Picornaviridae Entérovirus - Sharing Pharma

3ème année
Virologie
Picornaviridae
Entérovirus, hépatovirus (VHA) et Parechovirus.
Structure virions :
20-30 nm diamètre. ARNmc, linéaire, non segmenté, ARN+. Capside icosaédrique, non enveloppés.
Entérovirus
Poliovirus
Epidémio
Physiopat
Clinique
Diagnostic
Vaccin
Trois sérotype. Épidémio : réservoir humain. Élimination salive et selles. Féco-oral. Mondiale.
Saisonnier. Vaccin obligatoire.
- Phase alimentaire où le virus se multiplie niveau muqueuse pharyngé et muqueuse
intestinal. (IgA sécrétoires)
- Phase lymphatique où le virus se multiplie dans ganglion et provoque Ac. Si marche
élimination.
- 10% passage sang (Phase virémique), si neutralisé alors forme atténué.
2% SNC pour poliomyélite.
Forme spinale classique
Incubation 2-3 semaines.
Phase d'invasion ou pré-paralytique (4-5jours), déjà SNC. Phase d'état ou paralytique brutal
(flasque). Évolution lente (2-3semaines). Récupération possible, incomplète.
Examen LCR. Diagnostic viro direct (PCR du génome), indirecte (sérologie), ttt
symptomatique (pas d'antiviraux). Déclaration obligatoire, vaccination obligatoire
Vaccin inactivé ou tué : composé de trois types. Ac dans le sang seulement. Cher.
Vaccin atténué (pas france) : trois types vivant sans neurovirulence. CI : ID et enceinte.
Coxsackievirus et Echovirus
Physiopatho
Clinique
Vaccin
Phase alimentaire où le virus se multiplie niveau muqueuse pharyngé et muqueuse intestinal.
Phase lymphatique où le virus se multiplie dans ganglion et provoque Ac. Si marche élimination.
Phase virémique : sang vers tissus, organes. Selon sérotype partout.
Atteinte SNC
Poliomyélite
Encéphalite
méningite lymphocytaire
Poliovirus
Echovirus, Coxsackievirus
les trois
Manif cutanéomuqueuse
Herpangine (vésicule)
Syndrome main pied bouche
exanthème fébrile
exanthème de boston
Coxsackievirus A
Coxsackievirus A16
Echovirus, Cox A B, polio
echovirus 16
Manif musculaire
Myalgie épidémique Bornholm
Coxsackievirus B
Atteinte cardiaque
Myocardite et péricardite
Coxsackievirus B
Atteinte respiratoire
Rhinopharyngite bronchite et
pneumonie
Bronchiolite
Échovirus, Coxsackievirus
A et B.
entérovirus 68
Atteinte hépatique
Hépatite
Coxsackievirus B
Manif oculaire
Conjonctivite aiguë hémorragique. Entérovirus 70, Coxsackievirus
A24.
pas de vaccin.
Rhinovirus humain.
Rhume ++ Incubation rapide (1-3J), puis éternuement, rhinorhée, malaise. Parfois autres localisation.
Évolution favorable 2-5J. Cependant complication respiratoire enfant ou surinfection possible. Pas vaccin.
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3ème année
Virologie
Togaviridae
Rubivirus rubeolae
Virus de la Rubéole
Structure
virion
Épidémio
Pouvoir
pathogène
ARNmc +, monosegmenté, linéaire. Capside icosaédrique. Enveloppe. 60-70nm. Un
seul type antigénique =>vaccin.
Ag d'importance : hémagglutinine (HA) immunogène.
Réservoir humain. Transmission directe et aérienne. 8J avant et 8J après éruption
(contagiosité pdt 16j).
Mondial, saisonnier, endémique.
Ac anti-rubéole=immunité durable.
- Primo-infection
Se multiplie dans muqueuse respiratoire et ganglion cervicaux, puis sang pour
virémie. Donne infection généralisé dans la plus part des organes. Synthèse d’Ac,
réponse immune.
Classique : incubation 16J, durée 4j. Adénopathie cervicale, fièvre modérée, absence
catarrhe oculo-nasal, éruption élément maculeux rose pale petit, espacés.
Tache papule vésicule bulle.
Existe inapparente ou sans éruption ou morbilliforme.
Complication : arthralgie, encéphalite, thrombopénie.
- Rubéole congénital
Dans les 3 premiers mois. Si primo-infection maternelle. Nécrose, inhibition mitose,
phénomènes auto-immuns, apoptose.
Mort in utero ou embryopathie : œil, oreille, cœur, snc ; foetotoxicité infection
persistante, excrétion virus grorge, urine, larmes = contagiosité+++
Attention à primo-infection de la femme enceinte.
- Direct : génome par PCR sur amniotique (17SA) ou sang (22SA).
- Indirect : Ac. IgM puis IgG. Titrage par ELISA<15UI/ml : doit être vacciner
Diagnostic
avant grossesse.
labo
Ac apparaissent 15J après contagion, résiduel plateau. Réinfection IgG en 7-11J.
Recherche IgM par immunocapture, et test d'avidité des IgG. IgA présent pour primoinfection.
Traitement Aucun.
Vaccin trivalent (rougeole oreillon rubéole). SC. Éviter grossesse dans les 2 mois
Prophylaxie après vaccination.
CI : ID, grossesse.
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3ème année
Virologie
Parvoviridae
Erythovirus B19
(=Parvovirus B19)
Structure
Épidémio
Pouvoir
pathogène
ADN mc, linaire, un segment. Capside icosaédrique. Nu.
Homme, direct aérienne, transplacentaire ou sanguine.
Mondiale. Endémique. Fin hiver. (10 % chez <5ans et 70 % chez >60ans)
Virus inhalé → migration vers précurseur érythroïde de la moelle osseuse → virémie
→ synthèse Ac-> réaction Ac-Ag formant complexe immun = l'éruption et arthralgie
Mégalérythème : 1semaine incubation avec fièvre, céphalées et douleur musculaire
puis 2semaines d'éruptions maculopapuleuses en aile de papillon.
Clinique Évolution favorable
Erythroblastopenie aiguë ou chronique: chez ceux déjà anomalie GR ou les ID.
Infection in utero si primo infection de la mère, mort fœtus si pas de tansfusion
Diagnostic Direct par PCR. Indirect recherche IgM et IgG anti-virus B19
Pas spécifique.
Traitement Pour fœtal : exsanguino-transfusion.
Pour adulte transfusion. Pas vaccin.
Coronaviridae
Structure
Clinique
Traitement
ARN monocaténaire, +, capside héliocoïdale, enveloppe.
Respiratoire, digestif, SNC. Rhinite, pharyngite, bronchiolite. GE.
Juste hygiène.
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3ème année
Virologie
Orthomyxoviridae
Influenza A B C.
Affinité pour muco-protéine.
Structure type A :
8segments, ARNmc -.
Capside hélicoïdale.
Enveloppe (M1, M2,
glycoprotéines)
Propriétés Ag :
Ag de l'enveloppe : HA
(hemagglutinine) et NA
(neuraminidase). Spécifique des
sous type.
Segment
Protéine codée
Localisation
Fonction
1
PB2
2
PB1
En relation avec ARN
Complexe transcriptase/
polymérase
3
PA
4
HA
Glycoprot d'enveloppe
Hémagglutinine
5
NP
Capside
Rôle dans réplication
6
NA
Glycoprot d'enveloppe
Neuraminidase
7
M1 et M2
Couche interne enveloppe
Protéine de matrice
Diverse interaction
8
NS1 et NS2
Prot non structurale
Rôle dans multiplication
Modifications majeures : sauts
antigéniques : cassures antigéniques
(pandémie)
Modifications mineures :
glissements antigéniques : dérives
progressives (chaque année)
Type concerné
A
A et B
Mécanisme
1) réassortiment de gène entre souche
2) transmission direct homme-animal.
Mutation ponctuelle
Conséquence
taxonomique
Emergence de nouveaux sous-types A
Émergence de nouveaux variants
A et B
Conséquence
immunitaire
Absence d’immunité croisée entre 2
sous-types A
Immunité croisée partielle entre 2
variants consécutifs
Conséquence épidémio
Pandémie tous les 10-30ans
Épidémie tous les ans
Conséquence vaccinal
Péremption du vaccin
Vaccin encore valide
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3ème année
Virologie
Multiplication
1) Adsorption/fixation de l’hémagglutinine sur les récepteurs cellulaires = acide sialique
2) Pénétration par endocytose → formation d’un endosome
3) Fusion entre enveloppe virale et membrane de l'endosome, dû à un abaissement du pH, entraînant un
changement de conformation de l' hémagglutinine
→ Libération des ribonucléoprotéines (RNP)
4) Migration des 8 fragments d'ARNv vers le noyau
5) Réplication des différents fragments d'ARN par action du complexe polymérase (PB1, PB2, PA)
6) Transcription de chaque fragment en ARNm (+)→migration vers le cytoplasme
7) Traduction en protéines sur les ribosomes de la cellule
8) Insertion de l’ hémagglutinine et neuraminidase dans la membrane plasmique
9) Formation des NC dans le noyau
10) Migration vers le cytoplasme
11) Assemblage et formation du bourgeon avec pénétration des NC dans le bourgeon
12) Libération des virions par action de la neuraminidase
Épidémio
Physiopatho
Transmission direct, aérienne et indirecte. Automne hivers. Enfant.
Pénétration inhalation. Multiplication dans muqueuse respiratoire cilié : nécrose et
hypersécrétion, entraînant surinfections bactériennes.
-
Clinique
-
Forme typique : incubation 1-2J, brutal avec fièvre céphalée courbature,
irritation conjonctive laryngo et bronchique. Dure 3-4J. Guérie en 3-5J possible
asthénie résiduelle.
Complication du virus lui même, pneumonie grippale primitive (œdème), neuro,
du à surinfection.
Immunité dure 1an. Ac dans muqueuse respiratoire
Traitement
Symptomatique + complications bactériennes
Antivirale : anti-neuraminidase (Oseltramivir, Zanamavir)
Prophylaxie
Vaccin
Oseltamivir+++, amantadine : sujets non vaccinés à rique
Vaccination inactivé
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3ème année
Virologie
Paramyxoviridae
Para-influenza (FHN), oreillons (FHN), VRS (F), rougeole (FH).
Structure : Enveloppe (F : facteur de fusion, H : hémagglutinine, N : neuraminidase), capside hélicoïdale,
ARNmc -, linéaire monosegmenté
Parainfluenza : Tractus respiratoire, souvent chez nourrisson et enfant. Ni chimio ni vaccin.
Oreillons
Rubulavirus
Epidémio
Physiopatho
Clinique
Traitement
Prophylaxie
Homme, salive, contagiosité de 6J avant à 10j après, immunité durable.
Pénétration salive et rhinopharyngé, multiplication cell rhinopharynx et ganglions locaux.
Virémie. Dissémination glande salivaire, méninge et autres système glandulaire : tropisme
glandulaire et neurotropisme. Excrétion virus salive- urine.
Inapparente 1/3. Incubation 3 semaines, fièvre modéré, parotidite.
Autres localisations : méningite, orchite, ovarite, pancréatite, hépatite, thyroïdite.
Pas de ttt.
par vaccin à virus vivant atténué sauf enceinte et ID
Rougeole ou virus morbilleux
Morbillivirus
Epidémio
Physiopatho
Clinique
Traitement
Enveloppe avec F H pas N.
Mondial, humain, transmission direct ou sécrétion rhino et oculaire. Contagieux 4jours avant,
2 après.
Pénétration aérienne, multiplication muqueuse respiratoire et conjonctivale, système
lymphoïde, virémie, leucocyte (leucopénie), invasion tissus (endothélium vasculaire et
tégument).
Incubation 10-12J.
Invasion marquée par catarrhe oculo-nasale, toux, fièvre élevé, exanthème et énanthème
(signe de Köplick)
Guéri en 8J.
Complication respiratoire (ou surinfection), otites, nerveuse, kératite.
Pan encéphalite sclérosante subaiguë. Mortel, 1/1Mo. Sept ans après rougeole.
Pas ttt. Prophylaxie : Ig standard. Vaccin à virus vivant atténué
Virus respiratoire Syncytial (VRS)
Pneumovirus
Epidémio
Clinique
Diagnostic
Traitement
Très résistant et très contagieux. Mondial.
Bronchiolite du nourrisson, pneumonie et bronchite chez enfant, syndrome grippaux.
Ag ou génome par PCR dans sécrétion respiratoire.
Ttt : symptomatique, ribavirine pour sévère.
Prévention Ag=palivizumab.
Vaccin en développement.
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3ème année
Virologie
Rhabdoviridae
Virus de la Rage
Méningo-encéphalite des mammifères
ARCmc non segmenté, linéaire, Epidémio
Capside hélicoïdale, protéine N. Enveloppé en forme d’obus. Porte glycoprotéine G à
propriété H.
Transmission par morsure, griffure ou léchage et manipulation d'objets souillés.
Multiplication au point d’inoculation dans les cellules musculaires striées pendant 3j.
Place pour sérovaccination d’urgence.
Physiopatho Puis point de non retour.
Phase centripète : cheminement le long des nerfs, arrivé SNC. Multiplication dans
neurones, corps de Négri.
Phase centrifuge : diffusion le long des nerfs. Glande salivaire, papille de la langue,
rétine, cornée.
Incubation à durée variable
- Phase début : fièvre légère, hyperesthésie.
- Phase d’état : encéphalite forme spastique ou furieuse : 41°, hallucination,
Clinique
contracture. Hydrophobie, aérophobie, modification voix, écoulement salive,
trouble conscience, coma, mort 2-10J.
Encéphalite forme paralytique : paralysie flasque ascendante avec évolution
plus lente.
Pas efficace quand déclarée.
Traitement Uniquement Préventif : Désinfecté plaie et Injecter Ig antiarabique avant 3jours!!
Vaccin curatif inactivé en 3 injections.
Prophylaxie : vaccin préventif, et animaux domestique et renard.
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7/12
3ème année
Virologie
Adenoviridae
Epidémio
Physiopatho
Clinique
Traitement
ADN bicaténaire, capside icosaédrique, nu.
Direct ou indirect sécrétion respiratoire, féco-oral, matériel ophtalmo pour
chaque infection.
Pénétration aérienne, multiplication gorge, voie respiratoire, œil, TD. Affinité
pour tissu lymphoïde.
A : intestinal asymptotique de l’enfant
B : épidémie, pharyngite, pneumonie (20%) ; épidémie d’infection respiratoire ;
cystite hémorragique et infection rénale, asymptotique.
C : 50%. Endémique enfant. Adénopharyngite, adénite mésentérique, infection
latente du tissu lymphoïde.
D : épidémie de kératoconjonctivite. Asymptotique.
E : rare, respiratoire.
F : Gastro-entérite enfant.
G : Gastro-entérite
symptomatique
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3ème année
Virologie
Herpersviridae
ADN bicaténaire, linéaire. Capside icosaédrique. Enveloppé. 120-200nm. Virus humain.
Multiplication intracellulaire
Phase d’initiation de l’infection : adsorption sur récepteur. Fusion enveloppe. Décapsidation.
Phase d’éclipse de synthèse : ADNv synthèse prot et propre réplication.
Phase d’assemblage, maturation, libération par lyse.
ADN polymérase ADN dépendante d’origine virale.
HSV
Epidémio
Physiopatho
Clinique
Diagnostic
Traitement
Alphaherpesvirinae, simplex virus. 1 labial, 2 génital. HHV1 et 2.
Humain, transmission direct. 1 par salive, 2 IST.
- Primo-infection
Pénétration par muqueuse respective. Multiplication dans cellules épithéliales des
muqueuses. Lyse formant vésicule riche en virus. Pénétration dans fibres
sensitives proches : neurone centripète. Localisation dans ganglion nerveux
régionaux (Gasser ou sacré).
- Latence :
État latent dans neurone. ADN épisomal présent mais pas intégré. Ni réplication,
ni expression mais transcription ARNv.
- Réactivation :
Lésion vésiculaire de la primo infection. Fréquence variable.
- HHV1 : gingivo-stomatite de l’enfant, éruption muqueuse, douleur, fièvre,
adénopathie cervicale. 90% inapparente. Réactivation : bouton de fièvre,
par fièvre soleil règle fatigue stress.
- HHV2 : éruption vésiculeuse sur organe externe, lésion douleur avec fièvre
et adénopathie inguinale. Réactivation : symptôme moins fort, excrétion
intermittente de virus.
Manifestations Graves :
- HHV1 : Kératite herpétique (conjonctivite voir cornée, vers cécité).
Encéphalite herpétique (convulsion, trouble, paralysie, coma, mortel 70%
ou sequelle). ID : lésion extensive, localisation viscéral mortel.
- HHV2 : Herpès neonatal 3/100k. Fièvre et localisation généralisé.
Favorable si œil peau bouche.
Direct par PCR, indirect par IgM IgG.
Ttt existe, aciclovir, valaciclovir. Pour formes resistantes : foscarnet, ganciclovir.
Vaccin en développement.
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9/12
3ème année
Virologie
VZV varicelle
Epidémio
Alphaherpesvirinae, varicellovirus. HHV3
Mondiale, humain. Direct par salive ou contact lésion. Varicelle Primo-infection. Zona =
réactivation.
Contagieux 2/3J avant, 5J après.
Physipatho
Primo-infection : pénétration aérienne, multiplication tractus respiratoire supérieur, ganglion
lymphatique, virémie. Par vague successive multiplication dans organe cible (cell épiderme
formant vésicule), cheminement le long des nerfs.
Phase de latence dans ganglion nerveux ; racine postérieur du nerf rachidien ou ganglion
sensitif du nerf crânien. Multiplication du virus et cheminement le long des nerfs.
Récurrence (zona) : atteinte de la peau, réaction inflammatoire de la racine du nerf
concerné : douleur intense et éruption de vésicule sur la peau.
-
Clinique
Diagnostic
Prophylaxie
Traitement
Typique de l’enfant : incubation 2weeks, fièvre 2J, éruption vésiculeuse d’abord tête
puis face puis tronc puis membre. Macule, papule, vésicule puis croûte sans trace
aux 8ème J. Par poussée.
- Complication : surinfection de grattage. Pneumonie +/- hépatite (mort 10%),
encéphalite (rare).
- Enceinte : varicelle grave mère. Si <20ème risque faible, si après : mort 20%.
- ID : varicelle hémorragique, infection disséminée (pneumopathie, hépatite,
pancréatite, encéphalite.
- Zona : Typique maladie douloureuse, adénopathie et douleur intense, éruption,
douleur persistante, évolution en 15J avec croûte qui tombe.
- Complication : kératite, algie post zostérienne, dissémination viscéral chez ID. Pas
de risque fœtal.
Direct par isolement cell et PCR.
Indirect par détection et quantification des IgM et IgG spécifique.
vaccin atténué.
Symptomatique. Spécifique par (val)aciclovir, ID ou IC mais grave chez F.enceinte et
nouveau né. Foscarnet ou ganciclovir si résistance.
Cytomegalovirs CMV
Betaherpesvirinae, cytomegalovirus. HHV5
Epidémio
Humain, mondial surtout défavorable. Direct par salive urine, sécrétion génitale, lait, larme,
sang, transplacentaire. Mais pas indirect car fragile.
Primo-infection : Pénétration, dissémination sanguine vers Rein, glande salivaire,
moelle osseuse, poumon, foie, snc, dig, peau, et dans les cell macrophagique, LT LB,
endothélium vasc.
Physioatho
- Latence : persistance dans LB LT, macrophage, cell réticulo-endothéliale, cell epith
glandulaire.
- Réactivation : asymptomatique mais virémie et excrétion. Symptomatique chez ID.
Clinique
-
Diagnostic
Traitement
Prophylaxie
Primo-infection : asymptomatique souvent si vieux possible éruption, fièvre
prolongé, syndrome mononucléosique mais sans angine. Complication poumon
hépatite, anémie hémolytique et thrombopénie, encéphalite.
Congénital : 95% non détection dont 15% anomalie tardive. 5% symptomatique dont
15% tardive, 80% infection localisé, 5% maladie inclusion cytomégalique.
ID : primo infection : fièvre prolongé, pneumopathie, hépatite, glomérulonéphrite,
colite, encéphalite, rejet d’organe.
Direct : PCR génique, isolement des cell.
Indicrect : détection IgM anti CMV et quantification par immunocapture des IgG anti CMV
par Elisa.
(Val)Ganciclovir, foscarnet, cidofovir.
Choix donneur/receveur. Valaciclovir ou valganciclovir. Ig riche en Ac antiCMV au
transplanté.
Vaccin en dev.
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10/12
3ème année
Virologie
Autre betaherpesvirus
HHV6 et HHV7.
Virus Epstein-Barr EBV.
HHV4. Gammaherpesvirinae, Lymphocryptovirus.
Epidémio
Humain (95% adulte). Interhumaine salive, transplacentaire, baisé, sang.
Primo infection, Multiplication oropharynx, infection LB circulant immortalisant
Physiopatho et prolifération, latence dans cell epith oropharynx et LB. Réactivation et
multiplication salivaire.
Primo infection : MNI. Incubation 20-60J. fièvre, angine, adénopathie et
Clinique
splénomégalie, parfois éruption, guérie en 2-3 semaines mais asthénie résistante.
Nombreuses Pathologies associées.
Primo infection par clinique et hématologie, biochimique et viro (IgM anti VCA).
Diagnostic
Parfois ancienne par IgG anti VCA ou anti EBNA. PCR pour pathologie associé.
Traitement
MNI par spécifique. Lymphome par rituximab (contre CD20).
Prophylaxie
vaccin en développement
HHV8 : agent du sarcome de kaposi endémique chez ID, associé au lymphome des séreuses et à la
maladie de Castelman multicentrique.
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11/12
3ème année
Virologie
Papillomaviridae
Alphapapillomavirus, Beta ... Zeta, 30 genres et 120 espèces.
ADN bc, circulaire, torsadé. Capside icosaédrique, nu, 55nm.
Epidémio
Physipatho
Clinique
Diagnostic
Traitement
Prophylaxie
- Transmission
Réservoir humain. IST. Femme surtout. 6% 18-35ans sont porteuses.
Installation cancer invasif. Intégration du génome viral, expression gène,
immortalisation.
Initiation, promotion, progression.
- Soit régression des lésions spontanées ou ttt, soit persistance dans
l’épithélium sans lésion ou cancer.
Microtraumatisme entrainant pénétration. Cell germinal de la couche basale de
l’épithélium, multiplication. Cell différenciées au niveau du noyau, formation
d’une verrue ou d’un condylome (végétation), par hypertrophie des papilles
dermiques ou par hyperplasie des différentes couches cell de l’épithélium.
- Tumeur bénigne de la peau et des muqueuses. Verrue, papillome oraux,
condylome ano-génitaux (acuminé ou plan).
- Cancer ORL. Type 16.
- Cancer génitaux Type 16 et 18.
Prélèvement (frotti ou biopsie). Examen cytologie du frotti. Efficace, détection
lésion précoce, présence koïlocyste.
PCR, hybridation moléculaire. Génotypage par PCR ou séquençage. 16 18 ou 33.
Condylome par topique, cryothérapie, laser.
Neoplasie intra épithéliale du col : laser et suivi.
Carcinome invasif du col : chirurgie.
Vaccin et suivi. Gardasil ou cervarix.
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