Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Mention de Master Biologie Santé Université Paris Sud – Paris Saclay & Université Paris Est Créteil Master 2 Finalité IMMUNOLOGIE Fiche de renseignement concernant les laboratoires d’accueil (Remplir les champs grisés directement dans word puis retourner la fiche à l’attention de G. SchlechtLouf par mail [email protected] ) I. Renseignements concernant le laboratoire d’accueil Laboratoire d’accueil Intitulé et n° : Adresse complète : Thématique de recherche : Ecole doctorale de rattachement : Responsable de l’équipe : N° de téléphone : Adresse électronique : Inflammation, Chemokines and Immunopathology Inserm UMR_S996 32 rue des Carnets 92140 Clamart Immunologie ED569 : Innovation Thérapeutique, du Fondamental à l’Appliqué Dr. Françoise Bachelerie 01 41 28 80 01 [email protected] II. Renseignements concernant le sujet proposé pour un stage de M2 (Renseigner cette partie seulement si vous souhaitez encadrer un étudiant en M2 à la rentrée 2016) Nom de l’encadrant : N° de téléphone : Adresse électronique : Dr. Marion Espéli 01 41 28 80 04 [email protected] Titre du sujet : Analyse de la migration et de la fonction des plasmocytes à l’état basal et au cours du lupus systémique Mots clefs : Plasmocytes, anticorps, chimiokines, niches, autoimmunité, lupus systémique Résumé du sujet (en quelques lignes) : Les plasmocytes sont les cellules responsables de la production et de la sécrétion des anticorps. Ces cellules sont cruciales pour la mise en place d’une réponse immune vaccinale efficace. Il est maintenant clairement établi que les plasmocytes sont également impliqués dans le développement et la sévérité de plusieurs maladies autoimmunes, dont le lupus sytémique, via la production d’auto-anticorps pathologiques. Malgré leur rôle essentiel dans les réponses immunes normales et pathologiques, la biologie des plasmocytes reste encore mal comprise. Ce domaine d’étude est pourtant indispensable pour le développement de Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot nouvelles thérapies visant à améliorer la réponse vaccinale ou, inversement, à éliminer les plasmocytes autoréactifs dans le cadre des maladies autoimmunes. Ce projet de M2 vise à étudier plus précisément les mécanismes contrôlant la survie et la migration des plasmocytes ainsi que la sécrétion des anticorps. Il sera basé sur l’utilisation de modèles murins et de prélèvements de patients déjà présents aux laboratoires. Des techniques de cytométrie en flux, de culture cellulaire in vitro et d’analyse transcriptionnelle seront utilisées. Responsable Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Mention de Master (M2) Biologie Santé (Université Paris Sud) & (Université Paris Est Créteil) Spécialité IMMUNOLOGIE Fiche de renseignement concernant les laboratoires d’accueil (Remplir les champs grisés directement dans word puis retourner la fiche à l’attention de G. SchlechtLouf par mail [email protected] ) I. Renseignements concernant le laboratoire d’accueil Laboratoire d’accueil Intitulé et n° : Adresse complète : INSERM UMRS 951 - Généthon 1 bis rue de l'Internationale 91002. EVRY Thématique de recherche : Réponses immunitaires associées au transfert de gène Ecole doctorale de rattachement : SDSV (Paris Saclay) Responsable de l’équipe : N° de téléphone : Adresse électronique : Pr Sylvain FISSON 06 62 08 93 34 [email protected] II. Renseignements concernant le sujet proposé pour un stage de M2 (Renseigner cette partie seulement si vous souhaitez encadrer un étudiant en M2 à la rentrée 2016) Nom de l’encadrant : N° de téléphone : Adresse électronique : Pr Sylvain FISSON 06 62 08 93 34 [email protected] Titre du sujet : Etude des réponses immunitaires associées au transfert de gène intraoculaire Mots clefs : Thérapie génique ; Oeil ; rAAV ; Inflammation ; Immuno-modulation Résumé du sujet (en quelques lignes) : La thérapie génique est actuellement considérée comme une approche thérapeutique très prometteuse pour le traitement de nombreuses maladies oculaires à composante génétique et a déjà fait ses preuves chez l’Homme en permettant à des patients de retrouver la vue, comme dans le cas de l’amaurose congénitale de Leber. Cependant, les conséquences sur le système immunitaire du transfert de gènes par voie intraoculaire n’ont été que très peu explorées. Une tolérance immunitaire systémique, appelée axe camérulo-splénique ou ACAID (pour Anterior Chamber–Associated Immune Deviation), est observée lorsqu’un antigène est introduit dans un œil. A l’aide de modèles murins précédemment développés, le stage visera à évaluer les conséquences sur les réponses immunitaires locales et périphériques après une ou plusieurs injections intraoculaires de vecteurs de thérapie génique. Seront particulièrement pris en compte, l'impact du site d'injection du vecteur (e.g. sousrétinien, intra-vitréen, chambre antérieure), le niveau d'expression du transgène (par bioluminescenceet/ou GFP) et les différents types de cellules rétiniennes transduites. Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Mention de Master Biologie Santé Université Paris Sud – Paris Saclay & Université Paris Est Créteil Master 2 Finalité IMMUNOLOGIE Fiche de renseignement concernant les laboratoires d’accueil (Remplir les champs grisés directement dans word puis retourner la fiche à l’attention de G. SchlechtLouf par mail [email protected] ) I. Renseignements concernant le laboratoire d’accueil Laboratoire d’accueil Intitulé et n° : immunotoxicologie » Adresse complète : INSERM UMR 996 Equipe 2 « Allergie, et Faculté de Pharmacie, Châtenay-Malabry Thématique de recherche : Réponse immunitaire innée et physiopathologie Ecole doctorale de rattachement : ED 425 Innovation thérapeutique Responsable de l’équipe : N° de téléphone : Adresse électronique : Pr Marc Pallardy 01 46 83 54 92 [email protected] II. Renseignements concernant le sujet proposé pour un stage de M2 (Renseigner cette partie seulement si vous souhaitez encadrer un étudiant en M2 à la rentrée 2016) Nom de l’encadrant : Pr Sylvie Chollet-Martin et Dr Luc de Chaisemartin N° de téléphone : 01 46 83 55 27 ou 01 40 25 85 21 Adresse électronique :[email protected] et [email protected] Titre du sujet : Lymphocytes T mémoires et allergie aux curares Mots clefs : Lymphocytes T mémoires, Allergie, Curares, diagnostic Résumé du sujet (en quelques lignes) : L’allergie aux curares myorelaxants représente la principale cause des réactions anaphylactiques per-opératoires. Ces réactions sont sévères et engagent souvent le pronostic vital. Les tests diagnostiques actuels manquent de sensibilité et ne peuvent être pratiqués que tardivement. L’objectif de ce projet est de documenter l’existence de lymphocytes T mémoires spécifiques et d’évaluer leur fréquence comme outil diagnostique supplémentaire et précoce. Cette mesure de fréquence se fera par une méthode ELISPOT sensibilisée (maturation accélérée des cellules dendritiques), sur une biothèque déjà constituée de cellules de patients ayant fait un choc anaphylactique (cohorte NASA). De plus, la polarisation, l'état d'activation et le potentiel de prolifération de ces lymphocytes T seront évalués par cytométrie en flux. L’analyse des différents paramètres recueillis permettra de définir ceux qui seraient le mieux adaptés au diagnostic, et potentiellement d’améliorer significativement la prise en charge de l’allergie aux curares. Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Mention de Master Biologie Santé Université Paris Sud – Paris Saclay & Université Paris Est Créteil Master 2 Finalité IMMUNOLOGIE Fiche de renseignement concernant les laboratoires d’accueil (Remplir les champs grisés directement dans word puis retourner la fiche à l’attention de G. SchlechtLouf par mail [email protected] ) I. Renseignements concernant le laboratoire d’accueil Laboratoire d’accueil Intitulé et n° : Adresse complète : cedex 15 Groupe Immunité Néonatale - Dpt Immunologie INSTITUT PASTEUR 25 rue du Dr Roux 75724 Paris Thématique de recherche : Infection et regulation immune Ecole doctorale de rattachement : BioSPC Responsable de l’équipe : Immunologie G. Eberl N° de téléphone : Adresse électronique : Richard Lo-Man rattaché au Dir. Departement 01 45 68 83 52 [email protected] II. Renseignements concernant le sujet proposé pour un stage de M2 (Renseigner cette partie seulement si vous souhaitez encadrer un étudiant en M2 à la rentrée 2016) Nom de l’encadrant : N° de téléphone : Adresse électronique : Richard Lo-Man 01 45 68 83 52 [email protected] Titre du sujet : l'infection Etude des propriétés des lymphocytes B régulateurs dans Mots clefs : Infection - Breg - Nouveau-né Résumé du sujet (en quelques lignes) : Les lymphocytes B regulateurs (Bregs) sont apparus récemment comme des regulateurs majeurs dans l’autoimmunité, la transplantation, et les infections. Il s’agit ici notamment d’étudier les interactions des Bregs néonataux avec différents pathogènes, viraux et bactériens responsables de pathologies chez le nourrisson. Le role des Bregs est analysé dans l’infection et dans le contrôle des réponses inflammatoires et de la polarisation des réponses effectrices des lymphocytes T CD4 (Th1, Th2, Th17 ou Th22) ou de l’activation des lymphocytes T CD8. Refs : Immune regulatory function of B cells. Annu Rev Immunol. 2012 vol. 30 pp. 221-41 Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Mention de Master Biologie Santé Université Paris Sud – Paris Saclay & Université Paris Est Créteil Master 2 Finalité IMMUNOLOGIE Fiche de renseignement concernant les laboratoires d’accueil (Remplir les champs grisés directement dans word puis retourner la fiche à l’attention de G. SchlechtLouf par mail [email protected] ) I. Renseignements concernant le laboratoire d’accueil Laboratoire d’accueil Intitulé et n° : Adresse complète : Thématique de recherche : Institut Cochin, U1016, UMR8104 22 rue Méchain, 75014 Paris Dynamique des interactions lymphocytaires T Ecole doctorale de rattachement : Responsable de l’équipe : N° de téléphone : Adresse électronique : BioSPC Emmanuel Donnadieu 33(0)1 40 51 65 64 [email protected] II. Renseignements concernant le sujet proposé pour un stage de M2 (Renseigner cette partie seulement si vous souhaitez encadrer un étudiant en M2 à la rentrée 2016) Nom de l’encadrant : N° de téléphone : Adresse électronique : Marianne Mangeney Titre du sujet : Etude du rôle de Fam65b dans la réponse anti-tumorale Mots clefs : lymphocyte T, signalisation, réponse anti-tumorale 33(0)1 40 51 66 40 [email protected] Résumé du sujet (en quelques lignes) : Malgré l’émergence de nouvelles approches thérapeutiques, l'immunothérapie active des cancers est loin de produire une réponse clinique durable et efficace. On sait que dans bien des cas une réponse immunitaire anti-tumorale est détectable chez les patients, mais que les lymphocytes T (LT) dirigés contre la tumeur sont très mal recrutés dans les masses tumorales, et que ceux trouvés au niveau des tumeurs sont le plus souvent anergiques. De là découlent deux enjeux majeurs de la recherche dans ce domaine : déterminer les conditions du déclenchement de l’activation des LT, et déchiffrer les mécanismes qui permettent aux LT d'entrer en contact avec les cellules tumorales. Notre équipe s’intéresse depuis sa création aux voies de signalisation précoces mises en œuvre en aval d’une stimulation du TCR. Elle s’intéresse tout particulièrement aux rôles des facteurs de transcription FoxO dans ce processus. Les facteurs de transcription de type Forkhead contrôlent un grand nombre de fonctions telles que le cycle cellulaire, la réparation des dommages de l’ADN, et certaines voies métaboliques. Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Notre équipe a identifié une nouvelle cible transcriptionnelle de FOXO1, le gène Fam65b, et montré au niveau fonctionnel que (i) Fam65b inhibe l’adhésion et la migration des LT en réponse aux chimiokines; (ii) Fam65b est un des effecteurs moléculaires de la quiescence induite par FoxO1, dont l'inhibition de l'expression est un prérequis à toute prolifération et dont le niveau d’expression régule le seuil d’activation des LT. L’ensemble de ces résultats montre donc que Fam65b régule deux processus essentiels à l’établissement d’une réponse immune, la migration et la prolifération. Projets Pour la poursuite de ce projet, notre équipe a développé une lignée de souris dans laquelle le gène fam65b est invalidé spécifiquement dans la lignée T (T/Fam65bKO). Le but du stage proposé sera de tester les conséquences de l’invalidation de ce gène sur la réponse anti-tumorale. En effet, Fam65b, inhibant à la fois le mouvement et l’activation des LT, pourrait favoriser la mise en place d’une réponse anti-tumorale efficace. Le modèle tumoral utilisé, et qui est au point dans le laboratoire, est basé sur la transplantation dans des souris receveuses de la lignée tumorale TC1. La lignée TC1 a été obtenue à partir de cellules épithéliales de poumon d'une souris C57BL/6, après immortalisation par les antigènes E6 et E7 du papillomavirus et transformation par l’oncogène c-Ha-ras. Sept jours après l’injection en sous-cutané de 105 cellules, on obtient des tumeurs mesurables chez la totalité des souris injectées. L’injection d’un vaccin, composé de 20µg de vaccin E7 associé à 6x105 unités d’IFN alpha permet d’induire une régression des tumeurs qui est cependant transitoire puisque l’on observe chez la quasitotalité des animaux une reprise de la croissance tumorale (4). Ce modèle permettra donc à la fois d’évaluer le rôle de Fam65b dans le cadre d’une réponse anti-tumorale de base mais également d'évaluer les possibles synergies avec une approche vaccinale. Concrètement, le projet proposé consistera à comparer la réponse anti-tumorale dans des souris T/Fam65bKO à celle obtenue dans des souris normales (WT) en termes de croissance tumorale, en absence ou après vaccination. Outre le suivi de la croissance tumorale, les conséquences de l’invalidation de Fam65b seront analysées à la fois sur l’activation et la migration des LT. Plus précisément, cette étude sera réalisée en étudiant le nombre de LT spécifiques de la tumeur (tetramer), les différentes sous-populations lymphocytaires T, ainsi que leur niveau d’activation. Enfin, pour évaluer l'importance dans la réponse anti-tumorale de la fonction de régulation de la migration des LT portée par Fam65b, nous analyserons la géographie de la localisation des différentes populations cellulaires par microscopie. Au cours de son stage, l’étudiant bénéficiera de l’expertise de notre équipe qui maitrise toutes les techniques ainsi que les modèles murins nécessaires à la réalisation du projet. Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Mention de Master Biologie Santé Université Paris Sud – Paris Saclay & Université Paris Est Créteil Master 2 Finalité IMMUNOLOGIE Fiche de renseignement concernant les laboratoires d’accueil (Remplir les champs grisés directement dans word puis retourner la fiche à l’attention de G. SchlechtLouf par mail [email protected] ) I. Renseignements concernant le laboratoire d’accueil Laboratoire d’accueil Unité de Signalisation des cytokines, Institut Pasteur, INSERM U1221 Adresse complète : Institut Pasteur, 25 rue du Dr. Roux, 75015, Paris Thématique de recherche : Immunologie, Biochimie et Biologie moléculaire Ecole doctorale de rattachement : Physiologie, Physiopathologie et Thérapeutique, ED394 Responsable de l’équipe : N° de téléphone : Adresse électronique : Sandra Pellegrini, Chef d’Unité 01 45 68 86 35 [email protected] II. Renseignements concernant le sujet proposé pour un stage de M2 Nom de l’encadrant : Frédérique MICHEL, Directeur de Recherche, IP N° de téléphone : Adresse électronique : 01 45 68 86 38 [email protected] Titre du sujet : Rôle de facteurs de transcription activés par la costimulation TCR/IFN-I dans l’expression de l’interleukine 10 Mots clefs : Interféron de type I, cytokines, différenciation lymphocytaire, T régulateurs, facteurs de transcription Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Résumé du sujet : Nous étudions l’activité immunorégulatrice des interférons de type I (IFNα/β) sur la réponse adaptative médiée par le lymphocyte T CD4+ chez l’homme. Nous nous intéressons à l’effet direct et rapide que l’IFN-I exerce sur le lymphocyte T CD4+ naif stimulé par le récepteur de l’antigène (TCR) et aux conséquences sur sa différenciation en sous-populations effectrices (T helper, Th) et régulatrices (Treg). Nous avons montré que l’IFN-I favorise le développement précoce d’une sous-population lymphocytaire qui secrète la cytokine antiinflammatoire IL-10 (Tr1-like cells). L’objectif du projet est d’approfondir les connaissances sur le mécanisme de la coopération entre les voies de signalisation du TCR et l’IFN-I, au niveau de la régulation transcriptionnelle de l’IL-10. Le rôle individuel et/ou combiné de deux protéines STATs (Signal Transducer and Activator of Transcription) sera plus particulièrement étudié. Le rôle d’autres facteurs de transcription activés par le crosstalk TCR/IFN pourra être également étudié sur la base nos études transcriptomiques récentes. Une approche d’interférence d’ARN messagers sera utilisée par transfection de siRNA (small interfering RNA) dans une lignée de lymphocytes T CD4+. Ce projet sera complété par des essais d’immunoprécipitation de chromatine afin de déterminer si les régulateurs identifiés se lient directement au locus IL-10 et par la mesure de leur expression par PCR quantitative en multiplex dans les lymphocytes CD4+ T primaires. Responsables Paris-Sud : Pr Olivier Lambotte Dr Géraldine Schlecht-louf Responsable UPEC: Pr Véronique Godot Mention de Master Biologie Santé Université Paris Sud – Paris Saclay & Université Paris Est Créteil Master 2 Finalité IMMUNOLOGIE Fiche de renseignement concernant les laboratoires d’accueil (Remplir les champs grisés directement dans word puis retourner la fiche à l’attention de G. SchlechtLouf par mail [email protected] ) I. Renseignements concernant le laboratoire d’accueil Laboratoire d’accueil Intitulé et n° : LRTS, Institut de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire, INSERM U967, CEA/DRF/IRCM Adresse complète : CEA, bât 5, 18 route du Panorama, 92260 Fontenay aux Roses Thématique de recherche : Radiobiologie, Réponse inflammatoire, Hématopoïèse Ecole doctorale de rattachement : HOB Responsable de l’équipe : Paul-Henri Romeo N° de téléphone : 01 46 54 85 85 Adresse électronique : [email protected] II. Renseignements concernant le sujet proposé pour un stage de M2 (Renseigner cette partie seulement si vous souhaitez encadrer un étudiant en M2 à la rentrée 2016) Nom de l’encadrant : N° de téléphone : Adresse électronique : Germain Rousselet 01 46 54 70 41 [email protected] Titre du sujet : Mécanismes moléculaires du rôle de TRIM33 dans l’activation des macrophages Mots clefs : d’ADN, enhancer, CTCF activation des macrophages, TRIM33, transcription, boucles Résumé du sujet (en quelques lignes) : Le laboratoire a montré un rôle majeur de la protéine TRIM33 dans le contrôle de l’expression de différents gènes lors des phases tardives de l’activation des macrophages (Ferri et al., Nat Commun, 6:8900, 2015). Une série d’expériences préliminaires suggère que ce contrôle passerait par des modifications de la structure tridimensionnelle de l’ADN (boucles), par une interaction fonctionnelle entre TRIM33 et les protéines de looping (CTCF, cohésine). Le sujet consistera à démontrer cette interaction fonctionnelle, et à rechercher son mécanisme moléculaire. Il repose sur des techniques de biologie cellulaire et moléculaire (western, co-IP, ChIP, 3c), incluant des analyses en séquençage haut débit si besoin.