UNIVERSITE TOULOUSE 3 Numéro dans le SI local : Référence GESUP : Corps : Article : Chaire : Section 1 : Section 2 : Section 3 : Profil : Job profile : Research fields EURAXESS : Implantation du poste : Localisation : Code postal de la localisation : Etat du poste : Adresse d'envoi du dossier : Contact administratif : N° de téléphone : N° de Fax : Email : Date de prise de fonction : Mots-clés : Profil enseignement : Composante ou UFR : Référence UFR : Profil recherche : Laboratoire 1 : Laboratoire 2 : Laboratoire 3 : Laboratoire 4 : Laboratoire 5 : Dossier Papier Dossier numérique physique (CD, DVD, clé USB) Dossier transmis par courrier électronique Application spécifique Référence GALAXIE : 4302 0213 Professeur des universités 46-1 Non 65-Biologie cellulaire Biotechnologie microbienne Microbiology has been revolutionized by the development of technologies that permit the collection of large data sets ranging from the scale of the molecule to the scale of the organism (genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics) and their integration into multiscale analyses. Other 0311384L - UNIVERSITE TOULOUSE 3 TOULOUSE 31062 Vacant DRRH - POLE CARRIERE 118, RTE DE NARBONNE - BAT. 3R1 31062 - TOULOUSE CEDEX 9 LAETITIA LAVIGNAC / MARIE-JO CHOIZIT GESTIONNAIRE / RESPONSABLE POLE CARRIERE 05.61.55.87.65 05.61.55.87.61 00.00.00.00.00 [email protected] 01/09/2015 Faculte des Sciences d'Ingenierie ( FSI ) UMR5100 (199911662K) - LABORATOIRE DE MICROBIOLOGIE ET GENETIQUE MOLECULAIRES A ( ) - Laboratoire non reference A ( ) - Laboratoire non reference NON NON NON OUI e-mail gestionnaire URL application https://appli-gestion.univ-tlse3.fr/RPM Poste ouvert aux personnes'Bénéficiaires de l'Obligation d'Emploi' mentionnée à l'article 27 de la loi n° 84-16 du 11 janvier 1984 modifiée portant dispositions statutaires relatives à la fonction publique de l'Etat (situations de handicap). Le profil détaillé se trouve en page 2 et suivantes FICHE DE POSTE UFR : FSI Section CNU : 65 Corps : PR N° de poste : 0213 __________________________________________________________________________________ Intitulé du profil : Biotechnologie microbienne Profil en anglais : Microbiology has been revolutionized by the development of technologies that permit the collection of large data sets ranging from the scale of the molecule to the scale of the organism (genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics) and their integration into multiscale analyses. The application of these technologies to the study of bacteria has numerous applications in biotechnology and food sciences. In this context, the Toulouse microbiology laboratories would like to reinforce the studies of mechanisms that are the basis for the organization and evolution of prokaryotic genomes. The successful candidate will apply his/her competences in the molecular genetics and genomics of prokaryotic organisms to develop a research project in this thematic. The successful candidate will be affected to either the LISBP or the LMGM, two laboratories that are strongly committed to integrative microbial biology. The LISBP, which is a mixed INSA/INRA/CNRS laboratory, explores by coordinated approaches biotechnology and its domains of application: health, water and environment, food sciences and chemistry. The laboratory houses two platforms implicated in the ‘France Genomics’ and ‘Metabolomics Hub’ programs (national infrastructure programs in Biology and Health Sciences). A convention with the UPS has recently been signed permitting university personnel to be housed in the LISBP. In particular, Team 4 (EAD4, Metabolic Engineering of Prokaryotes) headed by M. Cocaign-Bousquet, studies mechanisms of adaptive responses of bacteria with applications in biotechnology by phenotypic analyses (transcriptome to metabolome) and would like to develop an integrated approach combining data at the level of molecular phylogeny, comparative genomics and molecular genetics. The LMGM, which is a mixed UPS/CNRS laboratory and member of the CBI (Center of Biology Integrative), studies processes involved in the organization, expression and evolution of genomes of prokaryotic organisms by integrative approaches ranging from the analysis of single molecules to whole cells. In particular, the ‘Genetic Recombination and Cell Cycle’ team headed by F. Cornet studies mechanisms of stable transmission of genetic material in model bacterial organisms. The team has recently extended its studies to organisms of interest for biotechnology and would like to reinforce this area of research. Enseignement Ø Filières de formation concernées : LICENCE SCIENCES DE LA VIE - MASTER MABS Ø Objectifs pédagogiques et besoin d'encadrement : Le parcours de licence puis la mention de Master MABS (Microbiologie - Agrobiosciences - Biologie des Systèmes), constituent un ensemble de formations bien identifié en microbiologie à l'université Paul Sabatier. Les enseignements mis en place en Licence et Master, avec notamment deux parcours de master (M2 « Diagnostic microbiologique : approches innovantes » et M2 « Microbiologie ») couvrent les nombreux champs thématiques de la discipline, de la microbiologie générale à la microbiologie moléculaire et aux biotechnologies. Le recrutement d’un(e) Professeur(e) permettra de maintenir le potentiel d’enseignement et d’encadrement de l'équipe pédagogique de Microbiologie. La personne recrutée prendra en charge les nouveaux enseignements de Licence et Master axés sur la génétique et la physiologie des bactéries d'intérêt agroalimentaire ou biotechnologique. Une grande partie de cet enseignement sera basée sur les nouvelles méthodes d'analyse des microorganismes (diagnostic moléculaire, approches « omiques », microbiologie intégrative et synthétique). La personne interviendra également dans les modules en lien avec le monde industriel (élaboration de projets scientifiques tutorés, stages en entreprise,…) du M2 « Diagnostic microbiologique : approches innovantes ». Dans le cadre de la mise en place de la nouvelle accréditation la personne recrutée participera activement à la promotion d'une filière professionnalisante en microbiologie au sein du département de Biologie & Géosciences de la Faculté des Sciences et Ingénierie (FSI). Recherche Ø Activités de recherche : Mise en place d'un projet dans la thématique génétique moléculaire et génomique des procaryotes. Laboratoire(s) d'accueil : Type (UMR, EA, JE, ERT) N° Nbre de chercheurs Nbre d'enseignants-chercheurs (LMGM) UMR 5100 14.0 10.0 (LISBP) -UMR CNRS/INSA -UMR INRA/INSA -Convention d’accueil de personnel UPS-INSA T -5504 -792 -Avril 2009 78 Retraite : Ø nombre de départs à la retraite prévisibles dans les 2 ans pour la (ou les) équipe(s) concernée(s) : Informations complémentaires Enseignement : Département d’enseignement : Biologie Géosciences Lieu(x) d’exercice : Université Paul Sabatier - Toulouse Equipe pédagogique : Champ disciplinaire de microbiologie -resp Pascal Le Bourgeois - tel : 05 61 55 94 38 Nom directeur département : Eric CLOTTES Tel directeur dépt. : 0561556631 Email directeur dépt. : [email protected] URL dépt. : Recherche : Lieu(x) d’exercice : LMGM ou LISBP Nom directeur labo : Agamemnon Carpousis / Nic LINDLEY Tel directeur labo : 05.61.33.58.55/05 61 55 94 01 Email directeur labo : [email protected]/ [email protected] URL labo : https://www-lmgm.biotoul.fr/ http://www.lisbp.fr/ Descriptif labo : Le LISBP est un laboratoire de recherche situé sur le campus de l’Institut National des Sciences Appliquées (INSA) de Toulouse. Reconnu internationalement et récompensé quatre fois dans le cadre des Investissements d'Avenir (TWB, Synthacs, Probio3, MetaboHUB), le LISPB se positionne de façon novatrice à l’interface entre sciences du vivant et sciences des procédés. Il est également un des laboratoires labellisé de l'Institut Carnot 3BCar. Ses travaux ont des applications dans les secteurs de la santé, des biotechnologies, de l'eau et de l'environnement, de l'agro-alimentaire et des agro-industries, des éco-industries ainsi que de la chimie. Le LMGM étudie les processus régissant l’organisation, l’évolution et l’expression des génomes des bactéries et des bactériophages. Nos recherches vont des molécules uniques aux cellules vivantes bactériennes et à leurs interactions avec l’environnement, et reposent sur la génétique moléculaire, la biochimie, la génomique et la bioinformatique. Les bactéries et les phages que nous étudions sont des organismes modèles intéressants aussi bien pour la recherche fondamentale que pour les applications dans les domaines des biotechnologies, de l’industrie alimentaire et de la santé. Fiche AERES labo : LMGM : http://www.aeres-evaluation.fr/content/download/13938/231050/file/EVAL-0311384L LISBP : http://www.aeres-evaluation.fr/content/download/14251/234112/file/EVAL-0310152X Descriptif projet : La microbiologie vie une révolution grâce au développement des technologies permettant l’acquisition de données moléculaires à l’échelle des organismes entiers (génome, transcriptome, protéome, métabolome) et leur intégration dans des approches multi-échelles. L’application de ces technologies chez les bactéries est porteuse de nombreuses applications en biotechnologie et agroalimentaire. Dans ce cadre, les laboratoires de microbiologie toulousains souhaitent renforcer l’étude des mécanismes qui sous-tendent l’organisation et l’évolution des génomes procaryotes. Par ses compétences en génétique moléculaire et en génomique des procaryotes, le(la) professeur(e) aura la responsabilité de la mise en place d’un projet dans cette thématique. L'affectation pourra se faire au LISBP ou au LMGM, deux unités fortement engagées dans la biologie intégrative des microbes. Le LISBP (unité mixte INSA Toulouse/INRA/CNRS) explore, par une approche concertée, les biotechnologies et leurs domaines d'application : santé, eau et environnement, alimentaire, chimie. Il héberge 2 plateformes impliquées dans les projets "France Génomique"et "Metabohub" (programme Infrastructures Nationales en Biologie et Santé). En particulier, l'équipe EAD4 (Génie du métabolisme des procaryotes, dirigée par M. Cocaign-Bousquet), étudie les mécanismes de la réponse adaptative des bactéries d'intérêt biotechnologiques par une analyse phénotypique (du transcriptome au métabolome) et souhaite développer une approche intégrée combinant les données de phylogénie moléculaire, de génomique comparative et de génétique moléculaire pour l'étude des mécanismes de la réponse adaptative des bactéries modèles ou d'intérêt biotechnologiques. Le LMGM (unité mixte UPS/CNRS, membre du Centre de Biologie Intégrative de Toulouse) étudie les processus régissant l’organisation, l’évolution et l’expression des génomes des procaryotes par des approches intégrées allant de l’analyse de molécules isolées aux cellules entières. En particulier, l’équipe "Recombinaison génétique et cycle cellulaire", dirigée par F. Cornet, étudie les mécanismes de transmission stable du matériel génétique chez des bactéries modèles. Elle a récemment étendu ses études à des organismes d’intérêt biotechnologique et souhaite renforcer cet axe. Description activités complémentaires : Moyens : Moyens matériels : Les deux laboratoires proposent un environnement scientifique et matériel de renommée internationale dans les domaines de la microbiologie avec un accès aux différentes plateformes (génomique et transcriptomique, protéomique, métabolomique, bioinformatique et biostatistique, imageries, sociétale,…) du GIS GENOTOUL. Le LISBP propose également un environnement de renommée internationale dans les domaines de la biocatalyse et des bioprocédés, incluant certains systèmes expérimentaux uniques dans le paysage français. Le LMGM est équipé en matériel de purification automatisée de protéines, en microscopie à champ large (fluorescence), cytomètrie de flux, et pour l’étude des interactions moléculaires (Biacore). Moyens humains : LISBP : 82 chercheurs et enseignant-chercheurs, 58 ITA/BIATS, 97 doctorants et post-doctorants LMGM : 24 chercheurs et enseignant-chercheurs, 21 ITA/BIATS, 12 doctorants Moyens financiers : LISBP : environ 8,5 M€ / an. Financements provenant de fonds institutionnels (CNRS, INRA, INSA, région Midi-Pyrénées), de l’Union Européenne, et de contrats ANR. 25% de ces financements sont en lien avec le monde industriel. LMGM : environ 900 k€ / an. Financements institutionnels (CNRS, Université Paul Sabatier, région Midi-Pyrénées) et contrats ANR. Autres moyens : Le LISBP possède une forte implication dans le démonstrateur préindustriel TWB (Toulouse White Biotechnology), ainsi que dans le GIS GENOTOUL (hébergement de 3 des 10 plateformes) Autres informations : Compétences particulières requises : Expertise en phylogénie et génétique moléculaire, ainsi qu’en génomique des organismes modèles et d’intérêt biotechnologique (bactéries lactiques). Evolution du poste : Après une période d’intégration dans l’équipe d’accueil, la personne recrutée aura la responsabilité de la mise en place de la caractérisation de la diversité génétique et génomique des bactéries lactiques, de l'identification des éléments responsables de l'évolution et de l'adaptation de ces bactéries à leurs différents écosystèmes, et de l'étude des mécanismes qui sous-tendent ce potentiel adaptatif. Rémunération (€) : 36560