en caractériser la structure.