Sujet MS1 [12 février] populaire
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Concours blanc PAES – Tutorat PSA Samedi 12 Février 2011 MS1 : Méthodes d’analyse du génome, Sources actuelles et futures des principes actifs _______________________________________________ Durée : 30 minutes Documents et calculatrices interdits RECOMMANDATIONS IMPORTANTES AVANT DE COMMENCER L’EPREUVE Vous avez à votre disposition un fascicule de 20 QCM. (Réponses à reporter sur la grille de QCM) Assurez-vous que ce fascicule comporte bien 12 pages en comptant celle-ci. Dans le cas contraire, prévenez immédiatement un tuteur. Les questions 1 à 9 correspondent à la biologie moléculaire Les questions 10 à 20 correspondent à l’étude des sources des principes actifs Le code génétique et la séquence du gène étudié se trouvent en page 12. AUCUNE RECLAMATION NE SERA ADMISE PAR LA SUITE OBLIGATIONS CONCERNANT LA FEUILLE DE REPONSES AUX QCM : Vous devez absolument utiliser un stylo ou un feutre noir pour cocher votre réponse définitive sur la feuille de réponses. Il est vivement conseillé de remplir tout d’abord cette feuille au crayon (vous pouvez gommer), puis repasser les réponses à l’encre sans déborder des cases prévues à cet effet. Les feuilles de réponses remplies au crayon seront affectées de la note zéro. En cas d’erreur à l’encre, n’hésitez pas à demander une autre grille de réponses, l’usage de stylos correcteurs (blancs) étant vivement déconseillé. Il vaut mieux remplir une nouvelle feuille sur laquelle vous devrez reporter vos : NOM, PRENOM, N° de TUTORAT et N° de DOSSIER 1 Exercice (Pierre-Emmanuel et Tantely) Les questions (sss) nécessitent plus de temps et de réflexion que les autres. Le gène BDNF code une protéine contribuant à la survie et au développement des neurones. Il est le siège d'une mutation affectant un seul nucléotide au sein du codon 66, aboutissant au remplacement de la Valine (Val) par une Méthionine (Met). La séquence contenant l’exon 2 du gène avec un allèle sain est présentée ci-dessous. La séquence en gras et soulignée correspond au codon 60. 461 521 ATTATCCCTA P1 TATTTCATAC 581 AGGTGGCTTG GCCTACCCAG GTGTGCGGAC CCATGGGACT CTGGAGAGCG TGAATGGGCC 641 CAAGGCAGGT TCAAGAGGCT TGACATCATT GGCTGACACT TTCGAACACG TGATAGAAGA P3 GCTGTTGGAT GAGGACCAGA AAGTTCGGCC CAATGAAGAA AACAATAAGG ACGCAGACTT P4 GTACACGTCC AGGGTGATGC TCAGTAGTCA AGTGCCTTTG GAGCCTCCTC TTCTCTTTCT 701 761 821 CAGTTCCACC AGGTGAGAAG AGTGATGACC ATCCTTTTCC TTACTATGGT TTTGGTTGCA TGAAGGCTGC CCCCATGAAA GAAGCAAACA TCCGAGGACA GCTGGAGGAA TACAAAAATT ACCTAGATGC TGCAAACATG TCCATGAGGG TCCGGCGCCA P2 Question 1 : Quelle(s) est (sont) la (ou les) conséquence(s) possible(s) de la substitution d’un seul nucléotide au niveau du codon 66 (à partir de l’allèle sain)? A. Modification de la séquence protéique B. Apparition d’un codon STOP C. Modification du nombre d’acides aminés de la protéine D. Décalage du cadre de lecture puis apparition d’un codon STOP E. Pas de conséquence sur la séquence protéique 2 Question 2 : Parmi les propositions suivantes concernant la mutation Val66Met, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A. La mutation devrait entraîner une modification de la fonction de BDNF. B. C’est une mutation faux-sens. C. La mutation est une transversion. D. La mutation est une transition. E. La mutation peut être soit une transversion soit une transition. Une étude sur une lignée de souris homozygotes pour ce variant allélique montre que celles-ci ont un comportement plus anxieux que les autres souris. Question 3 : Parmi les procédés suivants indiquez celle(s) qui a (ont) pu permettre l’obtention de cette lignée : A. Une transgénèse. B. Une micro-injection d’ADNc issu d’ARN possédant le variant allélique dans des cellules somatiques de souris adultes saines. C. Une micro-injection d’ADNc issu d’ARN possédant le variant allélique dans des cellules somatiques de souris adultes possédant le variant allélique. D. Une micro-injection d’ADN d’origine génomique possédant le variant allélique dans des cellules somatiques de souris adultes saines. E. Une micro- injection d’ADN d’origine génomique possédant le variant allélique dans des cellules somatiques de souris adultes possédant le variant allélique. Les chercheurs souhaitent donc vérifier si cette mutation a également cet effet chez l’homme. Pour ce faire, ils doivent procéder à un génotypage des sujets de leur étude, ils expérimentent alors une nouvelle méthode qu’ils contrôlent par la suite avec des méthodes plus classiques. 3 Nouvelle méthode : PCR à 4 amorces On utilise simultanément 4 amorces pour une PCR (P1 à P4). Les amorces P1 et P2 sont non spécifiques et s’hybrident quelque soit la version de l’allèle. Les amorces P3 et P4 sont spécifiques : P3 s’hybride uniquement en présence de l’allèle sain et P4 uniquement en présence de l’allèle val66met. Les séquences grisées correspondent au début des séquences complémentaires aux amorces, les flèches indiquant la direction 3’ des amorces. Question 4 : Parmi les propositions suivantes concernant les séquences des amorces P1 et P2, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A. P1 : GGATGTCAAGGTGGTCCAGTCTTCTCAC B. P1 : CCTACAGTTCCACCAGGTGAGAAGAGTG C. P1 : GTGAGAAGAGTGGACCACCTTGACATCC D. P2 : ATGGATCTACGACGTTTGTACAGGTACT E. P2 : TCATGGACATGTTTGCAGCATCTAGGTA Question 5 (sss): Parmi les propositions suivantes concernant le nombre de fragments de tailles différentes d’ADN amplifié obtenu, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A. On en obtient trois pour un sujet homozygote. B. On en obtient quatre pour un sujet homozygote. C. On en obtient trois pour un sujet hétérozygote. D. On en obtient quatre pour un sujet hétérozygote. E. Aucune de ces propositions n’est exacte. 4 Question 6 (sss): Quelle(s) est (sont) la (ou les) électrophorèse(s) possible(s) correspondant au résultat de cette PCR à quatre amorces? 5 Méthodes de contrôle : digestion enzymatique On amplifie un segment d’ADN de 310 pb contenant le codon 66 par PCR. Ce segment est soumis à l’action de l’enzyme de restriction NlAIII dont le seul site de restriction au niveau de l’exon 2 peut se situer au niveau du codon 66, le site de restriction reconnu étant la séquence CA|TG. Les produits résultants de la digestion enzymatique si elle a lieu font 190bp et 120 bp. Les amorces utilisées pour la PCR ont une taille de 20 nucléotides. Question 7 (sssss): Dans quels segments du gène pourrait-on situer les amorces utilisées pour cette PCR ? A. Avant le 490ème nucléotide B. Entre les 490ème et 690ème nucléotides C. Entre les 690ème et 790ème nucléotides D. Entre les 790ème et 860ème nucléotides E. Après le 860ème nucléotide Voici le résultat d’une série d’analyse des fragments obtenus chez trois sujets différents. 6 Question 8 : Les fragments d’ADN amplifiés ont été révélés par un agent intercalant de l’ADN. Si à la place de cet agent on avait utilisé une sonde radioactive comme révélateur, quelle(s) sonde(s) aurai(en)t permis d’avoir les mêmes résultats que la série d’électrophorèse ci-dessus : A. Une sonde aspécifique d’un allèle s’hybridant en amont du codon 66. B. Une sonde aspécifique d’un allèle s’hybridant en aval du codon 66. C. Une sonde spécifique de l’allèle sain s’hybridant au niveau du codon 66. D. Une sonde spécifique de l’allèle muté s’hybridant au niveau du codon 66. E. Aucune réponse exacte. Question 9 : Que peut-on déduire des trois électrophorèses? Indiquez la (ou les) proposition(s) exacte(s) : A. Le sujet 1 est hétérozygote. B. Le sujet 1 est homozygote porteur de l’allèle sain. C. Le sujet 1 est homozygote porteur de l’allèle val66met. D. Les sujets 1 et 2 sont hétérozygotes. E. Les sujets 2 et 3 sont porteurs de l’allèle val66met. 7 Question 10 : On considère les deux molécules suivantes : 1- 2- Parmi les propositions suivantes, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) pour la molécule 1 : A. Il s’agit de la morphine. B. Il s’agit d’un alcaloïde naturel. C. Elle contient un squelette stéroïde. D. Elle peut être obtenue par extraction. E. Elle a une action antalgique. Question 11 : Parmi les propositions de la question 10, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) pour la molécule 2. 8 Question 12 : Parmi les propositions suivantes concernant médicaments et substances naturelles, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A. Le principe actif des médicaments d’origine naturelle peut être obtenu par hémisynthèse ou synthèse totale. B. L’ethnopharmacologie permet d’étudier l’utilisation des substances naturelles dans la médecine traditionnelle. C. L’extraction de molécules non naturelles est moins rentable que leur hémisynthèse. D. Les huiles essentielles sont mélanges naturels odorants composant des corps chimiques purs. E. L’hémisynthèse de principes actifs naturels permet la synthèse totale de nouveaux principes actifs n’existant pas à l’état naturel. Question 13 : Parmi les molécules suivantes indiquez celle (celles) qui peut (peuvent) être obtenue(s) par la fermentation de micro-organismes : A. L’artémisinine B. Le paclitaxel C. La naloxone D. La streptokinase E. La fosfomycine Question 14 : Parmi les molécules de la question 13, indiquez celle (celles) qui n’est (ne sont) pas des principes actifs naturels. Question 15 : Parmi les associations pharmacophore-activité suivants, indiquez celle(s) qui est (sont) exacte(s) : A. Amidine – curarisant B. Butyrophénone – antidiabétique C. Moutarde à l’azote – anti histaminique anti H1 D. Acide dihydroxylheptanoïque – bêta-bloquant E. Aminoalcool – antitussif 9 Question 16 : Parmi les associations de groupes chimiques suivants, indiquez ceux(s) qui correspond (ent) à des associations correctes de bioisostères : Question 17 : On considère la molécule suivante : Parmi les propositions suivantes, indiquez celle (celles) qui est (sont) exacte(s) : A. Il s’agit d’un sulfamide. B. Il s’agit d’un inhibiteur de la biosynthèse des facteurs de la coagulation. C. Elle peut être obtenue par l’activation d’une prodrogue. D. Sa pharmacomodulation par la modification du cycle aromatique peut lui conférer une action anti-diurétique. E. Sa pharmacomodulation par l’ajout de groupements chimiques au niveau de la fonction amine primaire liée au soufre peut lui conférer une action antidiabétique. 10 Question 18 : Parmi les propositions suivantes concernant les médicaments de synthèse, laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s) ? A. La modélisation moléculaire du pharmacophore fait appel à des méthodes indirectes permettant d’obtenir un « drug design ». B. Les essais précliniques sont pratiqués lors de la recherche fondamentale sur les principes actifs du futur médicament. C. L’optimisation pharmaceutique permet de modifier l’activité biologique d’un principe actif. D. Le rendement de la technique de criblage à haut débit est relativement faible. E. Les récepteurs couplés aux protéines G constituent la majorité des cibles protéiques des principes actifs. Question 19 : Parmi les produits suivants indiquez celui (ceux) qui est (sont) issu(s) de la technique de l’ADN recombinant : A. Des anticorps monoclonaux. B. Des anticorps polyclonaux C. Des toxines. D. Des antibiotiques. E. Des oligonucléotides. Question 20 : Parmi les propositions suivantes indiquez celle(s) qui est (sont) exacte(s) : A. La thérapie génique nécessite l’utilisation de produits issus de la technique de l’ADN recombinant. B. L’introduction d’un transgène dans une cellule d’un organisme modifie l’ensemble de ses cellules. C. Les thérapies géniques et cellulaires ne peuvent être toutes deux réalisées ex vivo. D. Les biomolécules sont éliminées par des enzymes de détoxification. E. Les biomolécules sont de plus grande taille que les molécules de synthèse. 11 SEQUENCE ETUDIEE : 461 521 581 641 701 761 821 ATTATCCCTA TATTTCATAC AGGTGGCTTG CAAGGCAGGT GCTGTTGGAT GTACACGTCC GCTGGAGGAA CAGTTCCACC AGGTGAGAAG TTTGGTTGCA TGAAGGCTGC GCCTACCCAG GTGTGCGGAC TCAAGAGGCT TGACATCATT GAGGACCAGA AAGTTCGGCC AGGGTGATGC TCAGTAGTCA TACAAAAATT ACCTAGATGC 12 AGTGATGACC CCCCATGAAA CCATGGGACT GGCTGACACT CAATGAAGAA AGTGCCTTTG TGCAAACATG ATCCTTTTCC GAAGCAAACA CTGGAGAGCG TTCGAACACG AACAATAAGG GAGCCTCCTC TCCATGAGGG TTACTATGGT TCCGAGGACA TGAATGGGCC TGATAGAAGA ACGCAGACTT TTCTCTTTCT TCCGGCGCCA
