Les arti cles en gras sont di sponib les au 27/ 02/20 09 SOMMAIRE TOME I SECTION I LE DIAGNOSTIC BACTÉRIOLOGIQUE 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 SECTION II Prélèvements en bactériologie clinique Métabolisme des micro-organismes d’intérêt médical Diagnostic phénotypique Identification conventionnelle Identification antigénique et anticorps monoclonaux Sérologie bactérienne Les systèmes automatiques d’identification bactérienne Diagnostic moléculaire en bactériologie Conservation des bactéries Les collections de souches bactériennes Sécurité au laboratoire de bactériologie clinique Assurance qualité au laboratoire de bactériologie Fiches techniques de bactériologie pratique Les tests rapides en bactériologie Les milieux chromogéniques en microbiologie clinique Méthodes de détection rapide des agents du bioterrorisme Diagnostic moléculaire en bactériologie : méthodes, intérêts et applications Gestion des bactéries multi-résistantes TAXONOMIE, ÉPIDÉMIOLOGIE 1 2 3 4 5 6 7 8 9 © ESKA février 2009 Taxonomie bactérienne Microbiologie et internet Chimiotaxonomie Marqueurs épidémiologiques Lysotypie, bactériocinotypie, ribotypie L’électrophorèse en champ pulsé Électrophorèse des protéines bactériennes L’amplification génique appliquée au marquage épidémiologique Génétique des populations et phylogénie bactérienne III SOMMAIRE AU 27/02/09 SECTION III ÉCOLOGIE ET POUVOIR PATHOGÈNE DES BACTÉRIES 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 Stratégies des bactéries pathogènes pour survivre dans l’organisme humain Toxines bactériennes Une stratégie bactérienne : la gestion de la perméabilité membranaire Mécanismes d’échappement des bactéries pathogènes à la réponse immunitaire Biofilms bactériens Bactériologie buccale Écologie microbienne du tube digestif Étude de quelques bactéries pathogènes pour le cheval et/ou les carnivores domestiques Risque microbiologique environnemental Infections bactériennes nosocomiales en réanimation : le point de vue du clinicien Bases de la microbiologie alimentaire pratique Flore microbienne de la peau saine La flore vaginale : composition, propriétés, perspectives Rôle du laboratoire de microbiologie en cas de risque bioterroriste Établissement du microbiote intestinal TOME II SECTION IV COQUES À GRAM POSITIF (CG+) 1 2 3 4 5 6 SECTION V Staphylococcus Rothia mucilaginosa Streptococcaceae Streptococcus pneumoniae Leuconostoc, bactéries apparentées et Vagococcus Arthrobacter BACILLES À GRAM POSITIF (BG+) 1 2 3 4 5 Listeria et listériose Erysipelothrix Bactéries aérobies sporulées Lactobacillus Corynebacterium et bactéries apparentées 6 Nouveautés dans la Famille des Bifidobacteriaceae : Aeriscardovia, Alloscardovia, Metascardovia, Parascardovia, Scardovia et Bifidobacterium scardovii SECTION VI ACTINOMYCETES ET MYCOBACTÉRIES 1 2 3 4 5 6 7 8 Nocardia et actinomycètes aérobies apparentés Streptomyces Mycobactéries : bacille de la tuberculose Mycobactéries autres que M. tuberculosis Mycobacterium leprae Mycobactéries et antibiotiques Apport de la biologie moléculaire en mycobactériologie Tropheryma whipplei, agent de la maladie de Whipple IV © ESKA février 2009 SOMMAIRE AU 27/02/09 SECTION VII ENTÉROBACTÉRIES 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Enterobacteriaceae : généralités Escherichia et Shigella Salmonella Yersinia pestis Yersinia autres que Y. pestis Klebsiella Enterobacter Serratia Citrobacter Proteae Autres entérobactéries Les Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) et la maladie de Hamburger SECTION VIII BACTÉRIES À GRAM NÉGATIF AUTRES QUE LES ENTÉROBACTÉRIES : (AUTRES BG-) 1 Neisseria gonorrhoeae et Neisseria meningitidis 1bis Moraxella (Branhamella) catarrhalis 2 Moraxella 3 Acinetobacter 4 Pseudomonas et Burkholderia 5 Les bacilles à Gram négatif non fermentants autres que Pseudomonas 6 Caulobacter 7 Francisella 8 Bacilles à Gram négatif inhabituels 9 Vibrio 10 Aeromonas 11 Plesiomonas shigelloides 12 Campylobacter 13 Helicobacter pylori 14 Legionella et légionellose 15 Bactéries intracellulaires d’amibes 16 Brucella 17 Pasteurella 18 Haemophilus 19 Bordetella 20 Kingella SECTION IX BACTÉRIES D’IDENTIFICATION DIFFICILE ET/OU INHABITUELLES 1 Mycoplasmes 2 Gardnerella vaginalis 3 Streptobacillus moniliformis 4 Tréponèmes pathogènes pour l’homme 5 Borrelia 6 Lept © ESKA février 2009 V SOMMAIRE AU 27/02/09 SECTION X ANAÉROBIES 1 2 3 4 5 6 7 Généralités sur les bactéries anaérobies Clostridium difficile Clostridium autres que C. difficile Anaérobies à Gram positif non sporulés Anaérobies à Gram négatif Cocci anaérobies à Gram positif (GPAC) Les cocci à Gram négatif anaérobies SECTION XI AGENTS ANTIBACTÉRIENS 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 Antiseptiques et antisepsie Antibiotiques : généralités Mécanismes d’action des antibiotiques Mécanismes de résistance aux antibiotiques Staphylococcus et antibiotiques Pneumocoques, autres streptocoques et antibiotiques Entérocoques et antibiotiques Neisseria meningitidis et antibiotiques Neisseria gonorrhoeae et antibiotiques Entérobactéries et bêta-lactamines Entérobactéries et aminosides Pseudomonas aeruginosa et bêta-lactamines Antibiotiques et bacilles à Gram négatif non fermentaires autres que P. aeruginosa Haemophilus influenzae et antibiotiques Détection rapide de la résistance aux antibiotiques Pharmacocinétique, pharmacodynamie clinique des antibiotiques Antibiotiques en agriculture et résistances bactériennes Légionelles et désinfectants La stérilisation des dispositifs médicaux à l’hôpital Les textiles antibactériens Résistances bactériennes et biocides (1re partie) Support génétique de la résistance Résistances bactériennes et biocides (2e partie) Biocides : principes actifs, caractéristiques générales L’antibiogramme en pratique courante SECTION XII MYCOLOGIE 1 Candida dubliniensis VI © ESKA février 2009