PATHfinder

PATHfinder
Bactéries et Parasites
Détection et quantification par PCR en temps réel

Le secteur alimentaire est, à l’échelle mondiale, un acteur déterminant dans les vies et la santé
de la population humaine et le consommateur y investit une confiance particulière.
Quand les maladies ou les épidémies d'origine alimentaire font la une des journaux, le publique
est naturellement perturbé et demande des règles plus serrées et une surveillance des produits
alimentaires plus efficace.
La détection traditionnelle des bactéries, culture-dépendante, est souvent longue et laborieuse et
reste en décalage avec les temps rapides d’exécution de l’industrie alimentaire moderne, en
considérant que souvent l’intervalle de temps de la ferme à l’assiette est de 24 heures seulement.
Les principaux avantages des méthodes basées sur la PCR sont la spécificité, l’information (par ex.
l'identification immédiate de la souche bactérienne), la sensibilité et la rapidité majeures par
rapport aux tests microbiologiques conventionnels. Bien qu’un passage de pré-enrichissement soit
souvent nécessaire, la simplicité et le gain de temps de la réaction de PCR la rendent une
méthode bien applicable à la détection des pathogènes bactériens, mais aussi des
microorganismes d’altération, dans les aliments et les boissons.
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Les méthodes d’analyse basées sur les acides nucléiques et leur standardisation sont le cœur des
activités d’R&D et de vente chez Generon,car nous aspirons à devenir le partenaire idéal pour
l’industrie des aliments et des boissons en ce domaine.
PATHfinder est le portefeuille de produits développés par Generon afin d’exploiter au mieux la
PCR en temps réel et offrir au consommateur des protocoles optimisés et validés pour vérifier la
présence d’une large varieté de microorganismes pathogéniques ou d’altération en recherchant
leur ADN. La collection inclut:
•PATHfinder Assays: amorces et sondes développées sur la base de nombreux articles
scientifiques, revus après une confirmation approfondie in–silico et in-vitro des données
publiées et mélangées à une polymérase bien sélectionnée afin d’assurer une détection au
top.
•PATHfinder SureXtra: pellets bactériens inactivés par la chaleur à une compte cellulaire
connue, assurant un stricte contrôle de l’efficace du procès d’extraction de l’ADN;
•PATHfinder DigiCount: calibreurs innovants de ddPCR à concentration connue, pour obtenir la
meilleure précision de quantification en unités génomiques.
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Le portefeuille PATHfinder est intégré avec les kits pour l’extraction des acides nucléiques à partir
des échantillons, produits développés par Generon ou par des partenaires techniquement
sélectionnés.
GENERlex 6% et GENERlex ION-Liquid Force le kit d’extraction rapide développé par l’équipe R&D
de Generon pour l’extraction d’ADN bactérien/fongique à partir du bouillon d’enrichissement.
Ion Spin DNA Prep One-for-All, développé par l’R&D Generon, est spécifiquement indiqué pour
l’extraction à partir de matrices “difficiles” (par ex. échantillons de chocolat). Il s’agit de la
meilleure solution aussi quand on veut extraire des bactéries Gram positifs, sporulées ou des
parasites, qui demandent des conditions d’extraction plus restrictives afin de pouvoir casser les
parois cellulaires.
Le kit Bio-Rad Aquadien™est spécifiquement sélectionné pour l’extraction d’ADN bactérien à
partir de tout type d’échantillon d’eau.
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Figure 1 –Application de la PCR en temps réel en microbiologie
Filtration de
l’échantillon
Extraction de l’ADN
Quantitative
PCR en temps réel
Présence/Absence
PCR en temps réel
ID des Colonies
PCR en temps réel
Échantillons
Solides
Échantillons
Liquides
Colonies
Isolées
Enrichissement
de l’échantillon
L'approche expérimental le plus approprié pour répondre aux exigences analytiques devrait
considérer les matrices testées, les caractéristiques de la bactérie, la concentration attendue et
les limites technologiques. Generon vous assiste pour trouver la meilleure solution du tout début.