GenMedNews

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Numéro 14,
Juin 2016
Dans ce numéro
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Congrès ESHG
Nouveautés NGS
Editorial
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Ce que nos tests géné-
tiques ont révélé
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Ce que nos tests géné-
tiques ont révélé
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Evénementiel
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Evénementiel
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Nos publications 2016
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Nos publications 2016
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Agenda scientifique
Maladies rares
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Nos prestations
Directeur de la revue: Abdelaziz Sefiani Rédactrice en chef : Imane Cherkaoui Jaouad Rédactrice adjointe: Ilham Ratbi
25 ans au service des maladies génétiques au Maroc
GenMedNews
Bulletin du département de Génétique Médicale de l’INH et du Centre de Génomique Humaine de la Faculté de Médecine et de Pharmacie, UM V Rabat
Éditorial : La tentation des raccourcis par la génomique
Lors du dernier congrès de l’ESHG, notre équipe a présenté des travaux sur le séquençage
d’exomes de patients marocains atteints de maladies héréditaires rares. Cette approche est dans
l’air du temps, car le séquençage haut débit en pratique médicale envahit aujourd’hui tous les
champs de la médecine comme en témoigne les centaines de communications à ce congrès, et
les nombreuses publications récentes. La particularité chez nos patients était dans la démarche.
En effet, l’exome a permis de poser des diagnostics, chez des familles où des enfants en bas âge
étaient atteints de pathologies graves, plusieurs fois létales mais sans aucun diagnostic précis.
L’exome a permis ainsi de reconnaitre des maladies, comme le déficit en carnitine ou la mala-
die de pompe, dont les diagnostics auraient à la limite pu être posés par une démarche classique
sans recours au séquençage haut débit. Ces observations opposent deux points de vues. Le pre-
mier, rappelle la place que devrait garder la clinique et les explorations classiques avant toute
investigation génomique onéreuse. Le deuxième, défendu par des familles lassées par l’errance
diagnostique et qui seraient prêtes à questionner d'emblée leurs génomes si de ces technologies
pourrait venir leur délivrance. Pour ou contre ce raccourci? Certainement non justifié comme
stratégie de santé publique, mais la démarche, reconnaissons le, est séduisante dans une méde-
cine individuelle, au cas par cas, et surtout après avis des experts en génétique pour éclairer les
familles sur les indications et les limites des ces nouvelles technologies. Pr. A. Sefiani
Notre équipe a été présente au con-
grès de l’European Society of Hu-
man Genetics «ESHG» du 21 au
24 Mai 2016 à Barcelone et a pré-
senté plusieurs travaux relatant
l’expérience de notre laboratoire
dans le domaine de la génétique
médicale. Ce congrès rassemble
chaque année plus d'un millier de
participants pour s’informer sur les
progrès de la génétique humaine et
pour échanger leurs expériences.
Le séquenceur haut débit est arrivé !!!
Le département de génétique médicale de l’INH vient d’acquérir un
séquenceur haut débit Ion Torrent PGM. Cette plateforme permettra à
l’équipe de répondre à des demandes variées de séquençage, en par-
ticulier pour le diagnostic et la recherche sur les maladies géné-
tiques. Les premières applications de cette nouvelle technologie dans
notre laboratoire porteront sur la cardiologie et l’oncologie.
Nouveaux tests diagnostiques réalisés par notre laboratoire
Recherche des mutations du gène VHL ( voir indications page 9)

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Ce que nos tests génétiques ont révélé !
Les mutations du gène HBB chez les enfants thalassémiques de la région de Larache
Gaoua S., Zerkaoui M., Lahrach J et Sefiani A
Selon l’OMS, 3% de la population marocaine serait porteuse de la bêta-thalassémie, maladie monogénique se transmettant selon
un mode autosomique récessif. Seuls les enfants nés de deux parents porteurs du gène risquent de développer les symptômes de
la maladie dite alors thalassémie majeure. Les enfants qui héritent l’allèle porté par un seul des deux parents sont considérés
comme porteurs d’une thalassémie mineure ou d’un trait thalassémique. Dans ce cas, la maladie est asymptomatique et se dé-
piste par un hémogramme. Dans le cadre des du diagnostic moléculaire des bêta-thalassémies réalisé par notre laboratoire, et en
collaboration avec le Docteur J. Lahrach, pédiatre à l’hôpital Princesse lalla Meryem à Larache, nous avons cherché par séquen-
çage Sanger du gène HBB, les mutations à l’origine de cette maladie chez 6 familles originaires de la région de Larache. Le sang
périphérique des patients a été prélevé à l’hôpital Princesse lalla Meryem et adressé à notre service après consentement des pa-
tients ou de leurs parents. Après extraction de l’ADN, nous avons analysé le gène HBB par méthode de séquençage de Sanger
sur ABI 310, Life technologie, en particulier à la recherche des mutations les plus fréquentes dans la population marocaine à
savoir les mutations c.-151C>T; c.-79A>G; c.-78A>G; c.-31C>T; c.20delA; c.25_26delAA; c.92+1G>A; c.92+2T>C;
c.92+6T>C; c.93-21G>A; c.93-1G>A; c.114G>A; c.118C>T; c.315+1G>A; c.316-106C>G; c.*+135T>C. Les figures ci-
dessous montre les arbres généalogiques de ces familles et les électrophorégrammes des mutations retrouvées. Nous avons iden-
tifié en effet les mutations causales chez les 6 familles, 3 avec des mutations homozygotes et 3 autres familles avec deux muta-
tions à l’état d’hétérozygotes composites. Le diagnostic moléculaire permettra ainsi une meilleure prise en charge des patients et
un conseil génétique des familles.
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Ce que nos tests génétiques ont révélé !
Double délétion du gène de la Dystrophine dans la dystrophie musculaire de Becker
Smaili W., Sbiti A., Zrhidri A., Lyahyai J. et Sefiani A
La dystrophie musculaire de Becker (DMB) est la moins sévère des dystrophinopathies, avec une incidence de 1/18518 nais-
sances masculines. Elle se manifeste généralement à un âge plus tardif que la forme de Duchenne (DMD), entre 5 ans et 15 ans
et son évolution varie selon les patients. Notre département réalise en routine depuis 1993 des diagnostics moléculaires de dys-
trophinopathies et nous avons également rapporté que 51,3% des patients marocains avaient des délétions du gène de la DMD/
DMB (Sbiti A et al. J Biomed Biotechnol. 2002; 2(3):158-160). Dans le cadre de cette activité, nous avons identifié récemment
chez un patient âgé de 20 ans et atteint d’une DMB, le premier cas marocain d’une double délétion d'exons non contigus, une
situation rarement décrite dans la littérature.
Après extraction de l’ADN sur sang périphérique, la PCR multiplex par amplification de plusieurs exons a montré chez notre
patient des délétions au niveau des exons 3,4 et 60 [figure 1]. Afin de borner les délétions chez ce patient, nous avons procédé à
une extraction de l’ARN, une reverse transcription, et un séquençage du cDNA du gène de la dystrophine, avec des amorces qui
bornent les deux régions délétées, ce qui nous a permis de définir les limites de ces deux délétions. Ainsi, notre patient a été re-
connu porteur d’une double délétion allant de l’exon 3 à l’exon 5 en 5’ et de l’exon 58 à l’exon 60 en 3’ (Figure 2).
Les doubles délétions dans les DMD/DMB ont été, comme chez notre patient, plutôt associées à un phénotype modéré de DMB
qui s’ expliquerait par une modification de l’effet de la 1ère délétion sur le cadre de lecture par la seconde, conduisant ainsi à une
protéine plus courte mais présente dans le muscle. Les deux délétions chez notre patient étaient en phase, respectant le cadre de
lecture. Cette nouvelle observation vient appuyer les données de la littérature et appelle à des études plus approfondies des mé-
canismes délétionnels de la dystrophine et leurs conséquences sur la structure et la fonction de la protéine.
Figure 1: Analyse du gène de la dystrophine par PCR multiplex.1 : contrôle normal
2: notre patient avec délétion des exons 3, 4 et 60. Les nombres à gauche indiquent
les exons amplifiés.
Figure 2: Electrophoregramme montrant le
résultat du séquençage Sanger du cDNA :
en 5’ l’exon 6 a fait suite à l’exon 2 et en
3’ l’exon 61 vient directement après l’exon
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Quatre membres de notre équipe ont participé aux 8èmes Assises
de Génétique Humaine qui se sont déroulées cette année à Lyon, à
la cité internationale, du 03 au 05 Février 2016. Ce congrès qui a
connu un franc succès, réunit tous les deux ans, les spécialistes
francophones en génétique humaine et médicale. Il a été l’occasion
pour les jeunes médecins et chercheurs de notre centre d’exposer les
résultats de leurs travaux de recherche et de partager avec les cen-
taines de participants étrangers leur expérience et de s’informer sur
les dernières avancées dans le domaine de la recherche, le diagnos-
tic et la prise en charge des maladies génétiques
GenMedNews
Séminaire: Maladies métaboliques au Maroc
Les Docteurs Wiam SMAILI et Soukaina GUAOUA, ont participé, du 10 au 13 Avril 2016 à Bertinoro en Italie,
au cours sur les cancers héréditaires «Spring Course of hereditary Cancer Genetics». Ce cours qui a été organisé par
l’European Society of Human Genetics «ESHG» et le centre universitaire de Bertinoro, avait pour objectif de déve-
lopper la recherche dans le domaine de l’oncogénétique et de promouvoir la collaboration Euro-méditerranéenne
notamment en oncogénétique.
Evénementiel
Spring Course of Hereditary Cancer Genetics
Le professeur Abdelaziz SEFIANI a présenté lors de la Journée sur les maladies métaboliques organisée par l’UPR
de pédiatrie, une conférence sur le diagnostic moléculaire des maladies métaboliques, entre la recherche ciblée de
mutations et le séquençage haut débit, le 28 Mai 2016 à l’Hôpital d’enfants de Rabat.
Progrès en cardiogénétique aux 6ème journées pratiques de la SMC
Le professeur Abdelaziz SEFIANI a participé, le 22 Avril 2016 à Tanger, aux 6èmes Journées pratiques de la so-
ciété Marocaine de cardiologie, par une conférence sur les progrès en cardiogénétique et l’évaluation des arythmies
héréditaires. Ce séminaire a été l’occasion d’échanges fructueux entre généticiens et cardiologues dans la perspec-
tive d’une mise en place au Maroc de tests génétiques à visée diagnostique de certaines cardiopathies héréditaires.

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Evénementiel
Activité associative: journée mondiale de la maladie cœliaque
Le Docteur Wiam SMAILI, résidente en génétique médi-
cale, a participé, du 19 au 21 Avril 2016 à Manchester, au
cours de dysmorphologie «Manchester Dysmorphology
course», organisé par l’European Society of Human Gene-
tics «ESHG» et animé par deux grands spécialistes en dys-
morphologie, les professeurs DONNAI et CLAYTON
SMITH. Au cours de ce séminaire a été discutée la dé-
marche diagnostique en dysmorphologie, en prenant certains
groupes de pathologies comme modèle. Cette réunion a été
également l‘occasion pour les dysmorphologistes de discu-
ter des dossiers de patients.
Manchester Dysmorphology Course
A l’occasion de la journée mondiale de la maladie cœliaque, l’Association
Marocaine des Intolérants et Allergiques au GLUTEN (AMIAG) a organisé
le samedi 21 Mai 2016, sa quatrième Journée Nationale de la Maladie
Cœliaque sous le thème " la Maladie Cœliaque et l’hérédité" au sein de la
Fondation du Roi Abdul-Aziz Al Saoud à Casablanca.
Au cours de cette journée, une conférence intitulée "Comment est transmise
la Maladie Cœliaque des parents aux enfants?" a été présentée par le Doc-
teur Wafaa JDIOUI, résidente en Génétique Médicale à l’INH. Cette confé-
rence débat a réuni des patients et leurs familles ainsi que des médecins et
professionnels de santé.
Atelier UNESCO sur la bioéthique au Maroc
Dans le cadre du programme international
de bioéthique de l’UNESCO, le professeur
Abdelaziz SEFIANI a participé à un atelier de
réflexion organisé sur les enjeux de bioé-
thique au Maroc. Cet atelier s’est déroulé le
31 Mai 2016 à Rabat, avec la contribution de
différents spécialistes qui ont partagé cer-
taines de leurs expériences sur les questions
éthiques en général et de bioéthique en parti-
culier. Cette rencontre a également permis de
soulever d’importantes questions en la ma-
tière et de tracer quelques pistes concrètes de
travail.
Départ et nouvelle affectation
Après une formation au département de géné-
tique médicale de l’INH, le Docteur Maria
MANSOURI, médecin spécialiste en géné-
tique, lauréate 2016, a été affectée au service
de génétique médicale au CHU Mohammed VI
de Marrakech. L’équipe de génétique médicale
de Rabat lui souhaite un plein succès dans ses
nouvelles fonctions et du bonheur dans sa
vie familiale.
Départ en retraite anticipée
Madame ZAOUAHIR Hanaa qui a été la
cheville ouvrière au secrétariat de notre
laboratoire en facilitant l’accueil, l’orien-
tation des malades et la gestion des ren-
dez-vous, a pris sa retraite anticipée le 30
Juin 2016. L’équipe du DGM la remercie
infiniment pour les bons moments passés
ensemble et lui souhaite plein de santé et
de bonheur pour tout ce qu’elle souhaite entreprendre.