Analyse informatique de Guides de Bonnes Pratiques Cliniques

THÈSE DE DOCTORAT DE L’UNIVERSITÉ PARIS 6
Spécialité : INFORMATIQUE MÉDICALE
présentée par
Melle Gersende GEORG
Pour obtenir le grade de
DOCTEUR de l’UNIVERSITÉ PARIS 6
Sujet :
Analyse Informatique de Guides de
Bonnes Pratiques Cliniques
Soutenue le 6 septembre 2006 devant le jury composé de :
Monsieur Alain-Jacques VALLERON Université Paris 6 (Président)
Monsieur Bernard MOULIN Université Laval, Québec, Canada (Rapporteur)
Monsieur Domenico PISANELLI CNR – ISTC, Italie (Rapporteur)
Monsieur Gilles CHATELLIER Université Paris 5 (Examinateur)
Monsieur Patrice DOSQUET Haute Autorité de Santé (Examinateur)
Madame Marie-Christine JAULENT INSERM UMR_S 729 (Directrice de thèse)

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Remerciements
Je remercie le Professeur Alain-Jacques Valleron de l’intérêt qu’il a bien voulu porter
à mon travail en acceptant de participer à ce jury.
Le Docteur Patrice Dosquet a suivi les développements de cette recherche et a été le
premier à m’encourager en ce qui concerne ses retombées potentielles. Je tiens à le
remercier de ses encouragements.
Je remercie le Professeur Gilles Chatellier pour son soutien et la confiance qu’il m’a
toujours temoignée. Ses conseils m’ont été précieux et m’ont enrichie tant au point de
vue scientifique qu’humain. Je le remercie également de m’avoir offert l’opportunité de
travailler sur le projet EsPeR.
Je remercie Marie-Christine Jaulent pour son écoute et sa compréhension pendant tout
le déroulement de cette thèse. Au cours de ces années, j’ai pu apprécier son soutien, sa
détermination et ses grandes qualités humaines.
Je suis heureuse que Domenico Pisanelli ait pu apporter le regard de son expérience de
l’informatique médicale. Je le remercie d’avoir accepté de juger cette thèse.
Les travaux du Professeur Bernard Moulin ont servi de point de départ à l’approche
utilisant les opérateurs déontiques. Je le remercie donc sincèrement d’avoir accepté de
jouer le rôle de rapporteur, et ses commentaires m’ont beaucoup encouragée.
Je voudrais remercier le Docteur Isabelle Colombet pour sa gentillesse, son aide, et ses
conseils. Le travail avec elle sur le projet EsPeR m’a beaucoup apporté.
Le Docteur Pierre Durieux s’est intéressé à ce travail, malgré son scepticisme envers
les systèmes informatiques, et a accepté d’être un des premiers évaluateurs du prototype.
Je remercie également le Professeur Jean-Michel Halimi d’avoir accepté de faire partie
des évaluateurs du prototype.
Je tiens à remercier le Professeur Joël Ménard pour son enseignement informel sur les
Guides de Bonnes Pratiques, que ce soit au niveau de leur élaboration que de leurs
retombées en pratique.
François Rastier m’a permis d’assister à ses séminaires « Sémantique des textes » me
permettant de découvrir un domaine que je connaissais que très peu et pour lequel il
m’a beaucoup appris et a attisé ma curiosité.

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Toute l’équipe du SPIM et de l’Inserm UMR_S 729, et en particulier le Professeur
Patrice Degoulet, m’a accueilli chaleureusement au sein du laboratoire.
Je tiens à remercier plus particulièrement quelques collègues pour avoir bien voulu relire
differents chapitres de cette thèse : Julie Niès, qui a fait une relecture très riche en
suggestions, ainsi que David Ouagne et Iulian Alecu.
Je remercie mes parents, pour m’avoir soutenue durant toutes ces années, et j’espère
qu’ils trouveront la concrétisation de leur soutien dans cette thèse. Les compétences
d’enseignante de ma mère ont également été mises à contribution lors des dernières
corrections du manuscrit.
Je remercie Jacqueline d’avoir toujours été présente pour moi ces dernières années. Je
voudrais également remercier mes grands-parents et plus particulièrement mon grand-
père à qui je dédie cette thèse.
Franco Zaroli a été le premier enseignant à avoir cru à mon potentiel. J’espère qu’il
trouvera dans cette thèse l’aboutissement du travail commencé à Strasbourg.
Je remercie de tout cœur Géraldine, mon amie depuis très longtemps ; nos
conversations, parfois très longues, ont été une source d’énergie constante … je la
remercie aussi bien évidemment pour sa relecture et tutti quanti ...
Enfin, les mots ne sauraient exprimer le soutien exceptionnel de celui qui partage ma
vie, Marc …

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Résumé :
Les Guides de Bonnes Pratiques Cliniques sont des documents normalisés destinés à
l’amélioration de la qualité des soins. L’informatisation des Guides de Bonnes Pratiques est
un enjeu majeur pour leur diffusion mais aussi pour les différentes étapes de leur cycle de
vie depuis leur rédaction. De nombreux travaux de recherche ont été consacrés à
l’informatisation des Guides de Bonnes Pratiques. Parmi eux, les approches documentaires
utilisent les développements récents des langages à base de balises pour la structuration des
documents, facilitant le traitement informatisé de ces documents. Nous proposons une
extension de l’approche documentaire qui est basée sur une analyse intelligente des
marqueurs de structuration des recommandations utilisant un analyseur à états finis. Cette
approche a été intégrée à l’environnement informatique G-DEE (Guideline Document
Engineering Environment) dédié à l’étude des Guides de Bonnes Pratiques, et peut servir pour
une aide à la rédaction, un support au consensus lors de l’écriture, et un support pour la
maintenance et l’actualisation des Guides de Bonnes Pratiques.
Mots-clés :
Guides de Bonnes Pratiques ; ingénierie documentaire ; opérateurs déontiques ; automates
à états finis ; G-DEE ; langages de balisage.