Le bocavirus humain (HBoV) : de la découverte moléculaire à la

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Le bocavirus humain (HBoV) :
de la découverte moléculaire
à la description de particules virales
V. Foulongne
N. Brieu
B. Gay
M. Segondy
Laboratoire de virologie,
pôle d’infectiologie,
hôpital Saint-Éloi,
centre hospitalier universitaire
de Montpellier,
34295 Montpellier Cedex 5
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Le bocavirus humain (HBoV) est un nouveau membre de la famille des Parvo-
viridae fréquemment détecté par biologie moléculaire dans les sécrétions respi-
ratoires de jeunes enfants qui présentent une infection respiratoire. Nous décri-
vons ici l’observation de particules virales dans des prélèvements respiratoires
préalablement détectés positifs par PCR pour l’ADN du HBoV. Les particules
observées, évocatrices d’un parvovirus, confirment ainsi les données moléculai-
res et apportent un argument supplémentaire pour conforter le potentiel infec-
tieux du bocavirus humain dans le tractus respiratoire.
L’utilisation de techniques de biologie moléculaire de plus en plus sophistiquées
a permis ces dernières années l’identification et la caractérisation de génomes
viraux préalablement inconnus conduisant à la découverte de nouveaux virus
humains potentiellement pathogènes. Ces progrès considérables dans le do-
maine de la virologie médicale permettent d’espérer que l’on sera bientôt
capable de définir ce que certains ont proposé de dénommer le « virome »
humain, c’est-à-dire l’ensemble des virus capables d’infecter l’homme. Toute-
fois, une certaine frustration demeure devant ces découvertes, car d’une part leur
signification clinique est souvent difficile à évaluer, et d’autre part les approches
virologiques traditionnelles comme la culture cellulaire, l’utilisation de modèles
animaux ou encore la microscopie électronique trahissent souvent leur incapa-
cité à concrétiser cette nouvelle vision moléculaire de la virologie moderne.
La découverte récente du bocavirus humain (HBoV) dans des prélèvements
respiratoires de jeunes enfants illustre bien ce décalage relatif entre des appro-
ches moléculaires performantes et les techniques traditionnelles de virologie. Ce
nouveau virus identifié par une technique moléculaire appelée DNase SISPA
(DNase Sequence-Independent Single Primer Amplification) [1] n’était à ce jour
caractérisé que par son seul génome. C’est en effet l’analyse des séquences
génomiques identifiées qui a permis de classer ce virus dans la famille des
Parvoviridae, sous-famille des Parvovirinae et dans le genre Bocavirus. Aucun
modèle cellulaire n’autorise à ce jour la culture du HBoV, on ne connaît pas de
modèle animal, et la morphologie des particules virales restait à définir.
De nombreuses études récentes basées sur l’amplification de séquences virales
rapportent une prévalence notable, de 2 % à 18 %, de ce nouveau virus dans les
prélèvements respiratoires de jeunes enfants [2]. Nous avons, au cours d’une
étude épidémiologique sur la prévalence du HBoV, testé par microscopie élec-
tronique des prélèvements respiratoires préalablement détectés positifs en PCR
temps réel pour le HBoV, afin de visualiser des particules virales [3].
Des prélèvements présentant une forte charge virale (> 8 log copies/ml) ont été
sélectionnés. Ces prélèvements ont été filtrés par centrifugation sur des colonnes
filtrantes de 0,22 lm (Ultrafree-MC, Millipore). Les filtrats ainsi obtenus ont
ensuite été concentrés sur des colonnes d’exclusion de 3 KD (Ultracell YM-3,
Millipore) par centrifugation à 14 000 g. Un volume de 10 ll a été adsorbé sur
une grille pour microscopie électronique (300 mesh) et coloré à l’acétate d’ura-
nyle 4 %. Ces colorations négatives ont été observées sur un microscope élec-
doi: 10.1684/vir.2008.0167
Virologie 2008, 12 (3) : 219-21
Virologie, Vol. 12, n° 3, mai-juin 2008 219
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A
B
C
Figure 1.Observation au microscope électronique (H7100, Hitachi, Tokyo, Japon) après coloration négative à l’acétate d’uranyle 4 % ;
1A : grossissement x 60 000 ; 1B : grossissement x 100 000 ; 1C : grossissement x 150 000. La barre blanche représente l’échelle de
taille 100 nm.
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tronique (H7100, Hitachi, Tokyo, Japon) à des grossisse-
ments allant de 60 000 x à 150 000 x.
Des particules évocatrices ont été observées dans les prélè-
vements sélectionnés, et leur présence n’était pas retrouvée
dans les échantillons de contrôle négatifs pour la détection
d’ADN viral. Ces particules ont une forme hexagonale avec
un centre présentant une coloration plus soutenue, évo-
quant une structure isosaédrique. La taille moyenne de ces
particules, mesurée au grossissement 150 000 x, est de
25 nm (+/- 4 nm) (figure 1). Ces observations correspon-
dent aux caractéristiques attendues de la capside d’un virus
appartenant à la famille des Parvoviridae et confirment
donc les données issues de la biologie moléculaire.
La microscopie électronique n’est plus utilisée en pratique
courante dans les laboratoires de diagnostic en virologie.
C’est en effet une technique lourde, nécessitant un appa-
reillage complexe et demandant un temps prolongé d’ob-
servation pour une sensibilité analytique très médiocre.
Elle ne permet de détecter que des particules présentes de
manière très abondante dans les prélèvements. Enfin, les
critères uniquement morphologiques ne permettent au
mieux que d’identifier l’appartenance à une famille virale
sans qu’il soit possible de définir le genre, l’espèce ou le
type en cause. La microscopie électronique conserve toute-
fois l’avantage de permettre une caractérisation morpholo-
gique incomparable, et elle est donc particulièrement pré-
cieuse pour l’étude morphologique de ces nouveaux virus
découverts par biologie moléculaire. De plus, la visualisa-
tion de particules virales dans des prélèvements patholo-
giques représente un argument supplémentaire pour établir
le probable caractère infectieux du bocavirus humain, la
détection d’ADN génomique n’étant qu’un argument indi-
rect pour démontrer la multiplication virale dans l’arbre
respiratoire.
Références
1. Allander T, Tammi MT, Eriksson M, Bjerkner A, Tiveljung-Lindell A,
Anderson B. Cloning of a human parvovirus by molecular screening of
respiratory tract samples. Proc Natl Acad Sci USA 2005 ; 102 : 12891-6.
2. Kahn J. Human bocavirus : clinical significance and implications. Curr
Opin Pediatr 2008 ; 20 : 62-6.
3. Brieu N, Gay B, Segondy M, Foulongne V. Electron microscopy obser-
vation of human bocavirus (HBoV) in nasopharyngeal samples from
HBoV-infected children. J Clin Microbiol 2007 ; 45 : 3419-20.
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