Pr Daniel GAUTHERET – Dr Charles FERTE Date : les 9 et 10 Mai 2016 Année Universitaire 2015-2016 Total heure : CM 6h et TP 8h Lieu : Sup’Biotech – Salle V301 HORAIRES 9h00 – 10h30 10h30 – 12h00 Pause 14h00 15h30 15h30 – 18h00 Lundi 9 Mai 2016 Mardi 10 Mai 2016 Introduction à la médecine de précision (CM) Dr C. FERTE Les principales technologies de séquençage à haut débit (NGS) et médecine (CM) Pr D. GAUTHERET /Y. BOURSIN Problématiques du clustering des données d'expression (CM) B. JOB Analyse quantitative des données RNA-seq : normalisation, expression différentielle (CM) M.A DILLIES – Institut Pasteur L’accès aux bases de données génomiques publiques et aux ressources associées (TP) Synapse, Cosmic, TCGA, Bioportal Dr C. FERTE/Pr D. GAUTHERET 14h00 Atelier RNA-seq : détection d’expression différentielle dans le 18h00 transcriptome tumoral (TP) Intervenants plateforme bioinfo ParisSud/Gustave Roussy Pr D. GAUTHERET/C. BILLEREY/M. DELOGER Initiation à la détection de variants génomiques par séquençage d’exome (TP) Intervenants plateforme bioinfo Gustave Roussy, Pr D. GAUTHERET/Y. BOURSIN/ C. BILLEREY Mercredi 11 Mai 2016 Pr Daniel GAUTHERET – Dr Charles FERTE Date : les 11 et 12 Mai 2016 Année Universitaire 2015-2016 Total heure : CM 10h et TP 3h Lieu : Gustave Roussy – Bâtiment de Médecine Moléculaire – Salle 62 HORAIRES 9h00 – 10h30 10h45 – 12h15 Mercredi 11 Mai 2016 HORAIRES Jeudi 12 Mai 2016 Analyse des CNA (arrays et NGS) : atelier pratique (TP) F. COMMO Non-coding genome & cancer. (CM) Pr D. GAUTHERET 8h45 – 9h15 Perspectives on precision medicine trials C. MASSARD (Gustave Roussy) 9h15 – 10h00 Highlights of the Tumor identity card research program A De REYNIES (Ligue Nationale Contre le Cancer) (TBC) 10h15 – 11h00 Computational imaging in Cancer Hugo Aerts, Dana Farber CC, Boston (TBC) Predicting drug efficacy in cancer Matthew Garnett, Wellcome Trust Cancer Institute (TBC) 11h00 – 11h45 Pause 14h00 15h30 15h30 17h00 Metastatic breast cancer sequencing: identification of driver genes of resistance (CM+TP) C. LEFEBVRE Liquid Biopsies L. LACROIX 11h45 – 12h15 Epidemium Open Data Open Science : example of Epidemium efforts (TBC) 14h00 - 15h00 Modèles prédictifs de la réponse au traitement et de la survie : l’expérience Quinten Y.G MATHE 15h00 – 15h45 Sharing Data issues Alain Viairi 45 min (TBC)