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Le libre accès à l’information:
Un enjeu majeur pour la recherche biomédicale
et pour les rapports entre médecine et société
Nicole Pinhas, Grégoire Moutel
et l’équipe HAL-Inserm
Académie des Sciences
14 mai 2007
Internet: outil de communication entre
médecine et société
 Un contexte en évolution
• Le travail des groupes de chercheurs passe impérativement par
Internet (plateformes dédiées, listes de partage, validations
communes de donnée, réunions en ligne)
• Les rapports entre cliniciens, chercheurs et patients: dossier
médical informatisé partagé (soin et recherche), listes de
discussion, libre accès à l’information (loi du 4 mars 2002)
• La formation des jeunes médecins et jeunes chercheurs: bases
de données pédagogiques et scientifiques labellisées
 Recherche d’information validée: un enjeu stratégique et
éthique
• Libre accès au savoir et à la connaissance
• Diversité culturelle et des points de vue
• Transparence du monde de la recherche vis à vis de la société
Académie des Sciences
14 mai 2007
Groupe de chercheurs et cliniciens-chercheurs: l’accès
libre à l’information s’inscrit dans un contexte nouveau
de partage et d’échange des données médicales
« Annuaire des adhérents » (informations pratiques, qui fait quoi)
« Outils utiles à l’exercice » (mise à disposition collective)
Intranet
sécurisé
« Espace de diffusion des connaissances avant validation »
« Travaux en cours, données intermédiaires »
« Espace de dialogue » (Réponses aux demandes/ groupes d’experts)
« Observatoire des idées, des dysfonctionnements… »
Messagerie
sécurisée
Internet et
libre accès
information
« Information à propos d’un patient , d’une situation clinique
ou d’une situation de recherche clinique»
• recueil des informations sur le parcours du patient par le praticien référent
• échange d’informations entre partenaires du soin ou de la recherche
à propos d’un patient
« Espace de diffusion des connaissances» (accès à la documentation
scientifique validée au plan scientifique et éthique)
« Accès international, Nord-Sud »
« Confrontation d’expériences et débat scientifique facilité »
Académie des Sciences
14 mai 2007
Au plan pratique…un usage plus simple pour
diffuser les travaux de recherche.
Académie des Sciences
14 mai 2007
Multidisciplinarité et diversité culturelle facilitées:
chacun accédant plus facilement aux savoirs de l’autre
(richesse scientifique et pédagogique)
SCIENCES
HUMAINES
SANTE
PUBLIQUE
DISCIPLINES
CLINIQUES
Génétique
ETHIQUE
MEDICALE
BIOLOGIE
MEDECINE
LEGALE
Académie des Sciences
14 mai 2007
Un outil de facilitation pour les échanges nord-sud et
une médecine de plus en plus internationale
Académie des Sciences
14 mai 2007
Communication scientifique et patients
 Un devoir d’information préalable sur le contexte scientifique,
sur les pré-requis, les études existantes, les données
antérieures (bénéfices/risques)
 Un devoir d’information en fin de recherche: droit des patients à
la communication des résultats globaux de la recherche (loi de
2004 encadrant la recherche biomédicale)
 Intérêt +++ d’orienter facilement vers des bases de
données ayant un niveau scientifique irréprochable et
équivalent aux grandes revues internationales
Académie des Sciences
14 mai 2007
La question de la validation
scientifique et éthique
HAL
 Rejoint la question de la qualité de la publication et des
données médicales sur Internet = le danger de la diffusion libre
sans validation
(ref: Moutel G, médecine et internet, www.ethique.inserm.fr,
2005)
 La nécessité d’une labellisation suite à des règles claires et
transparentes
• Validation scientifique avec lecteurs indépendants
• Exposé des conflits d’intérêts
• Respect des règles éthiques et de la protection des personnes
qui participent aux recherches
 Choix dans le domaine santé de mettre en ligne les
publications de revues internationales à comités de
lecture, respectant ces règles éditoriales.
Académie des Sciences
14 mai 2007
L’information biomédicale
 Un domaine moteur aux enjeux stratégiques
 La publication dans des revues à comité de lecture :
principal vecteur de la communication scientifique
biomédicale
 Une information organisée par les NIH (NLM/NCBI) autour de la
base bibliographique Medline :
 déclarée bien public en 1997...
 … donc, accès libre et gratuit sur le web : PubMed
 nœud d’un réseau liant de nombreuses bases factuelles
 permettant une navigation depuis la référence jusqu’au texte
intégral par des accords avec les éditeurs dès 1999 :
PubMed Central
Académie des Sciences
14 mai 2007
Un système intégré de liens vers plus de 35 bases factuelles
Genome Databases
Nucleotide Databases
Protein Databases
Structure Databases
Taxonomy Databases
Expression Databases
Chemical Databases
Une archive ouverte internationale
 1999, création de PubMed Central (PMC) par les
National Institutes of Health (NIH), sous l’impulsion de
son directeur Harold Varmus
author
72007000
dépôts
auteurs
manuscripts
depuis
2005
http://www.pubmedcentral.nih.gov/
Académie des Sciences
14 mai 2007
L’Inserm, acteur du « libre accès »
 2000 et 2003 : organisation en France de séminaires
internationaux
 2000 : lancement d’un prototype « d’archive ouverte »
 Octobre 2003 : signature de la déclaration de Berlin,
engagement collectif des institutions publiques européennes
 Depuis 2002 - soutien à la publication dans des revues en
« open access » : BioMedCentral et PLoS
 Février 2006, ouverture de l’interface de dépôt HAL Inserm,
avec mise en place d’une politique institutionnelle
 2007 : reversement dans PubMed Central
Académie des Sciences
14 mai 2007
Politique de l’Inserm en matière d’archives
ouvertes
 Dépôt incité…, non obligatoire pour l’instant, vers une
« obligation indirecte » d’ici à 2008
 Version «auteur» de l’article accepté dans des revues à
comité de lecture
 Mise en accès libre avec respect des droits des éditeurs
 Politique semblable à celle des autres organismes de
recherche – NIH , MRC….
 6 mois : durée d’embargo acceptable
Académie des Sciences
14 mai 2007
Contrôles
Les documentalistes
Dépôt
Consultation
article
1- Vérification technique du
document
2- Contrôle dans PubMed
(import PMID)
Embargo
Résumé
3- Vérification droits
Sherpa/Romeo
Mise en ligne
Texte intégral
http://www.sherpa.ac.uk/romeo.php
EXPORTS
IMPORTS
XML, WS
haL
HAL
HAL- Pasteur
HAL-INRIA
HAL- Inserm HAL SHS
OAI-PMH
REDIF
RSS
Etc.
Une meilleure valorisation des travaux de
recherche
 Faciliter la diffusion des travaux de recherche
 Augmenter l’usage et la visibilité internationale,
donc augmentation du taux de citation
Free online availability substantially increases a paper’s impact.
Lawrence S. Nature 2001 ; 411 : 521.
Open access, impact, and demand. Suber, P.
BMJ 2005;330:1097-1098.
Citation Advantage of Open Access Articles. Gunther
Eysenbach. PLos Biology 2006 May 4(5)
The Impact Factor Game. It is time to find a better way to assess
the scientific literature. PLoS Med. 2006 Jun 6;3(6): e291
Académie des Sciences
14 mai 2007
Interrogation PubMed
Free in PMC
Académie des Sciences
14 mai 2007
Lien au texte intégral
déposé dans PMC
Lien aux autres bases
Académie des Sciences
14 mai 2007
Manuscrit déposé dans HAL Inserm
Académie des Sciences
14 mai 2007
Pour les chercheurs, de nouvelles habitudes
 Les pratiques des communautés de chercheurs varient selon les
domaines
 Forte implication de la direction de l’Inserm
vers une obligation institutionnelle
 Des actions de plus en plus incitatives et coordonnées des
financeurs de la recherche aux niveaux national et international
 Des actions d’information/sensibilisation en direction des
chercheurs
- réunion des directeurs d’unités
- séminaires sur site
- mailings de rappel dès l’entrée dans PubMed
- lettres d’information
Un enjeu majeur pour la valorisation de la recherche
biomédicale française
Académie des Sciences
14 mai 2007
Encore un effort !!!
HAL
Laissons le temps au temps, mais déjà…
6 000 articles publiés
1 200 dépôts
Académie des Sciences
14 mai 2007
Conclusion :
La proprieté intellectuelle partagée…un enjeu universel
« Ayant dessein d'employer toute ma vie à la recherche d'une science si nécessaire,
et ayant rencontré un chemin qui me semble tel qu'on doit infailliblement la trouver
en le suivant, si ce n'est qu'on en soit empêché ou par la brièveté de la vie ou par le
défaut des expériences, je jugeais qu'il n'y avait point de meilleur remède contre
ces deux empêchements que de communiquer fidèlement au public tout le peu
que j'aurais trouvé. » René Descartes (1596-1649), Discours de la Méthode, sixième partie.
Pieter Bruegel l'Ancien, XVIe siècle
Académie des Sciences
14 mai 2007
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