Biologie au quotidien Ann Biol Clin 2011 ; 69 (5) : 588-92 Évaluation de la conservation des échantillons urinaires en vue d’une étude sur l’automate d’analyse urinaire UF 1000i (bioMérieux©) Copyright © 2017 John Libbey Eurotext. Téléchargé par un robot venant de 88.99.165.207 le 24/05/2017. Preservation of urine samples for UF 1000i (bioMérieux© ) analysis Christelle Fabbro1 Jacques Darolles2 Jean-Philippe Rault1,2 1 CHR Metz-Thionville, hôpital Bel-Air, laboratoire de microbiologie, Thionville, France <[email protected]> 2 Laboratoire de biologie médicale Pax, Metz, France Résumé. L’implantation de plateaux techniques et l’obligation d’accréditation posent la problématique de la gestion des conditions de conservation des échantillons avant analyse. Ce travail a évalué la conservation des échantillons urinaires, en présence ou absence d’acide borique, en vue d’une analyse sur l’automate UF 1000i (bioMérieux© ). Les résultats montrent qu’il n’y a pas de modification significative de la concentration en érythrocytes ou en leucocytes sur 48 heures en présence ou en absence d’acide borique. La qualité de conservation des érythrocytes est inférieure, mais la présence d’un agent de conservation est sans effet. Ainsi, pour les éléments figurés, même si une analyse rapide reste naturellement à privilégier, ces paramètres semblent néanmoins assez stables pour autoriser une analyse différée à 24 voire 48 h. Les résultats sont totalement différents pour les bactéries où une croissance bactérienne est démontrée, en l’absence d’agent de conservation, sur un délai qui varie selon l’importance de l’inoculum bactérien initial. L’efficacité remarquable de l’acide borique en tant que conservateur est mise en évidence par l’allure des courbes, qui tend également à relativiser la valeur de la concentration en acide borique. Enfin, l’acide borique n’interfère pas avec le dénombrement des érythrocytes, leucocytes et bactéries par l’automate et son utilisation est totalement adaptée pour la conservation des échantillons urinaires en vue d’une analyse sur l’automate UF 1000i (bioMérieux© ). Mots clés : conservation des échantillons urinaires, automate d’analyse urinaire UF 1000i® , examen cytobactériologique des urines Article reçu le 7 février 2011, accepté le 2 mai 2011 588 Key words: preservation of urine samples, UF 1000i® automated urine analyser, urinalysis Pour citer cet article : Fabbro C, Darolles J, Rault JP. Évaluation de la conservation des échantillons urinaires en vue d’une étude sur l’automate d’analyse urinaire UF 1000i (bioMérieux© ). Ann Biol Clin 2011 ; 69(5) : 588-92 doi:10.1684/abc.2011.0625 doi:10.1684/abc.2011.0625 Abstract. With the general tendency that’s to say the grouping of laboratories as technical divisions and the accreditation’s obligation, the handling of urinary sample preservation’s conditions is a major concern. Urinary sample preservation, with or without boric acid, for UF 1000i urinalysis was the purpose of this study. No significant modification was found in red blood cells and white blood cells concentration on a 48 h period with or without boric acid. Preservation’s quality of the red blood cells is lower, but the presence of preservative is ineffectual. Thus, for those elements, even if a fast analyse is obviously preferred, these parameters seem to be stable enough to allow a 24 to 48 h delayed urinalysis. Results are totally different for bacteria, which grow if no preservative is added, in a period of time based on the size of the initial bacteria’s inoculum. Efficiency of the boric acid as a preservative is shown by the curves, which put into perspective the concentration of acid boric. Finally, boric acid doesn’t interfere with the erythrocyte, leucocyte or bacteria’s count on UF 1000i and his use is totally suitable for the preservation of urine samples for UF 1000i analysis. Copyright © 2017 John Libbey Eurotext. Téléchargé par un robot venant de 88.99.165.207 le 24/05/2017. Conservation des urines pour analyse sur UF 1000i Le regroupement des outils d’analyse en plateaux techniques et le respect des recommandations émises par la norme NF EN ISO 15189 imposent de maîtriser la gestion du transport et des conditions de stabilité des échantillons avant leur analyse. Pour le traitement des échantillons urinaires, l’ensemble des référentiels préconise, à défaut d’une analyse dans les 2 h après le recueil, une méthode évitant la pullulation bactérienne telle que la conservation à + 4 ◦ C ou le recours à un milieu de transport avec acide borique (AB) [1, 2]. La conservation des échantillons à 4 ◦ C, procédure efficace dans certaines études [3, 4], n’en demeure pas moins délicate à mettre en place en pratique courante du fait des problèmes logistiques. Le recours à un milieu de transport contenant de l’AB apparaît donc comme la solution à privilégier. Néanmoins, le manuel utilisateur de l’UF 1000i précise que « les données d’analyse peuvent être incorrectes dans les conditions suivantes parmi lesquelles les échantillons contenant des conservateurs (. . .) ». De plus, d’après la norme NF EN ISO 15189, des recommandations, basées sur les principes techniques utilisés par l’automate, doivent être délivrées concernant le recueil, le transport et les conditions de stockage pour éviter les interférences [5]. Ce travail a donc évalué la conservation des échantillons urinaires, en présence ou absence d’AB, en vue d’une analyse sur l’automate UF 1000i (bioMérieux© ). Les pools (A et B) ont été répartis chacun dans deux récipients stériles, l’un sans conservateur (flacon stérile en polystyrène 40 mL, Gosselin® ) et l’autre contenant de l’AB (agent de conservation). Le remplissage du flacon a été réalisé suivant les recommandations du fabricant (flacon stérile en polystyrène avec AB, Gosselin® ), avec 40 mL d’urine pour une concentration finale d’AB de 13 g/L. Le pool C est réparti dans quatre récipients stériles, le premier récipient exempt de conservateur et les trois suivants contenant chacun 520 mg d’AB. Pour étudier l’influence d’un remplissage insuffisant du flacon par le patient, donc d’une concentration plus importante de conservateur que celle préconisée par le fabricant, le pool urinaire est réparti de la manière suivante dans les récipients avec conservateur : le premier selon les recommandations du fabricant (40 mL), le deuxième avec 20 mL pour une concentration finale en AB à 26 g/L et le dernier avec 13,3 mL, soit 39 g/L d’AB (remplissage égal au tiers du volume recommandé par le fabricant). Analyse sur UF 1000i Les deux premiers pools ont été analysés six fois aux temps T + 0 h, T + 2 h, T + 4 h, T + 8 h, T + 24 h et T + 48 h en mode automatique sur l’UF 1000i, à la différence du troisième pool qui n’est analysé que trois fois aux mêmes temps. Les pools ont été conservés à température ambiante durant tout le temps de l’étude. Matériels et méthodes Population L’ensemble des prélèvements urinaires, d’origine communautaire, adressé pour examen cytobactériologique, à l’exception des spécimens présentant un délai d’acheminement supérieur à 4 h, de patients âgés de moins de 15 ans ou de femmes enceintes, a été analysé sur l’automate, dès réception au laboratoire. À l’issue de la première sélection, les échantillons présentant une quelconque alarme, une conductivité mesurée inférieure à 8 mS/cm, une concentration significative de spermatozoïdes, de levures, de cristaux, de cylindres pathologiques, de cellules arrondies de petite taille ou de cellules épithéliales, ont été exclus de l’étude. Au total, 32 échantillons patients ont été retenus. Constitution des pools Trois pools urinaires (A, B et C) ont été constitués, afin d’obtenir des concentrations en érythrocytes, leucocytes et bactéries proches des seuils décisionnels pour ces paramètres, soit respectivement 104 globules rouges (GR)/mL, 104 globules blancs (GB)/mL et 103 à 105 unités arbitraires (UA)/mL pour les bactéries. Ann Biol Clin, vol. 69, n◦ 5, septembre-octobre 2011 Résultats Pour chaque pool d’urines, les valeurs obtenues aux différents temps, ainsi que les moyennes (m), écarts-types (s), coefficients de variation (CV) et intervalles de confiance (IC) en découlant sont déterminés pour chaque mode de conservation. Les graphiques, inhérents à ces résultats, permettent de suivre l’évolution des GR, GB et bactéries au cours du temps, selon le mode de conservation. Le chevauchement des intervalles de confiance indique une différence non significative entre les moyennes. Érythrocytes Nous notons l’absence de modification significative de la concentration en érythrocytes au sein de l’échantillon pendant un délai de 48 h avec ou sans agent de conservation. Une légère diminution de l’ordre de 20 % est observable dans les premières heures, mais n’est pas significative. Des concentrations plus élevées en AB jusqu’à 39 g/L n’ont pas d’influence sur l’évolution des hématies au cours du temps. Cela est vérifié pour des valeurs de concentration en érythrocytes d’environ 104 éléments/mL. Les résultats à T + 0 h 589 Biologie au quotidien mettent en évidence l’absence d’interférence de l’AB sur le comptage des érythrocytes par l’automate. La figure 1 permet de visualiser ces résultats. Les trois essais réalisés sont concordants entre eux et montrent l’absence d’évolution de la concentration en leucocytes des échantillons urinaires en présence ou en absence d’AB, quelle que soit la concentration du conservateur (étude de 13 à 39 g/L) (figure 2). Cela est vérifié sur une période de 48 h et pour des concentrations en leucocytes s’étendant de 7 × 103 à 4,3 × 106 /mL. Les résultats à T + 0 h mettent en évidence l’absence d’interférence de l’AB sur le comptage des leucocytes par l’automate. Érythrocytes et leucocytes Les résultats précédents montrent qu’il n’y a pas de modification significative de la concentration en érythrocytes ou en leucocytes sur une durée de 48 h en présence ou absence d’AB. Une étude de Kouri et al. [6] met également en évidence une bonne conservation des leucocytes sur une durée de 24 h sans conservateur. La qualité de conservation des érythrocytes est inférieure, mais la présence d’un agent de conservation est sans effet. Ainsi, pour les éléments figurés, même si une analyse rapide reste naturellement à privilégier, ces paramètres semblent néanmoins assez stables pour autoriser une analyse différée à 24 voire 48 h. Bactéries Bactéries Tous les essais montrent une augmentation significative de la concentration bactérienne au cours du temps en l’absence d’agent de conservation. Le délai, au-delà duquel l’inoculum bactérien est significativement différent, varie selon la concentration bactérienne initiale dans l’échantillon. Ainsi, pour une concentration bactérienne initiale égale à 80 000 UA/mL, les valeurs sont similaires jusqu’à 8 h après la première mesure, mais diffèrent significativement au bout de 24 h. Lorsque la concentration bactérienne initiale est 100 fois plus importante, il existe une différence significative dès la troisième heure après la première mesure. Ce même délai est retrouvé avec une concentration initiale égale à 200 000 UA/mL (pool C). Nous constatons également que les concentrations bactériennes ne sont pas modifiées au cours du temps en présence de concentration plus élevée d’AB, jusqu’à 39 g/L. Les résultats à T + 0 h mettent en évidence l’absence d’interférence de l’AB sur le comptage des bactéries par l’automate. Les figures 3 à 5 permettent de visualiser ces différents résultats. Erythrocytes (/mL) Copyright © 2017 John Libbey Eurotext. Téléchargé par un robot venant de 88.99.165.207 le 24/05/2017. Leucocytes Discussion Une augmentation de la concentration bactérienne est démontrée, en l’absence d’agent de conservation, sur un délai qui varie selon l’importance de l’inoculum bactérien initial. L’efficacité remarquable de l’AB en tant que conservateur est mise en évidence par l’allure des courbes, qui tend également à relativiser la valeur de la concentration en AB. Cette même efficacité est retrouvée dans de nombreuses études [4, 6, 7]. À noter que pour Lum et Meers [8], l’effet de l’AB semble être indépendant de l’action de tout autre antibiotique éventuellement présent dans le milieu. Une étude révèle l’importance de l’espèce bactérienne impliquée [9]. Si la croissance est exponentielle pour l’ensemble des bactéries, la phase de latence est variable selon l’espèce. Au contraire d’Escherichia coli ou des entérocoques, les staphylocoques présentent une phase de latence plus importante. Ainsi, selon ces auteurs, le délai de prise en charge de l’urine peut être admissible jusqu’à 4 h après l’émission. Néanmoins, l’ensemble des référentiels préconise, à défaut d’une analyse dans les 2 h après le recueil, une méthode évitant la pullulation bactérienne telle que la conservation à + 4 ◦ C 20000 [AB] = 0 g/L 15000 [AB] = 13g/L 10000 [AB] = 26g/L 5000 [AB] = 39g/L 0 0 10 20 30 40 50 Délai (en h ) Figure 1. Conservation des érythrocytes dans le temps en fonction du mode de conservation (pool C). 590 Ann Biol Clin, vol. 69, n◦ 5, septembre-octobre 2011 ou le recours à un milieu de transport contenant de l’AB. Bien que le manuel utilisateur de l’automate UF 1000i (bioMérieux© ) émette des réserves quant aux données de l’analyse lorsque des conservateurs sont présents dans les échantillons urinaires testés, les résultats précédents mettent en évidence l’absence d’interférence de l’AB pour le dénombrement par l’automate des érythrocytes, leucocytes et bactéries. L’utilisation de récipients contenant de l’AB pour le recueil, le transport et le stockage des échantillons urinaires est donc compatible avec une analyse par fluoro-cytométrie en flux sur l’automate d’analyse urinaire UF 1000i (bioMérieux© ). Conclusion Dans le cadre de l’accréditation des laboratoires de biologie médicale, la validation des méthodes et procédures est une des nombreuses exigences de la norme NF EN ISO 15189. La phase pré-analytique représente la première étape de la prise en charge des échantillons et ce travail a évalué la conservation des échantillons urinaires en vue d’une analyse sur l’automate d’analyse urinaire UF 1000i (bioMérieux© ). L’ajout d’AB, en tant qu’agent de conservation, s’avère très efficace pour prévenir la croissance bactérienne. En revanche, son utilité apparaît moindre pour la conservation des érythrocytes et leucocytes dans les Leucocytes (/mL) 14000 12000 10000 [AB] = 0g/L 8000 6000 [AB] = 13g/L 4000 2000 [AB] = 39g/L [AB] = 26g/L 0 0 10 20 30 40 50 Délai (en h) Figure 2. Évolution du nombre de leucocytes en fonction du délai et du mode de conservation (pool C). Bactéries (/mL) 250 000 200 000 150 000 [AB] = 0g/L 100 000 [AB] = 13g/L 50 000 0 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 Délai (en h) Figure 3. Évolution de l’inoculum bactérien au cours du temps en fonction du mode de conservation (pool A). Bactéries (/mL) Copyright © 2017 John Libbey Eurotext. Téléchargé par un robot venant de 88.99.165.207 le 24/05/2017. Conservation des urines pour analyse sur UF 1000i 100 000 000 80 000 000 60 000 000 [AB] = 0g/L 40 000 000 [AB] = 13g/L 20 000 000 0 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 Délai (en h) Figure 4. Évolution de l’inoculum bactérien au cours du temps en fonction du mode de conservation (pool B). Ann Biol Clin, vol. 69, n◦ 5, septembre-octobre 2011 591 Biologie au quotidien 1800000 1600000 Copyright © 2017 John Libbey Eurotext. Téléchargé par un robot venant de 88.99.165.207 le 24/05/2017. Bactéries (/mL) 1400000 1200000 [AB] = 0g/L 1000000 [AB] = 13g/L [AB] = 26g/L 800000 : [AB] = 39g/L 600000 400000 200000 0 0 10 20 30 40 50 Délai (en h) Figure 5. Évolution de l’inoculum bactérien au cours du temps en fonction du mode de conservation (pool C). échantillons urinaires sur une durée expérimentale de 48 h. Une concentration plus importante en AB, simulant un remplissage inadéquat d’un flacon d’urine ne modifie pas les résultats. Enfin, l’AB n’interfère pas avec le dénombrement des érythrocytes, leucocytes et bactéries par l’UF 1000i. Son utilisation est totalement adaptée pour la conservation des échantillons urinaires en vue d’une analyse sur l’automate UF 1000i (bioMérieux© ). 3. Watson PG, Duerden BI. Laboratory assessment of physical and chemical methods of preserving urine specimens. J Clin Pathol 1977 ; 30 : 532-6. 4. Lauer BA, Reller LB, Mirrett S. Evaluation of preservative fluid for urine collected for culture. J Clin Microbiol 1979 ; 10 : 42-5. 5. Afnor. NF EN ISO 15189. Laboratoires d’analyses de biologie médicale. Exigences particulières concernant la qualité et la compétence. 2007 ; 1-40. Conflits d’intérêts : aucun. 6. Kouri T, Vuotari L, Pohjavaara S, Laippala P. Preservation of urine for flow cytometric and visual microscopic testing. Clin Chem 2002 ; 48 : 900-5. Références 7. Gillespie T, Fewster J, Masterton RG. The effect of specimen processing delay on borate urine preservation. J Clin Pathol 1999 ; 52 : 95-8. 1. SFM, ed. Examen cytobactériologique des urines. 3e édition ed. REMIC. Référentiel en Microbiologie Médicale, 2007 ; 2M2. 8. Lum KT, Meers PD. Boric acid converts urine into an effective bacteriostatic transport medium. J Infect 1989 ; 18 : 51-8. 2. Afssaps. Diagnostic et antibiothérapie des infections urinaires bactériennes communautaires chez l’adulte. 2008. 9. Wheldon DB, Slack M. Multiplication of contaminant bacteria in urine and interpretation of delayed culture. J Clin Pathol 1977 ; 30 : 615-9. 592 Ann Biol Clin, vol. 69, n◦ 5, septembre-octobre 2011