Sujet MS1 [12 février] populaire

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Concours blanc PAES – Tutorat PSA
Samedi 12 Février 2011
MS1 : Méthodes d’analyse du génome, Sources
actuelles et futures des principes actifs
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Durée : 30 minutes
Documents et calculatrices interdits
RECOMMANDATIONS IMPORTANTES
AVANT DE COMMENCER L’EPREUVE
Vous avez à votre disposition un fascicule de 20 QCM.
(Réponses à reporter sur la grille de QCM)
Assurez-vous que ce fascicule comporte bien 12 pages en comptant celle-ci.
Dans le cas contraire, prévenez immédiatement un tuteur.
Les questions 1 à 9 correspondent à la biologie moléculaire
Les questions 10 à 20 correspondent à l’étude des sources des principes actifs
Le code génétique et la séquence du gène étudié se trouvent en page 12.
AUCUNE RECLAMATION NE SERA ADMISE PAR LA SUITE
OBLIGATIONS CONCERNANT LA FEUILLE DE REPONSES AUX QCM :
Vous devez absolument utiliser un stylo ou un feutre noir pour cocher votre réponse
définitive sur la feuille de réponses. Il est vivement conseillé de remplir tout d’abord cette
feuille au crayon (vous pouvez gommer), puis repasser les réponses à l’encre sans
déborder des cases prévues à cet effet. Les feuilles de réponses remplies au crayon
seront affectées de la note zéro.
En cas d’erreur à l’encre, n’hésitez pas à demander une autre grille de réponses,
l’usage de stylos correcteurs (blancs) étant vivement déconseillé. Il vaut mieux remplir
une nouvelle feuille sur laquelle vous devrez reporter vos :
NOM, PRENOM, N° de TUTORAT et N° de DOSSIER

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Exercice
(Pierre-Emmanuel et Tantely)
Les questions (sss) nécessitent plus de temps et de réflexion que les autres.
Le gène BDNF code une protéine contribuant à la survie et au développement des neurones.
Il est le siège d'une mutation affectant un seul nucléotide au sein du codon 66, aboutissant
au remplacement de la Valine (Val) par une Méthionine (Met). La séquence contenant l’exon
2 du gène avec un allèle sain est présentée ci-dessous. La séquence en gras et soulignée
correspond au codon 60.
461 ATTATCCCTA CAGTTCCACC AGGTGAGAAG AGTGATGACC ATCCTTTTCC TTACTATGGT
P1
521 TATTTCATAC TTTGGTTGCA TGAAGGCTGC CCCCATGAAA GAAGCAAACA TCCGAGGACA
581 AGGTGGCTTG GCCTACCCAG GTGTGCGGAC CCATGGGACT CTGGAGAGCG TGAATGGGCC
641 CAAGGCAGGT TCAAGAGGCT TGACATCATT GGCTGACACT TTCGAACACG TGATAGAAGA
P3
701 GCTGTTGGAT GAGGACCAGA AAGTTCGGCC CAATGAAGAA AACAATAAGG ACGCAGACTT
P4
761 GTACACGTCC AGGGTGATGC TCAGTAGTCA AGTGCCTTTG GAGCCTCCTC TTCTCTTTCT
821 GCTGGAGGAA TACAAAAATT ACCTAGATGC TGCAAACATG TCCATGAGGG TCCGGCGCCA
P2
Question 1 : Quelle(s) est (sont) la (ou les) conséquence(s) possible(s) de la
substitution d’un seul nucléotide au niveau du codon 66 (à partir de l’allèle sain)?
A. Modification de la séquence protéique
B. Apparition d’un codon STOP
C. Modification du nombre d’acides aminés de la protéine
D. Décalage du cadre de lecture puis apparition d’un codon STOP
E. Pas de conséquence sur la séquence protéique

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Question 2 : Parmi les propositions suivantes concernant la mutation Val66Met,
indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) :
A. La mutation devrait entraîner une modification de la fonction de BDNF.
B. C’est une mutation faux-sens.
C. La mutation est une transversion.
D. La mutation est une transition.
E. La mutation peut être soit une transversion soit une transition.
Une étude sur une lignée de souris homozygotes pour ce variant allélique montre
que celles-ci ont un comportement plus anxieux que les autres souris.
Question 3 : Parmi les procédés suivants indiquez celle(s) qui a (ont) pu permettre
l’obtention de cette lignée :
A. Une transgénèse.
B. Une micro-injection d’ADNc issu d’ARN possédant le variant allélique dans
des cellules somatiques de souris adultes saines.
C. Une micro-injection d’ADNc issu d’ARN possédant le variant allélique dans
des cellules somatiques de souris adultes possédant le variant allélique.
D. Une micro-injection d’ADN d’origine génomique possédant le variant
allélique dans des cellules somatiques de souris adultes saines.
E. Une micro- injection d’ADN d’origine génomique possédant le variant
allélique dans des cellules somatiques de souris adultes possédant le variant
allélique.
Les chercheurs souhaitent donc vérifier si cette mutation a également cet effet chez
l’homme. Pour ce faire, ils doivent procéder à un génotypage des sujets de leur
étude, ils expérimentent alors une nouvelle méthode qu’ils contrôlent par la suite
avec des méthodes plus classiques.

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Nouvelle méthode : PCR à 4 amorces
On utilise simultanément 4 amorces pour une PCR (P1 à P4). Les amorces P1 et P2
sont non spécifiques et s’hybrident quelque soit la version de l’allèle. Les amorces P3
et P4 sont spécifiques : P3 s’hybride uniquement en présence de l’allèle sain et P4
uniquement en présence de l’allèle val66met. Les séquences grisées correspondent
au début des séquences complémentaires aux amorces, les flèches indiquant la
direction 3’ des amorces.
Question 4 : Parmi les propositions suivantes concernant les séquences des
amorces P1 et P2, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) :
A. P1 : GGATGTCAAGGTGGTCCAGTCTTCTCAC
B. P1 : CCTACAGTTCCACCAGGTGAGAAGAGTG
C. P1 : GTGAGAAGAGTGGACCACCTTGACATCC
D. P2 : ATGGATCTACGACGTTTGTACAGGTACT
E. P2 : TCATGGACATGTTTGCAGCATCTAGGTA
Question 5 (sss): Parmi les propositions suivantes concernant le nombre de
fragments de tailles différentes d’ADN amplifié obtenu, indiquez celle (celles) qui est
(sont) exacte(s) :
A. On en obtient trois pour un sujet homozygote.
B. On en obtient quatre pour un sujet homozygote.
C. On en obtient trois pour un sujet hétérozygote.
D. On en obtient quatre pour un sujet hétérozygote.
E. Aucune de ces propositions n’est exacte.

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Question 6 (sss): Quelle(s) est (sont) la (ou les) électrophorèse(s) possible(s)
correspondant au résultat de cette PCR à quatre amorces?