Traitement et analyse d`images 2D et 3D - TIMC-IMAG

Yves Usson
Institut Albert Bonniot
Domaine de la Merci
38706 La Tronche cedex
[email protected]
DEA de Biologie Structurale et Fonctionnelle - DEA de Biologie Cellulaire et Moléculaire
Module de Microscopie Structurale
Cours n° 6
Traitement et analyse d’images 2D et 3D

Microscopie quantitative - Analyse d’images
Université Joseph Fourier Yves Usson 1999
Préparation cytologique
Etapes de la cytométrie par analyse d’image
Image physique
Objectif
NUMERISATION
Image analogique
Capteur vidéo
125 63 64 58 72 27
Image numérique
SEGMENTATION
Masques de segmentation
cell 1 : 1.05 30.48 0.23 ....... cell 2: 1.98 29.00 0.75
EXTRACTION DE MESURES
Fichier de mesures

Microscopie quantitative - Analyse d’images
Université Joseph Fourier Yves Usson 1999
Intensité de la lumière
0
0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
hématies
no
y
au
Nature de l’image
Coordonnée spatiale x (µm)
Coordonnée spatiale y (µm)
fond
Coordonnée spatiale x (µm)
051015 20 25

Microscopie quantitative - Analyse d’images
Université Joseph Fourier Yves Usson 1999
L’image numérique
Image numérique 256x256
pixels
Agrandissement de la zone
encadrée (8 fois)
points élémentaires ou
pixels (picture elements)

Microscopie quantitative - Analyse d’images
Université Joseph Fourier Yves Usson 1999
Taille du pixel
0,1 x 0,1µm
Nombre de pixels
256x256
L’échantillonnage spatial
Taille du pixel
0,2 x 0,2µm
Nombre de pixels
128x128
Taille du pixel
0,4 x 0,4µm
Nombre de pixels
64x64
Taille du pixel
0,8 x 0,8µm
Nombre de pixels
32x32