face à la réalité des prédictions bioinformatiques…

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SMILE: un des formats utilisés pour
représenter informatiquement une
molécule
Quelques propriétés
physicochimiques de base dont
‘TPSA’ = la surface polaire de la
molécule
estimation de la répartition de la molécule
entre l’eau et l’octanol (l’octanol est un
solvant qui possède des propriétés
similaires à celles de la membranes des
cellules):
logPo/w :
valeur positive: propriété hydrophobe
valeur négative: propriété hydrophile
Les molécules solubles dans l’eau peuvent
plus facilement être prises par voie orale
Si la molécule est un substrat de la protéine
P-gp, elle sera éjectée du cerveau
Probabilité que la molécule soit
absorbée au niveau du tractus
digestif (high or low)
Probabilité que la molécule soit absorbée
au niveau de la peau: une molécule passe la
peau si le score est supérieur à -5 (valeurs
positives)
Similarité avec un médicament existant
(pris par voie orale); MW le poids
moléculaire; SLOG et XLOGP:
hydrophilicité (voir ci-dessus)
face à la réalité
des prédictions
bioinformatiques…
La synthèse d’une molécule doit être
la plus simple possible pour optimiser
les coûts de production: plus le score
est élevé (1 à 10), plus la synthèse est
complexe.
Une ‘alert’ signifie que la molécule
contient des fragments connus pour
être toxiques, instables ou induisant de
‘fausses’ propriétés biologiques (par
exemple: liaison non spécifique aux
protéines)
* Valeurs importantes
Si le point rouge est dans le ‘blanc
de l’œuf’, la molécule possède les
propriétés d’un médicament à
prendre par voie orale; pour
qu’une molécule soit prédite active
dans le cerveau, il faut qu’elle soit
dans le ‘jaune d’oeu’f, et prédite P-
gp négative (voir plus bas)
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Lorsque plusieurs médicaments sont substrats de la
même CYP, la métabolisation de chaque molécule
peut être ralentie si elles sont administrées en même
temps. La concentration de ces molécules dans le
corps du patient peut alors être beaucoup plus
importante que prévue, et mener à des effets
secondaires.

Rofecoxib Paracetamol
Caféine
Thalidomide
Bisphenol
(plastiques) Nicotine
THC
molécule active du cannabis
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