Règles d`assemblages et restauration écologique des

R`egles d’assemblages et restauration ´ecologique des
communaut´es v´eg´etales herbac´ees m´editerran´eennes : le
cas de la Plaine de La Crau (Bouches-du-Rhˆone, France)
Cl´ementine Coiffait-Gombault
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Cl´ementine Coiffait-Gombault. R`egles d’assemblages et restauration ´ecologique des commu-
naut´es v´eg´etales herbac´ees m´editerran´eennes : le cas de la Plaine de La Crau (Bouches-
du-Rhˆone, France). Sciences agricoles. Universit´e d’Avignon, 2011. Fran¸cais. <NNT :
2011AVIG0322>.<tel-00943535>
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Université d‟Avignon et des Pays du Vaucluse
École doctorale 536 "Sciences et Agrosciences"
THESE
présentée pour l‟obtention du grade de Docteur
de l‟Université d‟Avignon et des Pays du Vaucluse
Règles d’assemblages et restauration écologique
des communautés végétales herbacées méditerranéennes
Le cas de la Plaine de La Crau (Bouches-du-Rhône, France)
COIFFAIT-GOMBAULT Clémentine
Soutenance prévue le 7 décembre 2011 devant le jury composé de :
Jordi Cortina i Segarra Professeur des Universités Rapporteur
Université d‟Alicante, Espagne
Didier Alard Professeur des Universités Rapporteur
Université de Bordeaux 1
François Mésleard Professeur assoc Examinateur
Université d‟Avignon et des Pays du Vaucluse
bastien Gallet Maître de Conférences Examinateur
Université de Bretagne Occidentale
Armin Bischoff Maître de Conférences, H.D.R. Examinateur
Institut Supérieur des Sciences Agronomiques,
Agroalimentaires, Horticoles et du Paysage
Elise Buisson Maître de Conférences, H.D.R. Co-directrice
Université d‟Avignon et des Pays du Vaucluse
Thierry Dutoit Professeur des Universités Directeur
Université d‟Avignon et des Pays du Vaucluse
Thèse préparée au sein de l‟Institut diterranéen d‟Ecologie et de Paléoécologie
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Remerciements
Anne
Françoise
Pépinière d‟Etat d‟Aix-les-Milles
Elise
Thierry
Renaud
Fred Swanni
Coraline
Catherine
Soizig
Sylvain
Arne Saatkamp
Daniel
G.R.T. gaz
Région P.A.C.A.
Christine mermann
Christiane
Carrière la Menudelle
Bergers
Franck Laure
Mie
Math
Brice
Poun & Moun
Marius
Sébastien Gallet
Freddy Rey
Jérôme
Mélanie
Jérémy
Maryse
membres P.C.P.
Alain
Thierry Tatoni
membres D.F.C.V.
Thierry G.
Yogan Vincent Philippe
J.B. Fanny
U.A.P.V./I.U.T.
Université de Provence
C.I.E.S.
Tim Nunu
Stef Lolo
Flavie
Virginie
Sylvain 1.
Solène
Isabelle
François Mésleard
Jordi Cortina
Jeff
Didier Alard
Armin Bischoff
Emmanuel Corcket
Méli
Diane
Jenifer Christelle
Réserve Naturelle des Coussouls de Crau
C.E.N.P.A.C.A.
S.A.G.E.S.S.
Ecomed
Sandrine
C.N.R.S. (I.N.E.E)
Membres du jury
Membres du
comité de pilotage
Partenaires techniques
Partenaires financiers
collègues de l‟Arbois
Membres de
l‟I.M.E.P
Famille Amis
Stagiaires
Axe 1: 60%
Axe 2 : 40%
Aline
Cathy
Lucie
Felipe
Paty
Didi
AFC des remerciements
Une thèse est une énorme aventure humaine. Cette AFC montre que l‟ensemble des différents acteurs présents
dans cette analyse expliquent à 100% le résultat de cet assemblage de connaissances. Cette analyse indique qu‟il
existe différents groupes (partenaires financiers, partenaires techniques, membres du comité de pilotage,
membres du jury, membres de l‟I.M.E.P., familles, amis, stagiaires) et que certains individus peuvent apparaître
dans plusieurs de ces groupes. Je tiens donc à remercier l‟ensemble des personnes de ces différentes
communautés scientifiques, familiales, amicales et institutionnelles.
Ma plus grande crainte lors de ce travail d‟écriture est bel et bien la partie des remerciements car je redoute
d‟oublier une des petites fourmis qui a contribué à bâtir cet « édifice ».
Je tiens tout d‟abord à adresser un gigantesque merci à Elise Buisson et Thierry Dutoit pour m‟avoir
pris sous leurs ailes, de m‟avoir accordé leur confiance, d‟avoir partagé leur savoir, leur expérience, leur temps
(même quand les protocoles n‟étaient pas rigolos) et de m‟avoir donné envie de marcher dans leurs pas.
La thèse n‟aurait pu être menée sans financement, je tiens donc à adresser mes remerciements à la gion
P.A.C.A pour m‟avoir attribué une bourse de thèse, les compagnies S.A.G.E.S.S et G.R.T.gaz, le C.N.R.S. et son
programme I.N.E.E. pour le financement des suivis et des expérimentations. Je remercie le C.I.E.S (et ses supers
secrétaires), l‟I.U.T. et sa direction, l‟Université d‟Avignon et des Pays de Vaucluse, la directrice d‟étude,
devenue directrice du département nie Biologique de l‟I.U.T. Aline Le Menn pour m‟avoir permis d‟exercer
le travail de moniteur pendant trois ans. Je remercie l‟Université de Provence et l‟équipe D.F.C.V (en particulier
4
Thierry Gauquelin et Cathy Fernandez) de m‟avoir permis d‟enseigner et de continuer mes recherches par
l‟attribution d‟un poste d‟A.T.E.R. pendant l‟année 2010-2011.
Je remercie chaleureusement tous les chercheurs qui ont partagé leurs connaissances au cours des colloques et du
comité de pilotage. Ils m‟ont permis de voir que les rencontres humaines et scientifiques étaient possibles, et au
final très courantes ! Je remercie en particulier les membres de mon comité de pilotage et les membres de mon
jury de thèse : Emmanuel Corcket, Freddy Rey, Christine Römermann, Arne Saatkamp, Sébastien Gallet, Didier
Alard, Armin Bischoff, Jordi Cortina et François sleard.
Cette opportunité de thèse n‟aurait pu être créée sans le passage par la case Master recherche. Je remercie donc
Thierry Tatoni et Valérie Andrieu-Ponel qui m‟ont ouvert les portes de cette formation et m‟ont conseillé de
rejoindre « cette équipe dynamique ».
Le travail de terrain, de stats et de rédaction n‟aurait été rien sans les stagiaires et copains de bureau : Un énorme
merci à Fred Henry qui m‟a transmis son titre de thésard en chef qu‟il portait si bien et à Renaud Jaunatre à qui
je relaie le titre (tu verras, ce n‟est pas rien à porter !) et qui le mérites déjà depuis bien longtemps. Je sais que
vous n‟oublierez jamais la Twingo amphibie, on pourra dire qu‟on a risqué nos vies pour faire de la science !
Alors qu‟ils pouvaient rester au chaud (ou au frais tout dépendait de la saison), ils ont bien voulu donner le coup
de mains gracieusement et/ou dans le cadre de leurs formations : Swanni Alvarado, Coraline Fafin, Catherine
Rugari, Laure Glatard, Sylvain Fadda, Christiane Rolando, Daniel Pavon, Jennifer Matwyschuk, Christelle
Fanelli et Soizig Le Stradic. Ils ont contribué à la folle ambiance de bureau avec Solène Masson, Isabelle Muller,
Jérémy Migliore, Jean-François Alignan.
Je garderai toujours gravé dans mes souvenirs toutes les bonnes volontés amicales qui sont venues sur le terrain :
Mathieu Cassien, Mie Dao, Yogan Monnier, Philippe Touflan, Vincent Robin, J.B., et même certains
« inconnus » (pas restés longtemps inconnus) : Diane, Lucie Morandet, Felipe Alcantara, Fanny Guillien.
Certes je remercie les structures de la Pépinière d‟Etat d‟Aix-les-Milles et le service Serres et Jardin de
l‟I.M.E.P. qui ont abrité mes expérience ex-situ mais je remercie plus particulièrement leurs personnels : Alain
Bence, Patrice Brahic, Nordine, José, Fabrice, Marie et Viviane.
De nombreuses autorisations ont être obtenues pour ce travail. Je tiens à remercier la serve naturelle
nationale des Coussouls de Crau, le C.E.N. P.A.C.A et leurs personnels pour m‟avoir laissé déambullé sur la
réserve. Je remercie la carrière S.C.L.M. de la Ménudelle et en particulier son directeur Pierre Bourguet pour
m‟avoir autorisé à prélever de la terre sur son exploitation et m‟a même mis à disposition l‟un de ces engins avec
chauffeur. Je remercie la famille Trouillard pour avoir mis à disposition sa friche et « son troupeau », je remercie
également les bergers : Caroline et Jean-Marc et Mossen le conducteur de tracteur.
L‟anglais naurait jamais été so good sans Paty Gombault, Tim Bahti, Alice Endamne et Mickael Paul et les
statistiques si bien compris sans Franck Torre.
J‟espère que les copains verront que cette thèse a été au final « un vrai travail ». Je quitte désormais le statut
d‟éternelle étudiante et vous rejoins : Lolo, Stef, Flavie, Virginie, Sylvain, Claire, Jiv, Laeti, Nunu. Merci pour
m‟avoir nourrie, abritée et/ou distraite pendant cette longue période (j‟espère que ça ne s‟arrêtera pas là). Vu que
je remercie les copains, j‟en profite pour faire un clin d‟œil aux amitiés qui se sont crées pendant les colloques,
notamment avec Jérôme ou Mélanie, les amitiés de bureau à Avignon avec Isabelle, Sandrin, et les membres
enseignants de G.B., à l‟arbois avec notamment Maryse, Mariannick, Nathalie, Morri ou à Saint Charles avec
Anne, Françoise, Anne-Cyrielle, Helena, Max, Virginie, Sylvie, Christine, Jean-Philippe, Caroline, Nathalie,
Laurent, et tant d‟autres… ainsi que la team P.C.P. (et en particuliers les anciens jeunes thésards).
Je me souviens d‟une petite conversation avec mon papa il y a une petite dizaine d‟années qui me disait « tu
verras tu feras une thèse » et de ma réaction qui a été de lui rire au nez en pensant cause toujours. Je remercie
donc ma famille pour avoir cru en moi, et aidé : Méli, la plus jeune « collecteuse » de graines et « colorieuse »
d‟étiquettes (8 ans), Didi pour m‟avoir suivi sur le terrain, ma maman pour la correction du français et mon mari
qui a bien voulu en plein weekend hivernal découvrir lécosystème steppique avec un mistral soufflant à 120
km/h pour remettre en état des filets, et qui m‟a aidé et soutenu durant toutes les étapes du manuscrit. Une
pensée également à Marius qui a été patient dans mon ventre et calme pendant les dernières phases de rédaction.
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