Etude des mécanismes de transfert de bactéries

THÈSE
THÈSE
En vue de l’obtention du
DOCTORAT DE L’UNIVERSITÉ DE TOULOUSE
Délivré par : l’Université Toulouse 3 Paul Sabatier (UT3 Paul Sabatier)
Présentée et soutenue le 01/04/2016 par :
Étude des mécanismes de transfert de bactéries déformables en
microfiltration frontale
JURY
ROQUES Christine Professeur, Université de Toulouse Président du jury
WISNIEWSKI Christelle Professeur, Université de Montpellier 1 Rapporteur
CRESPO João G. Professeur, Universidade Nova de Lisboa Rapporteur
LAFFORGUE Christine Maître de Conférences, INSA Toulouse Examinateur
LORAIN Olivier Responsable R&D, POLYMEM Examinateur
DAGUE Etienne Chargé de Recherche, LAAS-CNRS Invité
COETSIER Clemence Maître de Conférences, Université de Toulouse Invité
CAUSSERAND Christel Professeur, Université de Toulouse Directrice de thèse
École doctorale et spécialité :
MEGEP : Génie des procédés et de l’Environnement
Unité de Recherche :
Laboratoire de Génie Chimique de Toulouse (UMR 5503)
Directeur de Thèse :
Professeur Christel CAUSSERAND
Rapporteurs :
Christelle WISNIEWSKI et João G. CRESPO

A mon père

Avant-propos
Avant toute chose, je tiens à remercier l’ensemble des membres du jury qui m’ont fait
l’immense honneur de participer à l’évaluation de mes premiers travaux de recherche.
Un grand merci à Mme Roques, présidente du jury, pour son enthousiasme sans égal. Un
immense merci aux deux rapporteurs Mme Wisniewski et Mr Crespo qui ont contribué à
la finalisation de mon projet et pour les échanges très enrichissants qui en ont suivi ma
soutenance. Sincères remerciements, également, à Mme Lafforgue et Mr Lorrain pour
vos commentaires, questions et mises en perspectives de mes travaux.
Je remercie ensuite l’ensemble des personnes qui ont rendu ce travail possible.
Tout d’abord, la direction du Laboratoire de Génie Chimique : Mr Bacchin et Mr Aimar –
je vous remercie pour votre accueil et pour votre expertise précieuse. Un grand merci à
Mme Causserand qui m’a permis de réaliser ce doctorat et qui m’a permis de dépasser
les difficultés rencontrées pendant ces années. Toujours au sein du LGC, merci à Mme
Coetsier pour son intérêt porté à ma problématique et enfin merci à l’ensemble des
membres du LGC-Rangueil pour votre soutien quotidien. Je remercie également
Mr Dague de l’équipe Nano-Bio-Systèmes du LAAS pour son investissement dans mes
travaux et pour m’avoir fait découvrir la technologie AFM.
Je souhaite également adresser de vifs remerciements à toutes les personnes qui m’ont
accompagné dans mes démarches scientifiques et qui ont contribué à l’aboutissement de
ce travail. Merci à Sophie Pecastaings et Cathy Feuillolay de la Faculté de Pharmacie
pour leur aide dans le développement des technique de microbiologie ; merci à Aurélie Le
Ru de l’INRA d’Auzeville, à Elisabeth Neuhauser du LBAE de Auch, à Véronique et
Cécile de l’ITAV pour leurs aides si précieuses et leurs conseils avisés ; enfin merci à mes
trois stagiaires Maëlle, Alexandre et Marie qui m’ont aidé à valider certains points et
pour les dilutions par centaines que je leur ai imposé.
Enfin, un grand merci à mes proches, ma famille, mes amis pour leur soutient : ils ont
fini par admettre que tout était possible.