ChapitreII:Lanatureduvivant SurlaplanèteTerreilexisteunegrandediversitéd’êtresvivants.LaTerres’estforméeil ya4,5milliardsd’annéesbienavantquelespremiersêtresvivantsapparaissent. A- L’unitéstructuraleetchimiqueduvivant. TP/Coursn°4:L’unitéchimiqueduvivant. L’analyse de ce document nous montre que la matière organique est majoritairement constituéeàpartirde4élémentschimiques(Oxygène,Carbone,HydrogèneetAzote).On constateégalementquelamatièreminéraleauneconstitutionplushétérogène.L’océan est particulièrementricheen Oxygène eten Hydrogène(la molécule constitutiveétant l’eauH2O).Lacroûteterrestreétantmajoritairementconstituéed’oxygèneetdesilicium (SiO2:dioxydedesilicium).Ilestassociéàd’autresatomes(Al,Fe,Mg,Ca,Na,K…)pour former les silicates qui sont les principaux constituants du manteau et de l’écorce terrestre. Les êtres vivants sont formés de matière organique possédant la particularité d’être essentiellement constituée de quatre éléments chimiques (CHON). On sait également que la matière organique est principalement constituée par quatre types de molécules (glucides,lipides,protéinesetacidesnucléiques). Les éléments chimiques entrant dans la composition de la matière vivante sont tous disponiblessurlaplanèteTerre. Lacomparaisondelacompositiondesatomesconstitutifsdelamatièrevivanteetcelle du granite par exemple, permet de mettre en évidence l’originalité de la constitution chimiquedumondevivant. Les atomes qui constituent les êtres vivants se retrouvent également dans la matière nonvivantemaisdansdesproportionsdifférentes.LesatomesC,H,OetNreprésentent plusde95%delamassedesorganismes. Les molécules formant le vivant peuvent être classées en 2 types de constituants : les constituantsminéraux(eauetselsminéraux)etlesconstituantsorganiques. La molécule la plus abondante chez les êtres vivants est la molécule d’eau. Elle représente 60% de la masse totale d’un animal et 75% de la masse d’un végétal en moyenne. La quantité d’eau est cependant variable d’un organisme à l’autre. Ainsi, les méduses sontconstituéesàplusde95%d’eaualorsquelesgrainesn’encontiennentque10%... Exceptél’eau,laquasi-totalitédesmoléculesduvivantsontdesmoléculescarbonées. Unnombrelimitédemoléculessimplessontàlabasedetouslesêtrevivants.Cesont lesacidesaminés,lesacidesgrasetlesglucidessimples. Cesmoléculessimplespeuvents‘associerpourformerdesédificesmoléculairesplus complexe. Ainsi les protéines, sont de grosses molécules parfois constitués de plus de 300 acides aminés. Il existe 20 acides aminés différents dans la nature. Une protéine humaine,uneprotéined’éléphantouuneprotéinevégétaleserontdoncconstituéesà partirdesmêmesbriquesélémentaires. L’amidonetleglycogènesontdeuxglucidescomplexes.L’amidonestunemoléculede réservechezlesvégétaux;leglycogèneestunemoléculederéservechezlesanimauxet les levures. Ces deux glucides sont formés à partir des mêmes éléments de base : des moléculesdeglucose. Lesacidesgrasentrentdanslacompositiondesmembranesplasmiques.Unemembrane plasmique de cellule humaine ou une membrane plasmique de cellule de levure est forméedesmêmesacidesgras. Bilan: Les êtres vivants sont constitués des mêmes éléments chimiques : C, H O et N pour l’essentiel. La molécule la plus importante sur le plan quantitatif est l’eau. Les êtres vivants sont constitués de molécules organiques. Ce sont les mêmes types de molécules que l’on retrouvecheztouslesêtresvivants:glucides,lipidesetprotides. Cetteunitéchimiquedesêtresvivantstémoignedelaparentédesêtresvivants. B- L’organisationdesêtresvivantsàl’échelledelacellule. Nous savons qu’à l’échelle macroscopique il est possible de mettre en évidence des indicesdeparenté. Problème:Peut-ontrouverdesindicesdeparentéàl’échellemicroscopique? TP/Coursn°5:L’organisationmicroscopiqueduvivant. Lamembraneplasmiquedescellulesvégétalesestdoubléed’uneparoidecellulosequi assureunrôledesoutien.Cetteparoiestlaparoicellulosique. Lecytoplasmedescellulesvégétalescontientunevacuole.C’estuncompartimentlimité parunemembranequicontientdel’eauetdiversessubstancesdissoutes.Cettevacuole peutégalementcontenirdespigmentscolorantlacellule.Ainsileliquidecontenudansla vacuoledescellulesd’oignonsrougesestcoloréenrouge.Cespigmentssontégalement àl’originedescouleursvariéesdespétales. Les feuilles des végétaux sont constituées de cellules chlorophylliennes. Dans le cytoplasmedecescellules,ontrouvedenombreuxorganitesverts:leschloroplastes. Ces derniers contiennent un pigment, la chlorophylle qui donne la couleur verte aux plantes. Detrèspetitetaille,lesbactériessontdifficilementobservablesaumicroscopeoptique. LenombredebactériessurTerreestestiméparlesscientifiquesà5.1030. On les rencontre dans les milieux les plus divers voire dans les milieux extrêmes (Au fonddesocéans,dansleslacssalés,danslessourcesd’eauchaudes…) Onlesrencontreaussidansletubedigestifdel’homme(Escherichiacoli)ousursa peau.Onestimequ’uncmdepeauhumainepeuthébergerdesmilliersdebactériessans quecelaneposedeproblèmes. Ontrouveégalementdesbactériesdanslesalimentsquenousconsommonstelsles yaourts. TP/Coursn°6:L’unitéstructuraleduvivant. Bilan: Tous les êtres vivants sont constitués de cellules. Certains sont formés d’une seule cellulealorsqued’autressontconstituésdemilliardsdecellules. Toutes les cellules possèdent une membrane plasmique contenant du cytoplasme. La celluleestdoncl’unitéd’organisationdesêtresvivants. Cetteunitésurleplanstructuraltémoignedeleurparenté. Ondistinguedeuxtypesdecellules: - Des cellules qui se caractérisent par l’absence d’organites et notamment l’absencedenoyau.Lematérielgénétiqueestdanslecytoplasmedelacellule.Ce type de cellule est qualifié de procaryote. Les bactéries sont des cellules procaryotes. - Unautretypedecellulesquisecaractériseparlaprésencedanslecytoplasmede nombreux organites. Le matériel génétique est contenu dans un organite spécifique : le noyau. Ce type de cellule est qualifié d’eucaryote. Les cellules animales,végétalessontdescelluleseucaryotes. C- Leséchangesdematièreàl’échelledelacellule. Noussavonsqu’àtouslesêtresvivantsétaientconstituésdecellulesetquecetteunité sur le plan structural témoignait de leur parenté. La cellule est un espace délimité par unemembrane. Problème:Commentseréalisentleséchangesdematièreàl’échelledelacellule? TP/Coursn°7:Leséchangesdematièreàl’échellecellulaire. Échangedegaz Réalisationd’unschémadesynthèseoùtousleséchangesàl’échelledelacelluleseront résumés:échangededioxygène,glucoseetdedioxydedecarbone. Bilan: Cesexpériencesnouspermettentdeconclurequelacelluleréalisedeséchangesavecle milieuextracellulaire. Ceséchangessefontàtraverslamembraneplasmique.Ainsi,àl’intérieurdescellules, desréactionschimiquespermettentdesynthétiserduglycogèneàpartirdesmolécules deglucoseinitialementprésentesdanslemilieuextracellulaire. Remarque:Leglycogènepeutégalementêtreutiliséparlacellule. TP/Coursn°8:Miseenévidencedeséchangesdematièreàl’échellecellulaire. Bilan: Leslevuresréalisentdeséchangesgazeuxavecleurenvironnement.Ellesabsorbentdu dioxygèneetproduisentdudioxydedecarbone. Aprèsadditiondeglucose,laconsommationdedioxygèneetlaproductiondedioxyde decarboneaugmententdefaçonimportante.Cephénomèneestlarespiration. En présence de dioxygène, le glucose est transformé en dioxyde de carbone et en eau. Cette réaction chimique qui se déroule à l’intérieur des cellules permet d’extraire l’énergiecontenuedanslesmoléculesorganiquescommeleglucose. Lescellulessontlesiègedenombreusesréactionschimiques. Ilyadesréactionsdesynthèse(parexemple,nousavonsvuplusieursglucosesdonnant du glycogène) et des réactions de destruction (par exemple le glucose transformé en dioxyde de carbone et eau). L’ensemble de ces réactions est désigné sous le nom de métabolisme DM:Lafabricationdubioéthanol. Bilan: Quand le milieu ne contient plus d’02, les levures continuent cependant d’utiliser le glucose pour produire l’énergie nécessaire à leur développement. Elles transforment alorsceglucoseenCO2etenéthanol. Ceprocessusestlafermentationalcoolique. Lemétabolismepeutdoncêtredifférentselonlesconditionsdumilieu. ChapitreIII L’ADN,supportdel’informationgénétique Rappel de Troisième : Le programme génétique c’est-à-dire l’ensemble des informationsquipermettentlaréalisationdescaractèreshéréditairesestlocalisédans lenoyaudescellules. Le noyau des cellules contient des chromosomes visibles au moment de la division cellulaire. Ces chromosomes sont essentiellement constitués d’une substance chimique : l’ADN (acidedésoxyribonucléique). Au cours de la division cellulaire, l’ADN se compacte formant alors des bâtonnets visiblesaumicroscope:leschromosomes. A- L’ADN,unemoléculeuniverselle. Les chromosomes portent de nombreux gènes correspondant à une portion de chromosome et donc une portion de molécule d’ADN. Ils correspondent à une unité d’informationpermettantlaréalisationd’uncaractère. Problème:Quelleestlastructuredelamoléculed’ADN? TP/Coursn°9:Lastructuredel’ADN. L’ADNestconstituédequatretypesdenucléotidesdésignésparleursinitiales:A,T,Cet G.A/TetG/Csontrespectivementappariés. L’ADN est constitué de deux brins de nucléotides se faisant face selon cette règle de complémentarité. Cesdeuxbrinssontenroulésl’unautourdel’autresousformed’unedoublehélice. Les chromosomes portent de nombreux gènes correspondant à une portion de chromosome et donc une portion de molécule d’ADN. Ils correspondent à une unité d’informationpermettantlaréalisationd’uncaractère. Exercice:Uneexpériencedetransgénèse. Conclusion:Leplantdetomatetransgéniqueprésenteuncaractèrenouveau(lacapacité de produire un insecticide) à la suite de la transgénèse. Le gène introduit est un gène bactérien et pourtant les informations portées par ce fragment d’ADN ont été lues et traduitesparlacellulevégétaleduplantdetomate. Cette expérience démontre que l’ADN est le support universel de l’information génétique. Bilan:Lastructuredelamoléculed’ADN. C’estunemoléculeconstituéededeuxchaînesenrouléesl’uneautourdel’autreformant unedoublehélice. Desliaisonschimiques(liaisonsfaiblesdoncfacilesàrompre)unissentlesnucléotides des deux chaînes. Les chaînes ou brins sont qualifiés de complémentaires car A (adénine) est toujours apparié avec T (thymine) tandis que C (cytosine) est toujours appariéavecG(guanine). Cette universalité de la molécule d’ADN complète les données chimiques, moléculaires ainsiquelesobservationsréaliséesenmicroscopieoptiqueetélectroniqueauchapitre précédent. Cescaractèrespartagéspartouslesêtresvivantstémoignentdeleurparenté. B- Lanaturedumessageportéparl’ADN. 1- Ungènepeutexistersousdifférentesversions. Chezl’hommelegèneàl’originedugroupesanguinestpositionnésurleschromosomes 9pourtouslesindividus. Exercicesurlesgroupessanguins. Nousavonsdécouvertquelescellulessontlesiègederéactionschimiques.Noussavons, d’autre part, que les gènes sont des unités d’informations permettant la réalisation de caractèreshéréditairesparfoisvisibles. Problématique:Lesréactionschimiquessont-ellescontrôléespardesgènes? TP/Coursn°10:Métabolismeetprogrammegénétique. Les colonies se sont formées par division cellulaire à partir d’une cellule initiale (une cellule en donne 2 puis 2 cellules en donne 4…). Toutes les cellules d’une colonie sont doncidentiquesentreelles. DeslevuresdelasoucheAde2sontensemencées.Cescellulessedivisentenformantdes colonies.Noussavonsqueceslevuresontlaparticularitéd’êtrerouge. Ilestdoncsurprenantd‘observerdescoloniesblanchesalorsquelescellulesmèresde cescoloniesétaientrouges. Lesrésultatsobtenusnesontpasconformesauxrésultatsattendus. Les consignes insistent sur la nécessité. de travailler en aseptie (utilisation d’alcool, utilisation d’instruments stériles, travail autour d’un bec bunzen ou électrique) afin d’éviter la contamination des cultures par d’autres levures qui rendraient les résultats inexploitables. Enanalysantlesrésultatsobservéssurledocument,onpeutéliminerleshypothèses1 et3(respectdesrèglesdemanipulation,ensemencementdanslemêmemilieu). Onconstatequelescoloniesissuesdecellulesprélevéesdansunecolonieblanchesont égalementblanches. Cela signifie que la couleur blanche est un caractère héréditaire donc dépendant du programmegénétique. L’expérimentateurfaitvarierladuréed’expositionauxUV. Leparamètremesuréserale%decoloniesblanchesobtenues. Nous pouvons constater que plus le temps d‘exposition aux UV augmente et plus le nombredecoloniesblanchesobtenuesestimportant. Parallèlement, nous pouvons noter que le nombre total de colonies diminue avec l’augmentationdeladuréed’expositionauxUVcarlescellulessontdétruitesparlesUV. L’hypothèseformuléeaudépartestdoncvérifiée. Remarque : La présence de levures blanches après ensemencement de levures de souches Ade2 s’explique par des mutations spontanées c’est-à-dire qui ne sont pas induitesparunfacteurextérieur. Le pigment rouge de la levure a pour origine l’accumulation dans le cytoplasme de la levure,delamoléculenomméeAIR. Cette molécule s’accumule dans de cytoplasme car elle n’est pas transformée en moléculenomméeCAIR. Pourquoilamolécule«AIR»n’estellepastransforméeenmolécule«CAIR»? Nouscomprenonsquelamolécule«AIR»esttransforméeenmolécules«CAIR»parla protéinespécialisée(uneenzyme)symboliséeparlaportiondefromage. En absence de cette enzyme, la transformation n’a pas lieu, et la molécule AIR s’accumule ce qui nous amène à nous poser la question suivante : Pourquoi cette enzymen’existepaschezleslevuresdesouchesAde2? Cetteenzymen’existepaschezleslevuresdesoucheAde2carcettesouchenepossède paslaversiondugèneouallèlepermettantsasynthèse. Nousavonsdémontréquedesversionsdifférentesd’unmêmegènemodifiaitlanature des réactions chimiques se déroulant dans le cytoplasme des cellules. Le métabolisme cellulaireestdonccontrôléparleprogrammegénétique. Bilan: Les réactions chimiques qui se déroulent dans les cellules sont contrôlées par le programme génétique. Une mutation d’un gène peut empêcher la synthèse d’une moléculequivaalorspouvoirs’accumulerdanslacellule. Il peut également être à l’origine de la mort de la cellule si la molécule à produire est essentielle.