Quelques sujets de stage de Master 2 en cours (2015)
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Quelques sujets de stage de Master 2 en cours (2015) Evaluation de la fonction de nourricerie du fond de la baie de Saint-Brieuc pour l’ichtyofaune. Structure d’accueil : Réserve Naturelle Nationale de la Baie de Saint-Brieuc (Côtes d’Armor) -Thématique générale Fonctionnalité des prés salés au regard de l’Ichtyofaune . - Objectifs scientifiques -Caractérisation de la communauté de poissons qui fréquente les prés salés ainsi que des proies potentielles et consommées. - Evaluation de la fonction de nourricerie des marais salés au travers de l’évaluation des critères définissant une « zone de nourricerie ». -Tentative de reconstitution du réseau trophique à partir de l’analyse des isotopes stables des espèces les plus représentatives. Ces objectifs seront réalisés pour les deux espèces les plus abondantes : le Bar et les Gobies. Impacts de l’écrevisse invasive de Louisiane sur la faune native d’amphibiens (grenouille agile, triton palmé, triton marbré). Structure d’accueil : UMR 6553 ECOBIO Université de Rennes 1 - Thématique générale Ségrégation de niche entre la faune native d’amphibiens et l’écrevisse invasive de Louisiane dans un contexte de réseau de mares. - Objectifs scientifiques Volet 1 : identifier s’il existe une exclusion spatiale de 3 espèces d’amphibiens par l’écrevisse de Louisiane dans un réseau de mares (impacts à long terme de l’écrevisse). Volet 2 : caractériser et quantifier les impacts à court terme de l’écrevisse de Louisiane sur les amphibiens en termes de succès reproducteur, mobilité et morphologie des larves. Etude de la contribution des chiroptères dans la régulation des ravageurs en verger de pommier. Structure d’accueil : Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes - Thématique générale Biodiversité fonctionnelle en arboriculture fruitière -Objectifs scientifiques - Etude de la prédation de la Tordeuse orientale (Grapholitha molesta) et du Carpocapse de la pomme (Cydia pomonella) par les chiroptères en lien avec la dynamique de ces ravageurs. - Déterminer les espèces de chauves-souris impliquées dans la prédation et la fréquentation du milieu. - Définition des caractéristiques paysagères favorisant l’activité globale et l’activité de chasse des chiroptères en paysage agricole. - Etudier la prédation des ravageurs par les chiroptères autour d’une source de lumière. Structuration des assemblages d’Arthropodes des strates foliaires d’un réseau de haies. Structure d’accueil : EA 7316 Biodiversité et gestion des Territoires Université de Rennes 1 - -Thématique Facteurs écologiques-clés structurant les groupes fonctionnels -prédateurs et phytophages arthropodes - du feuillage des haies. Influence ‘micro-/macro-architecture des haies ‘ vs ‘exposition des haies’. -Objectifs - Quantifier les différences de températures au niveau des strates foliaires pour des haies soumises à différentes expositions solaires (mesures par capteurs thermiques) -Evaluer l’influence relative des amplitudes thermiques observées (exposition des haies), et des caractéristiques micro-architecturales et macro-architecturales de la strate foliaire (indices de complexité) sur la structuration des assemblages d’Araignées (diversité, densité, groupes fonctionnels) et d’Insectes phytophages (diversité, densité, abondance relative). Stratégie de conservation des bryophytes du territoire d’agrément du CBN du Massif Central : Cas de 9 espèces rares et menacées d’Auvergne. Structure d’accueil : Conservatoire Botanique National du Massif Central - - - Thématique générale Conservation in et ex situ des bryophytes rares et menacées d’Auvergne. - Objectifs scientifiques Affiner la connaissance sur la biologie, la répartition et l’écologie des espèces ciblées par le projet ; en particulier les exigences écologiques à l’échelle de la phytocénose et du microhabitat : à partir de la littérature scientifique, ainsi que par des expérimentations in situ. -Proposer des actions concrètes de mesures de conservation in situ, sous forme de fiches action à rédiger, et ce pour chacune des 9 espèces, la biologie et les écologies étant très variables au sein de ce premier « groupe » d’espèces. -Initier la mise en collection à but conservatoire (conservation ex situ) au CBN des espèces ciblées, dans un but de réintroduction à court terme. Dans certains cas, utiliser cette mise en collection : pour affiner les connaissances écologiques, par exemple la différence des taux de croissance et de survie au sein d’une espèce (Pallavicinia lyelli) pour définir les meilleures conditions de croissance et de développement ex situ des espèces, (quel substrat assure les meilleurs taux de croissance/reproduction (Aloina bifrons) ?). Densité et évolution démographique des populations de micromammifères par capture-marquage-recapture et analyse photographique de la fréquentation de passages à faune. Structure d’accueil : Conseil Départemental du Bas-Rhin - Thématique générale Suivi pluriannuel des passages à faunes dans les agroécosystèmes - Objectifs scientifiques -Etudier la répartition spatiale des campagnols des champs dans les parcelles, selon un gradient du bord de route, vers l’extrémité opposée de la parcelle. -Estimer l’efficacité relative des passages à faune en fonctions de la densité de population présente aux abords des passages Suivi de la colonisation et de la dispersion des amphibiens au sein d’un réseau de zones humides en forêt. Structure d’accueil : équipe IPA-PE (ingénierie du projet, aménagement, paysages et environnement) de l’UMR CNRS 7324 CITERES – Université François Rabelais de Tours. - Thématique générale Colonisation et dispersion des amphibiens au sein d’un réseau de zones humides forestières et connectivité fonctionnelle (approche génétique). - Objectifs scientifiques (1) Comprendre les patrons de dispersion et de colonisation des espèces d’amphibiens au sein d’un réseau de mares forestières restaurées, en fonction des conditions environnementales et de la structure spatiale du réseau.. (2) Analyser les capacités de déplacements d’espèces cibles au sein du réseau (3) aborder la diversité génétique intra-spécifique, des populations inféodées au réseau de mares forestières. Analyse comparative des méthodes d’échantillonnages et des méthodes d’identification des Aranéides de forêts tropicales Structure d’accueil : EA 7316 Biodiversité et gestion des Territoires Université de Rennes 1 - Thématique générale Stratégies d’échantillonnages des aranéides et estimateurs de biodiversité en couvert forestier tropical ; apport de la technologie du ‘barcoding pour la ségrégation des morpho-espèces. - Objectifs scientifiques Les communautés répondent de la même manière aux paramètres écologiques (période = jour vs nuit , altitude : bas vs. Inselberg). Les deux méthodes d’échantillonnage utilisées (fauchage sur transect et battage dans quadrat) ont-elles la même efficacité sur les deux sites échantillonnés (Guyane 2010 vs. 2013). ? - - La méthode du fauchage sur transect permet elle de collecter plus d’individus et une richesse taxonomique plus importante que la méthode du battage dans quadrat ?les proportions d’uniques et de dupliqués ainsi que l’indice de complétude (Richesse observée/Richesse estimée) sont-ils similaires entre les deux méthodes ?Les deux méthodes permettent-elles d’échantillonner les mêmes communautés (familles) puisqu’elles ne ciblent pas exactement les mêmes strates ? L’identification à la morpho-espèce et à l’espèce permettent d’obtenir une précision sensiblement similaire (Basset et al., 2000). L’identification grâce à la technologie du barcoding permet-elle de ségréger de manière plus précise les espèces et de mettre en évidence les espèces cryptiques que les critères morphologiques ne permettent de distinguer ? Cartographie et analyse de la structure des populations du Pique prune (Osmoderma eremita (Scopoli, 1763)) dans la Réserve Biologique Intégrale du Marquairès (Lozère – 48) Structure d’accueil : Office National des Forêts Languedoc Roussillon. - Thématique Structure, dynamique et conservation des espèces organisées en métapopulations. - Objectifs scientifiques Réaliser une cartographie et une analyse descriptive des populations du Pique prune sur le site du Marquaires afin : - de définir les préférences écologiques de l'espèce sur le site (essence, diamètre…) - de décrire la structure spatiale de la métapopulation - d'estimer la taille de la métapopulation - d'évaluer son état de conservation et les risques d'extinction locale dans un espace forestier en libre évolution A partir des éléments de biologie et d'écologie connus sur l'espèce et des données déjà accumulées dans la vallée du Tarnon, entamer une réflexion sur la stratégie de conservation de l'espèce à l'échelle de ce territoire. Quelques résumés de rapports de stages (promotion 2013-2014). Étude des facteurs environnementaux influençant le choix du site de reproduction du Crapaud calamite (Bufo calamita) sur la retenue de la Chèze. Structure d’accueil : Bretagne Vivante - Rennes De nombreuses espèces d'amphibiens, dont le Crapaud calamite (Bufo calamita), sontactuellement mises en danger par la fragmentation et la destruction de leurs habitats. En effet, cette espèce pionnière dont les populations sporadiques sont éloignées les unes des autres, estparticulièrement sensible à ces facteurs. Une meilleure connaissance des paramètres influençant larépartition du crapaud calamite, en période de reproduction, permettrait d'améliorer les politiques degestions conservatoires. Dans ce contexte, une étude a été réalisée sur une population de crapauds calamites suivie depuis quatre ans sur la retenue de La Chèze (Ille-et-Vilaine). Des caractéristiques structurelles et physico-chimiques ont été relevées pendant la saison de reproduction, sur cinquante tronçons. De plus des relevés paysagers ont été effectués en périphérie du site d'étude, afin d'identifier les trames potentiellement utilisées par le crapaud calamite. Une importante population estimée à 410 individus a été identifiée sur le site. Les résultats ont montré une préférence du crapaud calamite pour les milieux pionniers et les eaux alcalines. Par ailleurs, l'analyse des connectivités entre les sites de pontes identifiés a permis d'émettre l'hypothèse de la présence de deux sous-populations au sein de la retenue de La Chèze. Cette importante population est cependant menacée par la fermeture du milieu et le manque de connectivité entre les sous populations identifiées. Des mesures de gestion ont ainsi été préconisées, afin d'améliorer le statut du crapaud calamite sur la retenue de La Chèze. Néanmoins une étude de la connectivité à plus grande échelle serait à envisager pour améliorer les connaissances sur la viabilité des populations. Mots clés : Amphibiens, Fragmentation, Connectivité, Espèce pionnière, Gestion conservatoire Facteurs de répartition des espèces d’Anisoptères de rivières en Région Pays de Loire Structure d’accueil : GRETIA – Rennes Diagnostic écologique de Roselières et de leur potentialité d’accueil pour l’avifaune paludicole : le cas du marais du Pendé (Somme) Structure d’accueil : Conservatoire des Espaces Naturels de Picardie Restauration de la continuité écologique d’un marais littoral endigué : suivi du peuplement piscicole et espèces patrimoniales. Structure d’accueil : ONCFS Structure et composition des communautés d’Arthropodes de boisements issus de déprise : l’arbre va-t-il plus vite que la forêt ? Structure d’accueil : EA 7316, Biodiversité et gestion des Territoires, Université de Rennes 1 Evaluation du succès de réhabilitation de Zones Humides dans le Finistère à partir des communautés d’arthropodes terrestres: état initial et mise en place méthodologique. Structure d’accueil : Université de Bretagne occidentale, EA 2219 Géoarchitecture [Résumé] Cette étude a pour objectif de réaliser l’état initial du critère « Macro-invertébrés du sol » de trois projets du réseau expérimental de réhabilitation de zones humides du Finistère selon une méthodologie qui permettra dans les années à venir de suivre l’évolution des parcelles réhabilitées. Pour cela, les communautés de carabes et d’araignées ont été échantillonnées sur trois parcelles expérimentales et leurs trois parcelles de références. La méthode utilisée est celle des pièges Barber, sur chaque parcelle 3 réplicats de 4 pièges ont été positionnés et relevés toutes les deux semaines de mi-avril à mi-juin. Un total de 9 174 araignées et de 6 488 carabes, représentant respectivement 79 et 80 espèces, ont été récoltés et identifiés lors des 4 sessions de piégeage. L’hypothèse avancée est que les parcelles de référence, faiblement perturbées, seront dominées par des espèces de grande taille, spécialistes et brachyptères tandis que les parcelles expérimentales, plus perturbées, seront dominées par des espèces de petite taille, généralistes et macroptères. Les parcelles sont ainsi décrites en prenant en compte les paramètres de suivi spécifiques et fonctionnels de ces deux communautés. A partir de ces paramètres, la comparaison des parcelles expérimentales avec leurs parcelles de référence associées a été réalisée. L’hypothèse avancée a pu être validée pour deux des sites étudiés, tandis que sa non vérification pour le troisième site peut s’expliquer par les connaissances sur sa gestion. Parmi les paramètres suivis, ceux liés aux traits d’histoire de vie apparaissent comme étant les plus intéressants à suivre lors de l’évaluation future des travaux de réhabilitation. La fiabilité du dispositif d’échantillonnage et l’efficacité future des travaux de réhabilitation seront ensuite discutés. Mots clés : Réhabilitation ; Zones humide ; Araignée ; Carabe ; Traits fonctionnels
