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Jury :
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Toulouse 3 Paul Sabatier (UT3 Paul Sabatier)
Laborel-Préneron
di 1er juillet 2015
des sécrétomes de Staphylococcus aureus et Staphylococcus epidermidis
du microbiote cutané d'enfants atopiques sur la réponse immunitaire T CD4
BSB : Immunologie
INSERM UMR 1043 / CNRS UMR 5282 / Université Toulouse 3
Jean-Philippe Lacour, rapporteur
Pr. Jean-François Nicolas, rapporteur
Dr. Julien Seneschal, rapporteur
Pr. Franck Boralevi, examinateur
Pr. Denis Hudrisier, examinateur
Pr. Gérard Lina, examinateur
Christian Davrinche
2
3
Table des matières
Abstract ................................................................................................................................. 5
Résu................................................................................................................................. 6
Liste des abréviations ............................................................................................................ 7
La fonction barrière de la peau à l’état physiologique ...........................................................11
I.1. Structure de la peau (intérieur vers extérieur) ........................................................................... 11
I.1.1. L’hypoderme ......................................................................................................................... 11
I.1.2. Le derme ............................................................................................................................... 11
I.1.3. L’épiderme ............................................................................................................................ 12
I.2. La peau, barrière physique et chimique ...................................................................................... 14
I.2.1. Les kératinocytes : premières sentinelles ............................................................................ 15
I.2.2. Les peptides antimicrobiens (AMP) ...................................................................................... 15
I.3. Détection de la menace microbienne ......................................................................................... 16
I.3.1. Les récepteurs de reconnaissance des pathogènes (PRR) ................................................... 17
I.3.2. L’évaluation de la menace .................................................................................................... 18
I.4. La peau, barrière biologique ....................................................................................................... 22
I.4.1. Le SALT : skin-associated lymphoid tissues .......................................................................... 22
I.4.2. Les cellules dendritiques : à l’interface entre inné et adaptatif ........................................... 22
I.4.3. Présentation de l’antigène ................................................................................................... 26
I.4.4. Les lymphocytes T de la peau ............................................................................................... 29
I.4.5. Les autres cellules du système immunitaire de la peau ....................................................... 36
La dermatite atopique ...........................................................................................................39
II.1. Description de la maladie ........................................................................................................... 39
II.1.1. Clinique ............................................................................................................................... 39
II.1.2. Epidémiologie ...................................................................................................................... 41
II.2. Facteurs impliqués dans la DA.................................................................................................... 43
II.2.1. Les prédispositions génétiques ........................................................................................... 43
II.2.2. La composante immunitaire ................................................................................................ 46
II.2.3. Influence de l’environnement et du mode de vie ............................................................... 50
II.2.4. Importance du microbiote .................................................................................................. 51
II.3. Traitements ................................................................................................................................ 52
II.3.1. Pour les cas peu sévères ...................................................................................................... 52
II.3.2. Immunosuppresseurs systémiques ..................................................................................... 53
4
II.3.3. Anticorps ............................................................................................................................. 54
II.3.4. Utilisation de probiotiques .................................................................................................. 54
II.3.5. Autres thérapies .................................................................................................................. 55
Microbiote cutané et dermatite atopique ...............................................................................57
III.1. La composition du microbiote cutané et sa variabili............................................................. 57
III.1.1. Variabilité intra et inter individus ....................................................................................... 57
III.1.2. Facteurs innés ..................................................................................................................... 58
III.1.3. Evolution avec le temps...................................................................................................... 60
III.1.4. Facteurs comportementaux et environnement ................................................................. 61
III.2. Bactéries commensales et pathogènes du microbiote cutané ................................................. 61
III.2.1. Définitions .......................................................................................................................... 61
III.2.2. Contribution du microbiote cutané à l’immunité de l’hôte ............................................... 62
III.2.3. Rupture de l’homéostasie avec le microbiote .................................................................... 64
III.2.4. Dysbiose dans la DA............................................................................................................ 65
III.3. Staphylococcus aureus, une bactérie pathogène source de superantigènes ........................... 67
III.3.1. Description ......................................................................................................................... 67
III.3.2. Facteurs de virulence et mécanismes d’évasion ................................................................ 68
III.3.3. Superantigènes de S. aureus .............................................................................................. 70
III.4. Staphylococcus epidermidis, bactérie de la flore commensale ................................................. 73
III.4.1. Description ......................................................................................................................... 73
III.4.2. Ses actions bénéfiques pour l’hôte .................................................................................... 74
Objectifs du projet ................................................................................................................79
Résultats ..............................................................................................................................81
Suite du projet, perspectives et discussion ......................................................................... 111
Conclusion ......................................................................................................................... 121
Remerciements .................................................................................................................. 123
Références ......................................................................................................................... 125
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