Résistance aux antibiotiques revue générale

Transduction; résistance aux
antibiotiques médiée par des phages
• Rarement décrit
• Résistance à la méthicilline
chez Staphylococcus spp.
• Résistance à l ’érythromycine
chez S. epidermidis
• Multirésistance chez E. coli;
géne de porine mutée
Transformation
• 44 bacterial species including;
–
–
–
–
–
–
–
–
Streptococcus
Enterococcus
Staphylococcus
Enterobacteriaceae
Pseudomonas
Acinetobacter
Haemophilus
Neisseria
S. pneumoniae de sensibilité diminuée
à la Péni G en France (CNRP)
60
52 53
n = 44 470 souches
48
50
48
43
40
36
32
30
25
17
20
20
12
10
0,5 0,7
1
4
5
7
CNRP P. Geslin
20
01
20
02
20
03
19
84
19
85
19
86
19
87
19
88
19
89
19
90
19
91
19
92
19
93
19
94
19
95
19
96
19
97
0
CNRP E. Varon, L. Gutmann
Pneumocoque S
Streptocoques R
Pneumocoque S
Pneumocoque R
Pneumocoque R
Séquençage des gènes  PLP souche R = Structure en mosaïque:
Alternance séquences conservées et séquences divergeant des souches S résultant
d’échanges d’ADN entre pneumocoque et streptocoques Péni R, par transformation.
PLASMIDES
chromosome
plasmide
Bactérie
sensible
plasmide
Transfert de plasmide
Bactérie
résistante
plasmide
plasmide
2 bactéries résistantes
Biochemical mechanisms of antibiotic
resistance and their genetic determinants
+
+
Tn
Transposon
P2
Tn
Tn
Resistance genes
. Aminoglycosides
Chloramphenicol
. -lactams
Glycopeptides
• Trimethoprim
. Macrolides
. Cyclines
. Rifampicin
Chr
P1
•
.
• Sulfamides
Bacterial species: Gram (+), Gram (-)
Tn
Les systèmes de capture de gènes:
les intégrons
P ant
intI1
qacE∆
attI
integrase
sul1
3'- conserved segment
attC
resistance gene cassette (R gene)
Int
P ant
intI1
attI
R gene
attC
qacE∆
sul1
Integron
intI1
P ant
5'CS
intI1
ATB 1
(P 2 )
ATB2
qacE
Sul
3'CS
gene cassette
qacE
Sul
3'CS
5'CS
.... as a source of cross-resistance
Species
Integron
Enterobacteriaceae
P. aeruginosa, P. putida, P. cepacia
Acinetobacter sp., Alcaligenes spp.
Campylobacter spp. ; Shewanella sp.
Vibrio cholerae, Vibrio spp.
Corynebacterium glutamium,
C. striatum, C. casei, C.
ammoniagenes Staphylococcus spp,
Aerococcus, Brevibacterium
Antibiotic resistance -lactams
Aminoglycosides
Chloramphenicol
Erythromycin
Rifampicin
Trimethoprim
Sulfamides
Antiseptics
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Shewanella algae; le réservoir
de gènes de type qnrA
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Sp Sa Sa
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Poirel, Rodriguez-Martinez,
Mammeri, Nordmannn
AAC 2005