Nouveaux outils de cytogénétique moléculaire \(MLPA et CGH

Nouveaux outils de cytogénétique
moléculaire (MLPA et CGH)
utilisés en constitutionnel
COUTTON Charles
EC Génétique
Jeudi 12 Janvier 2012

Remaniements génomiques
• Regroupent les duplications, les délétions,
les insertions, les inversions et les
translocations.
• Impliquent des régions d’une centaine de
paires de bases jusqu’à plusieurs millions
• A l’origine de:
– polymorphismes bénins
– maladies génétiques regroupées sous le nom
de maladies ou désordres génomiques

Mécanismes
• Trois principaux mécanismes:
– NAHR (Non Allelic Homologous Recombination)
ou recombinaison homologue non allélique
– NHEJ (Non Homologous End Joining) ou
raccordement d’extrémités non homologues
– FoSTeS (Fork Stalling and Template Switching)
• Surviennent aussi bien dans les cellules germinales
(méiose) que dans les cellules somatiques (mitose /
mosaïque)
=> maladies génétiques / cancers

NAHR
• Dérive d’un mécanisme de réparation d’une CDB de l’ADN
• Recherche d’une matrice contenant une séquence homologue =>
erreurs possibles si une mauvaise matrice de réparation est
utilisée => NAHR
• Du à des séquences répétées appelées LCR (Low copy repeat) (5 %
de notre génome , forte homologie (>90%)
• A proximité de structures génomiques capables de générer des
CDB

NAHR
Pathogène ou bénin ? Bénin +++
Risque pour la descendance