L`Influenza aviaire (IA) et la maladie de Newcastle (MN) sont des

GRIPAVI 3éme Comité de Pilotage PRINCIPAUX POINTS A VALIDER A­ LES OBSERVATOIRES ­ Principaux points à valider par le comité de pilotage (Les activités de l’année 2 et le prévisionnel année 3 sont détaillés dans les rapports d’activités par observatoires et dans les tableaux de bord par activités) Pour se conformer aux demandes des comités de pilotage (« Le Comité a aussi souligné l’importance au cours de la première année de s’assurer de la faisabilité et de la durabilité des observatoires proposés »), les ajustements suivants sont proposés pour l’année 3 : • Pendant les deux premières années du projet, les observatoires Mali et Madagascar ont pu affiner les questions de recherche spécifiques et formaliser leurs protocoles définitifs. Les activités seront dans le prolongement de l’année 2 • Vietnam analyse de risque inter­espèces (porcs, volaille, homme). Zimbabwe West Nile. Pour les mener à bien, ces deux observatoires devraient faire l’objet d’investissements spécifiques en année 3 • Les observatoires Ethiopie et Mauritanie, plus spécialisés (filières domestiques – Newcastle pour l’Ethiopie, avifaune sauvage – AI pour la Mauritanie) devraient voir une extension de leurs activités en année 2 et 3 en étude de prévalence toutes maladies (Ethiopie) ; étude Brésil (Mauritanie) B­ LES COMPOSANTES DE GRIPAVI (Rappel) : Structuré en quatre composantes (C1 à C4), le projet GRIPAVI vise à mieux comprendre la dynamique d’introduction, de circulation et de maintien des virus de l’IA dans les populations aviaires par des approches combinant l’étude des facteurs environnementaux, des populations de virus, des pratiques d’élevage et de commercialisation. La compréhension des processus écologiques et épidémiologiques (C1) sera suivie d’une mise en application des connaissances pour l’élaboration de recommandations en matière d’évaluation et de gestion des risques puis de définition d’outils d’aide à la décision pour la surveillance et le contrôle de l’IA (C2). Les deux autres composantes sont transversales : C3 concerne la mise en oeuvre de la stratégie de communication définie pour le projet et la mise à la disposition de la communauté scientifique internationale des données et résultats obtenus au cours du projet. La composante C4 est consacrée au management de l’ensemble et aux aspects relatifs à la formation professionnelle et académique. D ­ LES COMPOSANTES DE GRIPAVI : Principaux points à valider par le comité de pilotage 1
(Les activités de l’année 2 et le prévisionnel année 3 sont détaillés dans les rapports d’activités par observatoire et dans les tableaux de bord par activité) Composante 1 : Ecologie et épidémiologie ƒ Achat de matériel pour le laboratoire de référence à Montpellier (CIRAD) afin d’améliorer la traçabilité et la conservation des échantillons (cf. argumentaire spécifique) ƒ Recrutement d’un intérimaire en virologie : en 2010 et compte­tenu du retard pris par certains observatoires associés au projet, la bonne marche du projet GRIPAVI va impliquer une augmentation des analyses à effectuer au sein de l’UMR15. Il est prévu ainsi d’effectuer en plus de ce qui était initialement prévu, des analyses sur des échantillons issus du Vietnam et de l’Ethiopie. Cela représentera une augmentation d’environ 4000 échantillons à traiter. En conséquence, l’UMR­15 du CIRAD, responsable du volet virologie du projet, demande à renforcer ses ressources humaines par le recrutement d’un assistant de laboratoire intérimaire niveau bac+3 pour une période de 10 mois. Cet intérimaire aidera au tri, à l’extraction d’ARN, aux réactions de PCR et de séquençage sur les échantillons déjà en stock et ceux prélevés dans les prochaines semaines • Sous composante : interaction entre communautés d’oiseaux sauvages et populations de virus (écologie virale 1) ƒ Continuité en année 2 des suivis longitudinaux dans les différents compartiments sauvages des observatoires concernés. ƒ Screening de nouveaux pathogènes (Ethiopie, Zimbabwe) (cf. argumentaire spécifique) ƒ Mise en complémentarité avec Brésil : appui au développent d’une étude comparative sur l’éco­épidémiologie des virus de l’influenza aviaire et de la maladie de Newcastle dans les écosystèmes du Brésil et d’Afrique sub­saharienne (Université de Sao Paulo, Cirad) (cf. argumentaire spécifique) • Sous composante : interaction entre communautés d’oiseaux domestiques et populations de virus (écologie virale 2 et épidémiologie quantitative): ƒ Pour le Mali et l’Ethiopie, il est proposé que les analyses virologiques en année 2 du projet soient effectuées au laboratoire du CIRAD sans doublons dans les laboratoires partenaires afin qu’ils puissent se concentrer sur les échantillons année 1 ; ce point devra être rediscuté en année 3 en fonction des résultats obtenus par ces laboratoires sur les prélèvements de l’année 1. ƒ Pour le Vietnam aux vues de résultats virologiques (très faible prévalence, pas d’isolement de virus), ainsi que des performances moins bonnes du laboratoire NIVR lors des essais interlaboratoire, et les retards accumulés par le laboratoire national partenaire, il est proposé, pour le screening virologique d’envoyer les échantillons individuels (campagne 1) ainsi que les pools (campagne 4) au laboratoire du CIRAD de Montpellier. Il est également proposé de faire participer l’employé du laboratoire NIVR en charge des analyses virologique aux analyses au CIRAD de Montpellier, son financement pouvant être pris en charge sur des fonds propre CIRAD. ƒ Suivi des enquêtes et analyses sero­épidémiologiques en année 3 sur tous les observatoires (IA et NDV) et des partenariats mis en place à cet égard (IP Hong Kong). Ligne budgétaire à formaliser pour finaliser la mise en place de la LoU. 2
ƒ Suivi des enquêtes et analyses (virologiques et sérologiques) des virus influenza présent chez le porc (Vietnam). Ligne budgétaire à formaliser (cf.supra) ƒ Continuation des activités basées des modèles mathématiques de réseaux sociaux ainsi que sur des méthodes de capture­marquage­recapture (dérivées de l’écologie et de méthodes capture­recapture dérivées la surveillance en santé publique) Composante 2 : Analyse de risque et épidémiologie appliquée • Sous composante : Estimation des risques liés au commerce. ƒ Continuité en année 2 des enquêtes filières et de des suivis longitudinaux (Vietnam, Ethiopie, Madagascar) ƒ Continuité et valorisation des activités d’évaluation des risques en Ethiopie (méthodes probabilistes) ƒ Etude de transmission inter­espèces (volaille/porc/homme) des virus influenza : dans le contexte actuel de pandémie humaine au virus H1N1, l’évaluation des risques de transmission/recombinaisons de virus influenza liés aux contacts entre porcs et volaille est incontournable. Les activités prévues entrent dans le cadre d’une thèse de l’ENVT accueillie au CIRAD qui a débutée en 2009 • Sous composante : Evaluation des stratégies de surveillance et de contrôle (gestion du risque) ƒ Mise en place d’une étude d’impact de la vaccination contre l’influenza aviaire au Vietnam basée sur les études rétrospectives sur les infections H5N1 et longitudinales sur l’efficacité de la vaccination contre l’influenza aviaire ƒ Liens avec le projet AFD en cours de montage (PhD) sur l’évaluation économique du système de surveillance influenza aviaire au Vietnam. ƒ Test croisé de protection vaccinale contre les souches du virus de la maladie de Newcastle isolées à Madagascar: détermination du niveau de protection conféré par les vaccins (La Sota vivant et Mukteswar) commercialisés à Madagascar contre les souches virales de la maladie de Newcastle (VMN) récemment isolées au DRZV au CIRAD dans le cadre du projet GRIPAVI. Composante 3 : Mise à disposition des données et des résultats, Communication • Sous composante Bases de données ƒ Organisation d’un séminaire annuel d’harmonisation inter­observatoire sur la qualité des données sanitaires pour l’écologie, l’épidémiologie et la socio­économie (occurrences, populations, unités d’observation, unités de mesure, variables, traitement des données manquantes, requêtes partagées, etc.) en septembre 2010. • Sous composante Communication 3
ƒ Organisation en décembre 2010 du premier atelier régional GRIPAVI à destination des partenaires scientifiques et techniques (CIRDES ou EISMV). A coupler avec le dernier comité de pilotage (Vidéoconférence ?). ƒ Ciblage des publications dans journaux à FI en privilégiant les revues en Open Access. Les couts de publications seront à la charge de GRIPAVI. Effort spécifique sur les publications des allocataires en premier auteur. ƒ Préparation d’une conférence de restitution finale sur les pestes aviaires Asie/Afrique en clôture du projet. Composante 4 : Formation professionnelle et académique, management • Sous composante formation professionnelle et académique ƒ Continuité des formalisations des liens académiques entre GRIPAVI et les principales formations universitaires au sud dans les domaines de l’épidémiologie, l’écologie et l’économie de la santé (présentation dans les modules d’enseignement des matériels, méthodes et résultats Gripavi, accueil d’étudiants en Master au sein des observatoires, etc.). Trois Masters Santé­Maladies Emergentes auxquels est associé le CIRAD sont concernés : MIVA (Thailande), EISMV (Sénégal), U. Pretoria (Afrique du Sud) • Sous composante Management : ƒ Modification de certaines lignes budgétaires (voir document annexe « bilan financier ») ƒ Après accord du comité de pilotage sur les réallocations de fond proposées, proposition d’un avenant à la convention de financement au cours du premier trimestre 2010. 4