Chercheur(se) en microbiologie spécialisé(e) en

Chercheur(se) en microbiologie spécialisé(e) en protéomique
L’Umr Cirad-Inra CMAEE « Contrôle des maladies animales exotiques et émergentes» (site de Duclos,
Guadeloupe) recrute un chercheur en microbiologie spécialisé en protéomique afin de renforcer les recherches
fondamentales associées aux interactions hôtes/pathogènes.
Ce travail se fera en interaction avec les recherches menées par les microbiologistes, les immunologistes et les
virologistes. Le modèle biologique principal sera Ehrlichia ruminantium une bactérie intracellulaire transmise
par les tiques aux ruminants.
Référence à
rappeler :
2209 Lieu d'affectation :
Guadeloupe, Centre INRA Antilles-Guyane, Site
CIRAD-Duclos, Petit-Bourg
Date de
publication :
28/05/2014
Type de contrat :
CDD 2 ans
Date de clôture :
18/06/2014
Date de prise de
fonction :
01/09/2014
CONTACT : http://www.cirad.fr/emplois-stages/postes-a-pourvoir/chercheurs/chercheur-se-en-
microbiologie-specialise-e-en-proteomique
Descriptif du poste
Dans un environnement scientifique propice, caractérisé par un campus de recherche de plus de 120 chercheurs
et une équipe Cirad de 20 personnes dont 8 chercheurs, avec des infrastructures performantes le (la) titulaire aura
pour missions :
• La mise en place de la plateforme de protéomique en Guadeloupe, suite à l’acquisition de nouveaux
équipements (IEF+SDS-PAGE, spot picker, Analyseur de gel et MALDI Tof/Tof déjà présent à
l’Institut Pasteur) en lien étroit avec les instituts partenaires (Instituto de Tecnologia Qimica e
Biologica, Portugal, Institut Pasteur de Guadeloupe)
• D’étudier le protéome d’Ehrlichia ruminantium au stade corps réticulé (forme intracellulaire) des
souches Gardel virulentes et atténuées et de faire l’analyse différentielle du protéome entre les différents
stades de développement (forme intra et extracellulaire) à la fois pour la souche virulente et la souche
atténuée
• D’étudier le protéome différentiel entre souches virulentes (Sénégal et Gardel) au stade extracellulaire
• De comparer le protéome des cellules non infectées et infectées avec la souche Gardel virulente en
fonction de l’avancée des taches associées au protéome de la bactérie. Possibilité de travailler sur 2
types cellulaires : micro et macro-vasculatures au stade précoce d’infection de manière à identifier les
mécanismes de pénétration et d’invasion de la bactérie
Ce projet conduira à caractériser le protéome d’E. ruminantium aux différents stades de développement et le
protéome des cellules hôtes (infectées vs non infectées). Les données de protéomique seront intégrées aux
données de transcriptomique de manière à comprendre la pathogénèse d’E. ruminantium .
Profil souhaité
• Thèse en biologie avec une solide expérience post doctorale en protéomique ainsi que sur les
interactions hôte/micro-organismes préférentiellement concernant les bactéries intracellulaires.
• Expérience en protéomique différentielle par gel ou par des approches de spectrométrie de masse
(DIGE, Nano LC - Maldi-ToF/ToF) et des logiciels d’analyse associés.
• Expérience dans la caractérisation des protéines et des modifications post-traductionnelles.
• Forte motivation pour travailler en équipe, en collaboration et en multi-disciplinarité, en particulier avec
des microbiologistes, immunologistes et virologistes.
• Goût pour la transmission de connaissances et de savoir-faire.
Contraintes du poste
• Accès contrôlé au laboratoire