Modélisation pour l`écologie intégrative

Modélisation pour l'écologie
intégrative

Plan
1. Ecosystèmes : comprendre et prédire
2. Modéliser
3. Quelques modèles existants
4. Vers plus d'intégration
5. Propositions
6. Conclusion

Ecosystèmes : comprendre et prédire
Ecosystème
Communauté
Espèce
Population
Individu
Trait / Processus
Gène
Climat
Activité humaine
Physico-
chimique
Plasticité
Adaptation
Perturbation
Exploitation
-> hétérogénéité, complexité, multi-échelle

Modéliser
Système réel
complexe
Questions
Modèle Réponses
Modèle numérique = ensemble de descriptions formelles mises en œuvre à travers
un programme informatique
Avantages : autorise les descriptions complexes, utilisation aisée de gammes de
paramètres variées, automatisation d'exploitation d'ensemble de données
Inconvénients : requiert une expertise informatique, long à concevoir, parfois difficile à faire
évoluer
Mise en oeuvre → langage de programmation (C, C++, Java, Lisp),
ou plate-formes (CAPSIS, NET-LOGO, SIMUPOP, ECOSIM, MODELMAKER),
ou prototypage avec R, MATLAB SCILAB (performance...)
Process-based, SDMs,
PDMs, génétique, économique,
MAM...
Empirique
ou explicite
Analytique
ou numérique

Quelques exemples
classe focus écosystème Individu
centré
Phenophit processus phénologie forestier non
Metapop évolution génétique forestier,
agricole
oui
Graeco processus,
management
multiple :
croissance,
allocation, flux..
forestier non
Castanea processus croissance,
flux
forestier non
Forgem évolution,
processus,
management
génétique,
croissance
forestier,
agricole
oui
Landclim processus,
management
croissance,
perturbations
forestier non
Aladyn évolution génétique,
spatialisation
tous types oui
Globiom économie usage des terres tous types non
Simupop évolution génétique tous types oui
Capsis processus,
evolution, autre
multiple tous types oui