Méthode: utilisation de colorants en microscopie optique l’hématoxyline un colorant basique et qui a une affinité pour les molécules acides, met en évidence la répartition de l’ADN, de l’ARN et des protéines acides dans les cellules. Méthode: utilisation de traceurs en microscope à fluorescence Les événements morphologiques de la mitose. Observation en microscopie à fluorescence de cellules PtK1 fixées au glutaraldéhyde à divers stades de la mitose puis perméabilisées et colorées. Les microtubules (rouge: la rodamine fixée sur la tubuline)ont été visualisés par des méthodes d’immunofluorescence indirecte, et les chromosomes (vert) mis en évidence par le colorant d’ADN Hoechst 33342. Échelle (I) : 10 μm. A) Début de prophase B) Fin de prophase C) Rupture de l’enveloppe nucléaire et début de la prométaphase D) Pro-métaphase E) Fin de pro-métaphase F) Métaphase G) Anaphase H) Télophase I) Fin de mitose (Tiré de CL Rieder & A Khodjakov, 1997. Mitosis and checkpoints that control progression through mitosis in vertebrate somatic cells. Progress in Cell Cycle Research, vol. 3, avec la permission de Plenum Press, New York). Les cellules endothéliales d’artères pulmonaires de bovins colorées au DAPI exposent leur noyau, seul compartiment subcellulaire qui contient l’ADN. Le cytosquelette d’actine (le « squelette » de la cellule) est quant à lui coloré en vert Par un Ac marqué à la fluorescéine.. Méthode: La cytophotométrie La photométrie est une méthode de mesure, par des moyens optiques, de concentration des substances colorées dans un milieu non opaque. C’est un aspect de la densitométrie. La connaissance du volume de substance traversée permet de déterminer les quantités. La cytophotométrie se pratique au microscope sur des préaparations cytologiques (cellules ou organites cellulaires). En ce sens la méthode est analytique et permet de localiser les substances cibles au sein des structures biologiques comme avec l’autoradiographie. Protocol expérimental Les cellules sont fixées puis marquées avec un colorant: l’acridine orange ou Hoescht 33258. Cependant, la réaction nucléale de Feulgen est considérée comme la coloration type en cytophotométrie: Le principe de la méthode est de dissocier les deux brins d'ADN grâce à une hydrolyse ménagée par l'acide chlorhydrique (HCl) et de colorer ensuite ceux-ci au moyen de la fuschine qui réagit avec les fonctions réductrices de l'ADN. La concentration de colorant doit être proportionnelle à la concentration d’ADN. La culture est balayée par une lumière monochromatique La lumière émise est captée par une cellule photoélectrique qui mesure l’intensité de coloration de chaque noyau. on peut ainsi obtenir pour chaque mesure l’image photo de la cellule étudiée et ainsi déterminer son état selon sa quantité d’ADN. L’acridine orange est un composé organique. Il est utilisé comme un fluorescent cationique des acides nucléiques colorant sélectif utile pour la détermination du cycle cellulaire. Il interagit avec l'ADN et de l'ARN par intercalation ou attractions électrostatiques respectivement. Permet l’analyse simultanée du contenu en ADN et en ARN des cellules: intercalé à l’ADN signal fluorescent vert (FL1) fixé à l’ARN signal fluorescent rouge (FL2) Méthode: La cytométrie en flux mesure de la quantité d’ADN par cellule par cytométrie en flux la longueur des phases du cycle cellulaire (G1, S, G2 + M) La progression des cellules dans le cycle Conditions: une population de cellules sélectionnées par le cytomètre (toutes dans la même phase). Les cellules sont cultivées en présence d’une molécule fluorescente qui se lie à l’ADN A l’aide d’un cytomètre en flux, on mesure la fluorescence dans chaque cellule. Illustration de « Molecular Biology of the Cell » Albert et al. Garland Publishing Inc. Limites de l’analyse par cytométrie Des informations multiples…..mais limitées : Cellules en G0 et G1 confondues Cellules en G2 et M confondues On ne peut pas mesurer les cellules en S car on n’observe pas de pic ? Instantané (cliché) d’une population à un moment donné contenant des informations multiples Méthode: autoradiographie Protocol expérimental Certaines Méthode: immunocytochimie -Pour repérer la phase S, on utilise la bromodesoxyuridine (moins dangereuse que les marqueurs radioactifs) qui s’incorpore dans l’ADN en réplication et que l’on révèle avec un anticorps marqué avec un fluorochrome ou une enzyme (immnocytochimie). - Le BrdU, peut être injecté chez l’homme Pour l’étude de certaines formes de cancer qui ont un cycle cellulaire accéléré. Seuls les cellules en S sont marquées ADN en réplication La BrdU a une structure analogue à celle de la thymidine et s’incorpore dans l’ADN. La dénaturation acide. The Click-iT® EdU Assay from Invitrogen is a novel alternative to the BrdU assay. EdU (5-ethynyl-2´-deoxyuridine) provided in the kit is a nucleoside analog of thymidine and is incorporated into DNA during active DNA synthesis. 1 Detection is based on a click reaction, a coppercatalyzed covalent reaction between an azide and an alkyne. 2 In this Click-iT® EdU Imaging Kits application, the EdU contains the alkyne and the Alexa Fluor® dye contains the azide. The advantages of the Click-iT® EdU labeling are readily evident while performing the assay. The small size of the dye azide allows for efficient detection of the incorporated EdU using mild conditions. Standard aldehyde-based fixation and detergent permeabilization are sufficient for the Click-iT® detection reagent to gain access to the DNA. This is in contrast to BrdU assays that require DNA denaturation (typically using HCl or heat or digestion with DNase) to expose the BrdU so that it may be detected with an anti-BrdU antibody (Figure 1).