UNIVERSITE DE MONTPELLIER Référence GALAXIE : 119

UNIVERSITE DE MONTPELLIER
Numéro dans le SI local :
Référence GESUP :
Corps :
Article :
Chaire :
Section 1 :
Section 2 :
Section 3 :
Profil :
Job profile :
Research fields EURAXESS :
Implantation du poste :
Localisation :
Code postal de la localisation :
Etat du poste :
Adresse d'envoi du
dossier :
Contact
administratif :
N° de téléphone :
N° de Fax :
Email :
Date de prise de fonction :
Mots-clés :
Profil enseignement :
Composante ou UFR :
Référence UFR :
Profil recherche :
Laboratoire 1 :
Dossier Papier
Dossier numérique physique (CD,
DVD, clé USB)
Dossier transmis par courrier
électronique
Application spécifique
Référence GALAXIE : 119
0746
Professeur des universités
46-1
Non
66-Physiologie
Réponses moléculaires des plantes aux microorganismes : adaptations à des bactéries à
effets contrastés ; enseignement en physiologie, biologie végétale et interactions microorganismes-Plantes.
Plant molecular responses to microorganisms, physiological and developmental
adaptations to contrasted Burkholderia species ; teaching plant physiology and plant
biology and plant-microbe interactions
Biological sciences Biology
Technology Biotechnology
Agricultural sciences Tropical agriculture
Agricultural sciences Agronomics
0342321N - UNIVERSITE DE MONTPELLIER
Montpellier
34000
Vacant
DEPOT DOSSIER ELECTRONIQUE
SUR APPLICATION NUMERIQUE
--MATHILDE KOLF
Bureau du recrutement
04 67 14 99 30
04 67 14 92 45
[email protected]
01/09/2016
physiologie végétale ; interactions plantes-micro-organismes ;
FACULTE DES SCIENCES
UMR_D186 (201119407B) - Interactions Plantes Microorganismes Environnement
NON
NON
NON
OUI
e-mail gestionnaire
URL application
https://campec.umontpellier.fr
Poste ouvert également aux personnes'Bénéficiaires de l'Obligation d'Emploi' mentionnée à l'article 27 de la loi n° 84-16
du 11 janvier 1984 modifiée portant dispositions statutaires relatives à la fonction publique de l'Etat (situations de
handicap).
Le profil détaillé se trouve en page 2 et suivantes
CAMPAGNE D’EMPLOIS ENSEIGNANTS-CHERCHEURS
2016
ETABLISSEMENT : Université de Montpellier
COMPOSANTE : Faculté des Sciences
SITE : Triolet
IDENTIFICATION DU POSTE :
N° : 0746
Corps : PR
Section CNU : 66
Article de référence : 46-1
Mots clefs: interactions plantes-microorganismes, physiologie végétale
Profil pour publication :
Réponses moléculaires des plantes aux microorganismes : adaptations physiologiques,
moléculaires et développementales à des bactéries à effets contrastés du genre Burkholderia ;
enseignement en physiologie et biologie végétale et interactions micro-organismes-Plantes.
Job profile :
Plant molecular responses to microorganisms, physiological and developmental adaptations to
contrasted Burkholderia species ; teaching plant physiology and plant biology and
plant-microbe interactions
Research field :
Biological sciences, Biology
Technology, Biotechnology
Agricultural sciences, Tropical agriculture
Agricultural sciences, Agronomics
ENSEIGNEMENT :
Profil d’enseignement :
Le (la) Professeur recruté(e) aura pour mission le renforcement des enseignements sur les
interactions plantes-microorganismes au sein des équipes pédagogiques de physiologie
végétale du département Biologie-Mécanismes du Vivant (Bio-MV) de la Faculté des
Sciences. Cet offre de formation, quasi unique en France, appuyée sur des équipes de
recherche reconnues dans le domaine et débouchant sur deux filières doctorales identifiées au
sein de l’Ecole Doctorale GAIA, implique de nombreux chercheurs. La mission principale du
(de la) Professeur recruté(e) sera de coordonner les enseignements relevant de ce domaine
dans différents parcours de Licence et de Master, et de consolider la liaison entre ces
différentes filières de formations en lien avec les unités de recherche du site.
Ce poste s’intègre dans le réseau montpelliérain IMH (Interaction Microorganismes–Hôtes)
qui fédère les équipes de recherche montpelliéraine travaillant sur les mécanismes des
interactions entre les microorganismes (bactérie, virus, champignons, parasites) et leurs hôtes
(Plantes, Invertébrés, Mammifères). Ainsi le (la) Professeur renforcera la structuration de
cette thématique dans l’enseignement en relation avec la recherche montpelliéraine.
En Licence Sciences de la Vie, le (la) Professeur participera à la formation en biologie
végétale au sens large (physiologie des plantes, mais aussi biochimie végétale, génétique
végétale, etc.) et en microbiologie en relation avec ses collègues végétalistes et
microbiologistes notamment dans le parcours Microbiologie et dans le parcours Biologie
Fonctionnelle de la Plante.
En Master Biologie-Agrosciences, il (elle) participera à l’enseignement sur les mécanismes
des interactions biotiques notamment des interactions microorganismes pathogènes/plantes. Il
contribuera à former et à préparer les étudiants à une vision globale et comparative du
fonctionnement des interactions microorganisme-hôtes à l’échelle de la plante et de
l’agrosystème. Il (elle) participera à l’enseignement en «Biotechnologies des Plantes
Tropicales», tourné vers les Pays du Sud (accueil d’étudiants des pays du Sud, partenariat à
développer avec des universités d’Asie, d’Afrique et d’Amérique du Sud, supports en anglais,
formation en français, échanges, stages internationaux, etc.).
Au-delà de ses charges d’enseignements statutaires, le (la) PR recruté(e) participera, en
association avec des chercheurs de l’IRD et du CIRAD, à des sessions de formation
spécifiques organisées dans les pays du Sud.
Lieu(x) d’exercice :
Département d’enseignement ou équipe pédagogique : Dépt. Biologie-Mécanismes du Vivant
Lieu(x) d’exercice : UM, Faculté des Sciences de Montpellier, Campus Triolet
Nom du Directeur département : Bruno TOURAINE
Tél. directeur département : +33 (0)4 67 14 47 99
Email directeur département : [email protected]
URL département : http://www.bio-mv.univ-montp2.fr
RECHERCHE :
Profil recherche :
Le (la) Professeur développera un programme de recherche original sur les interactions entre
plantes et microorganismes mutualistes et pathogènes dans l’UMR Interactions Plantes
Microorganismes Environnement (IPME) du CTE Biologie-Agronomie. Les projets réalisés
sur des plantes modèles, et d’importance agronomique, visant à décrypter des mécanismes
fondamentaux de réponse des plantes à des microorganismes seront privilégiés.
Depuis une vingtaine d’années, l’étude des mécanismes et des programmes génétiques des
microorganismes pathogènes et mutualistes de plantes révèlent des spécificités à chaque type
d'interactions, mais aussi des stratégies communes d’infection des tissus végétaux et de
contournement
des
défenses
de
la
plante
hôte.
La
frontière
entre
symbiose-commensalisme-pathogénie apparait ainsi de plus en plus ténue, laissant place à un
continuum d'un extrême à l'autre. Ces multiples analogies entre symbiotes et parasites posent
alors la question i) de l'existence réelle de barrières génétiques pouvant expliquer ces
différents statuts, empêchant les bactéries de basculer d’un type d’interaction vers un autre ;
ii) de la complexité des dialogues moléculaires plante-microorganismes régissant
l’établissement de ces interactions, permettant aux plantes de discriminer les symbiotes des
pathogènes.
Les bactéries du genre Burkholderia ont colonisé tous les types de milieux et d’hôtes, et
représentent un modèle intéressant d’adaptation des bactéries à différentes niches écologiques.
Certaines espèces sont ainsi mutualistes alors que d'autres sont pathogènes de plantes. Cette
diversité, entre des espèces proches génétiquement et évolutivement, permet une comparaison
des mécanismes adaptatifs bactériens, et en parallèle l’étude des interactions
plantes-microorganismes.
Le profil de recherche proposé consistera en une analyse approfondie, via des approches de
transcriptomiques et de post-génomique, des réponses de la plante lors d'interactions avec
différents partenaires bactériens mutualistes (rhizosphériques, endophytiques) et pathogènes.
En particulier, les mécanismes de perception de la bactérie par la plante et leur impact sur les
diverses voies de signalisation et de régulation impliquées seront analysées. L’étude débutera
sur la céréale modèle « riz » en interaction avec différents partenaires bactériens du genre
Burkholderia, en s’appuyant également sur des compétences présentes au sein de l’UMR
IPME.
Equipe d’accueil :
Intitulé de l’équipe : Adaptation des Burkholderia aux Interactions avec les Plantes (ABIP)
N° UMR : 186
Nom du chef d’équipe : Lionel Moulin
Composition de l’équipe (1 DR, 2 CR, 1 ITA/IATOS, 3 post-docs, 2 doctorants) :
# Chercheurs :
o DR2 : Gilles Béna (IRD)
o CR1 : Lionel Moulin (IRD),
o CR2: Agnieszka Klonowska (IRD)
# ITA :
o IR : Alexis Dereeper (IRD) (pour partie)
o Tech : Isabelle Rimbault (IRD)
L’emploi vient-il en soutien à une activité établie ou à l’émergence d’une nouvelle
thématique ?
L’emploi proposé vient consolider une activité de recherche établie par l’équipe depuis
plusieurs années, emploi qui se caractérise par des questionnements nouveaux et émergents
sur la symbiose (frontière mutualisme et pathogénie). C’est donc une évolution thématique en
continuité avec le modèle étudié dans l’équipe d’accueil focalisée jusqu’alors sur les
symbioses mutualistes. La thématique proposée se situe à l’interface entre symbiose (activité
établie) et pathogénie (activité émergente dans l’équipe et sur le modèle proposé).
Contexte scientifique local, national et international :
L’équipe ABIP travaille sur les frontières entre mutualisme et pathogénie chez les bactéries
associées aux plantes (modèle Burkholderia sur légumineuse, riz et blé). Au sein de l’UMR
IPME, elle travaille plus spécialement avec l’équipe Génomique Transcriptomique des
Interactions-Plantes Procaryotes (GTIPP). Aux plans régional et national, l’UMR concentre
ses études et mobilise ses forces les plus importantes sur la pathologie et la symbiose des
céréales, notamment le blé et le riz. Alliée aux autres équipes des UMR Montpelliéraines
travaillant sur le riz, ABIP constitue un groupe de recherche dynamique et performant dont la
lisibilité européenne est unique. A l’échelle internationale, cette position est également très
remarquée (voir CRP GRISP et collaborations dans le cadre du CGIAR).
Collaborations locales, nationales et internationales :
# Locales :
UMR LSTM (CIRAD INRA IRD SupAgro UM) sur les symbioses fixatrices d’azote
UMR
BGPI
(CIRAD
INRA
SupAgro)
sur
les
interactions
Burkholderia-Magnaporthe-riz.
Réseau Interactions Microorganismes-Hôtes de l’UM
# Nationales :
Laboratoire d’Ecologie Microbienne, Université Lyon I
Laboratoire des Interaction Plante-Microorganismes, Castanet-Tolosan
# Internationales Nord :
Département de Biotechnologie et de Sciences de la vie, Université d’Insubria, Italie
The James Hutton Institute, Dundee, Ecosse
# Internationales Sud :
Brésil (Embrapa-Cenargen et Soya à Brasilia, Embrapa-Agrobiologia à Rio)
Colombie (CIAT, Cali)
Burkina-Faso (LMI IRD-INERA : PathoBios)
Mali (IER, USTTB, JEAI Coana)
Sénégal (LMI LAPSE, UCAD et ISRA à Dakar, CORAF)
Cameroun (Univ. Yaoundé et IRAD)
Lieu(x) d’exercice : UMR Interactions Plantes Microorganismes Environnement (IPME)
Nom directeur labo : Valérie VERDIER
Tel directeur labo : 04 67 41 64 86 / 06 64 10 59 45
Email directeur labo : [email protected]
URL labo : www.umr/ipme.ird.fr
Descriptif labo : UMR 186 IPME (IRD-CIRAD-UM)
Fiche AERES labo :
Descriptif du projet :
Les
activités
de
recherche
de
l’unité
IPME
«
Interactions
Plante-Microorganismes-Environnement » portent sur l’étude des interactions entre la plante
et les micro-organismes en tenant compte des facteurs de l’environnement. Les six équipes
de l’UMR développent des études concertées sur les partenaires végétaux et les
microorganismes symbiotiques et/ou pathogènes associés et dans différents contextes de
stress (biotiques et abiotiques). Les thématiques prioritaires de recherche d’IPME portent sur
:
# La diversité des microorganismes associés aux plantes et les mécanismes qui leur
sont associés lors de la colonisation/infection des plantes,
# L’organisation et l’évolution des génomes viraux, bactériens et des nématodes,
# Les réponses et l’adaptation des plantes aux stress biotiques et abiotiques.
Nos recherches, dont les problématiques ont un impact sur l’agriculture et l’environnement
au Sud, sont réalisées sur des cultures tropicales d’intérêt agronomique, économique et
nutritionnel (comme le riz, le manioc, les citrus, les légumineuses, le café) en milieux
tropicaux et méditerranéens. Elles s’articulent autour de l’émergence de nouveaux concepts,
des moyens de prévention, des outils de lutte contre les maladies des plantes et de
l’amélioration de la résistance des plantes aux stress biotiques et abiotiques. Les recherches
ont pour objectifs de :
•
contribuer à une meilleure gestion et durabilité des systèmes de culture,
•
renforcer nos actions de recherche et de formation par la recherche en partenariat,
•
favoriser le transfert des connaissances au Nord comme au Sud.
DESCRIPTION ACTIVITES COMPLEMENTAIRES :
Moyens du laboratoire mis à disposition de l’équipe d’accueil :
Moyens matériels : Equipements du centre IRD de Montpellier, plateforme Genetrop, serres,
laboratoires de quarantaine, accès aux autres plates-formes de biologie des plantes à
Montpellier
Moyens humains : ressources de l’UMR IPME
Moyens financiers : récurrent IRD, UM, CIRAD + ressources externes (3ANRs, Agropolis,
Borlaug, Région, MENERGEP, autres) : soit en moyenne 40% de récurrent pour 60% de Rex
Autres moyens : contrats de l'équipe ABIP :
Projet MIC-CERES du Labex Agropolis/Cariplo 2014-2017
Projet SPE INRA 2014-2015
AUTRES INFORMATIONS :
Compétences particulières requises :
De par le projet de recherche proposé, le (la) candidat(e) devra posséder des bases solides tant
au niveau de la physiologie générale de la plante qu'au niveau de la connaissance des
interactions biotiques qu'elles soient symbiotiques ou pathogènes. De même, une expérience
dans le domaine des NGS et de l'étude du transcriptome serait pertinente.
Evolution du poste :
Au-delà des aspects fondamentaux, ce projet permet de développer des nouveaux fronts de
recherche à l’interface des groupes travaillant sur la symbiose et la pathogénie, permettant la
construction de nouveaux réseaux collaboratifs. Ce projet permettra de développer des
analyses comparatives des souches bactériennes impliquées dans différents types
d’interactions, et d’étudier les réponses des plantes à ces différents organismes (bénéfiques et
pathogènes). Les perspectives de recherche appliquée sur le développement de nouvelles
stratégies de lutte contre les parasites par l’utilisation de microorganismes antagonistes
(bio-contrôle) seront étudiées.
A plus long terme, ce sont les pratiques même de l'agro-écologie qui devraient en bénéficier
avec une amélioration des pratiques culturales plus respectueuses de l'environnement et
intégrant l'impact des interactions multiples au niveau de la rhizosphère (rhizobiome).
MODALITES DE MISE EN SITUATION PROFESSIONNELLE : Néant
Forme :
Durée :
Publicité :
Choix des thèmes des exposés des candidats :
MODALITES DE TRANSMISSION DES CANDIDATURES :
Les dossiers numériques doivent être déposés sur l’application de l’Université de Montpellier
du 25/02/2016 au 30/03/2016 :
https://campec.umontpellier.fr