Pr Daniel GAUTHERET Dr Charles FERTE
Date : les 9 et 10 Mai 2016
Année Universitaire 2015-2016
Total heure : CM 6h et TP 8h
Lieu : SupBiotech Salle V301
HORAIRES
Lundi 9 Mai 2016
Mardi 10 Mai 2016
Mercredi 11 Mai 2016
9h00
10h30
Introduction à la médecine de
précision (CM)
Dr C. FERTE
Problématiques du clustering des données
d'expression (CM)
B. JOB
10h30
12h00
Les principales technologies de
séquençage à haut débit (NGS) et
médecine (CM)
Pr D. GAUTHERET /Y. BOURSIN
Analyse quantitative des données RNA-seq :
normalisation, expression différentielle (CM)
M.A DILLIES Institut Pasteur
Pause
14h00 -
15h30
L’accès aux bases de données
génomiques publiques et aux
ressources associées (TP)
Synapse, Cosmic, TCGA, Bioportal
Dr C. FERTE/Pr D. GAUTHERET
14h00
-
18h00
Atelier RNA-seq : détection
d’expression différentielle dans le
transcriptome tumoral (TP)
Intervenants plateforme bioinfo Paris-
Sud/Gustave Roussy
Pr D. GAUTHERET/C. BILLEREY/M.
DELOGER
15h30
18h00
Initiation à la détection de variants
génomiques par séquençage d’exome
(TP)
Intervenants plateforme bioinfo
Gustave Roussy,
Pr D. GAUTHERET/Y. BOURSIN/ C.
BILLEREY
Pr Daniel GAUTHERET Dr Charles FERTE
Date : les 11 et 12 Mai 2016
Année Universitaire 2015-2016
Total heure : CM 10h et TP 3h
Lieu : Gustave Roussy Bâtiment de Médecine Moléculaire Salle 62
HORAIRES
Mercredi 11 Mai 2016
HORAIRES
Jeudi 12 Mai 2016
9h00
10h30
Analyse des CNA (arrays et NGS) :
atelier pratique (TP)
F. COMMO
8h45 9h15
Perspectives on precision medicine trials
C. MASSARD (Gustave Roussy)
10h45
12h15
Non-coding genome & cancer. (CM)
Pr D. GAUTHERET
9h15 10h00
Highlights of the Tumor identity card research program
A De REYNIES (Ligue Nationale Contre le Cancer) (TBC)
10h15 11h00
Computational imaging in Cancer
Hugo Aerts, Dana Farber CC, Boston (TBC)
11h00 11h45
Predicting drug efficacy in cancer
Matthew Garnett, Wellcome Trust Cancer Institute (TBC)
11h45 12h15
Epidemium Open Data Open Science : example of Epidemium efforts
(TBC)
Pause
14h00 -
15h30
Metastatic breast cancer sequencing:
identification of driver genes of
resistance (CM+TP)
C. LEFEBVRE
14h00 - 15h00
Modèles prédictifs de la réponse au traitement et de la survie :
l’expérience Quinten
Y.G MATHE
15h30 -
17h00
Liquid Biopsies
L. LACROIX
15h00 15h45
Sharing Data issues
Alain Viairi 45 min (TBC)
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