Génétique des Populations

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2006
Module de Génétique
Responsables P. Maury & R. Babilé
Document de démonstration
seulement quelques liens sont
actifs et consultables
…
(lorsque le pointeur de la souris prend la forme d’une main)
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1
Génétique des populations
PLAN du COURS
Introduction générale
Chapitre I : Variabilité génétique au sein des populations
Chapitre II : Modèles d’analyse de la variabilité génétique
Chapitre III : Evolution de la variabilité génétique
Conclusion générale
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2
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CHAPITRE I
La variabilité génétique au sein des populations
Introduction du chapitre I
Variations morphologique et chromosomique
Polymorphisme protéique
Polymorphisme de l ’ADN
Conclusion du chapitre I
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Principe

Caractériser des segments d ’ADN, c ’est
à dire obtenir des ‘marqueurs ’
moléculaires.
Deux types de marqueurs : Dominants et
codominants
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4
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Phénotypes donnés par le
marqueur
Principe (2)
A1
A1A1
1
A1A2
1
A2A2
0
A1
A1
3 Génotypes
A2
A2
A2
RETOUR
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SUITE
Suivant
CODOMIMANT
DOMIMANT
5
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Méthodes
RFLP : Restriction Fragment length Polymorphism (1980)
RAPD : Random Amplified Polymorphic DNA (1990)
Microsatellites : Séquences répétées en tandem (1992)
AFLP : Amplification Fragment length Polymorphism (1995)
SEQUENCAGE : caractérisation des différentes paires de bases
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6
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Exemple de profil RAPD
T0 Tl PM
Génotypes
PM
kpb
2027
1584
Marqueur
947
564
RETOUR
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Suivant
7
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Quelques remarques…..
Par rapport au polymorphisme protéique :
mise en évidence d ’un polymorphisme dans
les régions non codantes de l ’ADN et moins
soumis à la sélection naturelle.
Le polymorphisme de l ’ADN n ’entraîne pas
nécessairement des effets décelables sur le
développement
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8
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I-5. Conclusion

Une importante variabilité - ou polymorphisme génétique (présence de multiples allèles pour de
nombreux gènes) existe au sein des espèces

Comment apprécier cette variabilité? À plusieurs
échelles…..en résumé
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En résumé,
GENOTYPE
Polymorphisme
ADN
Polymorphisme
PROTEIQUE
PHENOTYPE
Variations
CHROMOSOMIQUES
Variations
MORPHOLOGIQUES
Précédent
Caractère
simple
Suivant
Caractère
complexe
Pour décrire un génotype
=> plus de ‘ marqueurs phénotypiques10’
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Génotype :
Description des allèles aux différents loci…..
Phénotype :
Expression physique d ’un génotype…..
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11
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CHAPITRE II
Modèles d ’analyse de la variabilité génétique
Introduction du chapitre II
Le modèle de HARDY - WEINBERG
Application du modèle
Test de conformité du modèle
Conclusion du chapitre II
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CHAPITRE III
Evolution de la variabilité génétique dans diverses populations
Introduction du chapitre III
Croisements entre individus apparentés
Effets de la migration et de la mutation
Effets de la sélection
Conclusion du chapitre III
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Coefficient de parenté1
Les individus I et J sont
apparentés
Individu A
B
D
J
I
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14
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Coefficient de parenté2
Individu A
A
Les individus I et J sont
apparentés
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gènes, copies issues
d ’un exemplaire ancestral
(présent chez A) …
B
a
Réplication
A A a a
D
J
I
Précédent
RETOURSuivant
SUITE
15
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Coefficient de parenté3
Individu A
A
Les individus I et J sont
apparentés
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gènes, copies issues
d ’un exemplaire ancestral
(présent chez A) …
B
a
Réplication
A A a a
D
J
I
Coefficient de parenté entre I et J : RIJ
‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’
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SUITE
16
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Coefficient de parenté4
Individu A
A
Les individus I et J sont
apparentés
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gènes, copies issues
d ’un exemplaire ancestral
(présent chez A) …
Réplication
A A a a
B
I
a
B A
D
A D
J
Coefficient de parenté entre I et J : RIJ
‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’
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Coefficient de parenté5
Individu A
A
Les individus I et J sont
apparentés
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gènes, copies issues
d ’un exemplaire ancestral
(présent chez A) …
a
Réplication
A A a a
B
D
Chaîne de parenté
I
B A
A D
J
Coefficient de parenté entre I et J : RIJ
‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’
Parenté augmente avec le nombre d ’ancêtres communs et si nombre de générations (ancêtre
commun et individus IJ) sont faibles
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